Gene: 2410022L05Rik

ID: uc009kyr.1_intron_1_0_chr8_13885882_r.3p

SPECIES: mm9

chr8:13885832 13886081 -

(1) OTHER.ip

(13) OTHER.mut

(2) OVARY

(8) PIWI.ip

(2) PIWI.mut

(1) TDRD1.ip

(46) TESTES

Sense strand

AGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAATCCGCAAAGTGCGTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACGCCCGGCAGAAAGTTTCTAACCATATGAGCAGACCTCCAGTTTATCATTTTTAAAAACTGTCTGTCTGTTCATAGCCAGTGGAGCTCAGAGCATCCCTGCTGACATTCCTGCCCATGCCGAGGGC ..................................................................((((((.(((.....)))(((((((((((.....))))).....((((((......)))))).))))))..))))))......((((..((((.....)))).))))............................................................................. ....................................................53.......................................................................................................................174..........................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGaca...............................................................................................................................................................................................	24	aca	61.00	0.00	14.00	-	1.00	2.00	7.00	5.00	3.00	2.00	2.00	11.00	3.00	1.00	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	1.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaaa................................................................................................................................................................................................	23	aaa	42.00	0.00	6.00	-	-	-	10.00	4.00	3.00	5.00	-	1.00	2.00	6.00	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaga................................................................................................................................................................................................	23	aga	23.00	0.00	2.00	-	-	-	1.00	15.00	-	2.00	-	-	-	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGacaa..............................................................................................................................................................................................	25	acaa	13.00	0.00	4.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	2.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................TATGAGCAGACCTCCAGTTTAT................................................................................	22	1	12.00	12.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	1.00	-	1.00	-	1.00	-	1.00	-	-	-
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...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaaaa...............................................................................................................................................................................................	24	aaaa	7.00	0.00	2.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaaga...............................................................................................................................................................................................	24	aaga	7.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	1.00	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CTAGAACTCAGAAATCCGCAAAGTGCGTC....................................................................................................................................................................	29	1	6.00	6.00	1.00	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................AAACTGTCTGTCTGTTCATAGa.................................................	22	a	6.00	6.00	-	-	-	-	-	4.00	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................AAACTGTCTGTCTGTTCATAG..................................................	21	1	6.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAtaa................................................................................................................................................................................................	29	taa	5.00	0.00	-	-	3.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCaaa.............................................................................................................................................................................................	26	aaa	5.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGacgt..............................................................................................................................................................................................	25	acgt	4.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................TAGAACTCAGAAATCCGCAAAGTGCGTC....................................................................................................................................................................	28	1	4.00	4.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCaa...............................................................................................................................................................................................	30	aa	4.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACGaa..........................................................................................................................	28	aa	4.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAagaa...............................................................................................................................................................................................	24	agaa	3.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCta...............................................................................................................................................................................................	24	ta	3.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGtat...............................................................................................................................................................................................	24	tat	3.00	0.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAaaa................................................................................................................................................................................................	29	aaa	3.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGta................................................................................................................................................................................................	23	ta	3.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCaaaa............................................................................................................................................................................................	27	aaaa	3.00	0.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGta................................................................................................................................................................................................	29	ta	3.00	0.00	-	-	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGaaaa..............................................................................................................................................................................................	25	aaaa	3.00	0.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGaag...............................................................................................................................................................................................	24	aag	3.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTAGaaag..............................................................................................................................................................................................	26	aaag	3.00	0.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGaaga..............................................................................................................................................................................................	25	aaga	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAata................................................................................................................................................................................................	23	ata	2.00	0.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................CACTTTGTAGACCAGGCTAGaaaa..............................................................................................................................................................................................	24	aaaa	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................CATATGAGCAGACCTCCAGTTTt.................................................................................	23	t	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaata...............................................................................................................................................................................................	24	aata	2.00	0.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAatta...............................................................................................................................................................................................	30	atta	2.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACGga..........................................................................................................................	28	ga	2.00	0.00	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAtatt...............................................................................................................................................................................................	30	tatt	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGaat...............................................................................................................................................................................................	24	aat	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................CGTGTGCCACCACGCCCGaa......................................................................................................................	20	aa	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................CACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAc.............................................................................................................................................................................................	25	c	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACGCaaa........................................................................................................................	30	aaa	2.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaaag...............................................................................................................................................................................................	24	aaag	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCga...............................................................................................................................................................................................	30	ga	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTAGacaa..............................................................................................................................................................................................	26	acaa	2.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGtca...............................................................................................................................................................................................	30	tca	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGTGCCAtcgt.............................................................................................................................	25	tcgt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................AAACTGTCTGTCTGTTCAaagc.................................................	22	aagc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAaaaa...............................................................................................................................................................................................	30	aaaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCatt.............................................................................................................................................................................................	26	att	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAtata...............................................................................................................................................................................................	30	tata	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................GGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCaa...............................................................................................................................................................................................	29	aa	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................TCAGAAATCCGCAAAGTGCGTCTGta................................................................................................................................................................	26	ta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGtaa...............................................................................................................................................................................................	24	taa	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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..........................................................TAGAACTCAGAAATCCGCAAAGTGCGTt....................................................................................................................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGTGCCAtaaa.............................................................................................................................	25	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACGacta........................................................................................................................	30	acta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................ATATGAGCAGACCTCCAGTTTATC...............................................................................	24	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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..................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCaaaa............................................................................................................................................................................................	28	aaaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaac................................................................................................................................................................................................	23	aac	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCg...............................................................................................................................................................................................	24	g	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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....................................................................................................TGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACGtta.........................................................................................................................	29	tta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................ACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGaaaa..............................................................................................................................................................................................	27	aaaa	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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....TTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCgtaa..........................................................................................................................................................................................................................	28	gtaa	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAaaat...............................................................................................................................................................................................	24	aaat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGtaaa..............................................................................................................................................................................................	25	taaa	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................ACTGTCTGTCTGTTCATAGtt................................................	21	tt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................ACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGatt...............................................................................................................................................................................................	26	att	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CTAGAACTCAGAAATCCGCAAAGTGCGT.....................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................CACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAaaaa..........................................................................................................................................................................................	28	aaaa	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGtag...............................................................................................................................................................................................	24	tag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGacac..............................................................................................................................................................................................	25	acac	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCata.............................................................................................................................................................................................	26	ata	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................CACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAat............................................................................................................................................................................................	26	at	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTA..............................................................................................................................................................................................	25	17	0.65	0.65	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	0.06	0.12	0.18	0.06	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAt.............................................................................................................................................................................................	26	t	0.47	0.65	-	-	0.18	0.06	-	-	-	-	0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................ACTGTCTGTCTGTTCAT....................................................	17	4	0.25	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAta............................................................................................................................................................................................	27	ta	0.24	0.65	-	-	0.06	-	-	-	-	-	0.12	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAG.............................................................................................................................................................................................	27	15	0.20	0.20	-	-	0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGA............................................................................................................................................................................................	27	15	0.20	0.20	-	-	0.07	-	-	-	-	-	0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAAC..........................................................................................................................................................................................	29	14	0.14	0.14	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAG.............................................................................................................................................................................................	26	16	0.12	0.12	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAat............................................................................................................................................................................................	27	at	0.12	0.65	-	-	0.06	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................GAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTA..............................................................................................................................................................................................	29	11	0.09	0.09	0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTA..............................................................................................................................................................................................	31	11	0.09	0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................ACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGA............................................................................................................................................................................................	29	13	0.08	0.08	-	-	-	-	-	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................CTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAAC..........................................................................................................................................................................................	30	13	0.08	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................CACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGA............................................................................................................................................................................................	26	15	0.07	0.07	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAA...........................................................................................................................................................................................	28	15	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................TGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAA....................................................................................................................................................................................	29	16	0.06	0.06	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAtt............................................................................................................................................................................................	27	tt	0.06	0.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

AGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAATCCGCAAAGTGCGTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACGCCCGGCAGAAAGTTTCTAACCATATGAGCAGACCTCCAGTTTATCATTTTTAAAAACTGTCTGTCTGTTCATAGCCAGTGGAGCTCAGAGCATCCCTGCTGACATTCCTGCCCATGCCGAGGGC ..................................................................((((((.(((.....)))(((((((((((.....))))).....((((((......)))))).))))))..))))))......((((..((((.....)))).))))............................................................................. ....................................................53.......................................................................................................................174..........................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
................CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAttt.............................................................................................................................................................................................................	29	ttt	21.00	0.00	1.00	6.00	2.00	5.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	2.00	-	2.00	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtta.............................................................................................................................................................................................................	29	tta	10.00	0.00	-	2.00	3.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
................CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTttt..............................................................................................................................................................................................................	28	ttt	6.00	0.00	-	1.00	2.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtttt.............................................................................................................................................................................................................	30	tttt	3.00	0.00	-	1.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGttt...............................................................................................................................................................................................................	27	ttt	3.00	0.00	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtc............................................................................................................................................	26	tc	3.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTtaga.................................................................................................................................................................................................................	26	taga	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................CAGGCTAGCCTAGAACTCActtt.......................................................................................................................................................................................	23	cttt	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtaat.............................................................................................................................................................................................................	30	taat	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
GTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTgcag............................................................................................................................................................................................................................	31	gcag	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgc............................................................................................................................................	26	cgc	2.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTtta..............................................................................................................................................................................................................	28	tta	2.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................GTCCTGGAACTCACTTTGTAccag.............................................................................................................................................................................................................	24	ccag	2.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAtaga..............................................................................................................................................	27	taga	2.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................AGGCTAGCCTAGAACTCAGAtgtc.....................................................................................................................................................................................	24	tgtc	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................AGGCTAGCCTAGAACTCAtgtc.......................................................................................................................................................................................	22	tgtc	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgt............................................................................................................................................	26	cgt	2.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................CTGGAACTCACTTTGTAtgta.............................................................................................................................................................................................................	21	tgta	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................CAGGCTAGCCTAGAACTCActct.......................................................................................................................................................................................	23	ctct	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................GACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAg.....................................................................................................................................................................................	25	g	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................TCCCGAGTGCTGGGATTAAcc.............................................................................................................................................	21	cc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................GTCCTGGAACTCACTTTGTAcggg.............................................................................................................................................................................................................	24	cggg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................GGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGctt............................................................................................................................................................................................................	28	ctt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................CCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAaat.....................................................................................................................................................................................	25	aat	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAcgta..............................................................................................................................................	27	cgta	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................ACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAATg..................................................................................................................................................................................	27	g	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................GGCTAGCCTAGAACTCAGAAAgggt...................................................................................................................................................................................	25	gggt	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................ACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAATCCt................................................................................................................................................................................	29	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAActaa............................................................................................................................................	29	ctaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................GGCTAGCCTAGAACTCAGAAAggg...................................................................................................................................................................................	24	ggg	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAtaaa.............................................................................................................................................	28	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................TGCGTCTGCCTCCCGAGTGCTgggg.....................................................................................................................................................	25	gggg	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAttg.............................................................................................................................................................................................................	29	ttg	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................CAGGCTAGCCTAGAACTCAGcaca......................................................................................................................................................................................	24	caca	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAtaaa.............................................................................................................................................................................................................	30	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcact............................................................................................................................................	27	cact	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcggg............................................................................................................................................	27	cggg	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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............................................ACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAaa.....................................................................................................................................................................................	25	aa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.............................................CAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAAttt...................................................................................................................................................................................	26	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................GCTGTCCTGGAACTCACTTTGgagc...............................................................................................................................................................................................................	25	gagc	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................CTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTacc.......................................................................................................................................	29	acc	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtta............................................................................................................................................	27	tta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAtta.............................................................................................................................................	26	tta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...............CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAttta.............................................................................................................................................................................................................	30	ttta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...............................................AGGCTAGCCTAGAACTCAGAta.....................................................................................................................................................................................	22	ta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATtaga................................................................................................................................................	25	taga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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................CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTtta................................................................................................................................................................................................................	26	tta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................CGTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAt..............................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................GGCGTGTGCCACCACgggt.............................................................................................................................	19	gggt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtgt............................................................................................................................................	28	tgt	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............CTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTtaaa..............................................................................................................................................................................................................	29	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................GCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAgat.............................................................................................................................................................................................................	26	gat	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAAtttt........................................................................................................................................................................................................................	28	tttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................GTCCTGGAACTCACTTTGTAcaga.............................................................................................................................................................................................................	24	caga	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................GGCTAGCCTAGAACTCAGActta.....................................................................................................................................................................................	23	ctta	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........GTGTAGCCCTGGCTGTCCTGcgt...........................................................................................................................................................................................................................	23	cgt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................CTGGAACTCACTTTGTAtgct.............................................................................................................................................................................................................	21	tgct	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........GTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTcgt......................................................................................................................................................................................................................	28	cgt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................CTGGAACTCACTTTGTAtttc.............................................................................................................................................................................................................	21	tttc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................AGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAt.....................................................................................................................................................................................	26	t	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................CAGGCTAGCCTAGAACTCActcc.......................................................................................................................................................................................	23	ctcc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........GTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAcat.........................................................................................................................................................................................................................	25	cat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.............................................GACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAA...................................................................................................................................................................................	26	16	0.69	0.69	-	0.12	-	0.25	-	-	-	-	-	-	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	0.06	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................ACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAA...................................................................................................................................................................................	25	17	0.24	0.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	0.06	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................CCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAA....................................................................................................................................................................................	23	17	0.24	0.24	-	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................GACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAATCC................................................................................................................................................................................	29	10	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................TTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCA.......................................................................................................................................................................................	27	15	0.20	0.20	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	0.07	-
.............................................GACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAA....................................................................................................................................................................................	25	16	0.19	0.19	-	-	-	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................AGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAA...................................................................................................................................................................................	27	16	0.19	0.19	-	0.06	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................ACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAA....................................................................................................................................................................................	24	17	0.12	0.12	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................TTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGA.....................................................................................................................................................................................	30	13	0.08	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................TTTGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCA.......................................................................................................................................................................................	28	15	0.07	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................GACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAAT..................................................................................................................................................................................	27	15	0.07	0.07	-	0.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................TGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAA....................................................................................................................................................................................	29	16	0.06	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................TGTAGACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAA...................................................................................................................................................................................	30	16	0.06	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................ACCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAAaa...................................................................................................................................................................................	27	aa	0.06	0.00	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................CCAGGCTAGCCTAGAACTCAGAAAgc...................................................................................................................................................................................	26	gc	0.06	0.00	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-