chr9:20448693 20449066 -
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(52)
TESTES

Sense strand
CGACTACTCCCAAGCCAGACAATCCTCCTACCGCGGAATCCCGGCTGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCATGCAGGGCCTGTGGCTTTCTGCTTTCATTCAAAGCTCAGCCTCAAACCCTGTGCTTGCTTCCCCGCCCCTGGTCGTAGTGACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGTGCAGGCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCCATGCATGTTGCGTACCACTCCGCGTGTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACGGGGAAAGAGCTTTTGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGATTAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGAGAGGAATCCCTTCTTAAATTCAA
...........................................................................................................................................((((.....)))).((((((.....((((((.....((((..((((......)))).))))...))))))))))))...............................................................................................................................................................
...........................................................................................................................................140...............................................................................222......................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................................................................................................................................................................TGATGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTT................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 4.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGTGACCGTTTCAGAGACTCCAGGG............................................................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGC............................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCCAAGCCAGACAATCCTCCTACCGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCC........................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCC........................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCCAT......................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCCA.......................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATGAAAACTAAGTCGGATCCTGGT.................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCATACGGGGAAAGAGCTTTTGCTTT....................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGA................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGA............................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................CGCGTGTCCGTGTCCTGCCTGCGAAG............................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGTTGGAAATAGCATACGGGGAAAGA.................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACG.......................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGAG...................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACGGG........................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGG........................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGG........................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATC......................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGTGACCGTTTCAGAGACTCCAGGGG........................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGGAGTCATGCAGGGCCTGTGGCTTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACGGGG....................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGTGCA....................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CAGGCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGG............................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
....TACTCCCAAGCCAGACAATCCTCCTACCG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGAT.......................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGA....................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TCCTACCGCGGAATCCCGGCTGCAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATC......................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AGGCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGAT.......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..ACTACTCCCAAGCCAGACAATCCTCCT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGAGAGGCCATGCATGTTGCGTACCA.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GATGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGA................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATTAAAGAATCGCGAGAGCTGGTG.......................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGTGGCTTTCTGCTTTCATTCAAAGCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAAATAGCATACGGGGAAAGAG................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGTGACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGc.......................................................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGTGCCGAAAagac..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 agac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCATACGGGGAAAGAGCTTTTGCTTTGA..................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGA............................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCCTGct.................................................................................................................................................................... 30 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGA........................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCCATGC....................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCCATG........................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGCAGGCTGCAGTTGATGAAAACTAAGT............................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCC........................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCAT............................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTT........................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCC........................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGTTGGAAATAGCATACGG......................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACa.......................................................................................... 26 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CAGGGGTGCAGGCTGCAGT.............................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCC........................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGAG...................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACGGGGA...................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TTTCATTCAAAGCTCAGCCTCAAACCC................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCATACGGGGAAAGAGCTTTTGC.......................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TACCACTCCGCGTGTCCGTGTCCTGCCTGC................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGTGCAG...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGAGAGGAAT................ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGTTGGAAATAGCATACGGGGAAAG................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTGTTCCAGATTAAAGAATCGCGAGAGC............................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
......................................................................................................................................................CCGTTTCAGAGACTCCAGGGGTGCAGGC.................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCTGGTGGGAGAGGAA................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGTGACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGT.......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGTGCAt...................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTTGGAAATAGCATACGGGGt...................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCC........................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATccg.......................................................................................... 26 ccg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GCGAAGATGTTGGAAATAGCATACG.......................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCC........................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TACCACTCCGCGTGTCCGTGTCCTGCC.................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCt........................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGA................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGt....................... 25 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TACCACTCCGCGTGTCCGTGTCCTGCCTGt................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCCT....................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACGG......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCCAAGCCAGACAATCCTCCTACCGCGGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCCAT......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TACGGGGAAAGAGCTTTTGCTTTGATTCT................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGt....................... 26 t 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAAT.................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAG................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TACCACTCCGCGTGTCCGTGTCCT....................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATTAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGA....................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATCGCGAGAGCTGGTGGGAGAGGA.................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCAGAGACTCCAGGGGTGCAGGCTGC................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGAGA..................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GACTCCAGGGGTGCAGGCTGCA................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCCCAAGCCAGACAATCCTCCTACCGa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTG....................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGCAGTTGATGAAAACTAAG................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATGAAAACTAAGTCGGATCCTGGgtg.................................................................................................................................................................. 28 gtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTGCTTGCTTCCCCGCCCCTGGTC....................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCC........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGAGAGGCCATGCATGTTGCGaaa............................................................................................................................................ 24 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GATGAAAACTAAGTCGGATCCT....................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTGCGAAGATGTTGGAAATAGCAT............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.............................................................................................................................................................................................AAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCC........................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCAGAGACTCCAGGGGTGCAGGCTG.................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGATGTTGGAAATAGCATAC........................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGTGACCGTTTCAGAGACTCCAGG............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CAATCCTCCTACCGCGGAATCCCGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGC............................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GGGGTGCAGGCTGCgaaa............................................................................................................................................................................................. 18 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00

Antisense strand
CGACTACTCCCAAGCCAGACAATCCTCCTACCGCGGAATCCCGGCTGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCATGCAGGGCCTGTGGCTTTCTGCTTTCATTCAAAGCTCAGCCTCAAACCCTGTGCTTGCTTCCCCGCCCCTGGTCGTAGTGACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGTGCAGGCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGAGGCCATGCATGTTGCGTACCACTCCGCGTGTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAATAGCATACGGGGAAAGAGCTTTTGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGATTAAAGAATCGCGAGAGCTGGTGGGAGAGGAATCCCTTCTTAAATTCAA
...........................................................................................................................................((((.....)))).((((((.....((((((.....((((..((((......)))).))))...))))))))))))...............................................................................................................................................................
...........................................................................................................................................140...............................................................................222......................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAGAGCTTTTGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGATTAAAGAATCGCGA................................... 52 1 19.00 19.00 - - - 19.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAA.................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACTCCCAAGCCAGACAATCCTCCTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 7.00 7.00 - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GTGACCGTTTCAGAGACTCCAGGGGT.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGA..................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAA.................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................GTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGA..................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGTGTCCGTGTCCTGCCTGCGAA.............................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAt..................................................................................................... 28 t 4.00 0.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAt.................................................................................................... 28 t 3.00 0.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGA................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................GTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAA.................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAA.................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAAT.................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TACCACTCCGCGTGTCCG............................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGT......................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAt.................................................................................................... 29 t 2.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGA..................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTCCGTGTCCTGCCT................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ACAATCCTCCTACCGCGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................AGGGCCTGTGGCTTTCTGCTTTCATTCA.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCA................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TCTGCTTTCATTCAAAGCTCAGCCT....................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCGCGTGTCCGTGTCCT....................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................TCCGTGTCCTGCCTGCGAA.............................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................TCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAtt..................................................................................................... 30 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGTGTCCGTGTCCTG...................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGAAATAGCATACGGG........................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGATTA.............................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTtt........................................................................................................ 28 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..ACTACTCCCAAGCCAGACAATC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GAAAACTAAGTCGGATCCTGGTTGAGA............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CAGGGCCTGTGGCTTTCTGCTTTCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCA................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CAGGGGTGCAGGCTGCAGTTGATGAA....................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGAT................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GAATCCCGGCTGCttta...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCTACCGCGGAATCCCGGCTGCAcgg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CCGGCTGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGGAAAGAGCTTTTGCTTTGATTCTTTAA............................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAt................................................... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GTCGTAGTGACCGTTTCAGAGACTCCA............................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAa.................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGCATGTTGCGTACCACTC....................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AGGCTGCAGTTGATGAAAACTAAGTCGGA........................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAAAGAATCGCGAGAGCT.............................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGCATGTTGCGTACCACTCc....................................................................................................................................... 20 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGATTAt.............................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAAagg.................................................................................................... 28 agg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GGCTGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CGGAATCCCGGCTGCAGGTGTGCCGAAt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GTGCTTGCTTCCCCGCCCCTGGTCGTA.................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................CCGGCTGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGGTGGGAGAGGAATCCCTTCTTA....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTGCGAAGATGTTGGAAATAGCA.............................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GGTGCAGGCTGCAGTTGATGAAAACTA.................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CTGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GCCGAAATGGAGTCATGCAGGGCCTGTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGA..................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GGGTGCAGGCTGCAGTTGATGAAAACTA.................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CCCAAGCCAGACAATCCTCCTACCGCGGAAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGA..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCA................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GTCATGCAGGGCCTGTGGCTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGt....................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCAGACAATCCTCCTAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCA................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCAAAGCTCAGCCTCAAACCCTGTc............................................................................................................................................................................................................................................................. 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................CCCGGCTGCAGGTGTGCCGAAATGGAGTCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................GTCCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAt..................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTGCCTGCGAAGATGTTGGAtt..................................................................................................... 29 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGTTGGAAATAGCAtcag.............................................................................................. 23 tcag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTTTGATTCTTTAATCTTGTTCCAGATTA.............................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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