(1)
OTHER.ip
(6)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(42)
TESTES

Sense strand
ACAAGCGGATGGCTGACAGCCTGGCCTCCAAGGTGACCAGGCTTAAATCGGTCAGTGGTGGCCCTCTTCCCTTCCGTGAGATACTTTGGTGGGTGGGGCTGAGAGGGGAGGAAGGAGGCCGTGTGCTGTCTGTGGGCATTGCTGACTGGAGAAGTGCTTCAGGTAATAACTTGGCCTTTTTTTTAGCTTTCTCTGGTAATAGGTACTTTTCAGAGTCGTGGGTAAAATGTAGCTGGTCTGAAGGGAAGGTGGGCACTACTCTCTGTGGCTTTGCTTGACGGTGCCTTCTGTATCCCAACCAGCTGGCTTTGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAACCGTTACTTAGA
................................................................................................................................................................................................................((((((.((...(((........)))))))))))((((.((.(((((((..((...((......))..)).))))))).))...))))........................................................
..........................................................................................................................................................................................................203................................................................................................302................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACC................ 27 1 92.00 92.00 18.00 15.00 11.00 16.00 3.00 9.00 7.00 2.00 - - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGAC................. 26 1 47.00 47.00 5.00 3.00 3.00 4.00 9.00 2.00 1.00 4.00 8.00 2.00 - 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTTTGGACATCGACAGGGACACA....................... 26 1 27.00 27.00 7.00 4.00 7.00 4.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGA............. 30 1 23.00 23.00 - - 1.00 - 3.00 - - - - 1.00 10.00 - - 3.00 - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGA.................. 25 1 21.00 21.00 8.00 3.00 1.00 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGACATCGACAGGGACACAGAGGA.................. 26 1 15.00 15.00 3.00 4.00 1.00 - - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGGACATCGACAGGGACACAGAGG................... 26 1 13.00 13.00 2.00 1.00 1.00 2.00 - - 2.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCA............... 28 1 12.00 12.00 1.00 2.00 - 1.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGACATCGACAGGGACACAGAGG................... 25 1 11.00 11.00 2.00 - - 1.00 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCTCTGTGGCTTTGCTTGACGGT...................................................................... 26 1 11.00 11.00 3.00 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAG.............. 29 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGG................... 24 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGt............. 30 t 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTTTGGACATCGACAGGGACAC........................ 25 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGACATCGACAGGGACACAGAGGAC................. 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTTCAGAGTCGTGGGTAAAATGTAG........................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAAC........... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTTTGGACATCGACAGGGACACAGAG.................... 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGA............. 27 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGCTGGCTTTGGACATCGACAGGGAC.......................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGAa................. 26 a 2.00 21.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAAC........... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAAC........... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACt................ 27 t 2.00 47.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAG.............. 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACATCGACAGGGACACAGAGGACC................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCTCTGTGGCTTTGCTTGACGG....................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GTAAAATGTAGCTGGTCTGAAGGGAAGG....................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TAAAATGTAGCTGGTCTGAAGGGAAGGTG..................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TGGTAATAGGTACTTTTCAGAGTCGT..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACATCGACAGGGACACAGAGGACCA............... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................AAGGGAAGGTGGGCACTACTCTCTGTG..................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TGTAGCTGGTCTGAAGGGAAGGTt..................................................................................................... 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGGCTTTGGACATCGACAGGGACAC........................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTGGACATCGACAGGGACACAGAGG................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TTCAGAGTCGTGGGTAAAATGTAG........................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACATCGACAGGGACACAGAGG................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TCCGTGAGATACTTTGGTGGGTGGGG.............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAAC........... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAAC........... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGAtc................ 27 tc 1.00 21.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAA............ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AAATGTAGCTGGTCTGAAGGGAAGGT...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGA............. 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGACAGGGACACAGAGGACCAGAACC.......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGACATCGACAGGGACACAGAG.................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................GCTGGTCTGAAGGGAAGGTGGGC.................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................CTACTCTCTGTGGCTTTGCTTGACGGT...................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTGGCTTTGCTTGACGGTGCCTTC................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGACATCGACAGGGACACAGAGGACC................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................GTAGCTGGTCTGAgagg........................................................................................................... 17 gagg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACAGGGACACAGAGGACCAGAACCGT........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCTCTGTGGCTTTGCTTGACGGTt..................................................................... 27 t 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCCAAGGTGACCAGGCTTAAATCGctgt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 ctgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTTTGGACATCGACAGGGACACAG...................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGt............. 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACa................ 27 a 1.00 47.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................TGGTCTGAAGGGAAGGTGGGCACTAg............................................................................................. 26 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGACACAGAGGACCAGAACCGTT....... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAACC.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCCAAGGTGACCAGGCTTAAATCGc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGA............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGACAGGGACACAGAGGACCAGAACC.......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................GTAGCTGGTCTGAAGGGt.......................................................................................................... 18 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GTAAAATGTAGCTGGTCTGAAGGGAAG........................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGA..................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGAac................ 27 ac 1.00 21.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAGGGACACAGAGGACCAGAACCGTT....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGACAGGGACACAGAGGACCAGAACa.......... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCTCTGTGGCTTTGCTTGACGGTG..................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCCAAGGTGACCAGGCTTAAATCGct............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAAt........... 32 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AATGTAGCTGGTCTGAAGGGAAGGTG..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGGGAAGGTG..................................................................................................... 15 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ACAAGCGGATGGCTGACAGCCTGGCCTCCAAGGTGACCAGGCTTAAATCGGTCAGTGGTGGCCCTCTTCCCTTCCGTGAGATACTTTGGTGGGTGGGGCTGAGAGGGGAGGAAGGAGGCCGTGTGCTGTCTGTGGGCATTGCTGACTGGAGAAGTGCTTCAGGTAATAACTTGGCCTTTTTTTTAGCTTTCTCTGGTAATAGGTACTTTTCAGAGTCGTGGGTAAAATGTAGCTGGTCTGAAGGGAAGGTGGGCACTACTCTCTGTGGCTTTGCTTGACGGTGCCTTCTGTATCCCAACCAGCTGGCTTTGGACATCGACAGGGACACAGAGGACCAGAACCGTTACTTAGA
................................................................................................................................................................................................................((((((.((...(((........)))))))))))((((.((.(((((((..((...((......))..)).))))))).))...))))........................................................
..........................................................................................................................................................................................................203................................................................................................302................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
..............CAGCCTGGCCTCCAAGGTGAgg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ACTTTTCAGAGTCG...................................................................................................................................... 14 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14