(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(31)
TESTES

Sense strand
TCCAGTCCCGCTTCTTTGCCTCCCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGCAGGCGCCGACCAGCGACCGCGGCCCACACGGCGCCTTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGGCGCCCCCACCCACGCCCCAGGCCCCGGCGGCCGAGCCCCT
..........................................................((((((.(((.....))).(((((......))).)).))))))........................................................................
..................................................51..................................................103....................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGC................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...............................................................................................................TTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGGCGCCCC.................................. 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGCAG............................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGG................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTCTTTGCCTCCCAGGGCTGCGCCCAGA...................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGG.................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGta.................................................................................................. 25 ta 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGCA................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TTCCAGGTGAGTAGGGGCCGGGCCGt....................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGt.................................................................................................. 25 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGGCGCC.................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGt................................................................................................. 26 t 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TAGGGGCCGGGCCGGGCGGG.................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CAGAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGGG................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCA............................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....................................AGAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGGGCCGGG........................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GGGGCCGGGCCGGGCGGGCAG............................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TTCTTTGCCTCCCAGGGCTGCGCCCAG....................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGt........................................ 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTAGGGGCCGGGCCGG....................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGC..................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCAGAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGGGC............................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGGCGat.................................... 26 at 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGGGCCGG............................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGGCGCCCt.................................. 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CCAGGCCCCGGCGGCCGAG..... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................AGAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGGGCC.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....................................GAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGG................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............TCTTTGCCTCCCAGGGCTGCGCCCAGA...................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................CCCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAG........................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCG.................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GTCCCGCTTCTTTGCCTCCC..................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CAGTCCCGCTTCTTTGCCTCCCAGGGCTGa............................................................................................................................................. 30 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CCTCCCAGGGCTGCGCCCA........................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGt................................................................................................... 24 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGGCGC..................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CCGACCAGCGACCGCGGC.......................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGtt.................................................................................................. 25 tt 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGCga............................................................................................... 28 ga 1.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TTCCAGGTGAGTAGGGGCCGGGCCGG....................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGAGT..................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CGCCCCAGGCCCCGGCGGCCGAGCCCCT 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGTCTCCGCAGGCCGCGCC.......................................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGta................................................................................................. 25 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......CCGCTTCTTTGCCTCCCAGGGCTGCGCCC......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTAGGGGCCGGGCCGGGC..................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGac................................................................................................ 27 ac 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................AGGGGCCGGGCCGGGCGGG.................................................................................................. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCCAGAGTCCATTCCAG........................................................................................................................... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GGGGCCGGGCCGGGCGGG.................................................................................................. 18 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17

Antisense strand
TCCAGTCCCGCTTCTTTGCCTCCCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGAGTAGGGGCCGGGCCGGGCGGGCAGGCGCCGACCAGCGACCGCGGCCCACACGGCGCCTTGTCTCCGCAGGCCGCGCCGGCGCCCCCACCCACGCCCCAGGCCCCGGCGGCCGAGCCCCT
..........................................................((((((.(((.....))).(((((......))).)).))))))........................................................................
..................................................51..................................................103....................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
...............................CGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGAGTA.................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCCCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCA............................................................................................................................ 29 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................GCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGA....................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................CCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCA............................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCA............................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GCCCAGAGTCCATTCCAGGTGAGTA.................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................CAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCA............................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAa............................................................................................................................ 24 a 3.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGA....................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCCCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCA................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CTGCGCCCAGAGTCCATT............................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AGTCCCGCTTCTTTGCCTC....................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAtg............................................................................................................................ 27 tg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCCAGAGTCCATTCCAGGTGAGTA.................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................CCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAc............................................................................................................................ 28 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAt............................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CTTTGCCTCCCAGGGCTGCGCCCAGA...................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................CAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTG........................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCCAGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCC............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AGTCCCGCTTCTTTGCCTCCCAagag.................................................................................................................................................... 26 agag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CTGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGA....................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGGGCTGCGCCCAGAGTCCATTCCAGGTGAa....................................................................................................................... 31 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -