(11)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(34)
TESTES

Sense strand
GGCCTCAGGGGACGGCGCGGACGTTGAGCGTCCTCTGGACGCCTCAGCTGGTGAGCGCGGACTGTCCTCGTACTTTTGTTTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTGGGATGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTCGGGTCCTAATCCCCAAACTTTGCCTTCTACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGGTT
.................................................................................................((((((((..(((....)))...)))..))))).........((((((((..(((...((.(((....))).))....)))...)))))))).............................................................
.....................................................................................86...........................................................................................................195.....................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGA........................................................... 25 1 123.00 123.00 37.00 36.00 1.00 5.00 15.00 12.00 3.00 - 1.00 3.00 1.00 1.00 2.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATC......................................................... 27 1 104.00 104.00 32.00 28.00 6.00 4.00 14.00 5.00 4.00 1.00 4.00 - 1.00 4.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGAT.......................................................... 26 1 102.00 102.00 35.00 28.00 4.00 5.00 10.00 10.00 6.00 - - - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGT............................................................... 27 1 95.00 95.00 23.00 26.00 3.00 5.00 9.00 7.00 8.00 5.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGC..................................................................................................................................... 27 1 41.00 41.00 1.00 2.00 9.00 8.00 - - - 7.00 5.00 - 2.00 - 1.00 - 4.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGG................................................................ 26 1 33.00 33.00 2.00 4.00 10.00 7.00 1.00 - - 1.00 2.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTGC................................................................................................................ 26 1 21.00 21.00 8.00 4.00 - 1.00 2.00 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGG................................................................. 25 1 19.00 19.00 - - 6.00 2.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - 2.00 1.00 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATC......................................................... 26 1 10.00 10.00 5.00 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTG.............................................................. 25 1 10.00 10.00 - - 3.00 2.00 1.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGG............................................................. 25 1 10.00 10.00 - 4.00 - - 1.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCT........................................................ 28 1 8.00 8.00 1.00 1.00 1.00 - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATC............................................................................................................................... 28 1 8.00 8.00 5.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGA.......................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTGCG............................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 - 5.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGG...................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAG................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGG........................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................AAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGC.................................................................................................................................. 28 1 6.00 6.00 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTAAGC............................................................................................................................................. 28 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATC............................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................................................TATCGCAATCGTGACTTGAGGGTG.............................................................. 24 1 4.00 4.00 - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTGCGC.............................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGG............................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................................................................CTTTTGTTTTGTTTTGTTTAAAATTGGTC..................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGACC........................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................AGCTTTTGGGCAGCATCGGGGACCTT...................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TTTGGGCAGCATCGGGGACCTTTATT.................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTG.............................................................. 28 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGt............................................................................................................................ 25 t 3.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGG............................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................TGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGG............................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGG....................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................AAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGC.................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TTTGGGCAGCATCGGGGACCTTTAT................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCA.................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGAT.......................................................... 25 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGAC......................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTTGTTTAAAATTGGTCTGG.................................................................................................................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTGTTTAAAATTGGTCTGGTAAGCTT........................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGGGATGATTATCGCAATCGTGACTTG.................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCTCAAACTGGGATGATTATCGCAA.............................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTA................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TTTGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTG................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGT............................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGa............................................................... 27 a 2.00 33.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTG................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TTTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGG.................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGg............................................................... 27 g 2.00 33.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGC.................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGGTT 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTAAG.............................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................AATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGC.................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGG............................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................AGCTGGTGAGCGCGGACTGTCCTCGT................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGTTTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGG.................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................ATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGC.................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTGAGCGCGGACTGTCCTCGTA.................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGtt........................................................................................................................... 26 tt 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGG............................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTCGG..................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCTCAAACTGGGATGATTATCGCAATC............................................................................ 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCG.............................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCG.............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGa.................................................................................................................................. 30 a 1.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTGGGAT......................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGAt......................................................................................................................... 28 t 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTC....................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGTTTTGTTTTGTTTAAAATTGGcctg................................................................................................................................................... 27 cctg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTATCGCAATCGTGACTTGAGGGcg.............................................................. 25 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTCGG..................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGGGATGATTATCGCAATCGTGACTT..................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGACCT....................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AACTGGGATGATTATCGCAATCGTGACT...................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTaaa..................................................... 31 aaa 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTaggg..................................................................................................................................... 27 aggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCTCAAACTGGGATGATTATCGCAATCGTt......................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................GCGGACGTTGAGCGTCCTCTGGACGCCTCAGt.......................................................................................................................................................................................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGgc......................................................................................................................... 26 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TTTGTTTAAAATTGGTCTG................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGt........................................................... 25 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TAATCCCCAAACTTTGCCTTCTACCT....................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGtt. 27 tt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..............................................GCTGGTGAGCGCGGACTGTCCTCGT................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTGCGt.............................................................................................................. 28 t 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGtgc..................................................................................................................................... 27 tgc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGGGCAGCATCGGGGACCTTTAT................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGTGACTTGAGGGTGGGATCTCGGGT................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGGT. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTtgga.......................................................................................... 28 tgga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TTGTTTAAAATTGGTCTGGTAAGCT............................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGAC......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGTTTAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTG........................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGt............................................................. 26 t 1.00 10.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TTCTCAAACTGGGATGATTATCGCAATC............................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................CGCCTCAGCTGGTGAGCGCGGACTGT......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGaga........................................................... 25 aga 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTC....................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCAT................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGGCAGCATCGGGGACCTTTA.................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAt................................................................................................................................... 29 t 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................AGCTTTTGGGCAGCATCGGGGACCT....................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTtc................................................................................................................ 26 tc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGa............................................................................................................................ 25 a 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGCCTTCTACCTAGAACGGTTGATGCC........ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTG................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGG............................................................. 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGG.. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGt........................................................................................................................... 26 t 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGtt.......................................................... 26 tt 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGT............................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................AAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAt................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................ATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTG.............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTC....................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCG... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCtgt. 27 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGa.. 26 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGAaa........................................................................................................................ 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TCAAACTGGGATGATTATCGCAATCGT.......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................CGGACGTTGAGCGTCCTCTGGACGCCTCAGCTGGT...................................................................................................................................................................................................... 35 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGAa.......................................................... 26 a 1.00 123.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TTATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTG............................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTGGG........................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GGGATGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGT............................................................... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GGGCAGCATCGGGGACCTTTATTG................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CCCAAACTTTGCCTTCTACCTAGAACGGT............... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATC......................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGACC........................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCGTACTTTTGTTTTGTTTTGTTTAAA............................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGAC......................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTcggc..................................................................................................................................... 27 cggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTa....................................................... 29 a 1.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................................TCAGCTGGTGAGCGCGGACTGTCCTC..................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CAGCTGGTGAGCGCGGACTGTCCTCttt.................................................................................................................................................................................. 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTG.............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GGATGATTATCGCAATCGTGACTTGAGG................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGt............................................................ 26 t 1.00 10.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................ATGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGG................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTGTTTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGG.................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATt............................................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGAaa......................................................... 29 aa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GCTGGTGAGCGCGGACTGTCCTCGTA.................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCAT................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TCTACCTAGAACGGTTGATGCCATCC.... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTA................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTGAGCGCGGACTGTCCTCGTACTT............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGAC......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGt.. 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATt......................................................... 27 t 1.00 102.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................TTAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTG........................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TCAGCTGGTGAGCGCGGACTGTCtc...................................................................................................................................................................................... 25 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCT........................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGCGCGGACTGTCCTCGTACTTT.............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTA................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCa........................................................ 28 a 1.00 104.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGt..................................................................................................................................... 27 t 1.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................AAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGC..................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGt................................................................ 26 t 1.00 19.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTGGGt.......................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTGGGA.......................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TATCGCAATCGTGACTTGA................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCTCAAACTGGGATGATTATCGCAAT............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGt........................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TCCCCAAACTTTGCCTTCTACCTAGAACG................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGTGACTTGAGGGTGGGATCTCGG..................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAAACTGGGATGATTATCGCAATCGTGA........................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TTTATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTG............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TTTTGGGCAGCATCGGGGACCTTTAT................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGta............................................................... 27 ta 1.00 19.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTAA............................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................................................TGGGATGATTATCGCAATCGTGACTTGAGG................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGG............................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGCAATCGTGACTTGAGG................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGGTAAGCTTTTGGG...................................................................................................................................... 15 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGCCTCAGGGGACGGCGCGGACGTTGAGCGTCCTCTGGACGCCTCAGCTGGTGAGCGCGGACTGTCCTCGTACTTTTGTTTTGTTTTGTTTAAAATTGGTCTGGTAAGCTTTTGGGCAGCATCGGGGACCTTTATTGCGCCACCCTTTCTCAAACTGGGATGATTATCGCAATCGTGACTTGAGGGTGGGATCTCGGGTCCTAATCCCCAAACTTTGCCTTCTACCTAGAACGGTTGATGCCATCCGGTT
.................................................................................................((((((((..(((....)))...)))..))))).........((((((((..(((...((.(((....))).))....)))...)))))))).............................................................
.....................................................................................86...........................................................................................................195.....................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.........................................................CTGTCCTCGTACTTactg............................................................................................................................................................................... 18 actg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
......................................................GCGCGGACTGTCCTCGTACTTTTGTT.......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACCTTTATTGCGCCACgaag........................................................................................................... 20 gaag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -