chr7:107425468 107425717 +
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(50)
TESTES

Sense strand
TAGATAGATAGAGCAAGCAAGCTTAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGTCTGCCTCTCACAAAGCATTTGTTTAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTATTTTTAACTATTCAAAAAATGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGCTTTCTAAATTTTCTATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGAGAGC
...................................................((((((....((((....)))).(((.(((((.((.......))....((((((((.........))))))))..))))))))........))))))......................................................................................................
...................................................52...................................................................................................153...............................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATG................... 26 1 165.00 165.00 57.00 40.00 33.00 9.00 14.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCC..................................................................................................... 28 1 48.00 48.00 11.00 17.00 10.00 6.00 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGA.................. 27 1 45.00 45.00 20.00 7.00 8.00 5.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAAC............. 27 1 37.00 37.00 10.00 6.00 6.00 5.00 4.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTT...... 26 1 16.00 16.00 2.00 7.00 3.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGC...................................................................................................... 27 1 15.00 15.00 2.00 6.00 2.00 1.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGt.................. 27 t 12.00 165.00 5.00 3.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAG................. 28 1 12.00 12.00 10.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCT....... 25 1 11.00 11.00 5.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCCA.................................................................................................... 29 1 9.00 9.00 4.00 - 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGG................ 27 1 9.00 9.00 5.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAA.............. 26 1 8.00 8.00 3.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTG..... 25 1 8.00 8.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGTC........................................................................................................................................................................................................ 27 1 8.00 8.00 1.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGG........... 27 1 7.00 7.00 2.00 - 2.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGAT.................... 25 1 7.00 7.00 1.00 - 1.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAG................. 26 1 7.00 7.00 - 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGA.................. 26 1 6.00 6.00 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGA..................... 27 1 6.00 6.00 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATG................... 27 1 5.00 5.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGA............... 25 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCACAAAGCATTTGTTTAGTACCAGGTA...................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGT............................. 28 1 5.00 5.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGG...................... 27 1 5.00 5.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGG........... 29 1 4.00 4.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAAC......................... 29 1 4.00 4.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGAC.................................................................................. 28 1 4.00 4.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAA................................ 27 1 4.00 4.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGA............... 30 1 4.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGAT.................... 28 1 4.00 4.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAAT............................... 28 1 4.00 4.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGA..................... 29 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAGAATGTGAACAGGATGAGGAAC............. 25 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGTTTAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGT........................................................................................................................................................ 30 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGA............... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTG.................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ATGTGAACAGGATGAGGAACGGGC......... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGTTTAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAG......................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTt..... 27 t 3.00 16.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGT........................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTG..... 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGC......... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGT............................. 30 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGAG... 27 1 3.00 3.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGt............... 28 t 3.00 9.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGA..................... 24 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGG................ 29 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAG....................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGt................ 27 t 3.00 7.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAAAATAGAAGAGAATGGCACA............................................................................................................................................................................................................. 22 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTG............................ 29 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACAAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGCT....................................................................... 28 1 3.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTATTTT................................................................................................................................................ 31 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTtt.... 28 tt 3.00 16.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGG........... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 -
.......................................................................................................................................................................................................GAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAG....................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TACATTAATTAAGAGGCCAAGACAAG............................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGt............... 27 t 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGG.......... 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGt........................... 29 t 2.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAA....................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGG...................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAAt............. 27 t 2.00 8.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGT..................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGTTTAGTACCAGGTAGAAACAAAATC........................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCCAtt.................................................................................................. 31 tt 2.00 9.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATG.............................. 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGTCTG...................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGAT.................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGG...................... 23 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTATT.................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACG............ 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGA..................... 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGA.... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAAC......................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAt................. 28 t 2.00 45.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCC........ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGG................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGAT.................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGA.... 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCC........ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGTC........................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATG................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTa..... 27 a 1.00 16.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGaaac............. 27 aaac 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGTA....................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................GAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGC...................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACAAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGCc....................................................................... 28 c 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACG............ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCTTAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGTC........................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGAATGTGAACAGGATG................... 17 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGtt................. 29 tt 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGAT.................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGC......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TTAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGt................................................................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTAT................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTa...... 26 a 1.00 11.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAt.............. 29 t 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................CCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGA.................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGG...................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAGAATGTGAACAGGATGA.................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTG............................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGATAGATAGAGCAAGCAAGCTTAAAA.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCC........ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGA................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCtt....... 25 tt 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCCAt................................................................................................... 30 t 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGC......... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGA.................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GATAGATAGAGCAAGCAAGCTTAAAATA............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TTAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTA.................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGt................ 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGCCAAGACAAGGAtaag....................................................................................... 18 taag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTG............................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCCt.................................................................................................... 29 t 1.00 48.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGt................................. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATG................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATt.............................. 29 t 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGG.......... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TTAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAA........................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGt.... 26 t 1.00 8.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAG....................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAAC............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCCAA................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGt..................... 28 t 1.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGtat............................... 30 tat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCACAAAGCATTTGTTTAGTACCAGtta...................................................................................................................................................................... 28 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGTAT...................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTaa..... 27 aa 1.00 11.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAa....................... 30 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACAAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGC........................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGt..................... 29 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATt................... 26 t 1.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGG.......... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGA.................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAaa................ 30 aa 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTCTATCAACAGAACCCTAAAGTAGAA................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGACC................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGt................................................................................... 31 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGt.................. 31 t 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ATGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGG....................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAA.............. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ACAAAGCATTTGTTTAGTACCAGGTAGt.................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TTCAAAAAATGAGAACCTGTACATTAATTA............................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CAAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGC........................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGA............... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGt................ 29 t 1.00 12.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGTTTAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAt......................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACA........................ 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGt......... 31 t 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTttt... 29 ttt 1.00 16.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................ATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTG............................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................ACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTATT.................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACa............ 26 a 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGG....................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGt...................... 29 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTG.................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGG................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCAACAGAACCCTAAAGTAG..................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGA.... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AACAGGATGAGGAACGGGCCTTGAG... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TAAAGTAGAAGAATGTGAACAG....................... 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCC........ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AAAGCATTTGTTTAGTACCAGGTAGAA................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGTGAACAGGATGAGGAACGGGCC........ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCACAAAGCATTTGTTTAGTACCAGGTAGAA................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGTCTGC..................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGtt............... 28 tt 1.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTA.................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGCT....................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGAC.................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGACC................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TTAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGT......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGA................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACAAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGCTT...................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGAGAGC 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCT....... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATG................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTCTATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAAT............................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACA........................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TACATTAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACA......................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCT....... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGG.......... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TTTAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGT........................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AAAGTAGAAGAATGTGAACAGGAT.................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAAC......................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGt...................... 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................CAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTG............................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................ATTCAAAAAATGAGAACCT........................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -

Antisense strand
TAGATAGATAGAGCAAGCAAGCTTAAAATAGAAGAGAATGGCACATTGTCTGCCTCTCACAAAGCATTTGTTTAGTACCAGGTAGAAACAAAATCAGTATTATTTTTAACTATTCAAAAAATGAGAACCTGTACATTAATTAAGAGGCCAAGACAAGGACAAAGTGACCAGAGTTTGCTTTCTAAATTTTCTATCAACAGAACCCTAAAGTAGAAGAATGTGAACAGGATGAGGAACGGGCCTTGAGAGC
...................................................((((((....((((....)))).(((.(((((.((.......))....((((((((.........))))))))..))))))))........))))))......................................................................................................
...................................................52...................................................................................................153...............................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...................................................................................................TTTTAACTATTCAAAccag.................................................................................................................................... 19 ccag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -