| Gene: 6430604K15Rik | ID: uc009jvd.1_intron_0_0_chr7_134518213_r.3p | SPECIES: mm9 |
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(31) TESTES |
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| .....TGGGATTAAAGGTGTGCGCCACgt............................................................................................................................................................................................................................. | 24 | gt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................................TGCTGCATTTGGACATCTGCACACTGCAC...................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TCTTTATGCTGCATTTGGACATCTGC............................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....TGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCAAtta......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | tta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................................................GAAGTCAGAGTCTGAGCTTTTTTCATGGT............................................................ | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................AGGAAAGGAAGAGACCAAGAGAAGAGAC....... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................GTCTGAGCTTTTTTCATGGTCTCCCAGC.................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................AAGAGACCAAGAGAAGAGACTGAAGCA | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TCCCAGCAGATTGCAGGCACGAGAAG................................. | 26 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGGGGCTGTGGAAATTAAGGGGCAGTA......................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................AGGAAAGGAAGAGACCAAGAGAAGAG......... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................TGCAGGCACGAGAAGGAAAGGAAGAG...................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................TAAGGGGCAGTAGAAGTCAGAGTCTG........................................................................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................ATTGCAGGCACGAGAAGGAAAGGAAGA....................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TGTGGAAATTAAGGGGCAGTAGAAGa.................................................................................... | 26 | a | 0.33 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |
| .........................................................................................................................................................................................................TTGCAGGCACGAGAAGGAAAGGAAGAGA..................... | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGATTGCAGGCACGAGAAGGAAAGG........................... | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................TAAGGGGCAGTAGAAGTCAGAGTCT............................................................................ | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................CACGAGAAGGAAAGGAAGAGACCAAG................ | 26 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................GGCACGAGAAGGAAAGGAAGAGACCAA................. | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TGGAAATTAAGGGGCAGTAGAAGTC................................................................................... | 25 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TGTGGAAATTAAGGGGCAGTAGAAGTCA.................................................................................. | 28 | 3 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................GCAGATTGCAGGCACGAGAAGGAAAGG........................... | 27 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGATTGCAGGCACGAGAAGGAAAGGt.......................... | 27 | t | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TCCCAGCAGATTGCAGGCACGAGAAGG................................ | 27 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................ATGGTCTCCCAGCAGATTGCAGGCAC....................................... | 26 | 4 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TCATGGTCTCCCAGCAGA................................................. | 18 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| AGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCAAGCCGAGGCCCAGACCCCTTTCTTTATGCTGCATTTGGACATCTGCACACTGCACATGCTCAGATGCTGTGACATCTCCACTCCTGTGTCCAGTCTGTCCCCTTGTGGGGCTGTGGAAATTAAGGGGCAGTAGAAGTCAGAGTCTGAGCTTTTTTCATGGTCTCCCAGCAGATTGCAGGCACGAGAAGGAAAGGAAGAGACCAAGAGAAGAGACTGAAGCA |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
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| ...............................................................................................TGTGACATCTCCACTCCTGTGTCCAt................................................................................................................................. | 26 | t | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |