chr7:116864152 116864401 -
(6)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(5)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(28)
TESTES

Sense strand
ACATTCATGTATTTGTCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGCGCATTTACGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTCACTTGCCTTTCCCAGGTGCACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGGCCATGGCCGG
.......................................................................((....(((((((.......)))))))...)).....((.(((..(((((....(((.(((....))).))).....(((((.....)))))...)))))..)))))........................................................................
..................................................................67..............................................................................................................179.....................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGC........................................................................................................................................ 27 1 62.00 62.00 35.00 - 8.00 1.00 - - - 6.00 - - 3.00 1.00 - 6.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................TTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGC........................................................................................................................................ 28 1 32.00 32.00 18.00 - - - - - 10.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGG......................................................................................................................................... 27 1 24.00 24.00 12.00 - 1.00 - - - 7.00 - - 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGG......................................................................................................................................... 26 1 21.00 21.00 10.00 - 3.00 - - - - 4.00 - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGC................................................................................................................................................................................................ 25 1 17.00 17.00 - 3.00 - - - 8.00 - - 2.00 - - - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCA....................................................................................................................................... 28 1 14.00 14.00 10.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGTCTTCACACTGTTGATCGGCCATGGC... 28 1 14.00 14.00 - 2.00 8.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGCTCTC............................................................................................................................................................................................ 29 1 10.00 10.00 - 4.00 2.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGCT............................................................................................................................................................................................... 26 1 9.00 9.00 - 3.00 - - - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGC........................................................................... 26 1 9.00 9.00 - - - - 2.00 5.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TCCTTCCATCATGTAGAATCTGGGG..................................................................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 - - - - 2.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGC........................................................................................................................................ 26 1 8.00 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGCTC.............................................................................................................................................................................................. 27 1 8.00 8.00 - - - 4.00 - 1.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCG.......................................................................................................................................... 25 1 8.00 8.00 - - - - - 1.00 - 1.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGGC......... 28 1 7.00 7.00 - 1.00 - - - 1.00 - 2.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCA....................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGa........................................................................................................................................ 27 a 6.00 21.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGA......................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 1.00 - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATGTAGAATCTGGGGATTGAAC.............................................................................................................................................................. 24 1 5.00 5.00 - - - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGT.............................................................................................. 28 1 5.00 5.00 - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................ACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGC.................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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................................................................................TGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGC................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTC............................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATGTAGAATCTGGGGATTGAACTC............................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGG..................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGT.................................................................................................................................................................................................. 23 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TCCATCATGTAGAATCTGGGGATTGA................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGg........................................................................................................................................ 27 g 3.00 21.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGt........................................................................................................................................ 27 t 3.00 21.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGG....................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCA........................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTC..................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGTATTTGTCCAGGTGAGGA............................................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGG................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCCC........................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTCCATCATGTAGAATCTGGGGATTG................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGGGGATT.................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TAGCTCACATGTGGGTCAGTGCTCTC............................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAcccc................................................................................................................................................................................................ 25 cccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGttg............................................................................................... 27 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCTGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGa................................................................................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGCTT.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CTGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGag................................................................................................................................................ 27 ag 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGCT............................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................TGTTGATCGGCCATGGCCGGa 21 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTG................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGT...................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...............................................................................CTGGGGATTGAACTCAGATGGTCAG.................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTc......................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
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................................................................................TGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGCTT.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGCTCTCCTTCCATCATGTAGAATCTG........................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TAGCTCACATGTGGGTCAGTGCTCT............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGC.................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAG...................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACTCA........................................................................................................................................................... 24 2 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TTGCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGG.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TCCTTCCATCATGTAGAATCTGGG...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTAGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCT.................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCC......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.............................................................................................................................................................TTTAGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTC................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGCc............................................................................................................................................... 27 c 1.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCA....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TCCATCATGTAGAATCTGGGGATTG................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAG...................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTC................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAGGTTT.................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGCa............................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 17.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGC........................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGATG....................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTCCATCATGTAGAATCTGGGGAct.................................................................................................................................................................. 25 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGAT................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTCCATCATGTAGAATCTGGGGtttg................................................................................................................................................................. 26 tttg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCCt........................................................................ 30 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGA......................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGGCCA....... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGGCa........ 29 a 1.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCACACTGTTGATCGGCCATGGCCGcg 28 cg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ATTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGa........................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGCTCACATGTGGGTCAGTGC................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCACACTGTTGATCGGCCATGGCCGGggg 30 ggg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TAGAATCTGGGGATTGAACTCAGATGGTCA................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TAGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTCACTa............................................................. 30 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAta..................................................................................................................................... 30 ta 1.00 14.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGCTTG............................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGa........................................................................................................................................ 28 a 1.00 24.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGt........................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCCC........................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................CAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGCGC.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGA......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGCG................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCG............................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGC........................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TAGAATCTGGGGATTGAACTCAGATGGTC.................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTCCATCATGTAGAATCTGG....................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGT.............................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAGctc..................................................................................... 26 ctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TCCATCATGTAGAATCTGGGGATTGAACac............................................................................................................................................................ 30 ac 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................CAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAAT........................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................TGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGa................................................................................................................................................ 26 a 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAG........................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGGGGA.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................ATCATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCA........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGCTt.............................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTCCATCATGTAGAATCTGGGG..................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................CAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAATC.......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCCCTGA..................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGt................................................................................................................................................................................................ 25 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGt........................................................................................................................................ 28 t 1.00 24.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGTCTTCACACTGTTGATCGGCCAT...... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGcc............................................................................................. 29 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGGG...................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTC............................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATGTAGAATCTGGGGATTGAAa.............................................................................................................................................................. 24 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGCGgcaa............................................................................................................................... 28 gcaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGTCTTCACACTGTTGATCGGCCATGG.... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTCCATCATGTAGAATCTGGGGATT.................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TCCTCTTGATGTCTTTAGGTTTTGT................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGCGC.................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCc....................................................................................................................................... 24 c 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTat.......................................................................................... 25 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCTGCGGTCCTCTTGATGT.............................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGTCTTCACACTGTTGATCGGCCATGGCC.. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TAGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTC................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGG..................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CCTCTTGATGTCTTTAGGTTTTGcgct.............................................................................. 27 cgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCActgt................................................................................................................................................................................................ 25 ctgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCG.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGTCTTCACACTGTTGATCGGCCATta.... 27 ta 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGGGGctt.................................................................................................................................................................. 30 ctt 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGg................................................................................................................................................................................................ 25 g 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGA................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGC........................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAGG....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTT........................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCCC........................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGATAGCTCACATGTGGGTCAGggc................................................................................................................................................................................................ 25 ggc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCG............................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCC.......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CATGTGGGTCAGTGCTCT............................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCTGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGC................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATGTAGAATCTGGGGATTGAAaaa............................................................................................................................................................ 26 aaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGATa....................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGC........................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................ATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGA......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGGGGATc.................................................................................................................................................................. 30 c 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGTTGCCCATGTCTTCACACTGTTtctc............ 28 tctc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGC........................................................................................................................................... 25 3 0.67 0.67 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACTC............................................................................................................................................................ 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAG.......................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGGGGATTGAACTCAGATGGT..................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAG.......................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAca......................................................................................................................................................... 26 ca 0.50 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTAGAATCTGGGGATTGAACT............................................................................................................................................................. 22 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCt.......................................................................................................................................... 25 t 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGC........................................................................................................................................... 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ATTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGC........................................................................................................................................... 26 3 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGG............................................................................................................................................ 23 8 0.25 0.25 - - - - - - - 0.12 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGC................................................................................................................................................ 19 13 0.15 0.15 - - 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGaggc........................................................................................................................................ 27 aggc 0.12 0.25 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ACATTCATGTATTTGTCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCACATGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCAGATGGTCAGGCTTGGCGGCAGGCGCATTTACGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTCACTTGCCTTTCCCAGGTGCACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGGCCATGGCCGG
.......................................................................((....(((((((.......)))))))...)).....((.(((..(((((....(((.(((....))).))).....(((((.....)))))...)))))..)))))........................................................................
..................................................................67..............................................................................................................179.....................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
...................................................................................................................................GCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTT.......................................................................................... 29 1 128.00 128.00 91.00 1.00 11.00 1.00 4.00 - 6.00 3.00 - 1.00 4.00 - - 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTT.......................................................................................... 28 1 27.00 27.00 24.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTT........................................................................................... 28 1 18.00 18.00 11.00 - 3.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTA......................................................................................... 26 1 16.00 16.00 11.00 - - - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............GTCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCA............................................................................................................................................................................................................... 29 1 15.00 15.00 - 8.00 - 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................................................................................................................................AGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTT.......................................................................................... 30 1 15.00 15.00 - - 1.00 - 1.00 - 11.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTT........................................................................................... 29 1 15.00 15.00 8.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GCACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACA..................... 27 1 6.00 6.00 - - 3.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCA............................................................................................................................................................................................................... 30 1 6.00 6.00 - 2.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TCAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAA............................................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................AGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTCACT.............................................................. 28 1 5.00 5.00 - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............TCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCA............................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCA............................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................ATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTA......................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACA..................... 25 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
........................................................................................................................................................................................................GTGCACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACA..................... 29 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTT.......................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................GCTCACATGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCA...................................................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTT........................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCCTGTTGCCCATGTCTTCACACTGT................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACAa..................... 27 a 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGA............................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCA................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCCCATGTCTTCACACTGTTGATC............ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTA......................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............TCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCACA............................................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGTA............................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACAggg..................... 27 ggg 2.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................ATCATGTAGAATCTGGGGATTGAACTCA........................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGCACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACA..................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCT............................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACA..................... 24 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTA......................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CCCATGTCTTCACACTGTTGATCGGCC........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTTACGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTC..................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GTCCAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCACA............................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................CCCTGATCTCACTTGCCTTTCCCAG.................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................GCTCTCCTTCCATCATGTAGAATCT......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGG.......... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCAaa....................... 26 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................ATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTT.......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GGTGAGGACACCCATGATAGCTCACA............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................CAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGA............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................................................................................................................................................................CACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACAgt..................... 28 gt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CCATGTCTTCACACTGTTGATCGGCCA....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACAcgg..................... 27 cgg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GTTGCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGG.......... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTCT.................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GATCTCACTTGCCTTTCCCAGGTGC.............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GCCCATGTCTTCACACTGTTGATCGGCCA....... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTT.......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTA......................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTtgc........................................................................................... 28 tgc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTT........................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTACGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTC..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCACAa............................................................................................................................................................................................................. 29 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAG........................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAA............................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................AGGTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTCA................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................GAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATG............................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGaat................................................................................................................................................................................. 29 aat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACAg..................... 27 g 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................ATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAGG....................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................ACATGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCAa...................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GCTCGCCCCTGATCTCACTTGCCT......................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GGTCAGGCTTGGCGGCAGGCGCATTTA............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................GAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGAT................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................GACACCCATGATAGCTCACATGTGGGTCA.................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CCATCTCTGCGGTCCTCTTGATG............................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTGCTCGCCCCTGATCTCACTTGCca........................................................... 27 ca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTC..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTTAGG....................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTCca..................................................................................................... 26 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................GAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTC............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACA..................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................GTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAA............................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCCTGTTGCCCATGTCTTCACACTGTTGA.............. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGTGCACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCACA..................... 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CAGGTGAGGACACCCATGATAGCTCAcac............................................................................................................................................................................................................... 29 cac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................GAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTGATGTCTTT.......................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................ATGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCA................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................ACATGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATC.................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CACATGTGGGTCAGTGCTCTCCTTCCA...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................GCTCTCCTTCCATCATGTAGAATCTGG....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TCAGTGCTCTCCTTCCATCAttca................................................................................................................................................................................... 24 ttca 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GTTTTGTGCTCGCCCCTGATCTCACT.............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TTGCCCATGTCTTCACACTGTTGATC............ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CATGTCTTCACACTGTTGATCGGCCA....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................CAGTGCTCTCCTTCCATCATGTAGAA............................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATTTACGCTGAGCCATCTCTGCGGTCCT...................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................GGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATG................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCTGAGCCATCTCTGCGGTCCTCTTG.................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGTA............................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GTGCACTGCCTGTTGCCCATGTCTTCA....................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGGGTCAGTGCTCTCCTTCCATCATGa................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCACATGTGGGTCAGTGCTCTCCT.......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GTGCTCGCCCCTGAtgg..................................................................... 17 tgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -