(6)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(27)
TESTES

Sense strand
TCTATTTAATTTGTATGTTATCATAAAATGTTTTTTCTTAGCTAGGCATGATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCAGGTAGGTAAAAGGCCAGCCTGGGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAATAAATATGAAATTTCTCTTAAACAGTGTGGTTTTGTTTTAAAGGTATCTTCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTAACATC
...........................................................((((.....(((((((((((((.((((...((......))....))))..))))))))...........)))))((....)).....))))....................................................................................................
...........................................................60................................................................................................................174..........................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGC............................................................................................................................................................... 27 3 6.67 6.67 - 1.67 - - - - 0.33 - 2.00 - 1.67 0.67 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGG................................................................................................................................................................ 26 3 3.00 3.00 - - - - 0.33 - - 1.67 - - 0.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGC............................................................................................................................................................... 29 3 2.67 2.67 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - 1.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - -
........................................................TGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGG...................................................................................................................................................................... 28 3 2.33 2.33 - - - - - - - - 2.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCA.............................................................................................................................................................. 28 3 2.33 2.33 0.33 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 0.33 - - - - -
...................................................................TCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCAGa............................................................................................................................................................ 27 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TTCTTAGCTAGGCATGATGGTGTGTG.............................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCAGGTAtc........................................................................................................................................................ 29 tc 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGA............................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGG................................................................................................................................................................. 27 3 1.67 1.67 - - - - - - - - 1.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGG.................................................................................................................................................................. 26 3 1.33 1.33 - - 0.33 - - - 0.33 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGG................................................................................................................................................................ 28 3 1.33 1.33 - - - - 0.33 - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - -
.....................................................................TCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCAGG............................................................................................................................................................ 25 3 1.33 1.33 - - - - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGA................................................................................................................................................................................ 26 3 1.00 1.00 - - - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAtgct.................................................................................................................................................................... 22 tgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CAGGACCGAGTCTCAAGAAAAC......................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGATGGTGTGTGTGTATAATCTCGag................................................................................................................................................................................ 26 ag 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGG.................................................................................................................................................................. 24 3 1.00 1.00 - - 0.67 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GAAAACAGCACAAAACAATAAATATGAAATT................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TACAGAACAGGACCGAGTCTCAAcac............................................................................................................ 26 cac 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAcgag....................................................................................................................................................................... 19 cgag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGTATCTTCTCCACggac................................. 18 ggac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTCAAAGt.............. 30 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGAA............................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TTCTTAGCTAGGCATGATGGTGTGTGT............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................ACAGGACCGAGTCTCAAGAAAACAG....................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TTTCTTAGCTAGGCATGATGGTGTGTG.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGG.................................................................................................................................................................. 28 3 1.00 1.00 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - -
........................................................TGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGt........................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGA............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAccct.................................................................................................................................................................... 24 ccct 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGGGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCAA............................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGG................................................................................................................................................................. 25 3 0.67 0.67 - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTG................................................................................................................................................................... 27 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.33 - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTG................................................................................................................................................................... 25 3 0.67 0.67 - - - - - - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
................................................TGATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGT.............................................................................................................................................................................. 28 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTC............................................................................................................................................................................. 26 3 0.67 0.67 - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CAGGAGGCTGGGGCAGGTAGGTA...................................................................................................................................................... 23 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGCTAGGCATGATGGTGTGTGTGTA.......................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGCTAGGCATGATGGTGTGTGTGT........................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAGCTAGGCATGATGGTGTGTGTGTAa......................................................................................................................................................................................... 27 a 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TAAACAGTGTGGTTTTGTTTTAAAGGTATC............................................. 30 5 0.40 0.40 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGA........................................................................................................................................................................ 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAG....................................................................................................................................................................... 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGG......................................................................................................................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCA.............................................................................................................................................................. 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - -
................................................TGATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTC............................................................................................................................................................................. 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCAAGAAAACAGCACAAAACAATAAATA....................................................................................... 28 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAG............................................................................................................................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CAAGAAAACAGCACAAAACAATAAATAT...................................................................................... 28 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGA........................................................................................................................................................................ 28 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCT.................................................................................................................................................................... 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
........................................GCTAGGCATGATGGTGTGTGTGTATAA....................................................................................................................................................................................... 27 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCCTTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTA..... 27 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTAACA.. 27 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGG...................................................................................................................................................................... 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGa................................................................................................................................................................ 26 a 0.33 0.67 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGt.................................................................................................................................................................. 28 t 0.33 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - -
.............................................................................................GTAGGTAAAAGGCCAGCCTGGGCTAC................................................................................................................................... 26 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGG...................................................................................................................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAG....................................................................................................................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCCTTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTAA.... 28 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGa................................................................................................................................................................ 28 a 0.33 1.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCT.................................................................................................................................................................... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGC..................................................................................................................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCAa............................................................................................................................................................. 29 a 0.33 2.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGC..................................................................................................................................................................... 28 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGt.................................................................................................................................................................. 26 t 0.33 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - -
................................................................TAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTG................................................................................................................................................................... 23 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGGTTTTGTTTTAAAGGTATCTTCTC........................................ 28 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCACTTCCTTCCTTGTCCC...................... 20 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTATTTAATTTGTATGTTATCATAAAATGTTTTTTCTTAGCTAGGCATGATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGGCAGGTAGGTAAAAGGCCAGCCTGGGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAATAAATATGAAATTTCTCTTAAACAGTGTGGTTTTGTTTTAAAGGTATCTTCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTAACATC
...........................................................((((.....(((((((((((((.((((...((......))....))))..))))))))...........)))))((....)).....))))....................................................................................................
...........................................................60................................................................................................................174..........................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
...........................................................................................................AGCCTGGGCTACAGAACAGGACCGAGTC................................................................................................................... 28 1 8.00 8.00 - - - - - - 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TTCTCTTAAACAGTGTGGTTTTGTTTTA..................................................... 28 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCA................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GGGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCA................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCAA............................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TCTCTTAAACAGTGTGGTTTTGTTTTA..................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................ACAGGACCGAGTCTCAAGAAAACA........................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGA............................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CCACTTCCTTCCTTGTCCCCTCAAA................ 25 5 1.80 1.80 - 0.20 - - - - - - 0.80 - - - - - - 0.80 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CCTTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTA..... 26 3 1.67 1.67 - 0.33 - - 0.33 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCA........................................................................................................................................................................... 27 3 1.33 1.33 - - 0.67 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
TATTTAATTTGTATGTTATCATAAAAaatg.............................................................................................................................................................................................................................. 30 aatg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................CCCCTCAAAGATGTTGACTAACATcca. 27 cca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTAccg..... 27 ccg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GAGTCCAGGAGGCTGGGGCAGGTAa.......................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................CAGCACAAAACAATAAATATGAAATTTCTC............................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGA........................................................................................................................................................................ 28 3 1.00 1.00 - - - - - 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GCTACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGA............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AAAACAATAAATATGAAATTTCTCTTA......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TTGTCCCCTCAAAGATGTTGACTAACAT. 28 3 1.00 1.00 0.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCTGGGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCA................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TACAGAACAGGACCGAGTCTCAAGAac............................................................................................................. 27 ac 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AGGACCGAGTCTCAAGAAAACAGCACAAtt.................................................................................................. 30 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................AGAACAGGACCGAGTCTCAAGAAttt............................................................................................................ 26 ttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CCTGGGCTACAGAACAGGACCGAGTCT.................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................GCTACAGAACAGGACCGAGTCTCA................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AAAACAGCACAAAACAATAAATAtttt....................................................................................... 27 tttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................AACAGGACCGAGTCTCAAGAAAACAt........................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GAGTCTCAAGAAAACAGCACAAAAcgt................................................................................................ 27 cgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TACAGAACAGGACCGAGTCTCAtccc................................................................................................................ 26 tccc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGAa........................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 0.33 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTCTTAAACAGTGTGGTTTTGTTTTAc..................................................... 27 c 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................AAAACAATAAATATGAAATTTCTCTTAt......................................................................... 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGA........................................................................................................................................................................ 27 3 1.00 1.00 - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - -
..................................................................................................................GCTACAGAACAGGACCGAGTCTCAA............................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AACAGGACCGAGTCTCAA............................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGAACAGGACCGAGTCTCAAGAAAACA........................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GGACCGAGTCTCAAGAAAACAGCACAA.................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TTTCTCTTAAACAGTGTGGTTTTGTTTTAa..................................................... 30 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CTGGGCTACAGAACAGGACCGAGTCTCA................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCAGGA........................................................................................................................................................................ 29 3 0.67 0.67 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - -
...................................................................................................................................AGTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAA............................................................................................. 26 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................AGTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAATA........................................................................................... 28 3 0.67 0.67 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAA............................................................................................. 25 3 0.67 0.67 - - 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCA........................................................................................................................................................................... 30 3 0.67 0.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AAAGGTATCTTCTCCACTTCCTTCCT............................ 26 4 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CACTTCCTTCCTTGTCCCCTCAAAGA.............. 26 5 0.40 0.40 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 -
..........................................................................................................................................AGAAAACAGCACAAAACAATAAATA....................................................................................... 25 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCTCAAGAAAACAGCACAAAACAA............................................................................................. 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................ACCGAGTCTCAAGAAAACAGCACAAAA................................................................................................ 27 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TAAAAGGCCAGCCTGGGCTACAGAACA............................................................................................................................. 27 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................AATCTCGGAGTCCAGGAGGCTGGGG................................................................................................................................................................ 25 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGTCCCCTCAAAGATGTTGACTAACAT. 27 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CCGAGTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAA............................................................................................. 29 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CTCAAGAAAACAGCACAAAACAAtct............................................................................................. 26 tct 0.33 0.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTCAAGAAAACAGCACAAAACAA............................................................................................. 23 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................ATGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCA........................................................................................................................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGTGTGTGTGTATAATCTCGGAGTCCA........................................................................................................................................................................... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GAGTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAA............................................................................................. 27 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GTCTCAAGAAAACAGCACAAAACAATAA.......................................................................................... 28 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GTGTATAATCTCGGAGTCCAGGA........................................................................................................................................................................ 23 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................AGAAAACAGCACAAAACAATAAATATG..................................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TATCTTCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCC..................... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TCTTCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTC................... 28 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCCAGGAGGCTGGGGCAGGTAGGTAAAA................................................................................................................................................... 28 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTCA.................. 27 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................ATCTTCTCCACTTCCTTCC............................. 19 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................GTGTGGTTTTGTTTTAAAGGTATCTTCT......................................... 28 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ACAGTGTGGTTTTGTTTTAAAGGTATCTT........................................... 29 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGTATCTTCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCT.................... 31 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GTATCTTCTCCACTTCCTTCCTTGTCC....................... 27 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTC................... 25 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................AAGGTATCTTCTCCACTTC.................................. 19 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTAAAGGTATCTTCTCCACTTCCTTCCTTG.......................... 30 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................CTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTCAAA................ 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTC................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GTTTTAAAGGTATCTTCTCCACTTCCTT............................... 28 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGTTTTAAAGGTATCTTCTCCACTTCCTT............................... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TCTCCACTTCCTTCCTTGTCCCCTCA.................. 26 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CCACTTCCTTCCTTGTCCCCTC................... 22 5 0.20 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................ACTTCCTTCCTTGTCCCCTCAAA................ 23 5 0.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................AAACAGTGTGGTTTTGTTTTA..................................................... 21 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................AACAGTGTGGTTTTGTTTTAAAGGTA............................................... 26 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GGGCAGGTAGGTAAAAG.................................................................................................................................................. 17 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17