| Gene: Gins2 | ID: uc009nrd.1_intron_2_0_chr8_123110093_r.5p | SPECIES: mm9 |
|
|
(12) OTHER.mut |
(7) PIWI.ip |
(41) TESTES |
| GAAACAGAGACAGAAGTGCCGCCTGTTACCTCCGGAATGGATGGATGTGGGTGAGCATTCCCGGGCCCGGGTGGGCGGGCTTGTACGGGGAGGGGGCTGTAGTGATGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCACTCTTTAGAGGCGGTAGAGGCAGGAAGATCTCTGAGTTTGAAGCCAGCTTGGTCCACAGAGGGAGGTGCAGGACAAACAGCCAGGACTACACAGTGAAACCCTGTCTGGGGGTGGGGTGGT |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCCCAGC.......................................................................................................................... | 20 | 10 | 61.90 | 61.90 | 12.10 | 16.80 | 10.60 | 10.20 | - | 3.80 | 6.30 | 1.70 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCCCAGC.......................................................................................................................... | 19 | 14 | 39.50 | 39.50 | 10.71 | 8.79 | 9.43 | 5.50 | - | 2.57 | 1.86 | 0.43 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | 0.07 | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCAGC.......................................................................................................................... | 21 | 10 | 39.40 | 39.40 | 8.20 | 10.90 | 5.30 | 6.20 | - | 3.40 | 3.30 | 1.30 | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | 0.10 | - | 0.10 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | 0.10 | - | 0.10 | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCCCAG........................................................................................................................... | 19 | 11 | 21.82 | 21.82 | 7.91 | 11.00 | 0.18 | 2.27 | - | 0.09 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.18 | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGC.......................................................................................................................... | 23 | 10 | 14.40 | 14.40 | 7.20 | 0.40 | 3.60 | 1.20 | - | 1.90 | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGagaa.................................................................................................................................................................................................... | 28 | agaa | 8.00 | 6.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGag...................................................................................................................................................................................................... | 26 | ag | 7.00 | 6.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................GGCGCACGCCTGTAGTCCCAGC.......................................................................................................................... | 22 | 10 | 6.30 | 6.30 | 4.40 | 0.40 | 0.40 | 0.40 | - | 0.60 | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCA............................................................................................................................ | 19 | 12 | 6.17 | 6.17 | 0.75 | 1.33 | 0.92 | 2.25 | - | 0.17 | 0.42 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCC.............................................................................................................................. | 17 | 13 | 6.08 | 6.08 | 1.54 | 0.08 | 3.46 | 0.23 | - | 0.46 | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGG........................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCC............................................................................................................................. | 18 | 12 | 5.75 | 5.75 | 1.33 | 0.42 | 2.67 | 0.25 | - | 0.25 | 0.50 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGTTACCTCCGGAATGGATGGATGTG......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCCCA............................................................................................................................ | 18 | 12 | 5.00 | 5.00 | - | 1.42 | 1.00 | 1.08 | - | 0.25 | 0.67 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCCCAG........................................................................................................................... | 22 | 11 | 5.00 | 5.00 | 4.27 | 0.36 | 0.09 | 0.09 | - | 0.09 | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCCCAG........................................................................................................................... | 18 | 16 | 4.62 | 4.62 | 2.31 | 1.88 | 0.12 | 0.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGa....................................................................................................................................................................................................... | 25 | a | 4.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..AACAGAGACAGAAGTGCCGCCTGTTACC............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCCC............................................................................................................................. | 17 | 12 | 2.42 | 2.42 | 0.33 | 0.08 | 0.83 | - | - | 0.50 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCCCA............................................................................................................................ | 21 | 12 | 2.25 | 2.25 | 0.83 | 0.67 | - | 0.25 | - | 0.08 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | 0.08 | - | - |
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| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGaga..................................................................................................................................................................................................... | 27 | aga | 2.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................TCCGGAATGGATGGATGTGGagaa.................................................................................................................................................................................................... | 24 | agaa | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..AACAGAGACAGAAGTGCCGCCTGTTA.............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................ACGCCTGTAGTCCCAGttac....................................................................................................................... | 20 | ttac | 2.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCCtagc.......................................................................................................................... | 19 | tagc | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CAGAAGTGCCGCCTGTTACCTCCGGAA..................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .AAACAGAGACAGAAGTGCCGCCTGTT............................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGTTACCTCCGGAATGGATGGATGTGt........................................................................................................................................................................................................ | 27 | t | 2.00 | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGT................................................................................................................................ | 15 | 13 | 1.85 | 1.85 | - | 0.15 | 0.38 | - | - | - | 1.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTC............................................................................................................................... | 16 | 13 | 1.23 | 1.23 | 0.38 | 0.23 | 0.38 | - | - | 0.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................CCGCCTGTTACCTCCGGAATGGATGGATGTGG........................................................................................................................................................................................................ | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGtg...................................................................................................................................................................................................... | 26 | tg | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................CACGCCTGTAGTCCCAGCtatt...................................................................................................................... | 22 | tatt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................CTCCGGAATGGATGGATGTGG........................................................................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGG....................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGga............................................................................................................................... | 15 | ga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................CCGCCTGTTACCTCCGGAATGGATGGATGT.......................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................ACGCCTGTAGTCCCAaggc........................................................................................................................ | 19 | aggc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGgccc............................................................................................................................. | 18 | gccc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GAGACAGAAGTGCCGCCTGTTACCTCC......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGGgt..................................................................................................................................................................................................... | 27 | gt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CCTCCGGAATGGATGGATGTG......................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGTTACCTCCGGAATGGATGGATGTa......................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............AAGTGCCGCCTGTTACCTCCGGAAT.................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TACGGGGAGGGGGCgaaa..................................................................................................................................................... | 18 | gaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGt........................................................................................................................................................................................................ | 24 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACCTCCGGAATGGATGGATGTGGa....................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTG......................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACCTCCGGAATGGATGGATGTGG........................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGTTACCTCCGGAATGGATGGATGT.......................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................CCGCCTGTTACCTCCGGAATGGATGGATG........................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGagt..................................................................................................................................................................................................... | 27 | agt | 1.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .AAACAGAGACAGAAGTGCCGCCTGTTA.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACCTCCGGAATGGATGGATGT.......................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............GAAGTGCCGCCTGTTACCTCCGGAATG................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................CCGCCTGTTACCTCCGGAATGGATGGAT............................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GAGACAGAAGTGCCGCCTGTTACCTC.......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TGCCGCCTGTTACCTCCGGAATGGATGG.............................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGTTACCTCCGGAATGGATGGATGcgt........................................................................................................................................................................................................ | 27 | cgt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCaccg........................................................................................................................... | 18 | accg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGat...................................................................................................................................................................................................... | 26 | at | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............GAAGTGCCGCCTGTTACCTCCGGAATGGt................................................................................................................................................................................................................. | 29 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........GACAGAAGTGCCGCCTGT................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGTTACCTCCGGAATGGATGGATG........................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACCTCCGGAATGGATGGATGTGGagat.................................................................................................................................................................................................... | 28 | agat | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCC.............................................................................................................................. | 16 | 13 | 0.77 | 0.77 | - | 0.08 | 0.38 | - | - | 0.31 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCCC............................................................................................................................. | 20 | 12 | 0.75 | 0.75 | - | 0.08 | 0.33 | - | - | 0.17 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCC.............................................................................................................................. | 19 | 12 | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.17 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................AGGAAGATCTCTGAGTTTGAAGCCAGC......................................................................... | 27 | 5 | 0.60 | 0.60 | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTC............................................................................................................................... | 15 | 15 | 0.60 | 0.60 | - | - | 0.47 | 0.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCCC............................................................................................................................. | 16 | 18 | 0.56 | 0.56 | - | - | 0.39 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCAG........................................................................................................................... | 20 | 11 | 0.45 | 0.45 | 0.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGAAGATCTCTGAGTTTGAAGC............................................................................. | 22 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCggc.......................................................................................................................... | 21 | ggc | 0.33 | 5.75 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCtagc.......................................................................................................................... | 21 | tagc | 0.31 | 6.08 | - | 0.08 | - | 0.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCCCAGCA......................................................................................................................... | 21 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCCtagc.......................................................................................................................... | 20 | tagc | 0.23 | 0.77 | - | 0.15 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................AAGATCTCTGAGTTTGAAGCCAGC......................................................................... | 24 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GGCAGGAAGATCTCTGAGTTTGAA............................................................................... | 24 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGAAGATCTCTGAGTTTGAAGCCA........................................................................... | 24 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................GGCGCACGCCTGTAGTCC.............................................................................................................................. | 18 | 12 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................GGCGCACGCCTGTAGTC............................................................................................................................... | 17 | 12 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................GGCGCACGCCTGTAGTCCtagc.......................................................................................................................... | 22 | tagc | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCCCAGttac....................................................................................................................... | 22 | ttac | 0.12 | 4.62 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCtaaa...................................................................................................................... | 27 | taaa | 0.10 | 14.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCAGCcact...................................................................................................................... | 25 | cact | 0.10 | 39.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCAGgta........................................................................................................................ | 23 | gta | 0.09 | 0.45 | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGa.......................................................................................................................... | 23 | a | 0.09 | 5.00 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCtgc.......................................................................................................................... | 21 | tgc | 0.08 | 5.75 | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTCCaag........................................................................................................................... | 22 | aag | 0.08 | 0.67 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCCCAc........................................................................................................................... | 20 | c | 0.08 | 6.17 | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAGTC............................................................................................................................... | 18 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................GCGCACGCCTGTAGTCtca............................................................................................................................ | 19 | tca | 0.08 | 1.23 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGGCGCACGCCTGTAG................................................................................................................................. | 16 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................CGCACGCCTGTAGTCacag........................................................................................................................... | 19 | acag | 0.07 | 0.60 | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCCCcgc.......................................................................................................................... | 19 | cgc | 0.06 | 0.56 | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GCACGCCTGTAGTCCCAcc.......................................................................................................................... | 19 | cc | 0.06 | 1.00 | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GAAACAGAGACAGAAGTGCCGCCTGTTACCTCCGGAATGGATGGATGTGGGTGAGCATTCCCGGGCCCGGGTGGGCGGGCTTGTACGGGGAGGGGGCTGTAGTGATGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCACTCTTTAGAGGCGGTAGAGGCAGGAAGATCTCTGAGTTTGAAGCCAGCTTGGTCCACAGAGGGAGGTGCAGGACAAACAGCCAGGACTACACAGTGAAACCCTGTCTGGGGGTGGGGTGGT |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) |
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