(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(5)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(49)
TESTES

Sense strand
AGTTAAAGCAGCTTCAGCAAAGGCGAGAAGAAGAAATGAAGAATCACCAGGTAGTCTGAGATACTGACATTTGGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCATACTCAGAAACCTGGGTTCGATTCCCAGAACCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAAAGAAAAGAATGGCAACTCAGATAAGTATTGTGTTTTCTCTAATATGAGAACATAGATTTAAAATTACTTATGT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037896(GSM510432)
ovary_rep1. (ovary)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccgc....................................................................................................................................................... 27 ccgc 647.00 0.00 251.00 231.00 81.00 50.00 5.00 - 20.00 2.00 1.00 - - 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGa.......................................................................................................................................................... 24 a 199.00 0.00 47.00 59.00 22.00 27.00 4.00 1.00 14.00 1.00 1.00 9.00 - - - - - 2.00 3.00 - 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgt........................................................................................................................................................ 26 cgt 117.00 0.00 3.00 2.00 2.00 1.00 26.00 20.00 - 25.00 - 1.00 22.00 - 13.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccat....................................................................................................................................................... 27 ccat 72.00 0.00 10.00 10.00 4.00 2.00 - - 2.00 - 19.00 1.00 - 12.00 - - - 1.00 - 6.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcca........................................................................................................................................................ 26 cca 69.00 0.00 6.00 12.00 1.00 2.00 6.00 - - 1.00 2.00 2.00 - 1.00 - 16.00 13.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGctcg....................................................................................................................................................... 27 ctcg 58.00 0.00 2.00 2.00 - - 17.00 17.00 - 9.00 1.00 - 4.00 - 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccg........................................................................................................................................................ 26 ccg 53.00 0.00 3.00 6.00 - 1.00 12.00 15.00 - 11.00 - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGg.......................................................................................................................................................... 24 g 48.00 0.00 10.00 6.00 1.00 6.00 1.00 - 2.00 - 8.00 1.00 - 7.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcaa........................................................................................................................................................ 26 caa 45.00 0.00 8.00 10.00 2.00 2.00 4.00 2.00 - 2.00 - 4.00 1.00 - 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGctca....................................................................................................................................................... 27 ctca 28.00 0.00 2.00 4.00 - - 3.00 - - 1.00 1.00 5.00 - - 1.00 4.00 4.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgtt....................................................................................................................................................... 27 cgtt 25.00 0.00 - - - - 13.00 5.00 - 3.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaa......................................................................................................................................................... 25 aa 24.00 0.00 8.00 3.00 2.00 1.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGggg.......................................................................................................................................................... 24 ggg 22.00 0.00 - - - - - - - - 6.00 - - 10.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGagaa............................................................................................................................................................ 22 agaa 20.00 0.00 13.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGT.......................................................................................................................................................... 24 10 18.50 18.50 5.30 2.40 4.40 1.10 0.50 0.10 1.40 - - 0.40 - 0.10 - - - 0.10 0.10 - - - 0.10 - - - 0.10 - 0.20 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - 1.40 0.10 - - - - - - - 0.10 0.10 0.10 0.10 0.10 -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcaaa....................................................................................................................................................... 27 caaa 18.00 0.00 1.00 3.00 1.00 3.00 2.00 3.00 1.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaaa........................................................................................................................................................ 26 aaa 18.00 0.00 5.00 5.00 - 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcata....................................................................................................................................................... 27 cata 16.00 0.00 - - - - 1.00 3.00 - 1.00 - 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGcg........................................................................................................................................................... 23 cg 16.00 0.00 2.00 1.00 1.00 2.00 - - 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGcgc.......................................................................................................................................................... 24 cgc 16.00 0.00 2.00 1.00 4.00 3.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcga........................................................................................................................................................ 26 cga 15.00 0.00 - 2.00 1.00 2.00 2.00 3.00 - 1.00 - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcatt....................................................................................................................................................... 27 catt 11.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - 3.00 - 1.00 2.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCtta.................................................................................................................................................................. 16 tta 10.00 0.00 2.00 2.00 2.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgct....................................................................................................................................................... 27 cgct 7.00 0.00 1.00 - - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGagcg....................................................................................................................................................... 27 agcg 7.00 0.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaaaa....................................................................................................................................................... 27 aaaa 6.00 0.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGtgc.......................................................................................................................................................... 24 tgc 6.00 0.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcatc....................................................................................................................................................... 27 catc 5.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccga....................................................................................................................................................... 27 ccga 5.00 0.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAcc.......................................................................................................................................................... 24 cc 5.00 0.00 - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTcga............................................................................................................................................................ 22 cga 5.00 0.00 - 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGc............................................................................................................................................................ 22 c 5.00 0.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgaa....................................................................................................................................................... 27 cgaa 5.00 0.00 - - - - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGagt............................................................................................................................................................. 21 agt 5.00 0.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTcgag........................................................................................................................................................... 23 cgag 5.00 0.00 - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgg........................................................................................................................................................ 26 cgg 5.00 0.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcag........................................................................................................................................................ 26 cag 4.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................................GTAGCTCAGTGGTAGAGTGCgtg..................................................................................................................................................... 23 gtg 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccgg....................................................................................................................................................... 27 ccgg 4.00 0.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGggca......................................................................................................................................................... 25 ggca 4.00 0.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGagca....................................................................................................................................................... 27 agca 4.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGagc........................................................................................................................................................ 26 agc 4.00 0.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcaga....................................................................................................................................................... 27 caga 4.00 0.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGag......................................................................................................................................................... 25 ag 4.00 0.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgac........................................................................................................................................................ 26 gac 4.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAtttt........................................................................................................................................................ 26 tttt 4.00 0.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAttt......................................................................................................................................................... 25 ttt 4.00 0.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgat....................................................................................................................................................... 27 cgat 3.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCAcgaa.......................................................................................................................................... 29 cgaa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAta.......................................................................................................................................................... 24 ta 3.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCgtg..................................................................................................................................................... 24 gtg 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGctt........................................................................................................................................................ 26 ctt 3.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgga....................................................................................................................................................... 27 cgga 3.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcaat....................................................................................................................................................... 27 caat 3.00 0.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccgt....................................................................................................................................................... 27 ccgt 3.00 0.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGtaga............................................................................................................................................................. 21 taga 3.00 0.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTtt............................................................................................................................................................. 21 tt 3.00 0.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGaagt............................................................................................................................................................ 22 aagt 3.00 0.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgta....................................................................................................................................................... 27 cgta 3.00 0.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgcc....................................................................................................................................................... 27 cgcc 3.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAtaa........................................................................................................................................................... 23 taa 2.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGttt.......................................................................................................................................................... 24 ttt 2.00 0.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcgtg....................................................................................................................................................... 27 cgtg 2.00 0.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGggc........................................................................................................................................................ 26 ggc 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTgag............................................................................................................................................................ 22 gag 2.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcagc....................................................................................................................................................... 27 cagc 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGaat............................................................................................................................................................. 21 aat 2.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcttt....................................................................................................................................................... 27 cttt 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCatgc.................................................................................................................................................... 30 atgc 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCgc...................................................................................................................................................... 28 gc 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcccg....................................................................................................................................................... 27 cccg 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGagat............................................................................................................................................................ 22 agat 2.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAcag........................................................................................................................................................... 23 cag 2.00 0.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGagc............................................................................................................................................................. 21 agc 2.00 0.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAcagc.......................................................................................................................................................... 24 cagc 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGtag.............................................................................................................................................................. 20 tag 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGac......................................................................................................................................................... 25 ac 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAtcga.......................................................................................................................................................... 24 tcga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGgagt............................................................................................................................................................ 22 gagt 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaac........................................................................................................................................................ 26 aac 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GTAGAGTGCTTGCCTAGCAcgat.......................................................................................................................................... 23 cgat 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcta........................................................................................................................................................ 26 cta 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGagtg............................................................................................................................................................ 22 agtg 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgaca....................................................................................................................................................... 27 gaca 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcct........................................................................................................................................................ 26 cct 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCttat................................................................................................................................................................. 17 ttat 2.00 0.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAttag........................................................................................................................................................ 26 ttag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGttat............................................................................................................................................................. 21 ttat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaaga....................................................................................................................................................... 27 aaga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGtga.......................................................................................................................................................... 24 tga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTttt............................................................................................................................................................ 22 ttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................AGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCATgtta......................................................................................................................................... 28 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............TCAGCAAAGGCGAGAAGAAGAAATGA................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGcaa.......................................................................................................................................................... 24 caa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaat........................................................................................................................................................ 26 aat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgcgc....................................................................................................................................................... 27 gcgc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................GGGTTCGATTCCCAGtcag.............................................................................................................. 19 tcag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGgagc............................................................................................................................................................ 22 gagc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAca.......................................................................................................................................................... 24 ca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGagca....................................................................................................................................................... 28 agca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTcgt............................................................................................................................................................... 19 cgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGata........................................................................................................................................................ 26 ata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CAGCAAAGGCGAGAAGAAGAAATGAAG................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAtcg......................................................................................................................................................... 25 tcg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGttt.............................................................................................................................................................. 20 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGTAGAGTGCTTGCCTAGCAcgtt.......................................................................................................................................... 24 cgtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaag........................................................................................................................................................ 26 aag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAtgt......................................................................................................................................................... 25 tgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTca........................................................................................................................................................ 25 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaatg....................................................................................................................................................... 27 aatg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTatgc...................................................................................................................................................... 26 atgc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGAGAAGAAGAAATGAAGAATCACCAG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GGTTCGATTCCCAGAcg............................................................................................................... 17 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCa....................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcagt....................................................................................................................................................... 27 cagt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TCAGCAAAGGCGAGAAGAAGAAATGAA.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GTAGAGTGCTTGCCTAGCAcaa........................................................................................................................................... 22 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGAGAAGAAGAAATGAAGAATCACaag........................................................................................................................................................................................................ 27 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGgcga............................................................................................................................................................ 22 gcga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaaac....................................................................................................................................................... 27 aaac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcacc....................................................................................................................................................... 27 cacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCAcgtt.......................................................................................................................................... 29 cgtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaggg....................................................................................................................................................... 27 aggg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccac....................................................................................................................................................... 27 ccac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCATtt........................................................................................................................................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGCAAAGGCGAGAAGAAGAAATGAAGAAT.............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgttt....................................................................................................................................................... 27 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcctc....................................................................................................................................................... 27 cctc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGattt....................................................................................................................................................... 27 attt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgat........................................................................................................................................................ 26 gat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGctta....................................................................................................................................................... 27 ctta 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGagcg............................................................................................................................................................ 22 agcg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTcgta.............................................................................................................................................................. 20 cgta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGctcc....................................................................................................................................................... 27 ctcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTgagc........................................................................................................................................................... 23 gagc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccct....................................................................................................................................................... 27 ccct 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGccaa....................................................................................................................................................... 27 ccaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgata....................................................................................................................................................... 27 gata 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGatt............................................................................................................................................................. 21 att 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCAcg............................................................................................................................................ 27 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTGGGTTCGATTCCCgtc................................................................................................................. 18 gtc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgg......................................................................................................................................................... 25 gg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCtttc................................................................................................................................................................. 17 tttc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcttg....................................................................................................................................................... 27 cttg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CTAGCATACTCAGAAACCTGGGTTCGA......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGaga........................................................................................................................................................ 26 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCttaa................................................................................................................................................................. 17 ttaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGggaa............................................................................................................................................................ 22 ggaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcctg....................................................................................................................................................... 27 cctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGggaa........................................................................... 34 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGcgca......................................................................................................................................................... 25 cgca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGcagg....................................................................................................................................................... 27 cagg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGct........................................................................................................................................................... 23 ct 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAtg.......................................................................................................................................................... 24 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGtgag............................................................................................................................................................. 21 tgag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AAGGCGAGAAGAAGAAATGAAGAATCACCAG........................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAcagg................................................................................................................................................................ 18 cagg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTgagt........................................................................................................................................................... 23 gagt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGat......................................................................................................................................................... 25 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGgaa........................................................................................................................................................ 26 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAtttt.......................................................................................................................................................... 24 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................AAAGGCGAGAAGAAGAAATGAAGAATC............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AGGCGAGAAGAAGAAATGAAGA................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCtatt................................................................................................................................................................. 17 tatt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TTGGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGT.......................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTaa........................................................................................................................................................ 26 aa 0.40 18.50 - - - 0.10 - 0.20 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTcgcg...................................................................................................................................................... 28 cgcg 0.20 18.50 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTatgc...................................................................................................................................................... 28 atgc 0.20 18.50 - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTG......................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTagg....................................................................................................................................................... 27 agg 0.10 18.50 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTatgt...................................................................................................................................................... 28 atgt 0.10 18.50 - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTagc....................................................................................................................................................... 27 agc 0.10 18.50 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTatgg...................................................................................................................................................... 28 atgg 0.10 18.50 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTacc....................................................................................................................................................... 27 acc 0.10 18.50 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTaaat...................................................................................................................................................... 28 aaat 0.10 18.50 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTca........................................................................................................................................................ 26 ca 0.10 18.50 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTcgc....................................................................................................................................................... 27 cgc 0.10 18.50 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTcg........................................................................................................................................................ 26 cg 0.10 18.50 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCT....................................................................................................................................................... 26 12 0.08 0.08 - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGC.................................................................................................................................................... 27 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08

Antisense strand
AGTTAAAGCAGCTTCAGCAAAGGCGAGAAGAAGAAATGAAGAATCACCAGGTAGTCTGAGATACTGACATTTGGGGATGTAGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCATACTCAGAAACCTGGGTTCGATTCCCAGAACCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAAAGAAAAGAATGGCAACTCAGATAAGTATTGTGTTTTCTCTAATATGAGAACATAGATTTAAAATTACTTATGT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037896(GSM510432)
ovary_rep1. (ovary)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
..................................................................................................................CCTGGGTTCGATTCCCAcctc................................................................................................................... 21 cctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CAGAAACCTGGGTTCGATTCCCAgaag................................................................................................................... 27 gaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -