| Gene: Aldoa | ID: uc009jst.1_intron_3_0_chr7_133939815_r | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(12) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(7) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(42) TESTES |
| TCATGGAAAATGCCAATGTTCTGGCCCGTTATGCCAGCATCTGCCAGCAGGTGGGATTGGACTACTTCCTAACACATTGATGCAGTGTGGGCTAGCTTTCTGTCTATCTGCCAGGATATCTGCCTCCCTCAGAGCAGCTGCTCTCAATACCCGCTGTGCGTCAGGCTCTTGAGTGGAGGCCCTCTGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGTACAGGCAGATTGATAGGATTGCTTGTCCCCTGTAATCTGCTGAGGCCTTTGAAGCCTGGGTCTCTGTCATCAAGTTAATGGTGAGGAGGCTCCTAGTCAGGAGGCCTTGCCTCATTACCCTGTCCCTCCCACAGAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGCCTGAAATTCTCCCTGATGGGGACCA ...................................................(((((..........))))).(((((((...)))))))..........((((.(((((((((........((((((((((((((.((.((...........))...)).....))))).))).))))))(((((((...))))))))))))...)))).)))).................................................................................................................................................................................... ..................................................51.................................................................................................................................................................214.................................................................................................................................................................................. |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................................................GTGGGATTGGACTACTTCCTAACACATTGATGCAGTGTGGGCTAGCTTTCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 52 | 1 | 258.00 | 258.00 | 196.00 | 62.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................TGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGT........................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 17.00 | 17.00 | - | - | 6.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................TGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTG......................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | - | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................TGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGTA....................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGGGATTGGACTACTTCCTAACAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGGGATTGGACTACTTCCTAACACA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................TGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGTAC...................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGCCTGGGTCTCTGTCATCAAGT............................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................TCTGCCAGGATATCTGCCTCCCTCAGAGC................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................TAGCTTTCTGTCTATCTGCCAGGATA.................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGCCTGGGTCTCTGTCATCAAGTT............................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................TCTGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTG......................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TATCTGCCAGGATATCTGCCTCCCTC........................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................CTATCTGCCAGGATATCTGCCTCCCTC........................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TGGAAAATGCCAATGTTCTGGCCCGTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 3 | 1.67 | 1.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGCCTG...................... | 29 | 5 | 1.60 | 1.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCTCAATACCCGCTGTGCGTCAGGttc.................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | ttc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TATCTGCCAGGATATCTGCCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................TATCTGCCAGGATATCTGCCTCCCT......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGGGATTGGACTACTTCC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................TCTGCCAGGATATCTGCCTCCCTCAG...................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCCTGAAATTCTCCCTGATGGGGACt. | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................ATGTAGAGGTGGCAACAGGTGTACAGG................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................TTGCTTGTCCCCTGTAATCTGCTGAGGCCT........................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................TGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGggt........................................................................................................................................................................................ | 26 | ggt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................CAATACCCGCTGTGCGTCAGGCTCTT................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................TGTAATCTGCTGAGGCCTTTGAAGCCTGGGT........................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAAGCCTGGGTCTCTGTCATCAAG.............................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TACCCGCTGTGCGTCAGGCTCTTGAG............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................CAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGTA....................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCATCAAGTTAATGGTGAGGAGGCT............................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................GCAGTGTGGGCTAGCTTTCTGTCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................GGCCCGTTATGCCAGCATCTGCCAcca......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | cca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGGGATTGGACTACTTCCTAACACATTGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGGGATTGGACTACTTCCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................GGCAGATTGATAGGATTGCTTGTCCCCTGTA...................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGT........................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................TGATAGGATTGCTTGTCCCCTGTAATC................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGCTCTCAATACCCGCTGTGCGTCAGGCT................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................GCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGTA....................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATTACCCTGTCCCTggtt..................................................... | 19 | ggtt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................TCTGCCAGGATATCTGCCTCCCTC........................................................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCTCAATACCCGCTGTGCGTCAGGCT................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................CACATTGATGCAGTGTGGGCTAGCTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................TGCAATGTAGAGGTGGCAACAGatgt........................................................................................................................................................................................ | 26 | atgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TACCCGCTGTGCGTCAGGCTCTTGAGT............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................GCTTTCTGTCTATCTGCCAGaa...................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................TGTAATCTGCTGAGGCCTTTGAAGC................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................TGTAGAGGTGGCAACAGGTGTACAGG................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................TGAGTGGAGGCCCTCTGCAATGTAGA....................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................TGCGTCAGGCTCTTGAGTGGAGGCCC.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................CTGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGT........................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGAGCCTGAAATTCTCCCTGATGGGGACC. | 32 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGCATTGTACCCATTGTGGA........................... | 22 | 7 | 0.57 | 0.57 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.57 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGGGATTGGACTACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGCC........................ | 28 | 6 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCATTGTACCCATTGTGGAGCC........................ | 23 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCCTGAAATTCTCCCTGATGGGGACC. | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGCC........................ | 29 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGC......................... | 28 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGC......................... | 27 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTACCCATTGTGGAGCCTGAAATTC................ | 27 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGAGCCTGAAATTCTCCCTGATG....... | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGGCATTGTACCCATTGTGGAGCCT....................... | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGAGCCTGAAATTCTCCCTGATGG...... | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - |
| ..........TGCCAATGTTCTGGCCCGTT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGGCATTGTACCCATTGTGGAG.......................... | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACCCATTGTGGAGCCTGA..................... | 19 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGC......................... | 26 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCATTGTACCCATTGTGGAGCCTG...................... | 26 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATTGTACCCATTGTGGAGCCTGA..................... | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCATTGTACCCATTGTGGAGC......................... | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGCCTGAAATTCT............... | 16 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 |
| TCATGGAAAATGCCAATGTTCTGGCCCGTTATGCCAGCATCTGCCAGCAGGTGGGATTGGACTACTTCCTAACACATTGATGCAGTGTGGGCTAGCTTTCTGTCTATCTGCCAGGATATCTGCCTCCCTCAGAGCAGCTGCTCTCAATACCCGCTGTGCGTCAGGCTCTTGAGTGGAGGCCCTCTGCAATGTAGAGGTGGCAACAGGTGTACAGGCAGATTGATAGGATTGCTTGTCCCCTGTAATCTGCTGAGGCCTTTGAAGCCTGGGTCTCTGTCATCAAGTTAATGGTGAGGAGGCTCCTAGTCAGGAGGCCTTGCCTCATTACCCTGTCCCTCCCACAGAATGGCATTGTACCCATTGTGGAGCCTGAAATTCTCCCTGATGGGGACCA ...................................................(((((..........))))).(((((((...)))))))..........((((.(((((((((........((((((((((((((.((.((...........))...)).....))))).))).))))))(((((((...))))))))))))...)))).)))).................................................................................................................................................................................... ..................................................51.................................................................................................................................................................214.................................................................................................................................................................................. |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................CAGCAGGTGGGATTGGACTACTTCCTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | - | - | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TGCCAGCAGGTGGGATTGGACTACTTCCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACCCTGTCCCTCCCACAGAATGGCA........................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |