chr7:134913681 134913930 +
(9)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(48)
TESTES

Sense strand
AGCTCAAAGCCTCCAGCCGCACATCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGTGGGAGGGGGTACACGGGGTGGGTAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTCAAGAAAATGGGTCCCCAGTACTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGGGACTGGAAAAACCCTTTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAAATGC
............................................................................(((.......)))....(((((..((((.((....(((....)))...)).)))).........(((((((((.........)))))))))...)))))...........................................................................
............................................................................77...................................................................................................178......................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGT........... 28 1 79.00 79.00 9.00 17.00 18.00 4.00 8.00 5.00 5.00 - 4.00 - - 1.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGG............ 27 1 54.00 54.00 7.00 9.00 8.00 2.00 5.00 1.00 - 1.00 3.00 1.00 2.00 - - - 7.00 - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGTCC......... 30 1 48.00 48.00 3.00 6.00 5.00 2.00 4.00 10.00 1.00 - 4.00 - - - 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - 3.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 -
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGTC.......... 29 1 42.00 42.00 4.00 9.00 9.00 1.00 5.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATC.............. 27 1 33.00 33.00 13.00 1.00 1.00 3.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCC............................................................................ 26 1 21.00 21.00 7.00 3.00 1.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 19.00 19.00 2.00 2.00 1.00 - - - 3.00 1.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCC............................................................................. 25 1 17.00 17.00 10.00 - - 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGGAAAAACCCTTTATGTCGGGCACAGC......................................... 28 1 16.00 16.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - 6.00 - - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCA........................................................................... 27 1 14.00 14.00 - 1.00 7.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGA..... 28 1 13.00 13.00 3.00 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAG......................................................................... 29 1 11.00 11.00 - 2.00 - - - - - 4.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGAG................................................................................................................................................................................................... 25 1 11.00 11.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCA....... 26 1 10.00 10.00 - 5.00 2.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCG............. 28 1 10.00 10.00 1.00 1.00 4.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGG............ 29 1 9.00 9.00 1.00 2.00 2.00 - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................TGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 9.00 9.00 - 1.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................TGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 28 1 8.00 8.00 - 2.00 2.00 - - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGAGG.................................................................................................................................................................................................. 26 1 8.00 8.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGA.................................................................................................................................................................................................... 24 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCAT......................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGT........... 30 1 6.00 6.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAG...... 27 1 6.00 6.00 - - 2.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGAAG........................................................................................ 28 1 5.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAA.......................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................TGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAGG.................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGG........................................................................ 30 1 4.00 4.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGTCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGTG.............................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTCAAG............................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AAGGGACTGGAAAAACCCTTTATGTCGGGC.............................................. 30 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGTCGGGCTTCGCCATGGTGAGG.................................................................................................................................................................................................. 23 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAAATGC 28 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGTC.......... 31 1 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATCG............. 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGA..... 34 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGgc................................................................................................................................................................................................... 27 gc 3.00 5.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTG..................................................................................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGG....................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCAT......................................................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TCGGGCACAGCTCTAGGAA................................. 19 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGATCGGTCCC........ 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGA..... 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATG........................................................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCC............................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAA.... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAAGATCGGTCCCAGAAATGC 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGAG................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAG................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................GTACTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTT..................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CTCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGG............ 30 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAAT................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGAAGG....................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGgcca................................................................................................................................................................................................. 27 gcca 2.00 3.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGt.................................................................................................................................................................................................... 26 t 2.00 5.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATa........................................................................................................................................................................................................ 27 a 2.00 6.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TACTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTA.................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAG........................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCac............................................................................ 26 ac 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCctg........................................................................................................................................................................................................ 27 ctg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATC.............. 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGgcc.................................................................................................................................................................................................. 26 gcc 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TACTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTT..................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGGGA...................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAAA... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCA.......................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATATAA............................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTCAA................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GGGACTGGAAAAACCCTTTATGTCGGGC.............................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGA................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAA.... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGGG....................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGG........................................................................ 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGCTCTGCTGTCGGGCTTCG............................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGCACGTGGTGGGAGAAGTCAAGA.............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAAATG. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAG................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGTCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGt................................................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATAT.............................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCTTTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGT............................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGAT................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGA................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGA.......................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................ATCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCC........................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGT............................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGt.................................................................................................................................................................................................... 24 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGACTGAATAAAAGGGT........................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGCCGCACATCTGCTCTGCTGa...................................................................................................................................................................................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GGGACTGGAAAAACCCTTTATGTCGGGCA............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAAAT.. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGT............................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CTCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGT........... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATg.............. 27 g 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................AGGGTTTCTTTAGGATAAAAGAAGGAGC.................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CAGTACTGGACTGAATAAAAG.............................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCC............................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATA............................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGG........................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................ACACGGGGTGGGTAAAGCAaaa............................................................................................................................................................... 22 aaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGCACGTGGTGGGAGAAGTCAAGAA............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGA................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTCAAGA.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGAA......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGTa.......... 31 a 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAcg......................................................................... 29 cg 1.00 14.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGTGG............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TACTGGACTGAATAAAAGG............................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GACTGAATAAAAGGGTTT......................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGT............................................................................... 23 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGATA............................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TGCTGTCGGGCTTCGCCATGGgg..................................................................................................................................................................................................... 23 gg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AGAAAATGGGTCCCCAGTACTGGACTG...................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......AGCCTCCAGCCGCACATCTGCTCTGC......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGa........................................................................ 30 a 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGT...................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CTAGGAATATAAACAGACTGAAGATC.............. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGAT............... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTCA................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGAT............... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATATA............................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGA................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGGGACTG................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGGGAC..................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACATCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCAT......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAGc.................................................................................................. 27 c 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGTGGG............................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGT........... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGG............ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ACAGACTGAAGATCGGTCCCAGA..... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TATGTCGGGCACAGCTCTAGGAAT................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................GTACTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTT...................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GAGGGGGTACACcaaa............................................................................................................................................................................. 16 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................................CCCCAGTACTGGACTGAATAAAAGGG............................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGGAAAAACCCTTTATGTCGGGCACcgc......................................... 28 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGGAAAAACCCTTTATGTCGGGaac............................................ 25 aac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTATGTCGGGCACAGCTCTAGGcat................................ 26 cat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TTCTTTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTC.............................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TAGGAATATAAACAGACTGAAGATagg............ 27 agg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTCcag............................................................................................................................................... 26 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATAAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGA.......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGAAG........................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CGGGCACAGCTCTAGGAATATAAACAGA....................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGTCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGT............................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGACTGAATAAAAGGGTTT......................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATATAAAC.......................... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGTCGGGCACAGCTCTAGGAATATAAACt......................... 29 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCagtc.......... 31 agtc 1.00 33.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGGGACT.................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTATGTCGGGCACAGCTCTAGGA.................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CAGCCGCACATCTGCTCTGCTGTCGGG.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TACTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTT...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATG........................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CACAGCTCTAGGAATATAAACAGACTG.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCC............................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGt..... 28 t 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................................................GGGTTTCTTTAGGATAAAAGAAGGAG..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGGGTAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTC.................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATcgc...................................................................................................................................................................................................... 27 cgc 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................AATATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAG...... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CATCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGC............................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GGAGCTAAGTCCCAAGGGACTGt.................................................................. 23 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GTCGGGCACAGCTCTAGGt.................................. 19 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGaa........... 30 aa 1.00 10.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................GTACTGGACTGAATAAAAGG............................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGCTCTAGGAATATAAACAGACTGAAG................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ATGTCGGGCACAGCT........................................ 15 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TATAAACAGACTGAAGA................ 17 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TTCTTTAGGATAAAAG........................................................................................... 16 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGCTCAAAGCCTCCAGCCGCACATCTGCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGTGGGAGGGGGTACACGGGGTGGGTAAAGCACGTGGTGGGAGAAGTCAAGAAAATGGGTCCCCAGTACTGGACTGAATAAAAGGGTTTCTTTAGGATAAAAGAAGGAGCTAAGTCCCAAGGGACTGGAAAAACCCTTTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATATAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAAATGC
............................................................................(((.......)))....(((((..((((.((....(((....)))...)).)))).........(((((((((.........)))))))))...)))))...........................................................................
............................................................................77...................................................................................................178......................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..................................................................................................................................................................................................TATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATATA............................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TCAAAGCCTCCAGCCGCACATCTGCT............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCCAGCCGCACATCTGCTCTGCTG....................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................ACCCTTTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAA................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CCGCACATCTGCTCTGCTGTCG.................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CCGCACATCTGCTCTGCT........................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GCTCTGCTGTCGGGCTTCGCCATGGTGA.................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CCTTTATGTCGGGCACAGCTCTAGGAATA............................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GTCGGGCTTCGCCATGGTGAGGGGTGGG............................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CACATCTGCTCTGCTGTCGGGC................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TAAACAGACTGAAGATCGGTCCCAGAA.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GTCGGGCACAGCTCTAGGAATATAAACAGA....................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGCACGTGGTGGGAGAAGTCAAGAAAA........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CCCAAGGGACTGGAAcga................................................................ 18 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...............................................................................................................................................................................................................GCTCTAGGAATATAAACAGACTGAAGAT............... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GCACAGCTCTAGGAATATAAACAGACT..................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CAGCTCTAGGAATATAAACAGACTGA................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGCCGCACATCTGCTCTGCTG....................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -