(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(40)
TESTES

Sense strand
ACTCTTCTCATAGACTGCATCTGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCCTTTCTGTGCCATACCATCCCACTTCCTTAGCTCTGCAGGGCAGCCAAAGCCAGCCCTGGTCGTTAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTTCTCTCTTCCCCCAGGTGGCAGGGCTGTGATGGCCCTTCCTACACACCTGGACTCTGCCTACCCA
......................................................................(((.....((.((...(((((((...))))))).)))).....)))...((((((.((((((((((((.((....))..)))))).....)))))).)))))).............................................................................
................................................................65...........................................................................................................................190..........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.....................................................................TGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTC.......................................................................................................................................................... 27 1 72.00 72.00 24.00 20.00 10.00 14.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCC......................................................................................................................................................... 28 1 63.00 63.00 20.00 26.00 7.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................TTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTC.......................................................................................................................................................... 28 1 18.00 18.00 9.00 3.00 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTC.......................................................................................................................................................... 30 1 12.00 12.00 4.00 4.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGACTA.............................................................................................................................................................................. 27 1 9.00 9.00 4.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGT........................................................................................................................................................... 29 1 8.00 8.00 3.00 - 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACT........................................................................................................................................................................................................ 26 1 7.00 7.00 - - - - 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................TGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCCT........................................................................................................................................................ 29 1 7.00 7.00 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.......................................................................................................................TTCCTTAGCTCTGCAGGGCAG.............................................................................................................. 21 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTC.......................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGACT............................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTT................................................................ 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TAGACTGCATCTGTTAGGATGAGGTGT..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAAAC............................................................................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGG............................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AAGGGAAGACTCTTTTGGACTATTTGT......................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TTAGCTCTGCAGGGCAGCCAAAGCCAGC................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCCCAGGTGGCAGGGCTGTGA................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGT........................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTTC............................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGAGGTGTTGGGGAAACGACTGGCA.................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGAGGTGTTGGGGAAACGACTGGC..................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCCTTTCTGTGCCATACCATCCCACTT................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TTGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAt............................................................................................................................................................................................. 25 t 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGACTATT............................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGTGCCATACCATCCCACTTCCTTAGCTCT....................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ACTGGCAAAGGGAAGACTCTTT..................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGAC......................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GGGTCCTTTCTGTGCCATACCATCCC..................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TCTGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAA.............................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGA........................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGT........................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTTCTCATAGACTGCATCTGTTAGGAT............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAG.............................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGAC................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TACCATCCCACTTCCTTAGCTCTGCAG................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCCCACTTCCTTAGCTCTGCAGGGCAGCC............................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCC......................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACTG....................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTTCTCATAGACTGCATCTGTTAGG.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGAGGTGTTGGGGAAACGACTGGCAA................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TCTTCTCATAGACTGCATCTGTTAGGA............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTT................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTC........................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CACTTCCTTAGCTCTGCAGGGCAGCCA........................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGT........................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AGACTCTTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGA................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCTCTTCCCCCAGGTGGCAGGGCTGT..................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................CTTTCTGTGCCATACCATCCCACTTC................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................ATCCCACTTCCTTAGCTCTGCAGGG................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAG............................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGAC......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGG............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AAAGCCAGCCCTGGTCGTTAGG...................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCCTT....................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTTC............................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................CGACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTTG................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...CTTCTCATAGACTGCATCTGTTAGGA............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTTG................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCCCCCAGGTGGCAGGGCTGTGATGG................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACT........................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTTAGGATGAGGTGTTGGGGgaaa............................................................................................................................................................................................................ 25 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCCTTTC..................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGAtt........................................................................................................................................................................................................ 26 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCTCATAGACTGCATCTGTTAGGATGA.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCaa........................................................................................................................................................ 29 aa 1.00 72.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGAC................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCT....................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAa............................................................................................................................................................................................ 25 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGCATCTGTTAGGATGAGGTGTTGGt................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTTCTGTGCCATACCATCCCACTTCCTTAG........................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TTTGTGCTCCCAGAAGGGTCCTTTCTt................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GTGGCAGGGCTGTGATGGC............................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GCATCTGTTAGGATGAGG........................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................ACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTT.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TACACACCTGGACTCTGCCTACCCAatc 28 atc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACTG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAAACG........................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCCCCCAGGTGGCAGGGCTGTGATGGC............................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TTGTGCTCCCAGAAGGGTCCTTTCTGTa................................................................................................................................................. 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............TGCATCTGTTAGGATGAGGTGTTGGGG................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAA............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTa................................................................ 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GTTAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCT................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCTCATAGACTGCATCTGTTAGGATG........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCT....................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGATGAGGTGTTGGGGAAACGACTGG...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AGGGCCAAGGAGAAATAGCAA.................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CCAAAGCCAGCCCTatag............................................................................................ 18 atag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................GTCCTTTCTGTGCCATACCATCCCACT.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGA................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GACTGCATCTGTTAGGATGAGGTGT..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCATAGACTGCATCTGTTAGGATGAGGT....................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCCCCCAGGTGGCAGGGCTGTGATGGCCat............................ 30 at 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAA.............................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.................................................................................................................................................................AGGGCCAAGGAGAAATAGCA..................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.....................TGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGA.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CATCCCACTTCCTTAGCTCTGCAGGGCAtt............................................................................................................. 30 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGCATCTGTTAGGATGAGGTGTTGG.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACTGCATCTGTTAGGATGAGGTGTTGGGGA............................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...........................GATGAGGTGTTGGGGAAACGACTGGC..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTC........................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACT........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCCCCCAGGTGGCAGGGCTGTGATGGa............................... 27 a 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGAAGGGTCCTTTCTGTG................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCT....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGt........................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TCTTCTCTCTTCCCCCAGGTGGCAGGGCT....................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TTGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAA............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCTCTTCCCCCAGGTGGCAGGGCTG...................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCACTTCCTTAGCTCTGCAGGGCAGCC............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GTTGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGAC.......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................TCTGTTAGGATGAGGTGTTGGGGgag............................................................................................................................................................................................................. 26 gag 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TAGCAATCTTCTCTCTTCCCCCAGGTG............................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................AACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTT...................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................AAGCCAGCCCTGGTCGTTAGGGCCAAGG............................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TTCCTACACACCTGGACTCTGCCTACCC. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ATCTGTTAGGATGAGGTGTTGGG................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACTGGC..................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGAa......................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................AGGTGTTGGGGAAACGACTGGCAAAG................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTTCTC............................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTTT..................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................AAACGACTGGCAAAGGGAAGAC.......................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............................................ACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGG.................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTT...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................AACGACTGGCAAAGGGAAGACT......................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGGATGAGGTGTTtagg................................................................................................................................................................................................................ 18 tagg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -

Antisense strand
ACTCTTCTCATAGACTGCATCTGTTAGGATGAGGTGTTGGGGAAACGACTGGCAAAGGGAAGACTCTTTTGGACTATTTGTGCTCCCAGAAGGGTCCTTTCTGTGCCATACCATCCCACTTCCTTAGCTCTGCAGGGCAGCCAAAGCCAGCCCTGGTCGTTAGGGCCAAGGAGAAATAGCAATCTTCTCTCTTCCCCCAGGTGGCAGGGCTGTGATGGCCCTTCCTACACACCTGGACTCTGCCTACCCA
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Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)