| Gene: Trmt1 | ID: uc009mmv.1_intron_9_0_chr8_87221238_f | SPECIES: mm9 | 
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  (10)  OTHER.mut  | 
  
  
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  (3)  PIWI.mut  | 
  
  
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  (43)  TESTES  | 
  
  
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    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | 
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| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGc....................................................................................................................................... | 28 | c | 22.00 | 4.00 | - | 5.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 6.00 | 2.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGct...................................................................................................................................... | 27 | ct | 13.00 | 8.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGACAC........................................................................................................................................... | 24 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | - | - | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................AGAATCCCGGGACTCATACATTCATGC.................................................................................. | 27 | 1 | 9.00 | 9.00 | 1.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAG........................................................................................................................................ | 25 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAG........................................................................................................................................ | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TCCCGAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACACCA......................................................................................................................................... | 33 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGa....................................................................................................................................... | 26 | a | 3.00 | 8.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGACA............................................................................................................................................ | 23 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................CTCATACATTCATGCCCCTTGCTCATC...................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAt........................................................................................................................................ | 27 | t | 2.00 | 18.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGctta.................................................................................................................................... | 29 | ctta | 2.00 | 8.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................AGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACACC.......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................GAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACACC.......................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................GAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACAC........................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................GAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGAC............................................................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGAC............................................................................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACA.................................................................................................................................................. | 17 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................GAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACAaa.......................................................................................................................................... | 28 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................GTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGc....................................................................................................................................... | 27 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................CAGAATCCCGGGACTCATACATTCATGC.................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................AGCACTGTGGACAGAGACAC........................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................GAGGCAGTGGGCCAGAATCC...................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................CGAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACACC.......................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TCCTCCAGTAACTCCCGAGTGT................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................TGTGGGCAGAGCCCATCCATGA............... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................GCCCCTTGCTCATCTGTATCCCTGGTGT........................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .TGGTCCTCCAGTAACTCCCGAGTGTG............................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGtt...................................................................................................................................... | 27 | tt | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGG....................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................AGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACAC........................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........CAGTAACTCCCGAGTGTGAGCACTGT....................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGca...................................................................................................................................... | 27 | ca | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGcttg.................................................................................................................................... | 29 | cttg | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TAACTCCCGAGTGTGAGCACTGTGG..................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................TTGGGGGCCCCATGTGGGCAGA........................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............AACTCCCGAGTGTGAGCACTGTGGAaa.................................................................................................................................................. | 27 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................TGTGGACAGAGACACCAGcttg.................................................................................................................................... | 22 | cttg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................AGAATCCCGGGACTCATACATTCATGCt................................................................................. | 28 | t | 1.00 | 9.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| .........................TGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGctg..................................................................................................................................... | 28 | ctg | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| ....................GAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGA.............................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................GTGGGCCCAGGTCAGAGGCAGTGG................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| ............TAACTCCCGAGTGTGAGCACTGTGGt.................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGA.............................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................TGTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGt....................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| ......CTCCAGTAACTCCCGAGTGTGAGCACT......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TGAGCACTGTGGACAGAG............................................................................................................................................... | 18 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TAACTCCCGAGTGTGAGCACTGTGGA.................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................GTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAtt....................................................................................................................................... | 27 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| GTGGTCCTCCAGTAACTCCCGAGTGTGAGCACTGTGGACAGAGACACCAGGTGGGCCCAGGTCAGAGGCAGTGGGCCAGAATCCCGGGACTCATACATTCATGCCCCTTGCTCATCTGTATCCCTGGTGTCCACAGCTTGGGGGCCCCATGTGGGCAGAGCCCATCCATGACCTGGACTTTGTGGG ........................................................................((((......((.((((....((((.....((.....)).....)))))))).)).))))...................................................... ........................................................................73.............................................................136................................................  | 
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| .........................................................................................................CCTTGCTCATCTGTATCCCTGGTGTCCA..................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| ............................................................................................................GCTCATCTGTATCCCTGGTGTCCACAt................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................CCCCTTGCTCATCTGTttt................................................................... | 19 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................CATGCCCCTTGCTCATCTGTATCCC.............................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |