chr8:86626120 86626694 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(6)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(51)
TESTES

Sense strand
TATATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGGTAGGACTAGGCCCTGCACTGGGCTGACCCTTCAGACAGCAGGCCTCAGCTGCTCCTGTATCAGTCAGCCTGTGTCCTGTGTGTAAATGGCAGTGCTGTACCAGTGGGGCGACCCTTGGAGAGTTGCTGAATTTTTAGGTCAAACTGGTGATTTCGTTTGGCTTAGGTATCACATATAGCCCATCTGATAGCCTTGGCCTGGGCCAGGATGCAGGCAGATTTCTTAGATTCACACAGGTTGTCACAGTGGCTTTAGCATTCCTCCTGGAGCCCTGCCTCTTGGTAGGGCGACTTCAGTTTCTGTTCCCATGGGCATAGAGGTAATGTATTCAGTCAGGGTCCCTCCAGCTTGCAGGGCTCTCTCTGGCTCAGGCCAGAGAGTGTCTGGACCACTTGCAATGGGAGCTCTTTTCTAGCTAGTGTGCTTCTGGTGTAGCCCTTCCTTAGGCTCGCACTGATGGAGCATGCCGCTTAGGTCCGGCAGGTGCGGCTCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTGTA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACC.... 28 1 71.00 71.00 7.00 - 3.00 5.00 8.00 2.00 6.00 3.00 2.00 1.00 3.00 - 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 3.00 - - 3.00 3.00 2.00 4.00 - - 1.00 2.00 - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAC..... 27 1 71.00 71.00 3.00 14.00 1.00 6.00 4.00 9.00 3.00 - 5.00 5.00 - 5.00 - - - 1.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - 5.00 - - - 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGA...... 26 1 21.00 21.00 6.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCT... 29 1 15.00 15.00 1.00 - 3.00 - - - - 1.00 - - 3.00 - - - 1.00 2.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACC.... 27 1 12.00 12.00 - 1.00 - 2.00 - 2.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTt.. 30 t 9.00 15.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTGT. 31 1 8.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAC..... 26 1 5.00 5.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTG.. 30 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGT........ 26 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........TACTGGTGGGAGTTCAACGTCCACAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAACGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACC.... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TTGGAGAGTTGCTGAATTTTTAGGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTGT. 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAC..... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTG....... 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGGTGATTTCGTTTGGCTTAGGTATC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................TGGGAGTTCAACGTCCACAGCAAGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGGTc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 c 2.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACa.... 28 a 2.00 71.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCTCTTCCAGGACGAGGAGATCT............. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTtta 32 tta 2.00 15.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTCAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGCAGATTTCTTAGATTCACACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTtt. 31 tt 2.00 15.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACCTCTACTGGTGGGAGTTCAACGTCt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AGAGTTGCTGAATTTTTAGGTCAAACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGGTc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 c 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCTCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAG......... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGGGCATAGAGGTAATGTATTCAG................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTA............ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTCAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGttct......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 ttct 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGA...... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTtat 32 tat 1.00 15.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TATCACCTCTACTGGTGGGAGTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAt..... 27 t 1.00 21.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCTACTGGTGGGAGTTCAACGTCCAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACt.... 28 t 1.00 71.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCTCTTCCAGGACGAGGAGAT............... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAac.... 27 ac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGGTGATTTCGTTTGGCTTAGGTAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTGCAGGGCTCTCTCTGGCTCAGGC....................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................................TCAAGCTGGTAGGACTAGGCCCTGCACTaga...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCACTGATGGAGCATGCCGCT..................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCT... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TCAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGGTcctt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 cctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..TATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCgacg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 gacg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGT........ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATC.............. 18 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAGAGTTGCTGAATTTTTAGGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TCAAGCTGGTAGGACTAGGCCCTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CTCTACTGGTGGGAGTTCAACGTCCACAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TAGCCCATCTGATAGCCTTGGCCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACg.... 28 g 1.00 71.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTCAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGGTct......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 ct 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGACGAGGAGATCTACAGTGACCT... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTG....... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGACTAGGCCCTGCACTGGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGCACTGATGGAGCATGCCGt...................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAC..... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTAC........... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CAAGCTCAAGCTGGTAGGACTAGGCa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCAGGACGAGGAGA................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTGTA 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGt...... 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTGTtt 33 tt 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TACTGGTGGGAGTTCAACGTCCACAGCAAGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTat. 31 at 1.00 15.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGaga...... 28 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTAGATTCACACAGGTTGTCACAGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTTAGGCTCGCACTGATGGAGCATG.......................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCAGGACGAGGAGAT............... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCATGGGCATAGAGGTAATGTATTC.................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACtt... 29 tt 1.00 71.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGA...... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACGAGGAGATCTACAGTGACCTt.. 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TACTGGTGGGAGTTCAACGTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TAAATGGCAGTGCTGTACCAGTGGGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...ATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAACttcc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 ttcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCTCTTCCAGGACGAGGA.................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAACGc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CACCTCTACTGGTGGGAGTTCAACGTCCACt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAa..... 27 a 1.00 21.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGGCTCTTCCAGGACGAGGAGATCTAC........... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGGAGCATGCCGCTTAGGTCCGGC........................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGt...... 26 t 1.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAgt.... 27 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGGTAATGTATTCAGTCAGGGTC........................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACC.... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGACGAGGAGATCTACAGTGAa..... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACaa... 29 aa 1.00 71.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GGTGGGAGTTCAACGTCCAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TATATCACCTCTACTGGTGGGAGTTCAACGTCCACAGCAAGCTCAAGCTGGTAGGACTAGGCCCTGCACTGGGCTGACCCTTCAGACAGCAGGCCTCAGCTGCTCCTGTATCAGTCAGCCTGTGTCCTGTGTGTAAATGGCAGTGCTGTACCAGTGGGGCGACCCTTGGAGAGTTGCTGAATTTTTAGGTCAAACTGGTGATTTCGTTTGGCTTAGGTATCACATATAGCCCATCTGATAGCCTTGGCCTGGGCCAGGATGCAGGCAGATTTCTTAGATTCACACAGGTTGTCACAGTGGCTTTAGCATTCCTCCTGGAGCCCTGCCTCTTGGTAGGGCGACTTCAGTTTCTGTTCCCATGGGCATAGAGGTAATGTATTCAGTCAGGGTCCCTCCAGCTTGCAGGGCTCTCTCTGGCTCAGGCCAGAGAGTGTCTGGACCACTTGCAATGGGAGCTCTTTTCTAGCTAGTGTGCTTCTGGTGTAGCCCTTCCTTAGGCTCGCACTGATGGAGCATGCCGCTTAGGTCCGGCAGGTGCGGCTCTTCCAGGACGAGGAGATCTACAGTGACCTGTA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACGAGGAGATCTACAGTGACCTGTA 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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