chr7:116662687 116663148 +
(1)
OTHER.ip 		(9)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(5)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(44)
TESTES

Sense strand
CTCGCGAGACTTCGTGAGCTCCTCCCTTTTCCCTTTCTGCCACCGCCATGGTAGGTCTTCTCTTGGCCTCCGCTCCATCGCGGAGGGTCGGGGCTCTGCTTCCCAGCCTTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTGGGTCTCCATGGCTGGGCGTAGCCTGCGGGGCGGGATGACCCACTCGGGTGTGGGGCGAGGAACGTGGGGCCGCGTGTTCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTGGACGTGCGGGCCCGGGCGGCTGAGCACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGCTTAGCCGGTGCTCCAGAAGGCAAGTCCTCGTGTGCAGGCCTGATCCGGGCAGGCAGGCATTGCTGCCCTCTCCCCGGTCTCCCCATCCTCTAAGCAGGCCTAACCACTTTGCTGTTTTTCCCACGCAGCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGGCCACGTGAGCCACGG
................................................................................................................................................................................................................((.(((.(((((((((.(((..((((......))))..)))..((......))..)))))).)))..(((.(((((...))))).)))...))).)).............................................................................................................................................................
...............................................................................................................................................................................................................208................................................................................................307.........................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTC.................... 27 11 57.64 57.64 13.45 12.82 10.27 8.82 9.55 0.18 - - - 0.18 0.09 0.18 - 0.27 0.09 0.09 - - - - - - 0.36 - - - - 0.45 0.09 0.09 - - - - - - - 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACT..................... 26 11 20.00 20.00 5.36 4.45 3.18 2.91 3.09 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.27 0.09 - - - - - - - - 0.09 - 0.09 0.18 - 0.09 - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCC................... 28 11 12.82 12.82 2.82 3.45 3.09 1.91 1.09 0.09 - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - 0.09 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAC...................... 25 11 7.91 7.91 1.64 1.00 1.45 0.45 1.09 0.18 - - - 0.45 - 0.18 - 0.09 - 0.09 - - 0.18 - - - 0.09 - - - - 0.27 0.09 0.09 - - - - - - - 0.09 0.18 0.09 - 0.18 - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCTGGGATCGCGTGGA................................................................................................................................................................................................................................ 16 1 7.00 7.00 - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTGGAC............................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAA........................ 28 1 5.00 5.00 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCGGTGCTCCAGAAG............................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGTTCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTG.................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TTCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTG.................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGC.................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAA....................... 24 11 2.64 2.64 0.09 0.18 0.18 0.09 0.09 0.18 - - - - - 0.09 - 0.18 - - - - - - - - 0.45 - - 0.09 0.09 0.18 - 0.09 - - - - - - - 0.09 0.09 - 0.09 - 0.18 0.18 - -
......................................................................................................................................................................................................................................CGCGTGGACGTGCGGGCCCGGGCGGCTGAGCAC....................................................................................................................................................................................................... 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCAGCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGt.......................... 29 t 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GAGGGTCGGGGCTCTGCTTCC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AACGTGGGGCCGCGTGTTCCGACC................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGCTT................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTCCTCGTGTGCAGGCCTGATCCGG.................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGCACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGCT................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCGTGTGCAGGCCTGATCCGGGCAt.............................................................................................................................. 28 t 2.00 0.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCGGCTTAGCCGGTGCTCCAGAAG............................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTGG................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GGGGCGGGATGACCCACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCa................... 28 a 1.82 57.64 0.45 0.55 0.45 0.09 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGG................. 30 9 1.56 1.56 0.11 0.11 - 0.33 0.11 - - - - 0.33 - - - 0.22 - - - 0.22 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................CACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGCTT................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CAGAGCTGGGATCGCGTGGACGTGCG.......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTGGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CTCTTGGCCTCCGCTCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTGt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ACCAGAGCTGGGATCGCGTGGACGTG............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTCGTGTGCAGGCCTGATCCGGGC................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTCCTCGTGTGCAGGCCTGATCCGG.................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................CGTGTTCCGACCAGAGCTGGGATCGCGT................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CCCTTTCTGCCACCGCCATGGc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGCTTc............................................................................................................................................................................... 29 c 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TTCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTGGAC............................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGtt................................................................................................................................................................................. 27 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCCAGACTGAGGAAGACCCcgaa........................ 26 cgaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGCCTCCGCTCCATCGCGGAGGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GCTCCATCGCGGAGGGTCGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CTCGGGTGTGGGGCGAGGAACGTGG.................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TCCGACCAGAGCTGGGATCGagtt.................................................................................................................................................................................................................................. 24 agtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................ATCGCGGAGGGTCGGGGCTCTGCTTCCCAGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CTCCATCGCGGAGGGTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CATCGCGGAGGGTCGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................CACTCGGGTGTGGGGCGAGG........................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGAGCTGGGATCGCGTGGACGTGCGG......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CCTCCGCTCCATCGCGGAGGGTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CTCCGCTCCATCGCGGAGGGTCGGGGCTCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCTGGGCGTAGCCTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGtc.............. 26 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCCTCTCCCCGGTCTCCCCATCCTCTt...................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGca............... 28 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................ATGGCTGGGCGTAGCCTG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TTCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTGt................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................CGCGTGGACGTGCGGGCCCGGGCGGCT............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTGGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CCAGAGCTGGGATCGCGTGGACGT............................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CTCCATCGCGGAGGGTCGGGGCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGTCTTCTCTTGGCCTCCGCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCTGGGCGTAGCCTGCGGGGCGGa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCGGGTGTGGGGCGAGGAACGTGGG................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAAACTCCGGtgga............. 15 tgga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCTTGCTATGGTCCTAGTGGGTCTCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAaaaa............................. 19 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CCAGAGCTGGGATCGCGTGGACGTGC........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TATGGTCCTAGTGGGTCTCCATGGCa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGGTGCTCCAGAAGGCAAGTCCTCGTGT................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ACCAGAGCTGGGATCGCGTGGACGTGC........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCatga......................... 22 atga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................AGCTGGGATCGCGTGGAC............................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCTGGGCGTAGCCTGCGGGGCG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTAAGCAGGCCTAACCACTTTGCTG................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GCTCCATCGCGGAGGGTCGGGGCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CATCGCGGAGGGTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CCATCGCGGAGGGTCGGGGCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GCTGGGATCGCGTGGACGTGC........................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................CATCGCGGAGGGccgg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 ccgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGt.......................... 22 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CCGCTCCATCGCGGAGGGTCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACTCCGGGGCCACGTGAGt..... 20 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAA........................ 23 12 0.83 0.83 - - 0.08 0.08 - - - - - 0.08 - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - 0.08 0.08 - - - - - - - - 0.08 0.17 - - - - - - 0.08
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTC.................... 25 12 0.83 0.83 0.08 - 0.33 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCt................... 28 t 0.82 57.64 0.18 0.45 0.09 - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCG.................. 29 10 0.80 0.80 - 0.20 0.10 0.10 0.10 - - - - 0.20 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCt.................. 29 t 0.73 12.82 0.18 0.18 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGt................. 30 t 0.70 0.80 - 0.30 0.20 - 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAA........................ 27 12 0.67 0.67 0.08 - 0.25 - 0.17 - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAt...................... 25 t 0.64 2.64 - 0.09 0.18 - 0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTC.................... 26 11 0.55 0.55 0.18 0.09 - - - - - - - - - - - - 0.09 - 0.09 - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAGACTTCGTGAGCTCCTCCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAA........................ 26 12 0.50 0.50 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCaa.................. 29 aa 0.45 57.64 0.18 0.09 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGGCCAC........... 29 7 0.43 0.43 - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGA......................... 22 12 0.42 0.42 - - - - - 0.08 0.08 - - 0.08 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAaa..................... 26 aa 0.36 2.64 0.18 - 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAC...................... 26 11 0.36 0.36 - 0.18 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCCAGACTGAGGAAGACCCGGA......................... 24 12 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCG.................. 28 10 0.30 0.30 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAa...................... 25 a 0.27 2.64 - - - 0.18 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAt...................... 26 t 0.27 0.27 0.18 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAtaa.................... 27 taa 0.27 2.64 0.09 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAA....................... 25 11 0.27 0.27 - 0.09 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGAAACTCCGGGGCCACGTGA....... 23 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 21 12 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 20 12 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.08 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGA......................... 25 12 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTa.................... 27 a 0.18 20.00 - 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTt.................... 27 t 0.18 20.00 0.09 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAaaa.................... 27 aaa 0.18 2.64 0.09 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAt....................... 24 t 0.17 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGt.......................... 25 t 0.17 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGACTGAGGAAGACCCG........................... 19 12 0.17 0.17 - - - - - 0.08 - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCGGAAACT..................... 24 12 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAA........................ 25 12 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAACTCCGGGGCCACGTGAGCCACG. 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGGCCAC........... 32 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGAAACTCCGGGGCCACGTGAG...... 23 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGAC.............................. 18 17 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGG................. 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGG............... 31 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGGCC............. 29 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGGC.............. 25 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGG................ 28 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGTCTTCTCTTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 15 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGGCC............. 27 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGG............... 30 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CTTTTCCCTTTCTGCCACCGCCATG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTat................... 28 at 0.09 20.00 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAA....................... 26 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAattt................... 28 attt 0.09 2.64 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAatc.................... 27 atc 0.09 2.64 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAC...................... 27 11 0.09 0.09 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTata.................. 29 ata 0.09 20.00 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACa..................... 26 a 0.09 7.91 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAtta.................... 27 tta 0.09 2.64 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAC...................... 28 11 0.09 0.09 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCaa.................. 28 aa 0.09 0.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCC................... 26 11 0.09 0.09 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCC................... 27 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTtt................... 28 tt 0.09 20.00 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCC................... 25 11 0.09 0.09 - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTaa................... 28 aa 0.09 20.00 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAgtc.................... 27 gtc 0.09 2.64 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAAaat.................... 27 aat 0.09 2.64 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACT..................... 27 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCaaaa................ 31 aaaa 0.09 57.64 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 25 12 0.08 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAgg...................... 25 gg 0.08 0.83 - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCG........................... 20 12 0.08 0.08 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGca........................ 27 ca 0.08 0.08 - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 22 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAA........................ 24 12 0.08 0.08 - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGA......................... 26 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAtaa..................... 26 taa 0.08 0.83 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAcac...................... 25 cac 0.08 0.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCCGGAtttt..................... 26 tttt 0.08 0.42 - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCCGGA......................... 23 12 0.08 0.08 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCATCCAGACTGAGGAAGACCCG........................... 24 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCg................... 26 g 0.08 0.83 - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCCAGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 24 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGAGGAAGACCCGGAAAC...................... 22 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGACTGAGGAAGACCC............................ 19 13 0.08 0.08 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCCAGACTGAGGAAGACCC............................ 20 13 0.08 0.08 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCG........................... 18 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGACTGAGGAAGACCCGG.......................... 18 14 0.07 0.07 - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCCGGAA........................ 21 14 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTGAGGAAGACCCGGA......................... 18 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGACTGAGGAAGACCC............................ 17 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATCCAGACTGAGGAAGACC............................. 21 16 0.06 0.06 - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCCAGACTGAGGAAGA............................... 18 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCGCGAGACTTCGTGAGCTCCTCCCTTTTCCCTTTCTGCCACCGCCATGGTAGGTCTTCTCTTGGCCTCCGCTCCATCGCGGAGGGTCGGGGCTCTGCTTCCCAGCCTTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTGGGTCTCCATGGCTGGGCGTAGCCTGCGGGGCGGGATGACCCACTCGGGTGTGGGGCGAGGAACGTGGGGCCGCGTGTTCCGACCAGAGCTGGGATCGCGTGGACGTGCGGGCCCGGGCGGCTGAGCACGCTCTGAGTCCCGGCCTCGGCTTAGCCGGTGCTCCAGAAGGCAAGTCCTCGTGTGCAGGCCTGATCCGGGCAGGCAGGCATTGCTGCCCTCTCCCCGGTCTCCCCATCCTCTAAGCAGGCCTAACCACTTTGCTGTTTTTCCCACGCAGCCATCCAGACTGAGGAAGACCCGGAAACTCCGGGGCCACGTGAGCCACGG
................................................................................................................................................................................................................((.(((.(((((((((.(((..((((......))))..)))..((......))..)))))).)))..(((.(((((...))))).)))...))).)).............................................................................................................................................................
...............................................................................................................................................................................................................208................................................................................................307.........................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
...........................................................................................................................................................................................................GCCGCGTGTTCCGACCAGAGCTGGGA......................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 34.00 34.00 4.00 5.00 - 2.00 1.00 1.00 7.00 9.00 - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCCCATCCTCTAAGCAGGCCTA............................................................................ 25 1 6.00 6.00 - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GCTTGCTATGGTCCTAGTGGGTCTCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CCGCGTGTTCCGACCAGAGCTGGGA......................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGTCCTAGTGGGTCTCCATGGCTGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CCAGCCTTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................CCTTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACTTTGCTGTTTTTCCCACGCAGC................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GCCTTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GGCCGCGTGTTCCGACCAGAGCTGGGA......................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTGGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTAGTGGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTTTTCCCACGCAGCCA............................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCGGTCTCCCCATCCTCTAAGCA.................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GGTCGGGGCTCTGCTTCCCAGCCTTTCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGGCCTGATCCGGGC................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGGCCTAACCACTTTGCTGTTT............................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCGGTGCTCCAGAAGGCAAGTCCTC..................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGTCTCCCCATCCTCTAA..................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCGGTGCTCCAGAAGGCAAGTCCT...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAGGCAAGTCCTCGTGTGCA.............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CCCTTTCTGCCACCGCCATGGTAGGTC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAGCCGGTGCTCCAGAA................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCCCATCCTCTAAgca..................................................................................... 18 gca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGTCCCGGCCTCGGCTTAGCC............................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGCCATCCAGACTGAGGA.................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTGAGTCCCGGCCTCGGCTTA............................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................CTTTCAGCTGCTTGCTATGGTCCTA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTGAGTCCCGGCCTCGGCTT................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CTTCCCAGCCTTTCAGCTGCTTGCTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCCTCTAAGCAGGCCTAACCACTT..................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGGTCTCCCCATCCT......................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GCCGCGTGTTCCGAC.................................................................................................................................................................................................................................................... 15 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -