(1)
OTHER.ip
(6)
OTHER.mut
(8)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(33)
TESTES

Sense strand
TTCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATGACCCATCTGTGGCTGCTTAATGTAAGTTTTCAATGCAGTGAAGTGTTTACACGTTATAAGGAACATTGGAACCTCAAGAAAAACTCACTTCGAGGACACTGGTTAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGTAGCCCACTCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACCTTGTGCTGGGGATCCCAAGTTACCACACCCAGCCTCCAGACAGGAACCTGGAAAGTCTGTATTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGCTGGTTCCCCTGGGTGACCTTTTCCCCCCCTCTCCCATAGATGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAAAACCCACACGCTTGCTGCTGCAG
..................................................................................................................................................................(((((..((((...(((....)))...))))...)))))............((((..((((..(((.....)))..))))...(((((...))))).)))).......................................................................................................
..............................................................................................................................................................159............................................................................................................270..............................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGAAAGTCTGTATTAGACAGTGGCAT.................................................................................................... 27 1 34.00 34.00 10.00 11.00 5.00 3.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACC............................................................................................................................................................................... 28 1 23.00 23.00 10.00 6.00 3.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAA....................... 26 1 23.00 23.00 12.00 7.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGAAAGTCTGTATTAGACAGTGGCA..................................................................................................... 26 1 22.00 22.00 8.00 5.00 2.00 1.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTA................................................................................................................................................................................. 26 1 17.00 17.00 7.00 4.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TGGAAAGTCTGTATTAGACAGTGGCATT................................................................................................... 28 1 14.00 14.00 3.00 8.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGA........................ 25 1 12.00 12.00 5.00 - 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................TTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGCT........................................................................................ 26 1 10.00 10.00 - - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAAA...................... 27 1 8.00 8.00 5.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 - - - - - 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGATGGACACTGAGGGAGACTGTCC........................... 26 1 6.00 6.00 1.00 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GAAAAGGATTGGTGTACATCTTACCT.............................................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGTAGC............................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................TAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGCTG....................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GAAAAGGATTGGTGTACATCTTACC............................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCAATGCAGTGAAGTGTTTACACGTT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTAC................................................................................................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGATCAGCCTTTACAGTAAACATGACCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 4.00 4.00 - 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GAAAAGGATTGGTGTACATCTTACCTT............................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGTAAACATGACCCATCTGTGGCTGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................CAGGAACCTGGAAAGTCTGTATTAGACAG.......................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................CTCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTT.................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TATAAGGAACATTGGAACCTCAAGAA................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TACAGTAAACATGACCCATCTGTGGCTGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TGTATTAGACAGTGGCATTCTCTGGTG........................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGTAGCC.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................CAGGAACCTGGAAAGTCTGTATTAGACA........................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................AAAGTCTGTATTAGACAGTGGCATTCTCT............................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................AAGAAAAACTCACTTCGAGGACACTGGT.......................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACC............................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................TTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGG.......................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGGAGACTGTCCTGAAAACCCACA............... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGATCAGCCTTTACAGTAAACATGACCCAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACCT.............................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGATGGACACTGAGGGAGACTGTCCTG......................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................TTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGC......................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAAAAACTCACTTCGAGGACACTGGTT......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAAAAC.................... 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCAGCCTTTACAGTAAACATGACCCATC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TATTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGC......................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGTTAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGT.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCC........................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TCCAGTAGCCCACTCAGAAAAGGATTG............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGA........................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATAGATGGACACTGAGGGAGACTG.............................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TATTAGACAGTGGCATTCTCTGGTG........................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..............................................................................................................................................................................TTGGTGTACATCTTACCTTGTGCTGGG..................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTGAGGGAGACTGTCCTGAAAAgt................... 25 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CAGACAGGAACCTGGAAAGTCTGTA.................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CAGACAGGAACCTGGAAAGTCTGTAT................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................AAAGGATTGGTGTACATCTTACCTTGT........................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GAACATTGGAACCTCAAGAAAAACTCACTTC...................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................ACATTGGAACCTCAAGAAAAACTCA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGTA................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................AGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACCTT............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................TTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGCTG....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................................................................................................................................TACCACACCCAGCCTCCAGACAGGAACCT.............................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................TACAGTAAACATGACCCATCTGTGGCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TAAGGAACATTGGAACCTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGt........................ 25 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................AGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACC............................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGTAGCCC............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGGTGGCTGGTTCCCCTGGG............................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACCT.............................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................AGGATTGGTGTACATCTTACCTTGTG.......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ATCAGCCTTTACAGTAAACATGACCCATC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATGACC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................ACTCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTT.................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAAAAC.................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTGAGGGAGACTGTCCTGAAAACCC.................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................CCAGACAGGAACCTGGAAAGTCTGTA.................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TATTAGACAGTGGCATTCTCTGG............................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 6.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CTGGAAAGTCTGTATTAGACAGTGGC...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TTGATCAGCCTTTACAGTAAACATGACC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCTGGGTGACCTTTTCCCCCCCTCT......................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TACCTTGTGCTGGGGATCCCAAGTT.......................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGAAAACCCACACGCTTGCTGC..... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CGAGGACACTGGTTAAAATTCACAGG............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................GAAAGTCTGTATTAGACAGTGGCATT................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAA....................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TCAGAAAAGGATTGGTGTACATC.................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAA....................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGAga............................... 18 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAAACCCACACGCTTGCTGCTGCA. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGACCCATCTGTGGCTGCTTtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TTCGAGGACACTGGTTAAAATTCACAGGAAGT......................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGACACTGAGGGAGACTGTCCTG......................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AGGACACTGGTTAAAATTCACAGGAAG.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGT.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TGTATTAGACAGTGGCATTCTCTGGT............................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCATAGATGGACACTGAGG..................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCCTG......................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGCAGTGAAGTGTTTACACGTTATAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCAATGCAGTGAAGTGTTTACACGTTAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGCATTCTCTGGTGGCTGGTTC................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AATGCAGTGAAGTGTTTACACGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................AAAAGGATTGGTGTACATCTTACCTTGT........................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACAGGAACCTGGAAAGTCTGat.................................................................................................................. 27 at 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TACAGTAAACATGACCCAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACACTGAGGGAGACTGTCCT.......................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TAAGGAACATTGGAACCTCAAGAAAAACT............................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGAAAACCCACACGCTTGCTGCTGC.. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGAGGGAGACTGTCCTGAAAACCCACA............... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................TTCAATGCAGTGAAGTGTTTACACGTTA......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGATGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGA........................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................AAAAGGATTGGTGTACATCTTACCTT............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGCAGTGAAGTGTTTACACGTTATAAGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................CAGGAACCTGGAAAGTCTGTATTAGACAGTG........................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TCTTACCTTGTGCTGGGGATCCCAAG............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTGTCCTGAAAACCCACACGCTTGC........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CCTTTACAGTAAACATGACCCATCTGTG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGGGGATCCCAAGTTACCACACCCAGC.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGAGACTGTCCTGAAAACCCACACGCT........... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATAGATGGACACTGAGGGAGACTGTC............................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CACTCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTT.................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCACTTCGAGGACACTGGTTAAAATTC.................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................TATTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGCT........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCACAGGAAGTGTCCAGTAGCCCACTC......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................TGTATTAGACAGTGGCATTCTCTGG............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGTAGg............................................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GGAACCTGGAAAGTCTGTATTAGACAGTGGC...................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TAAAATTCACAGGAAGTGTC...................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTCCTTGATCAGCCTTTACAGTAAACATGACCCATCTGTGGCTGCTTAATGTAAGTTTTCAATGCAGTGAAGTGTTTACACGTTATAAGGAACATTGGAACCTCAAGAAAAACTCACTTCGAGGACACTGGTTAAAATTCACAGGAAGTGTCCAGTAGCCCACTCAGAAAAGGATTGGTGTACATCTTACCTTGTGCTGGGGATCCCAAGTTACCACACCCAGCCTCCAGACAGGAACCTGGAAAGTCTGTATTAGACAGTGGCATTCTCTGGTGGCTGGTTCCCCTGGGTGACCTTTTCCCCCCCTCTCCCATAGATGGACACTGAGGGAGACTGTCCTGAAAACCCACACGCTTGCTGCTGCAG
..................................................................................................................................................................(((((..((((...(((....)))...))))...)))))............((((..((((..(((.....)))..))))...(((((...))))).)))).......................................................................................................
..............................................................................................................................................................159............................................................................................................270..............................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAAACCCACACGCTtcta........... 18 tcta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00