chr8:87093602 87093851 +
(9)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(6)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(32)
TESTES

Sense strand
CCAAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTATAAGACACAGCCAGTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGTGGGGCAGTGGAATTGAACATCCCGGTGGAACCCTCAGTGGTGAGAGGACAGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGATGT
...........................................................................((((((((.(((...))).....((..(((((...((((...))))..)))))..))......))))))))...((((.((((..((((.((.((.......)))).)).))..)))).))))....................................................
..........................................................................75...........................................................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGG.................................................................................................................................................. 25 1 26.00 26.00 - 2.00 - 7.00 6.00 1.00 6.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGT................................................................................................................................................ 27 1 25.00 25.00 3.00 5.00 1.00 1.00 - 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGG................................................................................................................................................. 26 1 15.00 15.00 - - - 2.00 5.00 - 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGAACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGC........................................................ 27 1 14.00 14.00 - 1.00 - - - 1.00 - 2.00 - 1.00 7.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTG............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 11.00 11.00 4.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGAACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGCC....................................................... 28 1 9.00 9.00 - - - 8.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGa.................................................................................................................................................. 25 a 8.00 2.00 - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGAACTGCGATCTGAGTACCCCTCTG......................................................... 26 1 7.00 7.00 - - - 1.00 - 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAGT.................................................................. 28 1 7.00 7.00 - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTGGC........................................................................................................................................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 - - 5.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................ACAGGAAGGACCCATGAAC.............................................................................. 19 1 6.00 6.00 - - - 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTGG............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 5.00 5.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAGTGTCTCTCAGGTGG............................................................................................................................................................................................................................ 18 1 5.00 5.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ATCCCGGTGGAACCtcca............................................................................................................ 18 tcca 5.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - -
............TAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTCTT.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCCTCAGC................................................. 29 1 4.00 4.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGTG............................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGAACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCC...................................................... 29 1 4.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGa................................................................................................................................................ 28 a 3.00 2.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAGT.................................................................. 27 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTGGCT.......................................................................................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAGAGGACAGGAAGGACCCATGAAC.............................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AGGACAGGAAGGACCCATGAACTGCGATC....................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAGAGGACAGGAAGGACCCATGAACT............................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GTCGCTGACAGATGGCTAGGGTGGGGC........................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TGGCTAGGGTGGGGCAGTGGAATTGAAC.............................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGT..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTACATCCTGAACCTGCGCTACTTCG...... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGG................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAG................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATAAGACACAGCCAGTGCCCCATTGAGAGT.................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTC.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCCTCAG.................................................. 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCC...................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CAGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAGT.................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAG................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAGCTGCACTGGACTATAAGACACAGC...................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGGACTATAAGACACAGCCAGTGCCCCA............................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCAGCTGCACTGGACTATAAGACACAGC...................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGAACATCCCGGTGGAACCCTCAGTGGT....................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TATAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAG...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGA..... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CATTACATCCTGAACCT................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CATCCCGGTGGAACCtcc............................................................................................................. 18 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............TAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTCT................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAGCTGCACTGGACTATAAGACAC......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TATAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTC.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................ACAGGAAGGACCCATGAACTGCGATC....................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TCGCTGACAGATGGCTAGGGTGGa............................................................................................................................................. 24 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATATAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGA........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CAGCTGCACTGGACTATAAGACACAGC...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TTTCAGCTGCACTGGACTA................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTGAACATCCCGGTGGAACCCTCAGT.......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ATCCCGGTGGAACCtcc............................................................................................................. 17 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................................CAGATGGCTAGGGTGGGGCAGTGGA..................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTt............................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CGCTGACAGATGGCTAGGGTGGGG............................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAG...................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGATG. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGagg.............................................................................................................................................. 29 agg 1.00 15.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGT................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CCCTCAGTGGTGAGAGGACAGGAAGGAC...................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................CTGGACTATAAGACACAGCCAGTGCCCCA............................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTCTTaa................................................................................................................................................................................................................ 29 aa 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TCAGTGGTGAGAGGACAGGAAGG........................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTGGa........................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTCTT.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGg................................................................................................................................................ 27 g 1.00 15.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCTGAACCTGCGCTACTTCGAG.... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGTGGTGAGAGGACAGGAAGGACCCATGAAC.............................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TTTCAGCTGCACTGGACTATAAGACAC......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................................TGAACATCCCGGTGGAACCCTCAGT.......................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGaga.............................................................................................................................................. 29 aga 1.00 15.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGAAGGACCCATGAACTGCGATCTG..................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATAAGACACAGCCAGTGCCCCATTGAGAa..................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GAGGACAGGAAGGACCCATGAACTGC........................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGTGGTGAGAGGACAGGAAGGACCCATG................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CTCTGCCCTCAGCCTTCGCCGGCTGTG................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CCCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAG................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGCC....................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGT.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CTCAGCCTTCGCCGcgcc..................................... 18 cgcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................................................TCAGTGGTGAGAGGAgtct............................................................................................ 19 gtct 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GAGGACAGGAAGGACCCATGAAC.............................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TGGCTAGGGTGGGGCAGTGGAATTGAA............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TTTCAGCTGCACTGGACTATAAGACA.......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAGAGGACAGGAAGGACCCATGAACTGa........................................................................... 29 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TTTCAGCTGCACTGGACTATAAGACACA........................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCCTCAGa................................................. 29 a 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGATG. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TAATATAAGTGTCTCTCAGGTGGCTG......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GAGGACAGGAAGGACCCATGAACTGCGA......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGTGGTGAGAGGACAGGAAGGACCCAa.................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGA..... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...AGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTG............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TAAGACACAGCCAGTGCCCCATTGAGA...................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGac.................................................................................................................................................................................................................... 26 ac 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGACCCATGAACTGCGATCTGAGTACCCC............................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTagca.......................................................................................................................................................................................................................... 30 agca 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTA.................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGA... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGG.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCATTACATCCTGAACCTGCGC............. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CATTACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGATG. 33 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GGCAGTGGAATTGAACATCCCGGTGGAAC................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAGCTGCACTGGACTATAAGACACAGa...................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCCT..................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................ACCCATGAACTGCGATCTGAGTACCCCT............................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CAGGAAGGACCCATGA................................................................................ 16 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCAAGGGTAATATAAGTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTATAAGACACAGCCAGTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAGGGTGGGGCAGTGGAATTGAACATCCCGGTGGAACCCTCAGTGGTGAGAGGACAGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAGTACCCCTCTGCCCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGATGT
...........................................................................((((((((.(((...))).....((..(((((...((((...))))..)))))..))......))))))))...((((.((((..((((.((.((.......)))).)).))..)))).))))....................................................
..........................................................................75...........................................................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
...........................................................................CCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTA.................................................................................................................................................... 27 1 57.00 57.00 2.00 36.00 - 4.00 - 3.00 1.00 - - 10.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCCATTACATCCTGAACCTGCGCTA........... 25 1 13.00 13.00 - - - 1.00 - 3.00 - 1.00 3.00 - 1.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGA... 26 1 11.00 11.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCATTACATCCTGAACCTGCGCTACTT........ 29 1 10.00 10.00 - - - - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACA........................... 27 1 7.00 7.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................................................GAATTGAACATCCCGGTGGAACCCTCA............................................................................................................ 27 1 7.00 7.00 - - - - - 1.00 - - 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
............................................................................CATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTA.................................................................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 - - - 3.00 - - - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGCTGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTA................................................................................................................................................................................................. 29 1 7.00 7.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGA... 27 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................GTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGA.......................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGA... 25 1 6.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CGCCGGCTGTGCCATTACATCCTGA..................... 25 1 6.00 6.00 - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GACAGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGA.................................................................... 30 1 6.00 6.00 2.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGA.......................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................AATTGAACATCCCGGTGGAACCCTCA............................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................................................................................................................................................................TACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGA..... 26 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGA.................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGA... 28 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCGCCGGCTGTGCCATTACATCCTGA..................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GCCGGCTGTGCCATTACATCCTGAa..................... 25 a 4.00 0.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTA.................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................GCCCCATTGAGAGTCGCTGACA............................................................................................................................................................ 22 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGTCTTTCAGCTGCACTGGACTATAA.............................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................ACAGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGA.................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CCATTACATCCTGAACCTGCGCTA........... 24 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACA........................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCGCCGGCTGTGCCATTACATCCTG...................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................GTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACA............................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GCTGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTA................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GCTGTGCCATTACATCCTGAACCTGCG.............. 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCCATTACATCCTGAACCTGCGCTAC.......... 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TGCCCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCA................................ 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCATTACATCCTGAACCTGCGCTA........... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CCATTACATCCTGAACCTGCGCTACTT........ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CAGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAa.................................................................... 29 a 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GCCGGCTGTGCCATTACATCCTGA..................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGGCTGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTA................................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GAGAGTCGCTGACAGATGGCTAcatg.................................................................................................................................................... 26 catg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCTTTCAGCTGCACTGGACTATAAGAC........................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................AGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGA.................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCCATTACATCCTGAACCTGCGCTACT......... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CATTACATCCTGAACCTGCGCTACTT........ 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACATCCTG...................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................AGGACCCATGAACTGCGATCTGAGTA................................................................. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GCTGTGCCATTACATCCTGAACCTG................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACA........................... 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCGGCTGTGCCATTACATCCTGAACCT................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCT..................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CTTCGCCGGCTGTGCCATTACATCCTG...................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCA................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................AGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAGTA................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TTTCAGCTGCACTGGACTATAAGACAc.......................................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCCATTACATCCTGAACCTGCGCTACTT........ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACAa........................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCAGCTGCACTGGACTATAA.............................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAgt............................................................................................................................................................ 25 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAcg.................................................................................................................................................... 26 cg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TGAGAGGACAGGAAGGACCCATGAa................................................................................ 25 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ATCCTGAACCTGCGCTACTTCGA..... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GAATTGAACATCCCGGTGGAAaa.................................................................................................................. 23 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CCCCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTAg.................................................................................................................................................... 30 g 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCCAGTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAG........................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGA... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGAACTGCGATCTGAGTACCCCTCTG......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GGACAGGAAGGACCCATGAACTGCGA......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GCAGTGGAATTGAACATCCCGGTGGA................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTATA............................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TCTTTCAGCTGCACTGGACTATAAGACACa......................................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGAT......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGA... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GTGTCTCTCAGGTGGCTGAAGTCTTTCA............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTATAA.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTAcc................................................................................................................................................................................................. 28 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CCATGAACTGCGATCTGA.................................................................... 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AACATCCCGGTGGAACCCTCAGTGG........................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CCCATTGAGAGTCGCTGACA............................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TCCTGAACCTGCGCTACTTCGAc..... 23 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGAGTACCCCTCTGCCCTCAGCCTT.............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ATCCCGGTGGAACCCTCAGTGGTGAGA................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CCATGAACTGCGATCTGAGTACCCCT............................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TTTCAGCTGCACTGGACTATA............................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACA........................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGCTGTGCCATTACATCCTGAACCTGCG.............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CCCATTGAGAGTCGCTGACAGATGGCTA.................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCCAGTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACA............................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGATG. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGAc.......................................................................................................................................................... 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CAGTGCCCCATTGAGAGTCGCTGACA............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................ATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAGAt... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CCTGAACCTGCGCTACTTCGA..... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CCATTACATCCTGAACCTGCGCTAa........... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CCCATGAACTGCGATCTGA.................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GCCCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCC................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................AGGACCCATGAACTGCGATCTGAGT.................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ACATCCTGAACCTGCGCTACTTCGAG.... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........................GTGGCTGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGA.................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GCGATCTGAGTACCCCTCTGCCCTCA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCATTACAtg........................... 30 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTA................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCAtt................................ 26 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GAAGTCTTTCAGCTGCACTGGACTATA............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GTGCCCCATTGAGAGTCGCTGcggc............................................................................................................................................................... 25 cggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCCCCATTGAGAGTCGCTGACAGATGG....................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGAGGACAGGAAGGACCCATGAAtgcc............................................................................... 27 tgcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGCTGTGCCATTACATCCTGAACCTG................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCCTCAGCCTTCGCCGGCTGTGCCAa................................ 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AGGAAGGACCCATGAACTGCGATCTGAa.................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGAAGGACCCATGAACTGCGATCT...................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................ACCCATGAACTGCGATCTGA.................................................................... 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGCCCCATTGAGAGTCGCTGACA............................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................TCTTTCAGCTGCACTGGACTATA............................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CTGTGCCATTACATCCTGAACCTGCG.............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CCATTGAGAGTCGCTGACA............................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GCCGGCTGTGCCATTACATCCTGaaag...................... 27 aaag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTCGCCGGCTGTGCCATTACATCCTGA..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CTGTGCCATTACATCCTGAACCTGCGCT............ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -