| Gene: 9430010O03Rik | ID: uc009kug.1_intron_1_0_chr8_8681468_r.3p | SPECIES: mm9 |
|
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(1) OTHER.ip |
(4) OTHER.mut |
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(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(25) TESTES |
| TGGACTGGGAGGGGTGATTTAAATCTAGTGTTAGAAACCAATTTTTTAGTGGCTGCACAGTATATCATTGTCAGACAGAAAGGTGGCTGTAGAGCTGCCCTGTAAGTCAGATCAACAGAGCTGAGAGGAAGATTAGTAAATATTTGCTGTAGAGGCAAACACTTTATTTTTCTAACATCGCAACATGTCCTCCCCTTTAGGAGGAAGAGAGAGCAAAGCGTGAGGAACTGGAGCGGATATTAGAAGAAAA |
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| ..............................................................TATCATTGTCAGACAGAAAG........................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................................................................................................................................................AAAGCGTGAGGAACTGGAGCGGATATT......... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................CATTGTCAGACAGAAAGGTGGCTGTAG.............................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ........................................................................................................................................................................................................................AGCGTGAGGAACTGGAGCGGATATTt........ | 26 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................................................................................................................................GCGTGAGGAACTGGAGCGGATATTAGA...... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ....................................................................................................................................................................................................................GCAAAGCGTGAGGAACTGGAGCGG.............. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................CAGAAAGGTGGCTGTAGAGCTGC........................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................................................................................................................................................................................................................GAGGAACTGGAGCGG.............. | 15 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TGGACTGGGAGGGGTGATTTAAATCTAGTGTTAGAAACCAATTTTTTAGTGGCTGCACAGTATATCATTGTCAGACAGAAAGGTGGCTGTAGAGCTGCCCTGTAAGTCAGATCAACAGAGCTGAGAGGAAGATTAGTAAATATTTGCTGTAGAGGCAAACACTTTATTTTTCTAACATCGCAACATGTCCTCCCCTTTAGGAGGAAGAGAGAGCAAAGCGTGAGGAACTGGAGCGGATATTAGAAGAAAA |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
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