| Gene: Ftl1 | ID: uc009gvf.1_intron_1_0_chr7_52714031_r | SPECIES: mm9 |
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|
(1) OTHER.ip |
(9) OTHER.mut |
(2) OVARY |
(10) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(43) TESTES |
| TCGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGTGCAGGTAAGAAGCGGGGGTATTGGGCACTACCGAGCATGTGCGTTTACTTGCCATCCCCATAGTTTGGGCATCCGGATAGACGTCTTGGAAGGGAGTGGTGGCAGGACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAGCAACTAAACCCACCAGGATGTCAGAAACTGGAAAATGGGGGTAATTACAGAATACAGATGAGGACTGCTGGGCTGGGGAGAGGCGGTGTCTCTCTAGCTAGCATGGAAATCACAATGTAGACCAGGTTGCCTCCTATCAAGAGATCCTCCTGTCTTCTCGCCCAGTCTCTCAGTGGTGGGATTAAAGACAGTATCCCATTATTTTTCCCCACTGTGCCCACTTTTCCTGTGCAGTCAGTTTTATATTGGCTGGGTGAAGGATGTAATCTAGGCTTGATATTCTTGTGTGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATGGAAGCTGC ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((.((....((((...((.((((((.......)))))).)).))))....(((.......))).....)).)))))).................................................. .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................374................................................................................................473................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 4 | 416.75 | 416.75 | 144.00 | 130.50 | 51.50 | 46.25 | 14.25 | 3.25 | 0.75 | 11.00 | - | 1.25 | 0.75 | 0.25 | 1.25 | - | 1.50 | 2.25 | 2.25 | 0.50 | 0.25 | 0.25 | 1.00 | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | 0.25 | 0.25 | 0.75 | 0.25 | 0.50 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 4 | 122.50 | 122.50 | 35.00 | 35.75 | 14.75 | 14.00 | 8.25 | 3.00 | 0.50 | 7.50 | - | 0.50 | 0.25 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 4 | 101.25 | 101.25 | 23.50 | 26.00 | 10.50 | 10.00 | 4.50 | 11.00 | 1.50 | 5.50 | - | 0.75 | 1.75 | 0.25 | 0.25 | - | - | 3.50 | - | 0.25 | - | - | 0.50 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 4 | 68.75 | 68.75 | 18.25 | 16.50 | 11.50 | 9.75 | 4.75 | - | 1.25 | - | - | - | - | 0.25 | 0.50 | 0.25 | 1.25 | 0.25 | 2.00 | - | 0.50 | - | 0.50 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 4 | 52.00 | 52.00 | 14.25 | 15.50 | 9.00 | 7.25 | 2.00 | - | - | 1.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | 0.50 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 4 | 36.25 | 36.25 | 5.00 | 7.50 | 2.25 | 2.00 | 2.25 | 1.50 | 2.75 | 0.25 | - | 3.25 | - | 2.25 | - | 0.50 | - | 0.75 | 1.75 | 0.75 | - | 0.50 | - | 0.25 | 2.00 | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 4 | 25.75 | 25.75 | 3.25 | 2.00 | 0.25 | - | 0.25 | - | 4.25 | - | - | 4.00 | 0.25 | 2.75 | 3.75 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | 1.25 | 0.50 | 0.25 | - | 0.25 | 0.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 4 | 14.25 | 14.25 | 3.75 | 1.75 | 1.75 | 1.25 | 2.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 4 | 12.75 | 12.75 | 2.75 | 1.75 | 0.75 | 0.75 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.25 | 0.75 | - | 0.50 | - | 0.75 | 1.00 | 0.25 | 0.25 | - | 0.75 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 4 | 11.50 | 11.50 | - | - | - | - | - | 1.00 | 0.25 | - | 5.75 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | 0.50 | - | 0.25 | 0.25 | 1.50 | - | - | 1.00 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 4 | 11.50 | 11.50 | 2.50 | 1.50 | 1.50 | - | 1.25 | - | - | 0.75 | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.50 | 1.75 | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 4 | 10.50 | 10.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 0.75 | 2.00 | - | 3.75 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................CTGGGCTGGGGAGAGGCGGTGTC............................................................................................................................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 4 | 9.00 | 9.00 | 0.50 | 0.75 | 0.50 | 0.25 | 1.50 | 1.25 | 0.25 | - | - | 1.00 | - | 0.25 | 0.25 | 0.75 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 4 | 8.75 | 8.75 | 1.00 | 0.75 | 1.00 | - | 1.75 | - | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | 0.25 | - | 0.50 | - | 1.00 | - | 0.50 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | 0.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 4 | 7.50 | 7.50 | 0.50 | 1.25 | - | - | 1.00 | 1.00 | 0.25 | - | 1.75 | - | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | 0.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 7.25 | 101.25 | 2.00 | 2.75 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 7.25 | 101.25 | 2.50 | 2.00 | 1.00 | 1.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 4 | 7.25 | 7.25 | 2.25 | 2.00 | 0.75 | - | 1.50 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................GGAGTGGTGGCAGGACTAGTGTAGACAATAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 33 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 4 | 7.00 | 7.00 | 1.00 | 0.25 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | 2.00 | - | - | 0.25 | - | 0.25 | 0.50 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 4 | 6.25 | 6.25 | 1.25 | - | 0.75 | 0.25 | 3.00 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGGGGAGAGGCGGTGT............................................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 4 | 5.25 | 5.25 | 0.50 | 1.00 | - | 0.50 | 0.75 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGGGGAGAGGCGGT............................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 4 | 5.00 | 5.00 | 0.75 | 1.25 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.25 | - | 0.50 | - | - | 0.25 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 4 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 0.50 | - | 0.25 | 2.25 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 4 | 4.25 | 4.25 | 0.75 | - | 0.50 | - | 0.25 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | 0.25 | - | 1.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GTGGCAGGACTAGTGTAGACAATAGGAGTAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 31 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 4 | 3.75 | 3.75 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.25 | 0.75 | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 4 | 3.50 | 3.50 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | 1.50 | - | - | 0.25 | - | 0.50 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 3.25 | 122.50 | 1.00 | 1.25 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 4 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 2.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 3.00 | 36.25 | 0.75 | 1.00 | 0.25 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................TGTCAGAAACTGGAAAATGGGGGTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................CTAGTGTAGACAATAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 4 | 3.00 | 3.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 4 | 2.75 | 2.75 | - | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | 0.75 | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 4 | 2.75 | 2.75 | 0.25 | 0.25 | - | - | 1.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 4 | 2.50 | 2.50 | 0.50 | - | 0.25 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 4 | 2.50 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 4 | 2.50 | 2.50 | - | 0.50 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 4 | 2.50 | 2.50 | - | - | - | 0.25 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | a | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................CAGGATGTGCAGGTAAGAAGCGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAtt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | tt | 2.00 | 101.25 | 0.75 | 0.25 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TCCGGATAGACGTCTTGGAAGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................ACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGGGGAGAGGCGGTG.............................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 4 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 0.50 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 4 | 2.00 | 2.00 | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TCCAGGATGTGCAGGTAAGAAGCGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................GGGGTAATTACAGAATACAGATGAGGACTGCTG................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 33 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGCTTGATATTCTTGTGTGCAG.................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................GCAGGACTAGTGTAGACAATAGGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 4 | 1.75 | 1.75 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 4 | 1.75 | 1.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAG.............. | 28 | 8 | 1.75 | 1.75 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.38 | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........AACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 4 | 1.75 | 1.75 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 1.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 4 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 4 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 23 | 4 | 1.25 | 1.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 4 | 1.25 | 1.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 4 | 1.25 | 1.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGggc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | ggc | 1.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.25 | 122.50 | 0.75 | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........AACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 4 | 1.25 | 1.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 4 | 1.25 | 1.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................GGGGGCCGTGCACTCTTCCAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 6 | 1.17 | 1.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................GTGGTGGCAGGACTAGTGTAGACAA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................CGGATAGACGTCTTGGAAGGGAGTGGTGGCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGATGTAATCTAGGCTTGATATT............................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCttt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................AGGACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................AGGACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAGg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 33 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TAGACAATAGGAGTATGTAGAGCAAC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGa............. | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............CGATCGCGGGGGCCGcgca........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | cgca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCCAGGAGGCCATGGAAGCTGCcttt | 28 | cttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTAGGCTTGATATTCTTGTGTGC.................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................GGACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GAGTGGTGGCAGGACTAGTGTAGA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGATTAAAGACAGTA..................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGGGGAGAGGCGGTGTa............................................................................................................................................................................................................................................................ | 22 | a | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................AGGAGTATGTAGAGCAACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............CGATCGCGGGGGCCGTGCtt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................GGACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................ATAGGAGTATGTAGAGCAACTAAACCCACCAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | a | 1.00 | 12.75 | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................AGTGGTGGCAGGACTAGTGTAGACA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................AATAGGAGTATGTAGAGCAACTAAAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCg.......... | 29 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAat......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | at | 1.00 | 101.25 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........AACGATCGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................CAGGACTAGTGTAGACAATAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GGGAGTGGTGGCAGGACTAGTGTAGACAATAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........AACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GACAATAGGAGTATGTAGAGCAACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................TTCCAGGATGTGCAGGTAAGAAGCGG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................AGGACTGCTGGGCTGGGGAGAG.................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GTTTGGGCATCCGGATAGACG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................TAGGAGTATGTAGAGCAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGtcgt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | tcgt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATATTGGCTGGGTGAAGGATGTAA............................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGATGTAATCTAGGCTTG.................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................CGTCTTGGAAGGGAGTGGTGGCAGGACTAGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACAATGTAGACCAGGgc...................................................................................................................................................................................................................... | 17 | gc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................TAGGAGTATGTAGAGCAACTAAACCCAC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................TTGGGCACTACCGAGCATGTGCGTTTACTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 5 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTAGGCTTGATATTCTTGTGTGCAG.................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGT.......................... | 27 | 5 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 5 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGcgcc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | cgcc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGA............... | 27 | 8 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................GGACTAGTGTAGACAATAGGAGTA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................CAATAGGAGTATGTAGAGCAACTAAACCCAC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCTGGGGAGAGGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | aa | 1.00 | 101.25 | 0.50 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAGCAACT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................GTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAGCAACTA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................GACGTCTTGGAAGGGA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGggca........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | ggca | 1.00 | 0.25 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................TAGACGTCTTGGAAGGGAGTGGgga....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | gga | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................GGACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................ACTCTTCCAGGATGTGCA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 11 | 0.82 | 0.82 | - | - | - | - | - | 0.82 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 5 | 0.80 | 0.80 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 5 | 0.80 | 0.80 | - | - | - | - | - | 0.80 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGG............. | 29 | 8 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCagtg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | agtg | 0.75 | 0.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTtcac.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | tcac | 0.75 | 0.75 | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 4 | 0.75 | 0.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | t | 0.75 | 12.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........AACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 4 | 0.75 | 0.75 | 0.25 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 4 | 0.75 | 0.75 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 4 | 0.75 | 0.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGC............ | 30 | 7 | 0.71 | 0.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCA.......... | 27 | 7 | 0.71 | 0.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.43 | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 6 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 5 | 0.60 | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 5 | 0.60 | 0.60 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 5 | 0.60 | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................CGGGGGCCGTGCACTCTTCCAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 5 | 0.60 | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | a | 0.50 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTtca........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | tca | 0.50 | 0.75 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAg.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | g | 0.50 | 101.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAtt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | tt | 0.50 | 122.50 | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | c | 0.50 | 5.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | tt | 0.50 | 2.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGATGAATGGGGTAAAACC.................... | 24 | 6 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGaac.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | aac | 0.50 | 1.75 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 36 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | t | 0.50 | 8.75 | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACaa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | aa | 0.50 | 416.75 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | a | 0.50 | 1.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 30 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | t | 0.50 | 3.75 | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | t | 0.50 | 10.50 | - | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | a | 0.50 | 0.75 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 0.50 | 9.00 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATG........ | 28 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................GGGGCCGTGCACTCTTCCAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 22 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGG............................ | 27 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCAT......... | 27 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGC............ | 24 | 11 | 0.27 | 0.27 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCACa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | a | 0.25 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | a | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 33 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | tt | 0.25 | 25.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | tt | 0.25 | 2.75 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTaa....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | aa | 0.25 | 68.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ATCGCGGGGGCCGTGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | g | 0.25 | 3.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTacac.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | acac | 0.25 | 0.75 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGcgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | cgc | 0.25 | 5.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | a | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | c | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACgct....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | gct | 0.25 | 11.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGcc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | cc | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTGCcctc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | cctc | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | g | 0.25 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | ca | 0.25 | 0.75 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | a | 0.25 | 1.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGcgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | cgc | 0.25 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCtc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | tc | 0.25 | 10.50 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTtct........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | tct | 0.25 | 0.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | aa | 0.25 | 122.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAttt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | ttt | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................GCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | ta | 0.25 | 2.50 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............CGATCGCGGGGGCCGTGCAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 0.25 | 7.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCttgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | ttgc | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGggcc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | ggcc | 0.25 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | aa | 0.25 | 0.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTcca........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | cca | 0.25 | 0.75 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAaat........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | aat | 0.25 | 101.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 32 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGaact......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | aact | 0.25 | 1.75 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGggg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | ggg | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 33 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | c | 0.25 | 416.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGggca........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | ggca | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................CGCGGGGGCCGTGCACTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCC........... | 25 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............ACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGga........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | ga | 0.25 | 1.75 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................TCGCGGGGGCCGTGCACTCTT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CAGAACGATCGCGGGGGCCGcccg........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | cccg | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | ta | 0.25 | 1.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTacac.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | acac | 0.25 | 0.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 0.25 | 416.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCAta......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | ta | 0.25 | 101.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | a | 0.25 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | t | 0.25 | 25.75 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....TTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGcg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | cg | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | g | 0.25 | 5.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | t | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 0.25 | 14.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGcg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | cg | 0.25 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATGAATGGGGTAAAACC.................... | 22 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGaaa.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | aaa | 0.25 | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGcgca........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | cgca | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTtc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | tc | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........AGAACGATCGCGGGGGCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | a | 0.25 | 8.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | c | 0.25 | 36.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...AGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | t | 0.25 | 1.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 0.25 | 14.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGaga.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | aga | 0.25 | 1.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGgac.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | gac | 0.25 | 1.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCcc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | cc | 0.25 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGGCCatgc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | atgc | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGT.......................... | 29 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGtc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | tc | 0.20 | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGGacc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | acc | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TTCAGAACGATCGCGGGGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGTAAA....................... | 28 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGT.......................... | 25 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................CGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GAGTTTCAGAACGATCGCGGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........AACGATCGCGGGGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 16 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GTTTCAGAACGATCGCGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGTAA........................ | 29 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 16 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGGG........................... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATG.............................. | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCA.......... | 32 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGA............... | 29 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGG................ | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCATCTCAAGATGAATGGGGTAA........................ | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGG............................. | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGG............................. | 26 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATGGA...... | 30 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATa........ | 28 | a | 0.14 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATG........ | 31 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATGG....... | 27 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATGG....... | 29 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCA.......... | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCA.......... | 28 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGA............... | 28 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAG.............. | 29 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGG................ | 27 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGC............ | 26 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTAAAACCCAGGAGGCCATGGAAGCTG. | 27 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGGTAAAACCCAGGAGGCCATGG....... | 24 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGC............ | 27 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGG............. | 28 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAAACCCAGGAGGCCATGGAAGCTG. | 26 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCTCAAGATGAATGGGG........................... | 19 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGGTAAAACCCAGGAGGCC........... | 20 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGG............. | 26 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................CTCTTCCAGGATGTGCAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAATGGGGTAAAACCCAGGAGGC............ | 23 | 11 | 0.09 | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGGGTAAAACCCAGGAG.............. | 19 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................CTTCCAGGATGTGCAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAATGGGGTAAAAC..................... | 15 | 16 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TCGAGTTTCAGAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGTGCAGGTAAGAAGCGGGGGTATTGGGCACTACCGAGCATGTGCGTTTACTTGCCATCCCCATAGTTTGGGCATCCGGATAGACGTCTTGGAAGGGAGTGGTGGCAGGACTAGTGTAGACAATAGGAGTATGTAGAGCAACTAAACCCACCAGGATGTCAGAAACTGGAAAATGGGGGTAATTACAGAATACAGATGAGGACTGCTGGGCTGGGGAGAGGCGGTGTCTCTCTAGCTAGCATGGAAATCACAATGTAGACCAGGTTGCCTCCTATCAAGAGATCCTCCTGTCTTCTCGCCCAGTCTCTCAGTGGTGGGATTAAAGACAGTATCCCATTATTTTTCCCCACTGTGCCCACTTTTCCTGTGCAGTCAGTTTTATATTGGCTGGGTGAAGGATGTAATCTAGGCTTGATATTCTTGTGTGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGTAAAACCCAGGAGGCCATGGAAGCTGC ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((((((.((....((((...((.((((((.......)))))).)).))))....(((.......))).....)).)))))).................................................. .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................374................................................................................................473................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATCCTCCTGTCTTCTCGCCCAGTCTCTCA.......................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCCTGTCTTCTCGCCCAGTCTCTCA.......................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................GGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGTg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | g | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGTCTTCTCGCCCAGTCTCTCA.......................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................GGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGAcc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | cc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGTCTTCTCGCCCAGTCTCTCA.......................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGTCTTCTCGCCCAGTCTCTCAt.......................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCTCTCTAGCTAGCAT.............................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CCGTGCACTCTTCCAGGATGTt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................GCGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GAACGATCGCGGGGGCCGTGCACTCTTC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................CGGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGCAGAAGCCATCTCAAGATGAATGGGGTAA........................ | 33 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................GGGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGTGCA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................GGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................GGGGCCGTGCACTCTTCCAGGATGTGCA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |