(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(26)
TESTES

Sense strand
CTGTTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACGGCATGGTGAGAGCAGGGTCACTTCCCCACGGCAAGGGGAAGAGCAGCCGGAGTGAGAGTGGTGGGTCCTCCCCAGAGGCTGGGTGGGAAGGCACAAGGACTTTGGAAATGCGGATCTTTGTATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGGACACTTCAGCACGCTCCAACCCTAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGACTTGTTGGTC
..................................................((....))...(((.(((((((.......))))))).(((.(((((((.......(((..(((..(((((...)))))..)))...)))....)))))))...))).)))..........................................................................................
..................................................51...........................................................................................................160........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAG........... 26 1 29.00 29.00 9.00 6.00 1.00 2.00 - 2.00 7.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................CAGGCAAGCTCTGCAGTCACGGCATGG....................................................................................................................................................................................................... 27 1 17.00 17.00 6.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GAGCAGCCGGAGTGAGAGTGGTGG............................................................................................................................................. 24 1 13.00 13.00 - 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGCAGTCACGGCATGGTGAGAGCAGG............................................................................................................................................................................................. 26 1 9.00 9.00 - - 2.00 - - - - - - - - 3.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - -
.TGTTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGC............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 9.00 9.00 7.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAG.................................................................................................................................................................................................................. 30 1 9.00 9.00 - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGG.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGA.......... 27 1 7.00 7.00 - - - 1.00 1.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGC............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 7.00 7.00 3.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGG.............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAG............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTGGAAATGCGGATCTTTGTATAT................................................................................ 24 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGGAGAGCTCAGGCAAGCT........................................................................................................................................................................................................................ 19 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTATATCTG............................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCA............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................................................................................................GAAGGCACAAGGACTTTGGAAATGCGG............................................................................................ 27 1 4.00 4.00 - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGGAAGGCACAAGGACTTTGGAAATGC.............................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTATATCT.............................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCT........................................................................................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTATATCTGGAA.......................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTGAGAGCAGGGTCACTTCCCCACa............................................................................................................................................................................... 27 a 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGCGGATCTTTGTATATCTGGAAATGGTC.................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAt........................................................................................................................................................................................................................... 28 t 3.00 0.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTGAGAGCAGGGTCACTTCCCCAC................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGAGCAGGGTCACTTCCCCACGGC............................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGGCACAAGGACTTTGGAAATGCGGA........................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTG............................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGGACACTTCAGCACGCTCCAACCCT.................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCTCT...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - -
.....................................................................................................................................................................TATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGG........................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGAC......... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................CAACCCTAACGGAGGTACTCAAGATGT................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGGA.......................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTATATCTGGA........................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTGGAAATGCGGATCTTTGTATATC............................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCAGGCAAGCTCTGCAGTCACGGCAT......................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GAAGGCACAAGGACTTTGGAAATGCG............................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCTCTGC.................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTATctg............................................................................... 24 ctg 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGGAAGGCACAAGGACTTTGGAAAT................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................ATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGG........................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACTCAAGATGTTCAAGACTTGTTGGT. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGGAAGGCACAAGGACTTTGGAAATGCGa............................................................................................ 30 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAAGGACTTTGGAAATGCGGATCTTT...................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCTTTGTATATCTGGAAATGGTCTGG................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGACTc....... 30 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................GGGAAGGCACAAGGACTTTGGAAATa............................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TAGGAGAGCTCAGGCAAGCT........................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTC................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGGAAGGCACAAGGACTTTGGAAATGCGGA........................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................AGCAGGGTCACTTCCCCACGGCAAGG......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGCAAGCTCTGCAGTCACGGCATG........................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGCAGTCACGGCATGGTGAGAGCcgg............................................................................................................................................................................................. 26 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GTACTCAAGATGTTCAAGA.......... 19 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGAAATGGTCTGGCCCTGGA.......................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................................................................CACAAGGACTTTGGAAATGCGGATC......................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGGACACTTCAGCACGCTCCAACCCTA................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GCAGCCGGAGTGAGAGTGGTGGGTCC......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................AGCAGCCGGAGTGAGAGTGGTGGGTC.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAAGGACTTTGGAAATGCGGATtttt...................................................................................... 26 tttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GGCACAAGGACTTTGGAAATGCGGATC......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................GGGAAGGCACAAGGACTTTGG.................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATGTTCAAGACTTGTTGGTCact 28 act 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................................................................................................GACTTTGGAAATGCGGATCTTTGTATA................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCTatt..................................................................................................................................................................................................................... 29 att 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGG........................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................ATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGGA.......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGGACACTTCAGCACGCTCCAACCC..................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GAGTGAGAGTGGTGGGTCCTCCCCAGt................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AGGACTTTGGAAATGCGGATCTTTGTATA................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TTCAGCACGCTCCAACCCTAACGGAGGTA.......................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................................................................................................................TGGGTGGGAAGGCACAAGGACTTTGGAA.................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGGAGAGCTCAGGCAAGC......................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................GGCAAGCTCTGCAGTCACGGCATGGa...................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TTGTATATCTGGAAATGGTCTGGCCC.............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TCTGCAGTCACGGCATGGTGAGAGCA............................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGAGCAGGGTCACTTCCCCACGG.............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGGCCCTGGACACTTCAGCACGC............................................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGCTAGGAGAGCTCAGGC............................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TATATCTGGAAATGGTCTGGCC............................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGC......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................ACTTTGGAAATGCGGATCTTTGTATATC............................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTATA................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTA................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CAGTCACGGCATGGTGAGAGCAGGG............................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
....TTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCTC....................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................AGTCACGGCATGGTGAGAGCAGG............................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AGGACTTTGGAAATGCGGATCTTTGT.................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGAAATGCGGATCTTTGTATATCTGG............................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGACTT....... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TCTGGAAATGGTCTGGCCCTGGACA........................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TCTTTGTATATCTGGAAATGGTCTGGCC............................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCA............. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TTGGTGCGGCTAGGAtag.................................................................................................................................................................................................................................... 18 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................................................................................................................TGCGGATCTTTGTATATCTGGAAATGG...................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGAC......... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGta.......................................................... 27 ta 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GGAGGTACTCAAGATGTTCAAGACa........ 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GTGCGGCTAGGAGAGCTC................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGTTTGGTGCGGCTAGGAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACGGCATGGTGAGAGCAGGGTCACTTCCCCACGGCAAGGGGAAGAGCAGCCGGAGTGAGAGTGGTGGGTCCTCCCCAGAGGCTGGGTGGGAAGGCACAAGGACTTTGGAAATGCGGATCTTTGTATATCTGGAAATGGTCTGGCCCTGGACACTTCAGCACGCTCCAACCCTAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGACTTGTTGGTC
..................................................((....))...(((.(((((((.......))))))).(((.(((((((.......(((..(((..(((((...)))))..)))...)))....)))))))...))).)))..........................................................................................
..................................................51...........................................................................................................160........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
.................GAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACG............................................................................................................................................................................................................. 28 1 8.00 8.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GACACTTCAGCACGCTCCAACCCTA................................... 25 1 6.00 6.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................GCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACGGCA.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCAAGCTCTGCAGTCACGGCATGGTGA.................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCAC.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AGGACTTTGGAAATGCGGATCTTTGTA................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGAGAGCAGGGTCACTTCCCCACGGCA............................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GGAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACG............................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................AAGGACTTTGGAAATGCGGATCTTTGTA................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACGa............................................................................................................................................................................................................. 29 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACGGCA.......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAAGAC......... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCA............................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACG............................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................AGAGCTCAGGCAAGCTCTGCAGTCACG............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................CTGGACACTTCAGCACGCTCCAACCCTAA.................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAA............ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................TCAGGCAAGCTCTGCAGTCACGGCA.......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCTCTGCAGTCACGGCATGGTGAGAGCA............................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CTTCAGCACGCTCCAACCCTA................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AACCCTAACGGAGGTACTCAAGATGTTCAA............ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TCACTTCCCCACGGCAAGGGGAA..................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCAACCCTAACGGAGGTACTCAAGA................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -