(1)
OTHER.ip
(4)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(32)
TESTES

Sense strand
GAGACTTGAGAGCTCTCCCGGAAGGTTTCCCTGAGGGGATAGGAGCAGGTCAGCTGAGATGCCACGTGTTGCTGTGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCAGCAGTTGAGGAGACTCCCTTGTTGGGAGCAGGTGTAGGGCAGATAATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAGGAGCGCTAATACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAACTGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGTGGCAGAACTTCGCCTA
....................................................................................................................(((((.(((...((..(((.......))).))....))))))))..........................................................................................
..................................................................................................................115.........................................................175.........................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGA............................................................................... 25 1 46.00 46.00 9.00 15.00 8.00 - 2.00 1.00 2.00 - 2.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAATGAAGACCACGAGGACAGGCTGG................................................................................. 26 1 21.00 21.00 7.00 1.00 3.00 - 2.00 2.00 1.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAG.............................................................................. 26 1 10.00 10.00 4.00 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGGGGTGGCAGAACTTCGCCTA 26 1 9.00 9.00 2.00 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................TGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCAGt.................................................................................................................................................... 28 t 8.00 1.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GATAATGAAGACCACGAGGACAGGCTG.................................................................................. 27 1 7.00 7.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCAGCAGT................................................................................................................................................. 31 1 7.00 7.00 - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAACTGA........................................ 29 1 7.00 7.00 1.00 - - - - - - 2.00 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AGATAATGAAGACCACGAGGACAGGCT................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGA............................................................................... 27 1 5.00 5.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGGCAAACTGAGAGTCGAGGCCGACTG........................ 27 1 5.00 5.00 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TCATGTGGAGCAGCAGCAGTTGAGGA........................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TAATACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAAC........................................... 29 1 5.00 5.00 - - - - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGG.................... 23 1 5.00 5.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGGCAAACTGAGAGTCGAGGCCGACTGC....................... 28 1 4.00 4.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAa.............................................................................. 26 a 4.00 46.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGTTGGGAGCAGGTGTAGGGCAGATAA........................................................................................................ 27 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAACTGAG....................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTATCTGCCTAGGGCAAACTGAGAGTC................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATCTGCCTAGGGCAAACTGAGAGTC................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGG................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGG................................................................................ 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGG................................................................................. 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAG.............................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAATGAAGACCACGAGGACAGGCTG.................................................................................. 25 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GGGCAGATAATGAAGACCACGAGGACA....................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGT................ 27 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGGGGTGGCAGAACTTCGCCTAt 27 t 2.00 9.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAGG............................................................................. 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TAATACTACTTTATCTGCCTAG.................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TAATACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAA............................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GAAGACCACGAGGACAGGCTGGGA............................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TAGGAGCAGGTCAGCTGAGATGCCAC......................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGG................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CAGATAATGAAGACCACGAGGACAGGCT................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTG.................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGt............................................................................... 25 t 2.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGTTGGGAGCAGGTGTAGGGCAGATA......................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GACCACGAGGACAGGCTGGGAGGAGC.......................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CAGATAATGAAGACCACGAGGACAGGC.................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCA...................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAGa............................................................................. 27 a 2.00 10.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGaa............................................................................... 25 aa 2.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAt.............................................................................. 26 t 2.00 46.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAatt............................................................................ 28 att 1.00 46.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGTG............... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AATGAAGACCACGAGGACAGGCTG.................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGt................................................................................. 23 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCAG..................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGG................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CTAGGGCAAACTGAGAGTCGAGGCCGAC.......................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGGGAGCAGGTGTAGGGCAGATAATG...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGCTGGGAGGAGCGCTAATACTACTTTAT.......................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CTAGGGCAAACTGAGAGTCGAGGCCGA........................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGGCAAACTGAGAGTCGAGGCa............................. 24 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCAGC.................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGTt............... 28 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GGGCAGATAATGAAGACCACGAGGACAG...................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAACTG......................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAGGGCAGATAATGAAGACCACGAGGAC........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................................................................AATGAAGACCACGAGGACAG...................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCAG..................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGGAGGAGCGCTAATACTACTTTATC......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGTGGAGCAGCAGCAGTTGAGGAGAC........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGgg.............................................................................. 26 gg 1.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGGG................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGGGGTGGCAGAAC........ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCGACTGCcgg.................... 23 cgg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGGGGTGGCAGAACTTCGCCTt 26 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGTGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGC....................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAGGGCAGATAATGAAGACCACGAGGA......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGTGG.............. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GATAATGAAGACCACGAGGACAGGCTGG................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GAGGACAGGCTGGGAGGAGCGCTAA..................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGTGGAGCAGCAGCAGTTGAGGAGA......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATCTGCCTAGGGCAAACTGAGAG..................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ACTGCAGGGGGTGGCAGAACTTCGCCTA 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................GGTGGCAGAACTTCGtac. 18 tac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAATGAAGACCACGAGGACAGGCTGt................................................................................. 26 t 1.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GGTGTAGGGCAGATAATGAAGACCACa............................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGaa............................................................................... 28 aa 1.00 21.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................GGGAGCAGGTGTAGGGCAGATAA........................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TCCCTTGTTGGGAGCAGGTGTAGGGCAGATAA........................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................AATACTACTTTATCTGCCTAG.................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.......................................................................................................................TGTTGGGAGCAGGTGTAGGGCAGAT.......................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................ATACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAA............................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................................................................................TTTATCTGCCTAGGGCAAACTGAGAGT.................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................................................................................................................AGACCACGAGGACAGGCTGG................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGAGATGCCACGTGTTGCTGTGAA............................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGGCAAACTGAGAGTCGAGGCt............................. 22 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CAGCTGAGATGCCACGTGTTGCTGTGA............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCaagg......................... 18 aagg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCTGCCTAGGGCAAACTGAGAGTCGA................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAATGAAGACCACGAGGACAGGC.................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................AGGGGGTGGCAGAACTTCGCC.. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AGGGCAGATAATGAAGACCACGAGGACAG...................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TAATACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAACT.......................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GACCACGAGGACAGGCTGGGAGGAG........................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGG................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ATGAAGACCACGAGGACAGGCT................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGA............................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGg................ 27 g 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTGCTGTGAAGAGCCAGTCATGTGGAGC.......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGGCTGGGAGGAGCGCTAATACTACTTT............................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...................................................................................AGTCATGTGGAGCAGCAGCAGTTGAGG............................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGTGt.............. 27 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTGTTGGGAGCAGGT..................................................................................................................... 15 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17

Antisense strand
GAGACTTGAGAGCTCTCCCGGAAGGTTTCCCTGAGGGGATAGGAGCAGGTCAGCTGAGATGCCACGTGTTGCTGTGAAGAGCCAGTCATGTGGAGCAGCAGCAGTTGAGGAGACTCCCTTGTTGGGAGCAGGTGTAGGGCAGATAATGAAGACCACGAGGACAGGCTGGGAGGAGCGCTAATACTACTTTATCTGCCTAGGGCAAACTGAGAGTCGAGGCCGACTGCAGGGGGTGGCAGAACTTCGCCTA
....................................................................................................................(((((.(((...((..(((.......))).))....))))))))..........................................................................................
..................................................................................................................115.........................................................175.........................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
...........................................................TGCCACGTGTTGCTGTGAAGAGCCAG..................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GCCACGTGTTGCTGTGAAGAGCCAGTCA.................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTATCTGCCTAGGGCAAAC........................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................TGCCACGTGTTGCTGTGAAGAGCCAGTCA.................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -