| Gene: AK029875 | ID: uc009mcf.1_intron_0_0_chr8_73551105_f.5p | SPECIES: mm9 | 
![]()  | 
    
    ![]()  | 
  
| 
  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (11)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (6)  PIWI.ip  | 
  
  
  (3)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (43)  TESTES  | 
  
  
| GCAAAGAAAAGGAAGAGAATACTATTATCCAATGCATACAGAAACTGAAGGTATGTGCCACAATTTTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTCAGTGGGTAACATCCTTGTCTCCACGAGCATGGTAACCTGAGTTAGGATCTCTATGTAAAAAGGATGGAAGCACATGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCTGATGGGTGGTAGGGCTGGACAGAATCTGTGGGGTTTGCTGTCCAGCCCG ............................................................................................................((((((...((((((...((((...))))....)))))).....((((((.(((.....))).))))))......))))))............................................................. .....................................................................................................102..........................................................................................195.....................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGG........................................................... | 26 | 2 | 30.00 | 30.00 | 24.50 | 1.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................TACTATTATCCAATGCATACAGAAACTGAA......................................................................................................................................................................................................... | 30 | 2 | 8.50 | 8.50 | - | - | - | 2.00 | 0.50 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCTG................................................ | 26 | 2 | 7.00 | 7.00 | - | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | 3.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGA............................................................. | 24 | 2 | 6.50 | 6.50 | 1.00 | 2.00 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGC.................................................. | 24 | 2 | 6.50 | 6.50 | - | 5.00 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGG.............................................................. | 23 | 2 | 6.00 | 6.00 | 4.50 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................TGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTGC........................................................ | 25 | 2 | 4.50 | 4.50 | - | - | - | - | 1.50 | 2.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................TGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTGC..................................................... | 25 | 2 | 3.50 | 3.50 | - | - | - | - | - | 1.50 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................TGCTGATGGGTGGTAGGGCTGGAC............................. | 24 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................TACTATTATCCAATGCATACAGAAACTGA.......................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCTGA............................................... | 27 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 2.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAG............................................................ | 25 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCT................................................. | 25 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................TATTATCCAATGCATACAGAAACTGAAGctt..................................................................................................................................................................................................... | 31 | ctt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................TACTATTATCCAATGCATACAGAAACTGAAa........................................................................................................................................................................................................ | 31 | a | 2.00 | 8.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................TGTCTCCACGAGCATGGTAACCTGAGT..................................................................................................................... | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................TGTCTCCACGAGCATGGTAACCTGAGTTA................................................................................................................... | 29 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTG......................................................... | 28 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................TGTCTCCACGAGCATGGTAACCTGA....................................................................................................................... | 25 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................TGTAAAAAGGATGGAAGCACATGGC................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGG............................................................... | 22 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGT.......................................................... | 27 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................TGATGGGTGGTAGGGCTGGACAGAATC....................... | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................TGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTG......................................................... | 24 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........AAGGAAGAGAATACTATTATCCAATGCAT..................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGt........................................................... | 26 | t | 1.00 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTG................................................... | 23 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................AATACTATTATCCAATGCATACAGAAACTGA.......................................................................................................................................................................................................... | 31 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................TCCAATGCATACAGAAACTGAAGGTA..................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................................TCTGTGGGGTTTGCTGTCCAGC... | 22 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................TACAGAAACTGAAGGTATGTGCCAC............................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................TGCTGCTGATGGGTGGTAGGGCTGa............................... | 25 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCcgct................................................. | 25 | cgct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................TTATCCAATGCATACAGAAACTGAAGGc...................................................................................................................................................................................................... | 28 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................TCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTCAGTGt.......................................................................................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................TGTAAAAAGGATGGAAGCACATGG.................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................TGTAAAAAGGATGGAAGCACATGGCT................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................TCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTCA.............................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................TCTAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGC.................................................. | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................TGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTGCT.................................................... | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................TGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTtt..................................................... | 28 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................TGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGcgc........................................................ | 25 | cgc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................TACTATTATCCAATGCATACAGAAACTtaa......................................................................................................................................................................................................... | 30 | taa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TGAGTTAGGATCTCTATGTAAAAAGGATGGt........................................................................................... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................TGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTG...................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................TACTATTATCCAATGCATACAGAAACTGAAG........................................................................................................................................................................................................ | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................TTTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTC............................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCTGAT.............................................. | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................................AGAATCTGTGGGGTTTGCTGTCCA..... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TCTCCACGAGCATGGTAACCTGAGTT.................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................TCCACGAGCATGGTAACCTGAGTTAGGATC.............................................................................................................. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................TGTCTCCACGAGCATGGTAACCTGAGTTAG.................................................................................................................. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................TATCCAATGCATACAGAAA.............................................................................................................................................................................................................. | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................TGGTAGGGCTGGACAGAATCTGTGGGG................ | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................................TCTGTGGGGTTTGCTGTCCAGCtcga | 26 | tcga | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................CAGAGGAAAGGAAAATGGCTCAGTGG.......................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....GAAAAGGAAGAGAATACTATTATCCAATG........................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................TGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTGt..................................................... | 25 | t | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCTGt............................................... | 27 | t | 0.50 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......AAAAGGAAGAGAATACTATTATCCAATGC....................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................TGCTGATGGGTGGTAGGGCTGG............................... | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................ACTATTATCCAATGCATACAGA................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................GGAAAGGAAAATGGCTCAGTGGGTA....................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............GAGAATACTATTATCCAATGCATACAGAAAC............................................................................................................................................................................................................. | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................TGCCACAATTTTCCACAGAGGAAAGGAA....................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCTGATt............................................. | 29 | t | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................TGCTGCTGATGGGTGGTAGGGCTGG............................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGttgc........................................................ | 29 | ttgc | 0.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................TTTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTCAGTG........................................................................................................................................................... | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGa.................................................. | 24 | a | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......AAAGGAAGAGAATACTATTA............................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGcg......................................................... | 28 | cg | 0.50 | 30.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................TGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTG................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................TGCTGATGGGTGGTAGGGCTGGACA............................ | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................TGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTGa........................................................ | 25 | a | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................................TAGGGCTGGACAGAATCTGTGGGG................ | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................TTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTCA.............................................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................GATGGGTGGTAGGGCTGGACAGAATC....................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................TTGTCTCCACGAGCATGGTAACCTG........................................................................................................................ | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................TCCACGAGCATGGTAACCTGAGTT.................................................................................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................TATTATCCAATGCATACAGAAACTGA.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................TTTTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTCAGT............................................................................................................................................................ | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................GAAAGGAAAATGGCTCAGTGGGTAACA.................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................TCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTC............................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................TGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGa.......................................................... | 27 | a | 0.50 | 30.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................CTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTGC........................................................ | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TCTCCACGAGCATGGTAACCTGAGTTAGGATC.............................................................................................................. | 32 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................TTTTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTC............................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 
| .................................................................TTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTC............................................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................TTATCCAATGCATACAGAAAC............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 
| ...................TACTATTATCCAATGCATACAGAAACTG........................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................AACTGGGGAGGTGCTGCTGCTGATG............................................. | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 
| ...................................................................................................................................................................CATGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGA............................................................. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................CAATGCATACAGAAACTGAA......................................................................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................................TCTGTGGGGTTTGCTGTC....... | 18 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 
| GCAAAGAAAAGGAAGAGAATACTATTATCCAATGCATACAGAAACTGAAGGTATGTGCCACAATTTTCCACAGAGGAAAGGAAAATGGCTCAGTGGGTAACATCCTTGTCTCCACGAGCATGGTAACCTGAGTTAGGATCTCTATGTAAAAAGGATGGAAGCACATGGCTGCTGTCTAAGAACTGGGGAGGTGCTGCTGCTGATGGGTGGTAGGGCTGGACAGAATCTGTGGGGTTTGCTGTCCAGCCCG ............................................................................................................((((((...((((((...((((...))))....)))))).....((((((.(((.....))).))))))......))))))............................................................. .....................................................................................................102..........................................................................................195.....................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............AGAGAATACTATTATCCAATGCATACAGA................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................TATGTGCCACAATTTTCCACAGAGGgt.............................................................................................................................................................................. | 27 | gt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................TATGTGCCACAATTTTCCACAGAGGA............................................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................ACATCCTTGTCTCCACGAGCATGGTA............................................................................................................................. | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................GGGGAGGTGCTGCTGCTGATGGGTGGTA...................................... | 28 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................CTCAGTGGGTAACATCCTTGTCTCCA........................................................................................................................................ | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................GGAAAATGGCTCAGTGGGTAACATCCTT............................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......AAAAGGAAGAGAATACTATTATCCAATG........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................TGGGTAACATCCTTGTCTCCACGAGCA.................................................................................................................................. | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......AAAGGAAGAGAATACTATTATCCAATGCA...................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................TATGTGCCACAATTTTCCACAGAGGAAA........................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................CTCCACGAGCATGGTAACCTGAGTTA................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............AAGAGAATACTATTATCCAATGCATACAGA................................................................................................................................................................................................................ | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................CAGTGGGTAACATCCTTGTCTCCACGAGCA.................................................................................................................................. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........GAAGAGAATACTATTATCCAATGCATACAGA................................................................................................................................................................................................................ | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |