chr7:109049246 109049495 +
(11)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(48)
TESTES

Sense strand
CTCAAACGTTTCCTCTGACCTCAGAAATCCAGTAGTCAGTTTCAGTATTGTAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCCCCTGGGGTCACATGACTAACCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTATGGAGAGTTTCCTTTTAGCTGCTGCTTTTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCATGCCCTCC
................................................................((.((..(((...(((((.......((.((((((..(((....))).)))))).))..(((((........))))).))))).)))..)).)).............................................................................................
................................................................65..............................................................................................161.......................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTAT........................................................................................................................................................... 26 1 65.00 65.00 4.00 14.00 16.00 1.00 - 8.00 - 7.00 9.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGC............................................................................................. 27 1 49.00 49.00 20.00 - - 13.00 - - 2.00 - - 4.00 - - - 5.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATG.......................................................................................................................................................... 27 1 21.00 21.00 1.00 4.00 4.00 3.00 - 2.00 1.00 1.00 2.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGA............................................................................................... 25 1 17.00 17.00 5.00 - - 5.00 - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCT............................................................................................ 28 1 17.00 17.00 6.00 - - 2.00 - - 2.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCCCC................................................................................................................................................. 27 1 17.00 17.00 - 2.00 5.00 - 2.00 4.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTA................. 25 1 14.00 14.00 3.00 1.00 - 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGT......................................................................................................................................................... 28 1 13.00 13.00 - 6.00 2.00 - - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTA............................................................................................................................................................ 25 1 12.00 12.00 1.00 2.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGT.................. 24 1 12.00 12.00 6.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGTAATTCTATTGTGTGCCCATGAA................................................................................................................................................................................. 26 1 11.00 11.00 - - - - 5.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCAT....... 25 1 8.00 8.00 - 4.00 - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGAG........................................................................................................................................................................ 26 1 7.00 7.00 - 1.00 - - 3.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGAGA....................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGG................... 26 1 7.00 7.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCA...................................... 25 1 7.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTAT.......................................................................................... 30 1 7.00 7.00 - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTA........................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCATG...... 26 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGC......... 26 1 5.00 5.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGT...................... 27 1 5.00 5.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGG............... 27 1 5.00 5.00 - - - 1.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCT........................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGA.............. 28 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGT.................. 26 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TGTGTGCCCATGAAGAAGCTGAGAATC.................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTCCTCTGACCTCAGAAATCCAGTAGTC..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGG................... 27 1 4.00 4.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCA........ 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGG............... 25 1 4.00 4.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGAGGCTATGTGTTTCCCCTGGGGTC.......................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGTAATTCTATTGTGTGCCCATGAAG................................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGC............ 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TTGTAATTCTATTGTGTGCCCATGA.................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAA.............................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GACTAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGC............................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAG................ 26 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGAGAATC.................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATa.......................................................................................................................................................... 27 a 2.00 65.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGGACTCAGACTTGCTGAGCTATGGAG...................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGC............................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGG........................... 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................ATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTA........................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGC....................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTG....................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGACTAACCAAAGACTAAGATTTGGACTCA......................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGAGAGTTTCCTTTTAGCTGCTGCTT................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGACTAACCAAAGACTAAGATTTGGACT........................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTa..................... 28 a 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAAAAGAC................................ 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGA.......................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGACTAACCAAAGACTAAGATTTGGACTC.......................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GACTAAGATTTGGACTCAGACTTGCT................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGG.................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGAT......................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTG.......................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGA................................................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGT.................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGC....................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGT.................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCAAACGTTTCCTCTGACCTCAGAAATC............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTG........................................ 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGC......... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAt................ 26 t 2.00 14.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAG............. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTATGt........................................................................................ 32 t 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCCC.................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TAACCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGA....................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAA..................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCT........................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TCAGTATTGTAATTCTATTGTGTGC........................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGC....................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCATt...... 27 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCCCCa................................................................................................................................................ 28 a 1.00 17.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGC.............................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GGGATTGTGGGTAGGAGCAGCAT....... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGCTTTTGTAACCCCGCAGGAAGTAAG.......................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCcg................................................................................................ 24 cg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGa.................. 24 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTATG......................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTtcc.................................................................................................................................................. 26 tcc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTtccc................................................................................................................................................. 27 tccc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGt......................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCCGCAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTC.............................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GTTTCAGTATTGTAATTCTATTGTGTGC........................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAGTGCAAAAGACTCGGGATTG....................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGTGTTT..................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CAGACTTGCTGAGCTATGGAGAGTTTtc............................................................................... 28 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCT............................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTaag........................................................................................................................................................................ 26 aag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAG.......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGT.................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAAAAG.................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGt............... 27 t 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAAAAGA................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAt................ 28 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAAAAG.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTTTAGCTGCTGCTTTTGTAACCCCGC.................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCAT....... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGt.................... 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGA.............. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCAT....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGCTGCTGCTTTTGTAACCCa...................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TCTGACCTCAGAAATCCAGTAGTCAGTT................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACa..................................................................................................... 19 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................CTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGA......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGAT......................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGa......................................................................................................................................................... 28 a 1.00 21.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCCAGTAGTCAGTTTCAGTATTGTAATT................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AAGACTAAGATTTGGACTCAGACTTGCTG................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGa............ 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................ACTAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGA............................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGa............ 24 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTG........................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTtc.................................................................................................. 22 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGA.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AAGACTAAGATTTGGACTCAGACTT.................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGG............................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAAtt................................... 28 tt 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGG................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GGATTGTGGGTAGGAGCAGCATGCCC... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TTGTGGGTAGGAGCAGCATGCCCTCC 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGcgc....................................... 26 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGCTGCTGCTTTTGTAACCCCG..................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................AGACTAAGATTTGGACTCAGACTTGCT................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTATGG........................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGG.................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CGCAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGG............................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATG.......................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGAGAA...................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CTGCTGCTTTTGTAACCCCGCAGGAAG.............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................CTGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCC................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAGCTGCTGCTTTTGTAA.......................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GGGATTGTGGGTAGGAGCAGCATGCCt... 27 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAGTAAGTGCAAAAGACTCGG............................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGACTTGC.................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................ACCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGACTTG................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAAGACTCGGGATTGTGGGTAGt............... 23 t 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAAGACTCGGGATTGTGGGTAG................ 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TAACCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGACT..................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTTTAGCTGCTGCTTTTGTAACCCCGCAG.................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCA........ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...............................................TTGTAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAt............................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGT......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGT...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CGTTTCCTCTGACCTCAGAAAT.............................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCCCCT................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAG................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGa............ 26 a 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGC............ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATag......................................................................................................................................................... 28 ag 1.00 65.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTG.......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................ACCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGA....................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGG................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGTG........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGTGT....................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTGGACTCAGACTTGCTGAGCTA........................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGCCCATGAAGAAGCTGAGAATCAGAGG............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TAACCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGACTTGC.................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTAACCCCGCAGGAAGTAAGagc....................................... 24 agc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTATGGA....................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TAGTCAGTTTCAGTATTGTAATTCTATT.............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....................CAGAAATCCAGTAGTCAGTTTCAGTA........................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGCTGAGCTATGGAGAGTTTCCTTT............................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGTAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAA.............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGG............... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................TTGTAATTCTATTGTGTGCCCATGAc................................................................................................................................................................................. 26 c 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TCAGAGGCTATGTGTTTCCCCTGGGGT........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAG............. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGCTGAGCTATGGAGAGTTTCCTTTT........................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CTGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCCCC................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTG..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGct.................. 26 ct 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATT........................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...............................................................................................................................................................................AGCTGCTGCTTTTGTAACCCCG..................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCC................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TTGCTGAGCTATGGAGAGTTTCCTTTT........................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGCTGCTTTTGTAACCCCGCAGGAAG.............................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGgga............ 30 gga 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATT........................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGG................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAGACTCGGGATTGTGGGTAGGcgc............ 25 cgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAa................ 26 a 1.00 14.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGT...................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TAATTCTATTGTGTGCCCATGAAG................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................ACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGC......... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAAGATTTGGACTCAGACTTGCTtagc............................................................................................. 27 tagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAG................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCATt...... 26 t 1.00 8.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCA........ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATt.......................................................................................................................................................... 27 t 1.00 65.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCATG...... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CGCAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGA.......................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCAAACGTTTCCTCTGACCTCAGAAATCCAGTAGTCAGTTTCAGTATTGTAATTCTATTGTGTGCCCATGAAGAAGCTGAGAATCAGAGGCTATGTGTTTCCCCTGGGGTCACATGACTAACCAAAGACTAAGATTTGGACTCAGACTTGCTGAGCTATGGAGAGTTTCCTTTTAGCTGCTGCTTTTGTAACCCCGCAGGAAGTAAGTGCAAAAGACTCGGGATTGTGGGTAGGAGCAGCATGCCCTCC
................................................................((.((..(((...(((((.......((.((((((..(((....))).)))))).))..(((((........))))).))))).)))..)).)).............................................................................................
................................................................65..............................................................................................161.......................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
........................................................TATTGTGTGCCCATGAAGA............................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCCAGTAGTCAGTTTCAGTATTGTAATTCTA................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -