| Gene: Vwa3a | ID: uc009jna.1_intron_22_0_chr7_127935258_f.3p | SPECIES: mm9 |
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|
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(12) OTHER.mut |
(6) OVARY |
(4) PIWI.ip |
(32) TESTES |
| CCATGTCCAGGAGACATCAGGACTTAGTGATGGTAGCTCCAGCTTTCACTGGTCCAGACGAGGCCAAGGCACCTGAGATGGGAGGCAGGAGCCTGAGATTCCCAATGTCTAGGGTAGATCTTAGCTGAAATCGATGAAGCACTGTAGCTTCATCAATGGGACCTACAGAGTTGCCGAACCAACACTCAAATGTCTTCCAGCTGCAGCCCAACCTGAGAAAGAAGGGACGGTGGAACAGAGGATGAAGACC ....................................................................................................((((....((((((....))))))........((((((((......))))))))..)))).........((((......))))................................................................... ....................................................................................................101................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR037896(GSM510432) ovary_rep1. (ovary) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTct................................................................................................... | 19 | ct | 10927.00 | 2726.67 | 2540.33 | 1286.67 | 1222.33 | 2293.67 | 2133.67 | 97.33 | 91.00 | 503.00 | 272.33 | 193.67 | 107.67 | 49.67 | 2.00 | 2.33 | 20.33 | 27.67 | 28.67 | 19.33 | - | 2.67 | 10.67 | 5.33 | 6.00 | 3.00 | 1.67 | 1.33 | 1.67 | 0.67 | 0.33 | 1.00 | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTct................................................................................................... | 16 | ct | 7596.00 | 0.00 | 3026.00 | 2321.00 | 1722.00 | - | - | - | - | - | 307.00 | 220.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTct................................................................................................... | 17 | ct | 6116.83 | 397.17 | 1018.17 | 852.83 | 1151.67 | 1763.83 | 367.50 | 15.17 | 506.33 | 53.33 | 200.17 | 176.83 | - | - | 5.67 | 4.50 | - | - | - | - | 0.83 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCT..................................................................................................... | 17 | 3 | 2726.67 | 2726.67 | 152.00 | 364.67 | 84.33 | 61.33 | 457.33 | 1498.00 | 5.00 | 34.33 | 22.33 | 25.67 | - | - | 6.33 | 15.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctt.................................................................................................. | 20 | ctt | 1339.00 | 2726.67 | 403.33 | 210.33 | 206.33 | 160.33 | 203.67 | 0.33 | 7.33 | 40.00 | 38.00 | 25.33 | 7.00 | 7.67 | - | - | 4.67 | 6.00 | 6.67 | 3.00 | - | 0.33 | 1.00 | 2.00 | 1.67 | 0.33 | 1.33 | - | 1.00 | 1.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctt.................................................................................................. | 17 | ctt | 1243.00 | 0.00 | 487.00 | 369.00 | 296.00 | - | - | - | - | - | 54.00 | 37.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTct................................................................................................... | 18 | ct | 906.75 | 161.50 | 232.75 | 126.25 | 116.75 | 107.50 | 17.75 | 12.50 | 25.25 | 43.75 | 27.00 | 19.00 | 68.50 | 30.75 | 3.75 | 6.25 | 16.25 | 9.00 | 8.25 | 9.25 | - | 9.25 | 4.00 | 3.25 | 2.50 | 2.00 | - | 2.00 | - | 0.75 | 0.75 | 0.50 | 0.50 | 0.25 | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctt.................................................................................................. | 18 | ctt | 685.17 | 397.17 | 136.50 | 115.17 | 167.50 | 111.33 | 53.50 | - | 26.17 | 3.33 | 26.33 | 23.33 | 12.33 | 4.00 | - | 0.83 | 1.17 | 1.00 | 0.33 | 0.83 | 0.17 | 0.17 | 0.50 | - | - | - | 0.17 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTct................................................................................................... | 22 | ct | 676.00 | 147.00 | - | - | - | 12.00 | 20.00 | 100.00 | 395.00 | 124.00 | - | - | - | - | 14.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCT..................................................................................................... | 15 | 6 | 397.17 | 397.17 | 31.67 | 96.33 | 39.83 | 3.67 | 131.17 | 4.17 | 5.83 | 40.67 | 9.67 | 9.83 | - | - | 3.83 | 19.67 | - | - | - | - | 0.83 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTT.................................................................................................... | 18 | 1 | 370.00 | 370.00 | 68.00 | 113.00 | 32.00 | 18.00 | 13.00 | 39.00 | - | 65.00 | 12.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTc.................................................................................................... | 21 | c | 369.00 | 147.00 | 1.00 | - | - | 105.00 | 9.00 | 67.00 | 11.00 | 121.00 | - | - | - | - | 32.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | 18.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTt................................................................................................... | 17 | t | 245.00 | 199.00 | 43.00 | 73.00 | 38.00 | 22.00 | 35.00 | - | 8.00 | 2.00 | 10.00 | 14.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcttt................................................................................................. | 21 | cttt | 242.67 | 2726.67 | 91.33 | 55.00 | 50.00 | 10.67 | 14.67 | - | 0.67 | 0.67 | 7.00 | 6.67 | 0.33 | 1.00 | - | - | 1.00 | 0.67 | 1.00 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTT.................................................................................................... | 16 | 1 | 199.00 | 199.00 | 33.00 | 59.00 | 23.00 | 6.00 | 48.00 | 1.00 | 8.00 | 3.00 | 10.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcttt................................................................................................. | 18 | cttt | 176.00 | 0.00 | 54.00 | 53.00 | 37.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | 6.00 | 15.00 | 5.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTa.................................................................................................... | 18 | a | 172.33 | 2726.67 | 29.67 | 55.67 | 13.33 | 16.00 | 39.33 | 0.33 | 0.67 | 4.33 | 5.00 | 3.33 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | 1.00 | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTca................................................................................................... | 22 | ca | 162.00 | 147.00 | - | - | - | - | 18.00 | 68.00 | 43.00 | 24.00 | - | - | - | - | 2.00 | 5.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCT..................................................................................................... | 16 | 4 | 161.50 | 161.50 | 21.75 | 71.50 | 18.50 | 9.75 | 6.50 | 4.00 | 4.50 | 16.75 | 2.25 | 2.75 | - | - | - | 3.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcta.................................................................................................. | 20 | cta | 151.33 | 2726.67 | 37.33 | 28.67 | 21.00 | 21.00 | 32.00 | 0.67 | - | 0.67 | 3.00 | 2.67 | 0.67 | 1.00 | - | - | 0.33 | - | - | 1.33 | - | - | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCT..................................................................................................... | 20 | 1 | 147.00 | 147.00 | - | - | - | 4.00 | 12.00 | 44.00 | 26.00 | 31.00 | - | - | - | - | 16.00 | 13.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcttt................................................................................................. | 19 | cttt | 145.67 | 397.17 | 33.17 | 35.83 | 42.17 | 4.33 | 3.17 | 0.50 | 11.67 | - | 6.17 | 6.17 | 1.00 | 0.83 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcat.................................................................................................. | 20 | cat | 136.67 | 2726.67 | 52.00 | 32.00 | 27.33 | 6.33 | 2.00 | - | 5.00 | - | 6.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTt................................................................................................... | 19 | t | 121.00 | 370.00 | 32.00 | 4.00 | 2.00 | 31.00 | 35.00 | 1.00 | - | 10.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctt.................................................................................................. | 19 | ctt | 96.50 | 161.50 | 22.25 | 11.50 | 12.25 | 6.50 | 5.75 | 0.75 | 0.75 | 7.25 | 4.00 | 2.00 | 8.25 | 5.75 | - | - | 3.50 | 0.50 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | 0.25 | - | 0.50 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcta.................................................................................................. | 17 | cta | 91.00 | 0.00 | 19.00 | 46.00 | 19.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcta.................................................................................................. | 18 | cta | 85.67 | 397.17 | 7.17 | 10.17 | 8.83 | 45.67 | 5.33 | 0.33 | 0.33 | 1.00 | 2.00 | 1.83 | 1.67 | 0.50 | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcaa.................................................................................................. | 20 | caa | 85.00 | 2726.67 | 20.67 | 17.00 | 7.00 | 15.33 | 18.33 | - | - | 0.33 | 3.67 | 1.33 | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTtt.................................................................................................. | 18 | tt | 85.00 | 199.00 | 14.00 | 11.00 | 12.00 | 16.00 | 17.00 | - | 2.00 | 1.00 | 3.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctat................................................................................................. | 18 | ctat | 64.00 | 0.00 | 7.00 | 41.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGC...................................................................................................... | 16 | 3 | 60.67 | 60.67 | 5.00 | 8.67 | 4.67 | 7.00 | 11.67 | 20.33 | - | 1.67 | 1.00 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctta................................................................................................. | 21 | ctta | 56.00 | 2726.67 | 21.33 | 9.33 | 9.67 | 4.33 | 5.67 | - | - | - | 1.67 | 1.67 | 0.33 | 0.67 | - | - | 0.33 | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcat.................................................................................................. | 18 | cat | 47.67 | 397.17 | 13.50 | 11.50 | 11.83 | 2.50 | 1.33 | - | 1.00 | 0.17 | 2.17 | 2.00 | 1.33 | - | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTctt.................................................................................................. | 23 | ctt | 47.00 | 147.00 | - | - | - | 4.00 | 1.00 | 1.00 | 26.00 | 14.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctat................................................................................................. | 21 | ctat | 42.33 | 2726.67 | 7.67 | 17.00 | 8.33 | 3.33 | 4.00 | - | - | - | 0.67 | 0.33 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctta................................................................................................. | 18 | ctta | 39.00 | 0.00 | 9.00 | 19.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTT.................................................................................................... | 17 | 1 | 38.00 | 38.00 | 6.00 | 12.00 | 5.00 | 13.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTaa................................................................................................... | 19 | aa | 34.33 | 2726.67 | 4.00 | 16.00 | 2.67 | 3.67 | 5.33 | - | - | - | 0.33 | 0.33 | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTat................................................................................................... | 19 | at | 34.00 | 2726.67 | 8.33 | 12.00 | 2.33 | 2.67 | 4.67 | 0.33 | - | 0.67 | 0.67 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcc................................................................................................... | 19 | cc | 33.33 | 2726.67 | 3.33 | 2.67 | 3.00 | 11.33 | 8.67 | 0.33 | - | 1.00 | 0.33 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTa................................................................................................... | 17 | a | 27.00 | 199.00 | - | 7.00 | - | 13.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTtt.................................................................................................. | 20 | tt | 27.00 | 370.00 | 10.00 | 1.00 | 2.00 | - | 10.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcg................................................................................................... | 19 | cg | 24.00 | 2726.67 | 3.33 | 4.67 | 2.67 | 9.33 | 2.00 | - | 0.33 | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAtctc.................................................................................................... | 18 | tctc | 24.00 | 0.00 | 3.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 6.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctta................................................................................................. | 19 | ctta | 22.67 | 397.17 | 3.33 | 4.50 | 3.50 | 6.17 | 1.17 | 0.17 | 1.17 | 0.50 | 0.17 | 0.67 | 0.50 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctaa................................................................................................. | 21 | ctaa | 22.00 | 2726.67 | 7.00 | 3.00 | 2.67 | 4.00 | 3.67 | - | - | - | - | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcat.................................................................................................. | 19 | cat | 21.75 | 161.50 | 6.00 | 4.75 | 2.25 | 0.50 | - | - | 0.25 | 4.25 | 0.25 | 0.25 | 1.50 | 0.50 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcta.................................................................................................. | 19 | cta | 21.00 | 161.50 | 5.25 | 6.00 | 2.75 | 4.00 | - | - | - | 0.50 | 0.25 | 0.75 | - | 0.75 | - | - | 0.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGC...................................................................................................... | 19 | 1 | 21.00 | 21.00 | - | - | - | 2.00 | - | 4.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 5.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTa.................................................................................................... | 17 | a | 19.75 | 161.50 | 2.50 | 8.25 | 1.50 | 4.50 | 0.25 | - | - | 1.50 | 1.00 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcaa.................................................................................................. | 18 | caa | 19.33 | 397.17 | 2.00 | 1.83 | 1.33 | 9.67 | 2.67 | - | 0.33 | - | 0.17 | 0.50 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTt................................................................................................... | 18 | t | 19.00 | 38.00 | - | 1.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | 4.00 | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTa................................................................................................... | 19 | a | 18.00 | 370.00 | 2.00 | 8.00 | 2.00 | - | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTta.................................................................................................. | 18 | ta | 16.00 | 199.00 | 2.00 | 3.00 | 2.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcaa.................................................................................................. | 19 | caa | 16.00 | 161.50 | 1.75 | 1.25 | 1.00 | 10.25 | 0.25 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcttt................................................................................................. | 20 | cttt | 14.25 | 161.50 | 4.50 | 2.75 | 2.75 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.75 | 0.50 | 1.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTcta.................................................................................................. | 23 | cta | 14.00 | 147.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 6.00 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGC...................................................................................................... | 15 | 5 | 13.80 | 13.80 | 1.00 | 3.80 | 0.60 | 1.80 | 0.40 | 1.60 | - | 2.40 | 0.80 | 0.20 | - | - | - | 1.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CGATGAAGCACTGTAGCTct................................................................................................... | 20 | ct | 13.00 | 3.00 | 2.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctat................................................................................................. | 19 | ctat | 12.17 | 397.17 | 2.33 | 4.83 | 2.17 | 0.67 | 1.17 | - | - | 0.17 | 0.33 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTaa................................................................................................... | 18 | aa | 11.50 | 161.50 | 1.25 | 4.75 | 0.75 | 3.25 | - | - | 0.25 | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTat................................................................................................... | 17 | at | 10.33 | 397.17 | 2.00 | 3.83 | 1.83 | 1.17 | 0.33 | - | 0.17 | 0.17 | 0.33 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctc.................................................................................................. | 17 | ctc | 10.00 | 0.00 | 6.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTcttt................................................................................................. | 24 | cttt | 9.00 | 147.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcaat................................................................................................. | 18 | caat | 8.00 | 0.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctc.................................................................................................. | 20 | ctc | 8.00 | 2726.67 | 1.00 | - | 2.00 | 0.67 | 3.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctta................................................................................................. | 20 | ctta | 7.75 | 161.50 | 2.75 | 2.00 | 0.75 | 0.50 | - | - | 0.25 | - | - | 1.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCa..................................................................................................... | 17 | a | 7.33 | 60.67 | 1.00 | 0.67 | 0.33 | 2.67 | 0.67 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 1.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcaaa................................................................................................. | 21 | caaa | 7.00 | 2726.67 | 1.67 | 1.00 | 1.67 | 0.33 | 2.00 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcaat................................................................................................. | 21 | caat | 7.00 | 2726.67 | 2.33 | 2.33 | 0.33 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcatt................................................................................................. | 21 | catt | 7.00 | 2726.67 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CGATGAAGCACTGTAGCTc.................................................................................................... | 19 | c | 7.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCcct................................................................................................... | 17 | cct | 7.00 | 0.00 | 2.00 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcg................................................................................................... | 16 | cg | 7.00 | 0.00 | 1.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctag................................................................................................. | 21 | ctag | 6.67 | 2726.67 | 1.33 | 1.67 | 0.67 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctaa................................................................................................. | 20 | ctaa | 6.25 | 161.50 | 0.75 | - | 0.75 | 3.50 | 0.25 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcaaa................................................................................................. | 18 | caaa | 6.00 | 0.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAcctc.................................................................................................... | 18 | cctc | 6.00 | 0.00 | 2.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTa................................................................................................... | 18 | a | 6.00 | 38.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGttct................................................................................................... | 18 | ttct | 6.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTttt................................................................................................. | 19 | ttt | 6.00 | 199.00 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTta.................................................................................................. | 20 | ta | 6.00 | 370.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcct.................................................................................................. | 20 | cct | 5.67 | 2726.67 | 1.67 | 1.00 | 1.00 | - | 1.33 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctaa................................................................................................. | 19 | ctaa | 5.67 | 397.17 | 0.83 | 0.33 | 0.17 | 3.17 | 0.50 | - | 0.17 | - | 0.17 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCcc.................................................................................................... | 18 | cc | 5.33 | 60.67 | 1.67 | 0.33 | 0.67 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTat.................................................................................................. | 18 | at | 5.00 | 199.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctat................................................................................................. | 20 | ctat | 5.00 | 161.50 | 0.75 | 2.25 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTttt................................................................................................. | 21 | ttt | 5.00 | 370.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCa..................................................................................................... | 20 | a | 5.00 | 21.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcttc................................................................................................. | 18 | cttc | 5.00 | 0.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTT.................................................................................................... | 21 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcgt.................................................................................................. | 17 | cgt | 5.00 | 0.00 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTtt.................................................................................................. | 19 | tt | 5.00 | 38.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCcct................................................................................................... | 19 | cct | 5.00 | 60.67 | 2.00 | 0.33 | 1.00 | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcg................................................................................................... | 17 | cg | 4.67 | 397.17 | 0.67 | 1.67 | 0.33 | 1.00 | - | - | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTag................................................................................................... | 19 | ag | 4.67 | 2726.67 | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGttct................................................................................................... | 19 | ttct | 4.06 | 2.69 | 0.75 | 0.19 | 0.19 | 0.25 | 2.19 | - | - | 0.44 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTtc.................................................................................................. | 18 | tc | 4.00 | 199.00 | - | 1.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGgtct................................................................................................... | 17 | gtct | 4.00 | 0.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTat................................................................................................... | 22 | at | 4.00 | 147.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTaa.................................................................................................. | 18 | aa | 4.00 | 199.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCcttt.................................................................................................. | 18 | cttt | 4.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CGATGAAGCACTGTAGCTctt.................................................................................................. | 21 | ctt | 4.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTctta................................................................................................. | 24 | ctta | 4.00 | 147.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctaa................................................................................................. | 18 | ctaa | 4.00 | 0.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTa.................................................................................................... | 21 | a | 4.00 | 147.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTaaa.................................................................................................. | 20 | aaa | 4.00 | 2726.67 | 0.67 | 1.33 | - | 0.67 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcac.................................................................................................. | 17 | cac | 4.00 | 0.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcatt................................................................................................. | 19 | catt | 3.83 | 397.17 | 1.17 | 1.17 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTat................................................................................................... | 18 | at | 3.75 | 161.50 | 0.25 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcagt................................................................................................. | 21 | cagt | 3.67 | 2726.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcaaa................................................................................................. | 19 | caaa | 3.33 | 397.17 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 1.50 | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTT.................................................................................................... | 15 | 6 | 3.33 | 3.33 | 0.33 | 2.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTatt.................................................................................................. | 20 | att | 3.33 | 2726.67 | - | 0.67 | 1.67 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctc.................................................................................................. | 18 | ctc | 3.33 | 397.17 | 0.50 | 0.50 | 0.67 | - | 0.17 | - | 0.50 | - | 0.17 | 0.50 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcgt.................................................................................................. | 20 | cgt | 3.33 | 2726.67 | 1.67 | - | - | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCaa.................................................................................................... | 18 | aa | 3.33 | 60.67 | 0.33 | 1.67 | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CGATGAAGCACTGTAGCT..................................................................................................... | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctgt................................................................................................. | 18 | ctgt | 3.00 | 0.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAtct..................................................................................................... | 17 | tct | 3.00 | 0.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTcat.................................................................................................. | 23 | cat | 3.00 | 147.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGttc.................................................................................................... | 17 | ttc | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTaa.................................................................................................. | 20 | aa | 3.00 | 370.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCcca................................................................................................... | 17 | cca | 3.00 | 0.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAG....................................................................................................... | 15 | 16 | 2.69 | 2.69 | 0.31 | 0.38 | 0.06 | 0.62 | 0.06 | - | - | 1.12 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCc..................................................................................................... | 17 | c | 2.67 | 60.67 | 0.33 | 0.67 | - | - | 0.67 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTTtt.................................................................................................. | 17 | tt | 2.67 | 3.33 | 1.50 | 0.67 | 0.17 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctg.................................................................................................. | 20 | ctg | 2.67 | 2726.67 | 1.00 | 0.67 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcga.................................................................................................. | 20 | cga | 2.67 | 2726.67 | 0.67 | 0.67 | - | - | 0.67 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcct.................................................................................................. | 18 | cct | 2.50 | 397.17 | - | - | 0.17 | 1.33 | 0.67 | - | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcca.................................................................................................. | 20 | cca | 2.33 | 2726.67 | 1.00 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTaat.................................................................................................. | 20 | aat | 2.33 | 2726.67 | 0.67 | 1.00 | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCcca................................................................................................... | 19 | cca | 2.33 | 60.67 | 1.00 | - | 1.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcata................................................................................................. | 21 | cata | 2.33 | 2726.67 | 0.67 | 0.67 | 0.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTga.................................................................................................. | 20 | ga | 2.00 | 370.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................TCGATGAAGCACTGTAGCTct................................................................................................... | 21 | ct | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTcaaa................................................................................................. | 24 | caaa | 2.00 | 147.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAtcta.................................................................................................... | 18 | tcta | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTgaga................................................................................................ | 20 | gaga | 2.00 | 199.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTctaa................................................................................................. | 24 | ctaa | 2.00 | 147.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctct................................................................................................. | 21 | ctct | 2.00 | 2726.67 | 0.67 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCctt................................................................................................... | 17 | ctt | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcata................................................................................................. | 18 | cata | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGa...................................................................................................... | 19 | a | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTcc................................................................................................... | 22 | cc | 2.00 | 147.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcttg................................................................................................. | 18 | cttg | 2.00 | 0.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCcctt.................................................................................................. | 18 | cctt | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTctat................................................................................................. | 24 | ctat | 2.00 | 147.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTatt.................................................................................................. | 23 | att | 2.00 | 147.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTTCt.................................................................................................. | 17 | t | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTat.................................................................................................. | 20 | at | 2.00 | 370.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGgtc.................................................................................................... | 17 | gtc | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTatt.................................................................................................. | 18 | att | 1.83 | 397.17 | 0.17 | 1.00 | 0.33 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcagt................................................................................................. | 20 | cagt | 1.75 | 161.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcaag................................................................................................. | 21 | caag | 1.67 | 2726.67 | 0.33 | - | 0.67 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTgt................................................................................................... | 19 | gt | 1.67 | 2726.67 | - | 0.67 | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcaat................................................................................................. | 19 | caat | 1.67 | 397.17 | 0.33 | 0.50 | 0.33 | - | 0.33 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcttg................................................................................................. | 21 | cttg | 1.67 | 2726.67 | 0.33 | 0.67 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcg................................................................................................... | 18 | cg | 1.50 | 161.50 | 0.25 | - | 0.25 | 0.75 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGttc.................................................................................................... | 18 | ttc | 1.50 | 2.69 | 0.50 | - | 0.19 | 0.50 | 0.25 | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcgt.................................................................................................. | 18 | cgt | 1.33 | 397.17 | 0.17 | 0.83 | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctg.................................................................................................. | 18 | ctg | 1.33 | 397.17 | 0.50 | 0.50 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCg..................................................................................................... | 17 | g | 1.33 | 60.67 | - | 1.00 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTaga.................................................................................................. | 20 | aga | 1.33 | 2726.67 | 0.67 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcttc................................................................................................. | 21 | cttc | 1.33 | 2726.67 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcaaa................................................................................................. | 20 | caaa | 1.25 | 161.50 | 0.75 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTaaa.................................................................................................. | 18 | aaa | 1.17 | 397.17 | - | 0.17 | - | 0.17 | 0.33 | - | 0.17 | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcttc................................................................................................. | 19 | cttc | 1.17 | 397.17 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcca.................................................................................................. | 18 | cca | 1.17 | 397.17 | - | 0.33 | - | 0.50 | - | - | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTtaa................................................................................................. | 19 | taa | 1.00 | 199.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTC................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTcg................................................................................................... | 22 | cg | 1.00 | 147.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGttca................................................................................................... | 22 | ttca | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAcctc.................................................................................................... | 17 | cctc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CGATGAAGCACTGTAGCTcc................................................................................................... | 20 | cc | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTatt................................................................................................. | 20 | att | 1.00 | 38.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCTTCATCAATGGGggag...................................................................................... | 18 | ggag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGtt..................................................................................................... | 20 | tt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcact................................................................................................. | 21 | cact | 1.00 | 2726.67 | - | - | 0.33 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCcctt.................................................................................................. | 20 | cctt | 1.00 | 60.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcga.................................................................................................. | 17 | cga | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTta.................................................................................................. | 19 | ta | 1.00 | 38.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTat.................................................................................................. | 19 | at | 1.00 | 38.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCcaa................................................................................................... | 17 | caa | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGgtca................................................................................................... | 18 | gtca | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctgt................................................................................................. | 21 | ctgt | 1.00 | 2726.67 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctag................................................................................................. | 20 | ctag | 1.00 | 161.50 | - | - | 0.25 | 0.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCact................................................................................................... | 19 | act | 1.00 | 60.67 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAG....................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................GATCTTAGCTGAAcgac..................................................................................................................... | 17 | cgac | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCgct................................................................................................... | 16 | gct | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGCTcaa.................................................................................................. | 23 | caa | 1.00 | 147.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCaa.................................................................................................... | 17 | aa | 1.00 | 13.80 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTga................................................................................................... | 19 | ga | 1.00 | 2726.67 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGttaa................................................................................................... | 18 | ttaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTTg................................................................................................... | 17 | g | 1.00 | 199.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcac.................................................................................................. | 20 | cac | 1.00 | 2726.67 | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTtaa................................................................................................. | 21 | taa | 1.00 | 370.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcata................................................................................................. | 20 | cata | 1.00 | 161.50 | 0.50 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTccta................................................................................................. | 18 | ccta | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctct................................................................................................. | 18 | ctct | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................CGATGAAGCACTGTAGCTca................................................................................................... | 20 | ca | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTaag.................................................................................................. | 20 | aag | 1.00 | 2726.67 | - | - | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTActct.................................................................................................... | 18 | ctct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCg..................................................................................................... | 15 | g | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAcct..................................................................................................... | 17 | cct | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTaag................................................................................................. | 20 | aag | 1.00 | 38.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTaat................................................................................................. | 20 | aat | 1.00 | 38.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTtaa................................................................................................. | 20 | taa | 1.00 | 38.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcca.................................................................................................. | 17 | cca | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTcaca................................................................................................. | 18 | caca | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTCt.................................................................................................. | 20 | t | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGgtct................................................................................................... | 19 | gtct | 1.00 | 2.69 | - | 0.12 | 0.12 | - | 0.69 | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctct................................................................................................. | 19 | ctct | 1.00 | 397.17 | 0.33 | - | 0.17 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTTttt................................................................................................. | 20 | ttt | 1.00 | 38.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCgc.................................................................................................... | 18 | gc | 1.00 | 60.67 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTAGtat.................................................................................................... | 21 | tat | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTtat................................................................................................. | 21 | tat | 1.00 | 370.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCac.................................................................................................... | 18 | ac | 1.00 | 60.67 | 0.33 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTTtta................................................................................................. | 21 | tta | 1.00 | 370.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................ATCGATGAAGCACTGTcgct..................................................................................................... | 20 | cgct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGttt.................................................................................................... | 17 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTctag................................................................................................. | 18 | ctag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGttca................................................................................................... | 18 | ttca | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAttct.................................................................................................... | 18 | ttct | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctag................................................................................................. | 19 | ctag | 1.00 | 397.17 | 0.17 | - | 0.33 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcaga................................................................................................. | 19 | caga | 1.00 | 397.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | 0.67 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTga................................................................................................... | 17 | ga | 0.83 | 397.17 | - | 0.17 | - | 0.50 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcttg................................................................................................. | 20 | cttg | 0.75 | 161.50 | - | - | 0.25 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcaat................................................................................................. | 20 | caat | 0.75 | 161.50 | - | 0.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcaga................................................................................................. | 20 | caga | 0.75 | 161.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTac................................................................................................... | 19 | ac | 0.67 | 2726.67 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcga.................................................................................................. | 18 | cga | 0.67 | 397.17 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcaga................................................................................................. | 21 | caga | 0.67 | 2726.67 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcata................................................................................................. | 19 | cata | 0.67 | 397.17 | 0.17 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctga................................................................................................. | 21 | ctga | 0.67 | 2726.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTgtt.................................................................................................. | 20 | gtt | 0.67 | 2726.67 | - | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcaac................................................................................................. | 21 | caac | 0.67 | 2726.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCcttt.................................................................................................. | 20 | cttt | 0.67 | 60.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCcca................................................................................................... | 18 | cca | 0.60 | 13.80 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcct.................................................................................................. | 19 | cct | 0.50 | 161.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctc.................................................................................................. | 19 | ctc | 0.50 | 161.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTgt................................................................................................... | 17 | gt | 0.50 | 397.17 | 0.17 | - | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcttg................................................................................................. | 19 | cttg | 0.50 | 397.17 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcgt.................................................................................................. | 19 | cgt | 0.50 | 161.50 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTaat.................................................................................................. | 19 | aat | 0.50 | 161.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcaag................................................................................................. | 19 | caag | 0.50 | 397.17 | - | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctac................................................................................................. | 19 | ctac | 0.33 | 397.17 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctca................................................................................................. | 21 | ctca | 0.33 | 2726.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTctac................................................................................................. | 21 | ctac | 0.33 | 2726.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTaaaa................................................................................................. | 21 | aaaa | 0.33 | 2726.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCag.................................................................................................... | 18 | ag | 0.33 | 60.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcatc................................................................................................. | 21 | catc | 0.33 | 2726.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCctt................................................................................................... | 19 | ctt | 0.33 | 60.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCct.................................................................................................... | 18 | ct | 0.33 | 60.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCacc................................................................................................... | 19 | acc | 0.33 | 60.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTata.................................................................................................. | 20 | ata | 0.33 | 2726.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcctt................................................................................................. | 19 | cctt | 0.33 | 397.17 | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTTta.................................................................................................. | 17 | ta | 0.33 | 3.33 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTccaa................................................................................................. | 21 | ccaa | 0.33 | 2726.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCccta.................................................................................................. | 20 | ccta | 0.33 | 60.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcctt................................................................................................. | 21 | cctt | 0.33 | 2726.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTact.................................................................................................. | 20 | act | 0.33 | 2726.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTcccc................................................................................................. | 21 | cccc | 0.33 | 2726.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCaag................................................................................................... | 19 | aag | 0.33 | 60.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGCTccat................................................................................................. | 21 | ccat | 0.33 | 2726.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGtttt................................................................................................... | 19 | tttt | 0.31 | 2.69 | 0.06 | 0.19 | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTag................................................................................................... | 18 | ag | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTgaa.................................................................................................. | 19 | gaa | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctg.................................................................................................. | 19 | ctg | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcac.................................................................................................. | 19 | cac | 0.25 | 161.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctac................................................................................................. | 20 | ctac | 0.25 | 161.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcgta................................................................................................. | 20 | cgta | 0.25 | 161.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcaac................................................................................................. | 20 | caac | 0.25 | 161.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTac................................................................................................... | 18 | ac | 0.25 | 161.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTaaga................................................................................................. | 20 | aaga | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcatt................................................................................................. | 20 | catt | 0.25 | 161.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctga................................................................................................. | 20 | ctga | 0.25 | 161.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcctt................................................................................................. | 20 | cctt | 0.25 | 161.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTaag.................................................................................................. | 19 | aag | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTatat................................................................................................. | 20 | atat | 0.25 | 161.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcaag................................................................................................. | 20 | caag | 0.25 | 161.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTaaa.................................................................................................. | 19 | aaa | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTccta................................................................................................. | 20 | ccta | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTcga.................................................................................................. | 19 | cga | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTgt................................................................................................... | 18 | gt | 0.25 | 161.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCTctca................................................................................................. | 20 | ctca | 0.25 | 161.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCcctt.................................................................................................. | 19 | cctt | 0.20 | 13.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCcc.................................................................................................... | 17 | cc | 0.20 | 13.80 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCact................................................................................................... | 18 | act | 0.20 | 13.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCaga................................................................................................... | 18 | aga | 0.20 | 13.80 | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCgca................................................................................................... | 18 | gca | 0.20 | 13.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ATGAAGCACTGTAGCac.................................................................................................... | 17 | ac | 0.20 | 13.80 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTTtatt................................................................................................ | 19 | tatt | 0.17 | 3.33 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcaac................................................................................................. | 19 | caac | 0.17 | 397.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcagt................................................................................................. | 19 | cagt | 0.17 | 397.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTctgt................................................................................................. | 19 | ctgt | 0.17 | 397.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTTtaaa................................................................................................ | 19 | taaa | 0.17 | 3.33 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcgtt................................................................................................. | 19 | cgtt | 0.17 | 397.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTccaa................................................................................................. | 19 | ccaa | 0.17 | 397.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................GAAGCACTGTAGCTTa................................................................................................... | 16 | a | 0.17 | 3.33 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcatc................................................................................................. | 19 | catc | 0.17 | 397.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcatg................................................................................................. | 19 | catg | 0.17 | 397.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGAAGCACTGTAGCTcac.................................................................................................. | 18 | cac | 0.17 | 397.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGttt.................................................................................................... | 18 | ttt | 0.12 | 2.69 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGttca................................................................................................... | 19 | ttca | 0.06 | 2.69 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGtcct................................................................................................... | 19 | tcct | 0.06 | 2.69 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGgtca................................................................................................... | 19 | gtca | 0.06 | 2.69 | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGttat................................................................................................... | 19 | ttat | 0.06 | 2.69 | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................GATGAAGCACTGTAGgtc.................................................................................................... | 18 | gtc | 0.06 | 2.69 | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CCATGTCCAGGAGACATCAGGACTTAGTGATGGTAGCTCCAGCTTTCACTGGTCCAGACGAGGCCAAGGCACCTGAGATGGGAGGCAGGAGCCTGAGATTCCCAATGTCTAGGGTAGATCTTAGCTGAAATCGATGAAGCACTGTAGCTTCATCAATGGGACCTACAGAGTTGCCGAACCAACACTCAAATGTCTTCCAGCTGCAGCCCAACCTGAGAAAGAAGGGACGGTGGAACAGAGGATGAAGACC ....................................................................................................((((....((((((....))))))........((((((((......))))))))..)))).........((((......))))................................................................... ....................................................................................................101................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR037896(GSM510432) ovary_rep1. (ovary) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................TGATGGTAGCTCCAattg................................................................................................................................................................................................................. | 18 | attg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |