chr9:20693834 20694083 +
(12)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(6)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(44)
TESTES

Sense strand
GGGTCACACACTTCCTTATTTTGACCAAAACAGATAACAGTGTATACTTGGTGAGTGCGCGCCACACCGTCCCTTTCCCTCCCTGAGCCCCAGCTGCTCCTGTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTGAAGGAGCAGGGCTTTCCCTTCTCTCGCCCCACCCGCCAGCCAGACCCCTGCACCCTCACCCACCCTTTCTTTGGCAGAAGCTG
.....................................................................................................(((..((((.((((.((......)).)))))))))))....((((((.(((....))).))))))....................................................................................
................................................................................................97......................................................................169...............................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGC......................................................................................................................... 28 1 1506.00 1506.00 254.00 - 144.00 103.00 102.00 123.00 131.00 122.00 80.00 69.00 121.00 69.00 16.00 - 37.00 19.00 26.00 16.00 22.00 12.00 2.00 1.00 6.00 9.00 4.00 1.00 2.00 5.00 2.00 - - 3.00 - 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTA................................................................................................. 52 1 215.00 215.00 - 206.00 - - - - - - - - - - - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGC......................................................................................................................... 27 1 192.00 192.00 16.00 - 43.00 - 4.00 9.00 18.00 8.00 49.00 - 7.00 16.00 - - - - 4.00 5.00 - - 1.00 8.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAA................................................................................................ 52 1 157.00 157.00 - 73.00 - - - - - - - - - - - 84.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAG.......................................................................................................................... 27 1 99.00 99.00 12.00 - 3.00 6.00 2.00 20.00 7.00 13.00 5.00 - 2.00 3.00 5.00 - - - 4.00 5.00 3.00 5.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - -
....................................................................................................................................................AAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 17 1 91.00 91.00 4.00 - 12.00 35.00 8.00 - 3.00 - 2.00 11.00 1.00 2.00 8.00 - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 18 1 76.00 76.00 1.00 - 4.00 19.00 6.00 - 2.00 - 2.00 8.00 - 2.00 14.00 - 11.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAG.......................................................................................................................... 26 1 67.00 67.00 3.00 - 8.00 13.00 5.00 6.00 1.00 2.00 4.00 - 2.00 2.00 4.00 - - 2.00 2.00 1.00 1.00 - 7.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 20 1 44.00 44.00 - - 1.00 28.00 5.00 - - - - 3.00 1.00 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 19 1 31.00 31.00 - - 3.00 9.00 5.00 - 1.00 - - 2.00 - - 4.00 - - 3.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGA........................................................................................................................... 26 1 30.00 30.00 - - - - 5.00 7.00 1.00 9.00 2.00 - - - 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AAGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 19 1 27.00 27.00 - - - 7.00 - - 1.00 - - 11.00 - - 5.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGA....................................................................................... 34 1 27.00 27.00 - - - 13.00 1.00 - - - - 4.00 1.00 - - - 5.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGa......................................................................................................................... 28 a 20.00 99.00 - - 1.00 6.00 1.00 2.00 3.00 - 1.00 2.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCC...................................................................................................................................... 15 2 18.50 18.50 6.50 - 2.50 - 2.50 - 2.00 - 3.50 - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCC..................................................................................................................................... 16 1 16.00 16.00 5.00 - 6.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTG................................................................................................................................. 20 1 16.00 16.00 - - - - 5.00 - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AAGTAAACGCTCTGAAGTGA.................................................................................. 20 1 15.00 15.00 - - - - 4.00 - - - - 5.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 17 1 14.00 14.00 - - 1.00 - - - - - - 8.00 - 2.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGA........................................................................................................................... 25 1 14.00 14.00 - - - - 4.00 1.00 1.00 2.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 28 1 12.00 12.00 - - - 8.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 15 3 12.00 12.00 1.67 - 3.33 - 3.00 - 0.67 - 1.67 - - 1.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCTGAGCTCTTGTGATGCTGG........................................................................................................... 22 1 11.00 11.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGC................................................................................................................................ 21 1 10.00 10.00 - - - - 5.00 - 1.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGA....................................................................................... 35 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 18 1 10.00 10.00 - - - - 2.00 - - - - 3.00 - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTG............................................................................................................................ 25 1 9.00 9.00 3.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 24 1 9.00 9.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCC.............................................................................................................................. 22 1 8.00 8.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTtagc......................................................................................................................... 28 tagc 8.00 4.00 1.00 - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAAACGCTCTGAAGTGA.................................................................................. 19 1 8.00 8.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 16 3 8.00 8.00 - - 2.00 1.00 3.33 - 0.67 - 0.33 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGa......................................................................................................................... 27 a 8.00 67.00 - - - - - 1.00 - - - - 3.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 21 1 8.00 8.00 - - - - 1.00 - - - - 3.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 34 1 7.00 7.00 - - - 2.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCC............................................................................................................................... 22 1 7.00 7.00 - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAGTGA.................................................................................. 18 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 4.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCT........................................................................................................................ 28 1 6.00 6.00 - - 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAa.......................................................................................................................... 27 a 6.00 30.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 22 1 6.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCT...................................................................................................................... 30 1 6.00 6.00 - - 4.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTGAAGTGA.................................................................................. 21 1 6.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCAT................................................................................................................................... 18 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 20 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAAACGCTCTGAAGT.................................................................................... 17 1 5.00 5.00 - - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAtc......................................................................................................................... 28 tc 5.00 30.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCT........................................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATT.................................................................................................................................. 18 1 5.00 5.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCC............................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAAAGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCTGAGCTCTTGTGATGCTGGC.......................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGcgc......................................................................................................................... 28 cgc 4.00 9.00 - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAAAGTAAACGCTCTGAAGTGA.................................................................................. 22 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCT............................................................................................................................. 24 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATG............................................................................................................... 38 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CTGTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGC......................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATaa................................................................................................................................. 20 aa 3.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAAACGCTCTGAAGTGA.................................................................................. 17 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGt......................................................................................................................... 28 t 3.00 99.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGtgc......................................................................................................................... 28 tgc 3.00 9.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATa.................................................................................................................................. 19 a 3.00 5.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTGTaa................................................................................................................. 36 aa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTC....................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 36 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCT...................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTT..................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGC......................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCT............................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TGATGATGAGCCCATTGCCCTGAG.......................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTtcgc......................................................................................................................... 28 tcgc 2.00 4.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCAAAGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................................................................................TGCCCTGAGCTCTTGTGATGCTGG........................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TCAAAGTAAACGCTCTGAAGTGAAGGA.............................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..............................................................................................................................................GCTTCAAAGTAAACGCTC.......................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCC.............................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTG................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAcc......................................................................................................................... 28 cc 2.00 30.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAAAGTAAACGCTCTGAA...................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 16 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATT.................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTG............................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCT........................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCTGAGCTCTTGTGATGCTG............................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATG............................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAAAGTAAACGCTCTGAAGT.................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAGTaa.................................................................................. 18 aa 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TCTGAAGTGAAGGAGCAGGG........................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGcg.......................................................................................................................... 27 cg 2.00 9.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCC..................................................................................................................................... 15 6 1.83 1.83 - - 1.17 - - - - - 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AACGCTCTGAAGTGA.................................................................................. 15 3 1.33 1.33 - - 0.33 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 15 3 1.33 1.33 - - 1.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AGTAAACGCTCTGAAGTGAA................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CGCCCCACCCGCCAGgcc......................................... 18 gcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATG............................................................................................................... 37 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTtag.......................................................................................................................... 26 tag 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCT........................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTGAAGTGAA................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTGACCAAAACAGATAACAGTGTATACTTG........................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCccag.......................................................................................................................... 27 ccag 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCa........................................................................................................................ 28 a 1.00 192.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CGCTCTGAAGTGAAGGAGCAGG......................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTGA....................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGA....................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTGATGATGAGCCCATTG................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AAGTAAACGCTCTGAA...................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TTTGACCAAAACAGATAACAGTGTATACT.......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGggc......................................................................................................................... 28 ggc 1.00 9.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CCTGTCTGATGATGAGg....................................................................................................................................... 17 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAGT.................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGA....................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CGCTCTGAAGTGAAGGAGC............................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CGCTCTGAAGTGAAGGAaga........................................................................... 20 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAGCTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGT.................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGggct........................................................................................................................ 29 ggct 1.00 9.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATTGCCCTGAGCTCTTGTGATGCT............................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CCAAAACAGATAACAGTGTATACTTG........................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTa....................................................................................................................... 30 a 1.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GATGAGCCCATTGCCCTGAGC......................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGAGCCCATTGCCCTGAGa......................................................................................................................... 19 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ACGCTCTGAAGTGga................................................................................. 15 ga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTG.................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAA...................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AAGTAAACGCTCTGAAGT.................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCA.................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCttga........................................................................................................................... 26 ttga 1.00 7.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTcagc......................................................................................................................... 28 cagc 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAac......................................................................................................................... 28 ac 1.00 30.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GATGATGAGCCCATTGCCCTGAGC......................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AAGTAAACGCTCTGAAGTGAAGG............................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTa................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCTGAGCTCTTGTGATGCTGG........................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAaa......................................................................................................................... 27 aa 1.00 14.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAGTGAAGaaaa............................................................................ 24 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTcagt......................................................................................................................... 28 cagt 1.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAAAGTAAACGCTCTGAAt..................................................................................... 19 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGttc......................................................................................................................... 28 ttc 1.00 9.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAGCTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAG................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATGaa............................................................................................................. 26 aa 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTG.................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTGAAGTa................................................................................... 20 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAG..................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CTGAGCTCTTGTGATGCTGG........................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAtg..................................................................................... 15 tg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTGAtg..................................................................................... 18 tg 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TCTGAAGTGAAGGAGCAGG......................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTGAAG................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAt.......................................................................................................................... 27 t 1.00 30.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAtg......................................................................................................................... 28 tg 1.00 30.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTtagt......................................................................................................................... 28 tagt 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAAGTAAACGCTCTG........................................................................................ 15 2 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCcgtg.......................................................................................................................... 27 cgtg 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTG................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAGTGAAGG............................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAA...................................................................................... 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCCTTATTTTGACCAAAACAGATAACA................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..................................................................................................................................CTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCT........................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................AGTGAAGGAGCAGGGCTTTC................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CGCTCTGAAGTGAAGGAGCAGGG........................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGaa................................................................................................. 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGtg.......................................................................................................................... 27 tg 1.00 9.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGACCAAAACAGATAACAGTGTATAC........................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTC.......................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTa................................................................................................................................. 20 a 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACCAAAACAGATAACAGTGTATACTTG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTGAAGGA.............................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...........................................................................................................................CTGAGCTCTTGTGATGCTGGC.......................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGA....................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTAAACGCTCTGAAGTGAA................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GTCTGATGATGAGCCCATTGagc.............................................................................................................................. 23 agc 1.00 16.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CTGAGCTCTTGTGATGC.............................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AACGCTCTGAAGTGAA................................................................................. 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCTGATGATGAGCCCAT................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGGTCACACACTTCCTTATTTTGACCAAAACAGATAACAGTGTATACTTGGTGAGTGCGCGCCACACCGTCCCTTTCCCTCCCTGAGCCCCAGCTGCTCCTGTCTGATGATGAGCCCATTGCCCTGAGCTCTTGTGATGCTGGCTTCAAAGTAAACGCTCTGAAGTGAAGGAGCAGGGCTTTCCCTTCTCTCGCCCCACCCGCCAGCCAGACCCCTGCACCCTCACCCACCCTTTCTTTGGCAGAAGCTG
.....................................................................................................(((..((((.((((.((......)).)))))))))))....((((((.(((....))).))))))....................................................................................
................................................................................................97......................................................................169...............................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
................................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCT........................................................................................... 15 6 10.83 10.83 - - - - 0.67 - - - 0.17 3.17 1.50 0.17 1.17 - - 2.50 - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCaaat............................................................................................ 18 aaat 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GCTTCAAAGTAAACGCaggc............................................................................................ 20 aggc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GACCCCTGCACCCTcaat........................... 18 caat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCTaggc........................................................................................... 19 aggc 0.17 0.00 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTCAAAGTAAACGCTata........................................................................................... 18 ata 0.17 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -