(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(9)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(39)
TESTES

Sense strand
GGACGCGCAGATTCCACAGAGTTCCGGGAGAGTCCCGCGCTATCCTTACGGTGAGGGAACGCAGCGTGTGGCTGCCATTGGCACTCCGGGGAGTCAATACGGCCGTGAAACCGGAAGTGTCCCGGGGAGGCGTCGCTTCCGGAAGTGTGGCAAGTCCCCACCACACCAGGAAGTGTGGTGCGGCAGCGGCTCCTCAAAGTGTTGCTGTCCACCCAGTTGAGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTTGATGTACCGTGTTGGCAGAAGCCCAGCGGAGCGTCACCCATCCGAAAGTGCCGGAGGGTGCAAGTATTTGGTCATGGTTTTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAACCGTAGGGGAAACCGCACTAGGAATGTATCCGGGGGGTCTGGCTCCCTGAAGGCTTGTAAGAAGTTTTCTGTTGCTGCCCATCACCCTCGATTCCCCTTCTCTCCAGGGATGTGCAGATGGAGGCCGGAGGAGATAATGCTGTCCCAGCCCCCGGGG
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((..((......))........((((((....(((.....((((((((.....)))))))).......))).....))))))............)))....................................................
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................354................................................................................................453................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTAGGAATGTATCCGGGGGGTCTGGCTCCCTGAAGGCTTGTAAGAAGTTTT......................................................................................... 52 1 46.00 46.00 46.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TATCCTTACGGTGAGGGAACGCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGAGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTT.................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAACCGTA........................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAACC........................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTT.................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TACGGTGAGGGAACGCAGCGTGTGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGCGTCCTGTCGAAAACCGTAG....................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGAGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTTGA.................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGGTCATGGTTTTGAATGTCGCGTC....................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TTACGGTGAGGGAACGCAGCGTGTGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGTGTTGATGTACCGTGTT....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................TGATGTACCGTGTTGGCAGAAGCCCAGC......................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGAGATAAGAGGTTGAAACAGGTG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAAC............................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGGAACGCAGCGTGTGGCTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGAATGTATCCGGGGGGTCTGGCTC................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTCATGGTTTTGAATGTCGCGTCCTG.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................TACGGTGAGGGAACGCAGCGTGTGGCT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTCCCTGAAGGCTTGTAAGAAGTT........................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................ACACCAGGAAGTGTGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TTGAGATAAGAGGTaaga............................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................GTTGATGTACCGTGTTGGCAGAAGCCCAG.......................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................GAGGTTGAAACAGGTGTTGATGTACC............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................TGTTGGCAGAAGCCCAGCGGAGCGTCc................................................................................................................................................................................................................................ 27 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGATAATGCTGTCCCAGCCCCCGGcg 28 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTTTGAATGTCGCGTCCTGTCGc................................................................................................................................................................ 26 c 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................ACCAGGAAGTGTGGTGCGGCAGCGGg......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GATAAGAGGTTGAAACAGGTGTTGATG................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGGTTGAAACAGGTGTTGATG................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAA.............................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGGAACGCAGCGTGaga................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 aga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTTGGTCATGGTTTTGAATGTCGCGTC....................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GCTTCCGGAAGTGTGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGTCCTGTCGAAAACCGTAGGG..................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTATTTGGTCATGGTTTTGAATGTt............................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TCCTTACGGTGAGGGAACGCAGCGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGTGTTGATGTACCGTGTTGGCAG.................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGCCGGAGGGTGCAAGTATTTGG............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGGATGTGCAGATG..................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GTTGAGATAAGAGGTTGtat............................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 tat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CCAGGAAGTGTGGTGCGGCAGCGGCTCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CCAGGAAGTGTGGTGCGGCAGCGGCTCaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGAATGTATCCGGGGGGTCTGG................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AGGCGTCGCTTCCGGAAGTGTGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGTCGAAAACCGTAGGGGAAACCGCA............................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAAGAAGTTTTCTGTTGCTGCCC............................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TACGGCCGTGAAACCGGAAGTGTC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAACCGTA........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTCGAAAACCGTAGGGGAAACCGCA............................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGAGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTc.................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGAATGTATCCGGGGGGTCTGGC.................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAACCGT......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAAGTATTTGGTCATGGTTTTGAATGT............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GAGGCGTCGCTTCCGGAAGTGTGGCAA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCATGGTTTTGAATGTCGCGTCCTGTCGt................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TACGGCCGTGAAACCGGAAGTGTCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGCTGTCCACCCAGTTGAGATAAGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGAAGTTTTCTGTTGCTGCCCATC.......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTTG................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGGCTTGTAAGAAGTTTTCTGTTGC.................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGGAACGCAGCGTGTGGCTGCCATTGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTcg................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGAAAGTGCCGGAGGGTGCAAGTAT................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTTTGAATGTCGCGTCCTGTCGA................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GCTTCCGGAAGTGTGGCAAGTCCCCACCACACt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 33 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGGTTGAAACAGGTGTTGATGTA.............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGGAACGCAGCGTGTGGCTGCCAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTATTTGGTCATGGTTTTGAATGTCGCGTC....................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGAGTTCCGGGAGAGTCCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50

Antisense strand
GGACGCGCAGATTCCACAGAGTTCCGGGAGAGTCCCGCGCTATCCTTACGGTGAGGGAACGCAGCGTGTGGCTGCCATTGGCACTCCGGGGAGTCAATACGGCCGTGAAACCGGAAGTGTCCCGGGGAGGCGTCGCTTCCGGAAGTGTGGCAAGTCCCCACCACACCAGGAAGTGTGGTGCGGCAGCGGCTCCTCAAAGTGTTGCTGTCCACCCAGTTGAGATAAGAGGTTGAAACAGGTGTTGATGTACCGTGTTGGCAGAAGCCCAGCGGAGCGTCACCCATCCGAAAGTGCCGGAGGGTGCAAGTATTTGGTCATGGTTTTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAACCGTAGGGGAAACCGCACTAGGAATGTATCCGGGGGGTCTGGCTCCCTGAAGGCTTGTAAGAAGTTTTCTGTTGCTGCCCATCACCCTCGATTCCCCTTCTCTCCAGGGATGTGCAGATGGAGGCCGGAGGAGATAATGCTGTCCCAGCCCCCGGGG
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((..((......))........((((((....(((.....((((((((.....)))))))).......))).....))))))............)))....................................................
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................354................................................................................................453................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
....GCGCAGATTCCACAGAGTTCCGGGAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAATGTCGCGTCCTGTCGAAAACCGTA........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTCCGGGGAGTCAATagc..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GCGCAGATTCCACAGAGTTCCGGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................CCGGGGAGTCAATACGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCTCTCCAGGGATt.............................................. 17 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.................................................................................................................................................TGTGGCAAGTCCCCACCACACCAGGAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AAGTGTCCCGGGGAGata...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GAGAGTCCCGCGCTATCCT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -