(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(43)
TESTES

Sense strand
ACAGTTGCTATGGAGCTCGCTGAGGACTGGCTCGTGGAGTCTTTGCGATTGTAAATTGGCCCGTGGGCGGGTCTGATGGGCAATGGGAGAGGGCGCGTGCGGTTGTGGGCTCGTGGGCAGTGCCCAGGCACGGACCGATGGAGGTCCTGACCCCCGGCCTCTAGCTCTGGGACTCTGGGTCCTTTGTAAGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGCATGTGAGGGCTGATAAGGCACACATGGCCGGTTACCCTGGGCCGGATTCTAGGTTAACTTGAACACAGGTTTCTCCTGATTGTTCACCTCAACTTGGGGAAATCAACTTTATGGGAGTTCCGCAGGTGAGGAACCAAGGCTTGGTTCCTTATGGCCAGCCCGGTCTCATACACCAGGGAGGAAAATGCAGAAGAAAAGATTCAGCCCCATGTTTACCTAACTCCAGAGCCTGGTTCCACCAGTCCTTCAGCGATCTCCCAGTTCTTGGTTAGCTGTGCGTCGCGTGATTTTTGTAACCCTATCCTGCAGGTACCAAGACTTCCATGCATTTGACCTCTCAGGAGCCACTCGAGTCCTTG
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.(((...((((.....))))....((((((((....(((((.......)))))...))))).)))................))).))..................................................
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................424................................................................................................523................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
..................................TGGAGTCTTTGCGATTGTAAATTGGCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 8.00 8.00 3.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........ATGGAGCTCGCTGAGGACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 5.00 5.00 - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CAGGCACGGACCGATGGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGCGATTGTAAATTGGCCCGTGGGCGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGTTGCTATGGAGCTCGCTGAGGACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGGAGTCTTTGCGATTGTAAATTGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TGGAGTCTTTGCGATTGTAAATTGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........TGGAGCTCGCTGAGGACTGGCTCGTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGTTGCTATGGAGCTCGCTGAGGAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................TGGCTCGTGGAGTCTTTGCGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TTGCGATTGTAAATTGGCCCGTGGGCGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TAAGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TAAGGCACACATGGCCGGTTACCCTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGGGCTGATAAGGCACACATGGCCGGTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGTCTTTGCGATTGTAAATTGGCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGGGAGAGGGCGCGTGCGGTTGTGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CCGTGGGCGGGTCTGATGGGCAATGGGA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGAGGAAAATGCAGAAGAAAAGATTC............................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGTGAGGGCTGATAAGGCACACATGGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........ATGGAGCTCGCTGAGGACTGGCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTAAGCAAGTAATGTGACCAGATCCGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGATGGGCAATGGGAGAGGGCGCGTGa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TTTGTAAGCAAGTAATGTGACCAGATC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TCCTTTGTAAGCAAGTAATGTGACCAGATC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGTTAGCTGTGCGTCGCGTGATT...................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATGTGACCAGATCCGCGCATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGCTCTGGGACTCTGGGTCCTTTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTGTAAGCAAGTAATGTGACCAGATC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GAGCTCGCTGAGGACTGGCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGCTCTGGGACTCTGGGTCCTTTGTAAGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGGGAGAGGGCGCGTGCGGTTGTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GCTGAGGACTGGCTCGTtga....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 tga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGTTAGCTGTGCGTCGCGTGATTT..................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GCGATTGTAAATTGGCCCGTGGGCGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACCAAGACTTCCATGCATTTGACCTCTC.................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATGTGACCAGATCCGCGCATGTGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CTGATGGGCAATGGGAGAGGGCGCGTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGTACCAAGACTTCCATGCATTT............................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TGGGTCCTTTGTAAGCAAGTAATGTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GCTATGGAGCTCGCTGAGGACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCATTTGACCTCTCAGGAGCCACTC......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATTGTTCACCTCAACTTGGGGAAAT................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GTGGGCGGGTCTGATGGGCAATGGtgt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 tgt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGTGACCAGATCCGCGCATGTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGAAAAGATTgtca.......................................................................................................................................................... 18 gtca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCCGGATTCTAGGTTAACTTGAACACc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CCCGTGGGCGGGTCTGATGGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TAAGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..AGTTGCTATGGAGCTCGCTGAGGACTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGGACTCTGGGTCCTTTGTAAGCAAGTAA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAAGACTTCCATGCATTTGACCTCTCAtt................. 31 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.................................................................................................................................................................TAGCTCTGGGACTCTGGGTCCT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TCTGATGGGCAATGGGAGAGGGCGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........ATGGAGCTCGCTGAGGACTGGCTCGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................GTCTTTGCGATTGTAAATTGGCCCGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGa....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTTCCATGCATTTGACCTCTCAGG................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGATGGGCAATGGGAGAGGGCGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGTACCAAGACTTCCATGCATTTG........................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CGGTTGTGGGCTCGTGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGGAAATCAACTTTATGGGAGTTCC.............................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCATTTGACCTCTCAGGAGCCACTCG........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..AGTTGCTATGGAGCTCGCTGAGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGTTCCGCAGGTGAGGAACCA............................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTGCGTCGatga......................................................................... 16 atga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TAAGCAAGTAATGTGACCAGATCCGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TGCTATGGAGCTCGCTGAGGACTGGCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................AGTCTTTGCGATTGTAAATTGGCCCt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GGCGGGTCTGATGGGCAATGGGAGAGGGCGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATGGGCAATGGGAGAGGGCGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGTTAACTTGAACACAGGTTTCTCC........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTTCACCTCAACTTGGGGAAATCAACTT.......................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACCTCTCAGGAGCCACTCGAGTCC... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......GCTATGGAGCTCGCTGAGGACTGGCTCt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTAGCTGTGCGTCGCGTGATTT..................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TTGCGATTGTAAATTGGCCCGTGGGCGGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................AGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGCATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGTTCCGCAGGTGAGGAACCAA.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGTGAGGGCTGATAAGGCACACATGGCC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAAGACTTCCATGCATTTGACCTCTCAGt................. 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................................................................................................................................AGCAAGTAATGTGACCAGATC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GGCAATGGGAGAGGGCGCGTGCGGT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGTGACCAGATCCGCGCATGTGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGATTGTTCACCTCAACTTGGGGAAA................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........ATGGAGCTCGCTGAGGACTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GGTTGTGGGCTCGTGtcc....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CAGGCACGGACCGATGGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TATGGAGCTCGCTGAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ACAGTTGCTATGGAGCTCGCTGAGGACTGGCTCGTGGAGTCTTTGCGATTGTAAATTGGCCCGTGGGCGGGTCTGATGGGCAATGGGAGAGGGCGCGTGCGGTTGTGGGCTCGTGGGCAGTGCCCAGGCACGGACCGATGGAGGTCCTGACCCCCGGCCTCTAGCTCTGGGACTCTGGGTCCTTTGTAAGCAAGTAATGTGACCAGATCCGCGCATGTGAGGGCTGATAAGGCACACATGGCCGGTTACCCTGGGCCGGATTCTAGGTTAACTTGAACACAGGTTTCTCCTGATTGTTCACCTCAACTTGGGGAAATCAACTTTATGGGAGTTCCGCAGGTGAGGAACCAAGGCTTGGTTCCTTATGGCCAGCCCGGTCTCATACACCAGGGAGGAAAATGCAGAAGAAAAGATTCAGCCCCATGTTTACCTAACTCCAGAGCCTGGTTCCACCAGTCCTTCAGCGATCTCCCAGTTCTTGGTTAGCTGTGCGTCGCGTGATTTTTGTAACCCTATCCTGCAGGTACCAAGACTTCCATGCATTTGACCTCTCAGGAGCCACTCGAGTCCTTG
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.(((...((((.....))))....((((((((....(((((.......)))))...))))).)))................))).))..................................................
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................424................................................................................................523................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
..........................CTGGCTCGTGGAGTCTTTGCGATTGTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTCCTTCAGCGATCTCCCAGTTCT.............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................TGGGCGGGTCTGATGgcca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 gcca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCAGCGATCTCCCAGTTCTTGGTTA........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGAAGAAAAGATTttgt.............................................................................................................................................................. 19 ttgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCCACCAGTCCTTCAGC............................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -