(1)
OTHER.ip
(5)
OTHER.mut
(6)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(28)
TESTES

Sense strand
CTTTCAGCTACCTGAGCTCGGGGCTGTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAATCCCCAAGCCTGGAGGATAAAAAGCAAGCTCCATGCTTGCCATAGGCCTGTAGCAGCCTGGGACTGTAGTGAGTGGCTGTCTCTGCCGCAGGCTACACAGTAACACAGCTTTTCTTCTCTTTAGAGATAGTAAGTATGTGTATTATGTGAACGGGCCTGCCACAAGCAAGTTAG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
...........................................................................................................................................................................................................TAGTAAGTATGTGTATTATGTGAACGGGC.................. 29 1 13.00 13.00 - 1.00 - 2.00 - - - 2.00 - - 2.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 -
..........................TGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTA..................................................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGGGC........................................................................................................................................................................................ 28 1 8.00 8.00 2.00 - - 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................TGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGG.......................................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................................................................GGGACTGTAGTGAGTGGCT................................................................................................ 19 1 7.00 7.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGGG......................................................................................................................................................................................... 24 1 5.00 5.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TATGTGAACGGGCCTGCCACAAGCAAG.... 27 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCTGTAGCAGCCTGGGACTGTAGTGAGTGG.................................................................................................. 30 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGTGAACGGGCCTGCCACAAGCAAGTTAG 29 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................TCTGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGG.......................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAATCC........................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGGt......................................................................................................................................................................................... 27 t 3.00 8.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGTATGTGTATTATGTGAACGGGC.................. 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................TGTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCC....................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TAGTAAGTATGTGTATTATGTGAACG..................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTATGTGTATTATGTGAACGGGCCT................ 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCATG................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCA.................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAAT............................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTATGTGAACGGGCCTGCCACAAGCA...... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAATC............................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGTATGTGTATTATGTGAACGGGCCTGC.............. 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCA.................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GCAGCCTGGGACTGTAGTGAGTGG.................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCTGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAG........................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCATG................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGGGCC....................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGTGAACGGGCCTGCCACAAGCAAGT... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TACCTGAGCTCGGGGCTGTGGTTGTt........................................................................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGC........................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CACAGTAACACAGCTTTTCTTCTCTTT.................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...................................CTCTGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGt............................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGAACGGGCCTGCCACAAGCAAGT... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCTTGCCATAGGCCTGTAGCAGC..................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GCAGCCTGGGACTGTAGTGAGTGGC................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GTAAGTATGTGTATTATGTGAACGGGC.................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TAATCCCCAAGCCTGGAGGATAAAAAGC..................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCTGTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGC........................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TAGTAAGTATGTGTATTATGTGAACGG.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAGTAGAGCCTAGCATGTTGA............................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAATCCC.......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCTGTAGCAGCCTGGGACTGTAGTGAGagg.................................................................................................. 30 agg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AGCAGCCTGGGACTGTAGTGAGTGG.................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................TTGAGGGCCTGGATggag.............................................................................................................................................................................. 18 ggag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................TGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCATt................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAGCAGCCTGGGACTGTAGTGAGTGG.................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TATTATGTGAACGGGCCTGCCACAA......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCAT................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTA..................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GCTTGCCATAGGCCTGTAGCAGC..................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TATTATGTGAACGGGCCTGCCACAAGC....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGTGTATTATGTGAACGGGCCTGCCACA.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCATGT............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TAGTAAGTATGTGTATTATGTGAAC...................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAATCCCC......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CTGTGGTTGTGCCTCTGCAAG.............................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGTGTATTATGTGAACGGGCCTGCCAC........... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTCAGCTACCTGAGCTCGGGGCTGTG.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TAGGCCTGTAGCAGCCTGGGACTGTAGT........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTAGAGATAGTAAGTATGTGTATTATGT.......................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TAGTAAGTATGTGTATTATGTGAACGGGt.................. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TGAGGGCCTGGATTTAATCCCCAAGCC.................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................................................................................................................................................................................TGTGTATTATGTGAACGGGCCTGCCACAAt........ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGTATGTGTATTATGTGAACGGGCC................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCTTGCCATAGGCCTGTAGCAGCC.................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........................GTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..........................................................TTGAGGGCCTGGATggaa.............................................................................................................................................................................. 18 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......CTACCTGAGCTCGGGGCTGTGGTTGTGCC...................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................GTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGC................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCAT................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAA.............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGGG......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGAACGGGCCTGCCA............ 15 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CTGTAGCAGCCTGGGAC.............................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTTTCAGCTACCTGAGCTCGGGGCTGTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTAGCATGTTGAGGGCCTGGATTTAATCCCCAAGCCTGGAGGATAAAAAGCAAGCTCCATGCTTGCCATAGGCCTGTAGCAGCCTGGGACTGTAGTGAGTGGCTGTCTCTGCCGCAGGCTACACAGTAACACAGCTTTTCTTCTCTTTAGAGATAGTAAGTATGTGTATTATGTGAACGGGCCTGCCACAAGCAAGTTAG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
.........................GTGGTTGTGCCTCTGCAAGTAGAGCCTA..................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GAGTGGCTGTCTCTGCCGCAGGCTACA............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GAGTGGCTGTCTCTGCCGCAGGCTACAt............................................................................. 28 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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