Gene: Nxnl1

ID: uc009mdv.1_intron_0_0_chr8_74085709_r

SPECIES: mm9

chr8:74085659 74086202 -

(1) OTHER.ip

(9) OTHER.mut

(1) OVARY

(7) PIWI.ip

(2) PIWI.mut

(1) TDRD1.ip

(42) TESTES

Sense strand

TAGACTCCCACGAACAGATACCCTGAGCAAGATTCCCAGGTCTTAATCATGCACTAAAAATCCATAGAACCCCAAACTCAAAACTCCCATCCAAAACAAAACAAAAGAAGCAAAAAAGCACTCCTGCCAGGCGCACTCTGTGATGCACCCATGTCATTCAGCGCTCTGGTTGCAAGAGAGGGCCAGCAAGCTGACTCTGTGCAGATAGGCTCATGTTGTCAAGACTGACAACCCAAGTTCAATTCCTGGAACCCACTGAGTGGAAGAAAGACTGACTTCCGCAAGTCAGTTCTTTACACACACGATTGTAAGTGCATGCCCACACAGTGACAAATGAGTATATCTAGCAAAAATAGTTGGGATTTTGTTTTGTTTTGTATTGAGACAGGGTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGATCCTCCTGCCTCTGTCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCACTACCGCCACCTACAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAGGAAGAAAG .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((....)))))....((.((((.(((((.......)).)))..)))).)).........(((((.((..(((((.....))))).)).)))))................................................... ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................395................................................................................................494................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGCCA......................................	27	1	15.00	15.00	2.00	2.00	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	6.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................TCTGTGCAGATAGGCTCATGTTGTCAAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	9.00	9.00	-	-	-	-	-	9.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTG.........................................................................................................	26	1	9.00	9.00	-	4.00	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCT..........................................................................................................	26	1	6.00	6.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGCCAC.....................................	28	1	6.00	6.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGC.......................................................................................................	28	1	5.00	5.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCTCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCCT.....................................................................................................	35	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtgt......................................	27	tgt	3.00	1.50	1.25	0.50	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGTCCTCGAATTCGTGCTGTAAACCAGG............................................................................................................	30	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGC........................................	25	2	2.00	2.00	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................TGACTCTGTGCAGATAGGCTCATGTTGTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................TTCAGCGCTCTGGTTGCAAGAGAGGG..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCCTCGt..................................................................................................	28	t	2.00	0.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCGAACTCAGATCCTCCTGCCTCTGTat..........................................................................	29	at	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGCCACCTA..................................	31	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCCT.....................................................................................................	30	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCC......................................................................................................	29	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtaa......................................	27	taa	1.25	1.50	-	0.75	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGC.......................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTATAGCCCTGGCTGTCCgaac...............................................................................................................................	24	gaac	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTTTGTATTGAGACAGGGTCTCTG....................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGGGATTAAAGGCATGCACTACtttt.......................................	28	tttt	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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..............................................................................................................................................................................................................................................TCAATTCCTGGAACCCACTGAGTGGAAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGC...........................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
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........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCTCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGC...........................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TGTCATTCAGCGCTCTGGTTGCAAGA...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACtgaa.......................................	26	tgaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGCTGTAAACCAGGCTGGC.......................................................................................................	22	2	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................TGCCAGGCGCACTCTGTGATGCACCC..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAAACCAGGCTGGCCTCGAttta..............................................................................................	25	ttta	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................TACCCTGAGCAAGATTCCCAGGTCTTA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtga......................................	27	tga	1.00	1.50	0.75	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGC...........................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTATAGCCCTGGCTGTCCgggt...............................................................................................................................	24	gggt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................TCCAAAACAAAACAAAAGAAGCAAAAAAGC.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGCCACCT...................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtt.......................................	26	tt	0.75	1.50	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGaa.......................................	26	aa	0.75	1.50	0.50	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGC.......................................................................................................	25	2	0.50	0.50	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGC.......................................................................................................	23	2	0.50	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtatt.....................................	28	tatt	0.25	1.50	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtgca.....................................	28	tgca	0.25	1.50	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGttaa.....................................	28	ttaa	0.25	1.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtata.....................................	28	tata	0.25	1.50	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCACTACCGtta......................................	27	tta	0.25	1.50	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................TGAGCAAGATTCCCA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	15	8	0.12	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAACTCAGATCCTCCTGC..................................................................................	20	10	0.10	0.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGGTCTCTGTATAGCCCTGGCT.......................................................................................................................................	24	14	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAACTCAGATCCTCC.....................................................................................	17	14	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

TAGACTCCCACGAACAGATACCCTGAGCAAGATTCCCAGGTCTTAATCATGCACTAAAAATCCATAGAACCCCAAACTCAAAACTCCCATCCAAAACAAAACAAAAGAAGCAAAAAAGCACTCCTGCCAGGCGCACTCTGTGATGCACCCATGTCATTCAGCGCTCTGGTTGCAAGAGAGGGCCAGCAAGCTGACTCTGTGCAGATAGGCTCATGTTGTCAAGACTGACAACCCAAGTTCAATTCCTGGAACCCACTGAGTGGAAGAAAGACTGACTTCCGCAAGTCAGTTCTTTACACACACGATTGTAAGTGCATGCCCACACAGTGACAAATGAGTATATCTAGCAAAAATAGTTGGGATTTTGTTTTGTTTTGTATTGAGACAGGGTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTCGAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGATCCTCCTGCCTCTGTCTTCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCACTACCGCCACCTACAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAGGAAGAAAG .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((....)))))....((.((((.(((((.......)).)))..)))).)).........(((((.((..(((((.....))))).)).)))))................................................... ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................395................................................................................................494................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAatt...........................................................................................	26	att	75.00	0.00	31.00	6.00	5.00	5.00	3.00	5.00	4.00	8.00	-	-	-	-	2.00	2.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaaaa...........................................................................................	27	aaaa	36.00	0.00	10.00	2.00	5.00	4.00	5.00	-	2.00	3.00	1.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAttt...........................................................................................	28	ttt	35.00	0.00	3.00	-	8.00	4.00	-	-	3.00	1.00	7.00	5.00	-	-	-	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaat...........................................................................................	26	aat	28.00	0.00	13.00	2.00	-	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	2.00	2.00	-	-	1.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAagt...........................................................................................	26	agt	16.00	0.00	-	2.00	4.00	6.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTATAGCCCTGGCTGTCCTttt..................................................................................................................................	24	ttt	12.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	8.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCGAACTCAgctc.............................................................................................	21	gctc	11.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.00	-	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAatta...........................................................................................	27	atta	10.00	0.00	1.00	1.00	1.00	-	1.00	-	1.00	2.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAattt...........................................................................................	27	attt	9.00	0.00	1.00	1.00	2.00	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAtttt...........................................................................................	29	tttt	8.00	0.00	-	-	2.00	2.00	-	-	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTATAGCCCTGGCTGTCCTtttt..................................................................................................................................	25	tttt	6.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaaga...........................................................................................	27	aaga	5.00	0.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGttt............................................................................................	27	ttt	3.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaata...........................................................................................	27	aata	3.00	0.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAcatt...........................................................................................	26	catt	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGTCCTCGAATTCGTGCTGTAA..................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAttta...........................................................................................	29	ttta	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGGCTGTCCTCGAATTCGTGCTGTA...................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGAACTCAGATCCTCCTGCCTCTGT............................................................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGCTGTCCTCGAATTCGTGCTGTA...................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAccg...........................................................................................	27	ccg	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATGCCCACACAGTGACAAATGAGTA............................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAtat.............................................................................................	27	tat	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAatga...........................................................................................	27	atga	2.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAtatt.............................................................................................	31	tatt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAtagt.............................................................................................	27	tagt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................CTCTGTGCAGATAGGCTCATGTTGTCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAgttt...........................................................................................	27	gttt	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTtgta..................................................................................................................................	27	tgta	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTATAGCCCTGGCTGTttt.....................................................................................................................................	23	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAtat...........................................................................................	28	tat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTCGAAc..............................................................................................................................	28	c	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGActtt...........................................................................................	28	cttt	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAacaa.............................................................................................	28	acaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAttaa...........................................................................................	29	ttaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................AGACTGACAACCCAAGTTCAATTCCTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAtatt.............................................................................................	27	tatt	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAtct...........................................................................................	31	tct	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTATAGCCCTGGCTGTCCTctt..................................................................................................................................	24	ctt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAgtt...........................................................................................	29	gtt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................CCATCCAAAACAAAACAAAAGAAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTATAGCCCTGGCTGTttat.....................................................................................................................................	24	ttat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAgaa...........................................................................................	28	gaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATGCACTACCGCCACCTACAAAA.............................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAttt.............................................................................................	26	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTATAGCCCTGGCTGcca......................................................................................................................................	21	cca	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTCGAtaag...............................................................................................................................	29	taag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAtc.............................................................................................	26	tc	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAcaca...........................................................................................	26	caca	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAtcg...........................................................................................	28	tcg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................CAAGCTGACTCTGTGCAGATAGGCTCA...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................ATGTCATTCAGCGCTCTGGTTGCAAGA...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................AGAACCCCAAACTCAttac................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	ttac	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAttt...........................................................................................	29	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCActta.............................................................................................	27	ctta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................GTCTTAATCATGCACTAAAAATCCATAt..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAgata...........................................................................................	27	gata	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGtttt............................................................................................	28	tttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCGAACTCAcatt.............................................................................................	24	catt	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTttat..................................................................................................................................	27	ttat	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAcaat...........................................................................................	26	caat	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................CACTCTGTGATGCACCCATGTCATTCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAaaat.............................................................................................	28	aaat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................GACTCTGTGCAGATAGGCTCATGTTGTCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAat...........................................................................................	28	at	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTCGAAt..............................................................................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCGAACTCAGccgc............................................................................................	25	ccgc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................CACTCTGTGATGCACCCATGTCA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGGCCTCGAACTCAGATCgtgg.........................................................................................	24	gtgg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGATaga..........................................................................................	27	aga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTGGCCTCGAACTCActaa.............................................................................................	24	ctaa	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGTCCTCGAATTCGTGCTGTAAA.................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTGGCCTCGAACTCAGAggta...........................................................................................	23	ggta	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................ACTGACAACCCAAGTTCAATTCCTGGAA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTttt..................................................................................................................................	26	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTATAGCCCTGGCTGTCCTtag..................................................................................................................................	24	tag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAACCAGGCTGGCCTCGAACTCAttta.............................................................................................	27	ttta	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGATCag.........................................................................................	27	ag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGGCTGTCCTCGAATTCGTGCTGT....................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................GCACCCATGTCATTCAGCGCTCTGGTTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCCTCGAA.................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATTCGTGCTGTAAACCAGGCTGGCCTC....................................................................................................	29	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-