chr7:52381858 52382128 -
(1)
OTHER.ip 		(13)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(54)
TESTES

Sense strand
CCCTGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGATCCCTCCACCCTATGACAAGGTGAGCCTTGCAAGCCTAGCCTTACAGCCTCTGCGTCCAGCGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGCCTACCCTGCTGGCCTTCTTGCTAGGTGTTCCCAACAGGTCTCTGAGCATCTCTTTCTCTCAACAGAAAAAGCGGATGGTGGTCCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGCC
.........................................................................................((((((((((((......))))))............((((...((.......))..)))).))))))...................................................................................................................
.....................................................................................86........................................................................160.............................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCC................................................................................................................................. 52 1 42767.00 42767.00 27475.00 15292.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCC.................................................................................................................................. 52 1 787.00 787.00 620.00 167.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCA................................................................................................................................ 52 1 444.00 444.00 170.00 274.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGC.................................................................................................................................................................... 17 1 233.00 233.00 - - 48.00 - 4.00 - 47.00 69.00 - 18.00 - 13.00 6.00 - 11.00 17.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 26 1 92.00 92.00 - - 21.00 17.00 24.00 6.00 2.00 3.00 1.00 - 4.00 2.00 2.00 5.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCT................................................................................................................................................................... 18 1 87.00 87.00 - - 1.00 - - 19.00 10.00 6.00 14.00 14.00 - 4.00 4.00 2.00 6.00 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 27 1 79.00 79.00 - - 28.00 7.00 5.00 6.00 2.00 1.00 7.00 - 2.00 3.00 3.00 11.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTAC.............................................................................................................................................................. 23 1 62.00 62.00 - - 32.00 6.00 6.00 - 4.00 3.00 - 2.00 1.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTA.................................................................................................................................................................. 19 1 47.00 47.00 - - 5.00 - 1.00 9.00 2.00 8.00 - 4.00 6.00 - 5.00 - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 34 1 44.00 44.00 - - - 23.00 14.00 5.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 23 1 42.00 42.00 - - 4.00 - 11.00 7.00 1.00 - 4.00 - 3.00 - 1.00 2.00 - 6.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACC............................................................................................................................................................. 24 1 42.00 42.00 - - 9.00 - 2.00 2.00 4.00 6.00 - - 2.00 4.00 2.00 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTG..................................................................................................................................................................... 16 1 41.00 41.00 - - 3.00 - - - 17.00 1.00 - 7.00 - 4.00 3.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 28 1 38.00 38.00 - - - - 4.00 7.00 2.00 1.00 4.00 3.00 2.00 - 1.00 2.00 2.00 - 2.00 1.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 35 1 36.00 36.00 - - - 8.00 6.00 1.00 - - 13.00 - 5.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 25 1 32.00 32.00 - - 5.00 - 4.00 4.00 - - - 9.00 3.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 20 1 30.00 30.00 - - 5.00 3.00 - 3.00 - - 7.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 22 1 28.00 28.00 - - 7.00 10.00 2.00 3.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 25 1 28.00 28.00 - - - 11.00 - - - - 5.00 2.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 19 1 27.00 27.00 - - 7.00 - 2.00 6.00 2.00 - 4.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 31 1 26.00 26.00 - - 2.00 5.00 - 2.00 - - 12.00 - 1.00 - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 22 1 26.00 26.00 - - 2.00 14.00 - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTG..... 25 1 25.00 25.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 1.00 2.00 4.00 1.00 - - 1.00 1.00 - 5.00 - - - 5.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 24 1 24.00 24.00 - - 4.00 8.00 5.00 2.00 - - - - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATT................................................................................................................................................................ 21 1 23.00 23.00 - - 2.00 - - 11.00 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGC. 26 1 23.00 23.00 - - - - - - 2.00 2.00 3.00 6.00 - 5.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 34 1 23.00 23.00 - - 1.00 7.00 1.00 - - 1.00 11.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 26 1 22.00 22.00 - - 9.00 9.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTA............................................................................................................................................................... 22 1 19.00 19.00 - - - - 9.00 4.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 21 1 19.00 19.00 - - 1.00 - 2.00 3.00 - - - 1.00 - - 2.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 24 1 19.00 19.00 - - 1.00 4.00 - 1.00 1.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 30 1 17.00 17.00 - - 3.00 5.00 - - 1.00 - 6.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 17 1 17.00 17.00 - - - - 6.00 - - - 9.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 29 1 17.00 17.00 - - 6.00 - 4.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................ACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 18 1 16.00 16.00 - - 1.00 - 1.00 5.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 33 1 16.00 16.00 - - - - 7.00 5.00 - - - - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACA......................................................................................................................................................... 28 1 16.00 16.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 5.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 32 1 14.00 14.00 - - - 1.00 5.00 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 30 1 14.00 14.00 - - - 8.00 2.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTA.................................................................................................................................................................. 18 1 14.00 14.00 - - - - 3.00 - 2.00 - 6.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 21 1 14.00 14.00 - - 3.00 - 4.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 23 1 13.00 13.00 - - 7.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGG.................................................................................................................................................................................................................................................. 26 2 12.50 12.50 - - - - - - 0.50 - - 2.00 - 1.00 - 0.50 - 0.50 3.50 - 0.50 2.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - -
...........................................................................................................................................CCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 17 1 12.00 12.00 - - 9.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTAT................................................................................................................................................................. 20 1 12.00 12.00 - - - - - 3.00 2.00 - - 1.00 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 20 1 12.00 12.00 - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCT............................................................................................................................................................ 25 1 12.00 12.00 - - 1.00 - 2.00 1.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 27 1 11.00 11.00 - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 29 1 11.00 11.00 - - - - 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGA.... 26 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 3.00 - - - - 1.00 2.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 33 1 10.00 10.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - 3.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCT................................................................................................................................................................... 17 1 9.00 9.00 - - - - - 1.00 3.00 - - 2.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 35 1 9.00 9.00 - - - 3.00 1.00 2.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGt.... 26 t 9.00 25.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTAC.......................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 27 1 8.00 8.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTG..................................................................................................................................................................... 17 1 8.00 8.00 - - - - - - - 2.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 18 1 8.00 8.00 - - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 28 1 8.00 8.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTACC............................................................................................................................................................. 23 1 8.00 8.00 - - - - 2.00 - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 22 1 8.00 8.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 35 1 7.00 7.00 - - - - 3.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 32 1 7.00 7.00 - - - 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 32 1 7.00 7.00 - - - 4.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGCC 27 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTG...................................................................................................................................................... 31 1 6.00 6.00 - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCATGAAAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 - - 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 23 1 6.00 6.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATT................................................................................................................................................................ 20 1 6.00 6.00 - - - - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTGTT.................................................................................................................................................... 33 1 6.00 6.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGA................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 5.50 5.50 - - - - - - - - - 0.50 - 1.00 - - - - 0.50 - - 0.50 - 1.50 0.50 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGC. 29 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................ACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 19 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGG................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 5.00 5.00 - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - 1.00 - - - - 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGG........ 22 1 5.00 5.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 19 1 5.00 5.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 31 1 5.00 5.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGC.................................................................................................................................................................... 16 3 4.67 4.67 - - - - - - 1.67 1.67 - 0.33 - 0.33 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGTTGTTCGGCTGAAGC. 20 3 4.67 4.67 - - 1.00 3.00 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGC....... 23 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCTATTACC............................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGA.... 22 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................ACCTACATTGTTTGAGCC.............................................................................................................................................. 18 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AGCGGATGGTGGTCCCT............................. 17 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 33 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGGCTG..... 21 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGTTGTTCGGCTGAAGC. 21 3 4.00 4.00 - - 0.33 3.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 15 3 3.33 3.33 - - - - - - 0.67 - 1.67 - - 0.33 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAAAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTtgt................................................................................................................................................................ 20 tgt 3.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGC.................................................................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGC....... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGt................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 2.50 12.50 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACAT........................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................ATGTTCTGCTATTACCTA........................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 16 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AAGCGGATGGTGGTCCCTGC........................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAtacg.................................................................................................................... 28 tacg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCT...... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGGC....... 19 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CGGATGGTGGTCCCTGCTGCT....................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 17 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCT................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGt................................................................................................................... 34 t 2.00 16.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTGCTATTACCTACATTGT..................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGG........ 18 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGg.... 26 g 2.00 25.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CCCACTGGCTGAGACGCC.................................................................................................................. 18 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAA... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTG..... 22 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTA............................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGCC 30 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGAT................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 19 3 1.33 1.33 - - - - - 0.67 - 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGTTGTTCGGCTGAAGCC 22 3 1.33 1.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................CACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 15 4 1.25 1.25 - - 0.75 - - - - - - - - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAA... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCTATTAC.............................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTG...................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGCC 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................................................................................ACATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 40 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGAagc................................................................................................................... 31 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCAAGGTTGTTCGGCTGA.... 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAtc. 26 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ATGAAAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAAAACCCCACTGGCTGAtacg.................................................................................................................... 22 tacg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAtt.. 24 tt 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGC........................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................CTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCT...... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAat. 29 at 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTtt.... 26 tt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCATG......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................CTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 34 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCT.......................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCATGAAAACCCCACTGGCT.......................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGCGGATGGTGGTaga.............................. 22 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTtttt.. 28 tttt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATcacc............................................................................................................................................................. 24 cacc 1.00 12.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTGTTTGAGCCTCATGAA....................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCTA.................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCA................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AGCGTCTGTGATGTTCTGC.................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCT...... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AGCGGATGGTGGTCCCTGC........................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGttt.. 28 ttt 1.00 25.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTAC.......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGG............................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATaa............................................................................................................................................................... 22 aa 1.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CCACTGGCTGAGACGCCTAC............................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGtt................................................................................................................................................................................................................................................ 28 tt 1.00 12.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................GTGGTCCCTGCTGCTCTCAAGG................ 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................CCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTG..... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTA........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GTGATGTTCTGCTATTACCTACAT........................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTtacc............................................................................................................................................................... 22 tacc 1.00 87.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................AAAAAGCGGATGGTGGTCCCTGtt.......................... 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 16 2 1.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 21 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACG.................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................CTATTACCTACATTGTTTGAGCC.............................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGC....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGGTTGTTCGGCT...... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCa................................................................................................................................................................... 19 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CTACATTGTTTGAGCCTCATGAAAAC.................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................GCGGATGGTGGTCCCTGCTGCTC...................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATTGTTTGAGCCTCATGAA....................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGG........ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGTTTGAGCCTCATGAAAAC.................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CTGGCTGAGACGCCTACCCTGCTGGCC..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTAgc............................................................................................................................................................. 23 gc 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGCCat 26 at 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTGT..................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 35 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AGCGGATGGTGGTCCCTGCTGCTC...................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTtg................................................................................................................................................................. 20 tg 1.00 87.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................AAAAAGCGGATGGTGGTCCCTGC........................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CAAGGTGTTGGATGGGATCCCTCCAtc....................................................................................................................................................................................................................................... 27 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GAAAAAGCGGATGGTGGTCCCTGCTG......................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGtt... 27 tt 1.00 25.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAA... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGGCT...... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CCTCAAGGTGTTGGATG.................................................................................................................................................................................................................................................... 17 3 1.00 1.00 - - - - - 0.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................GCGGATGGTGGTCCCTGCTGCTCTCAAGGTTGT............ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCAAGGTTGTTCGGC....... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAA... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AACCCCACTGGCTGAGACtc................................................................................................................... 20 tc 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTatgc.................................................................................................................................................................... 17 atgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CATGAAAACCCCACTGGCTGAGAgg.................................................................................................................... 25 gg 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGCGGATGGTGGTCCCTGC........................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGC........................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................CCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGt.... 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGa.................................................................................................................................................................... 17 a 1.00 41.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CAGGTCTCTGAGCATCTCTTTCTCTCAACAG.................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGa. 26 a 1.00 28.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................GTCCCTGCTGCTCTCAAGG................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AAAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TCTCAACAGAAAAAGCGGATGGTGGT................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGC. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCTGTGATGTTCTGCTATTAC.............................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGa................................................................................................................... 35 a 1.00 44.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGATt............................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTACa............................................................................................................................................................. 24 a 1.00 62.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCTCATGAAAACCCCACTGaga.......................................................................................................................... 23 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTAa.............................................................................................................................................................. 23 a 1.00 19.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTg.................................................................................................................................................................. 19 g 1.00 87.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACa.................................................................................................................... 31 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAACCCCACTGGCTGAGAC..................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGatgt.... 26 atgt 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................TGGTCCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCG......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAggcc 27 ggcc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAAAGCGGATGGTGGTCCCTGCTGC........................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................CTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGC....... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGt. 26 t 1.00 28.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAAAGCGGATGGTGGTCCCTGCTGaa....................... 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGT............ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGgtt.. 28 gtt 1.00 25.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................AAGCGGATGGTGGTCCCTGCTGCTCTC.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TATTACCTACATTGTTTGAGC............................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CTGGCTGAGACGCCTACCCTGCTGGCCTTCTTG............................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CATTGTTTGAGCCTCATGA........................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGaa................................................................................................................................................................... 18 aa 1.00 41.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGC................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AACCCCACTGGCTGAGccgc................................................................................................................... 20 ccgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCTATTAta............................................................................................................................................................. 24 ta 1.00 19.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................GCGGATGGTGGTCCCT............................. 16 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................CCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCT...... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGA.... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CGTCTGTGATGTTCTGCa................................................................................................................................................................... 18 a 1.00 233.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCTGTGATGTTCTGCTATTACC............................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGTGATGTTCTGCTATTACCTACAT........................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAaacg.................................................................................................................... 33 aacg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CGGATGGTGGTCCCTGCT.......................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCTCTCAAGGTTGTTCGG........ 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................TGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGt........ 22 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TTGAGCCTCATGAAAACCCCAC............................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACA......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
............TCAAGGTGTTGGATGGGA................................................................................................................................................................................................................................................. 18 3 1.00 1.00 - - 0.33 - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ATGAAAACCCCACTGGCTGA........................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTCAAGGTGTTGGATGGGATCCC............................................................................................................................................................................................................................................. 23 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGTTGTTCGGCTGAAG.. 20 3 0.67 0.67 - - - - - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TCAAGGTGTTGGATGGG.................................................................................................................................................................................................................................................. 17 3 0.67 0.67 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CCTCAAGGTGTTGGATGGGA................................................................................................................................................................................................................................................. 20 3 0.67 0.67 - - - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGTTGTTCGGCTGAA... 18 3 0.67 0.67 - - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTCAAGGTGTTGGATGGG.................................................................................................................................................................................................................................................. 18 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGGTTGTTCGGCTGA.... 19 3 0.67 0.67 - - - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CCTCAAGGTGTTGGATGG................................................................................................................................................................................................................................................... 18 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGGTTGTTCGGCTG..... 18 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................ACCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGATC............................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGATCCCTC........................................................................................................................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGA................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGCGCCTCAAGGTGTTGGA...................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGG.................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATG.................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGg................................................................................................................................................................................................................................................. 27 g 0.50 12.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGCGGATGGTGGTCC............................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGAcggg.................................................................................................................................................................................................................................................. 26 cggg 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGCGGATGGTGGTCCC.............................. 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AAAGCGGATGGTGGTCC............................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGCGGATGGTGGTC................................ 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GCGCCTCAAGGTGTTGGA...................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGA...................................................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAAAGCGGATGGTGGT................................. 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGa.................................................................................................................................................................................................................................................. 26 a 0.50 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGATCCCT............................................................................................................................................................................................................................................ 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGATC............................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGa................................................................................................................................................................................................................................................... 25 a 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTG..................................................................................................................................................................... 15 17 0.47 0.47 - - - - - - 0.29 - - 0.12 - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGGTGTTGGATGGGAT................................................................................................................................................................................................................................................ 16 7 0.43 0.43 - - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CAAGGTGTTGGATGGGATCCCTCCACC....................................................................................................................................................................................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGTTGTTCGGCTG..... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGTTGTTCGGCTGAA... 19 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTCAAGGTGTTGGATGGGATCCCTCCAC........................................................................................................................................................................................................................................ 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCgaaa................................................................................................................................................................ 20 gaaa 0.33 4.67 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CCTCAAGGTGTTGGATGGG.................................................................................................................................................................................................................................................. 19 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGTTGTTCGGCTGAAGCC 21 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGTTGTTCGGCTGAAt.. 20 t 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GCCTCAAGGTGTTGGATGGGATC............................................................................................................................................................................................................................................... 23 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CCTCAAGGTGTTGGATGGGATCC.............................................................................................................................................................................................................................................. 23 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCTGTGATGTTCTGC.................................................................................................................................................................... 15 18 0.28 0.28 - - - - - - 0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TCTGTGATGTTCTGCT................................................................................................................................................................... 16 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGGTGTTGGATGGGATCCCTC........................................................................................................................................................................................................................................... 22 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AGGTGTTGGATGGGATCCCTC........................................................................................................................................................................................................................................... 21 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAGGTGTTGGATGGGA................................................................................................................................................................................................................................................. 16 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CCCCACTGGCTGAGA...................................................................................................................... 15 10 0.10 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CCCTGGAGCGCCTCAAGGTGTTGGATGGGATCCCTCCACCCTATGACAAGGTGAGCCTTGCAAGCCTAGCCTTACAGCCTCTGCGTCCAGCGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCATGAAAACCCCACTGGCTGAGACGCCTACCCTGCTGGCCTTCTTGCTAGGTGTTCCCAACAGGTCTCTGAGCATCTCTTTCTCTCAACAGAAAAAGCGGATGGTGGTCCCTGCTGCTCTCAAGGTTGTTCGGCTGAAGCC
.........................................................................................((((((((((((......))))))............((((...((.......))..)))).))))))...................................................................................................................
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Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR037897(GSM510433)
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small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR051940(GSM545784)
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Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037900(GSM510436)
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Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
........................GGATCCCTCCACCCTaaa..................................................................................................................................................................................................................................... 18 aaa 12.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 9.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GATGGTGGTCCCTGCTGCTCTCAAGGTTGT............ 30 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CAGCCTCTGCGTCCAGCGTCTGTGAg............................................................................................................................................................................ 26 g 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCTGAGCATCTCTTTCTCTCAACAGAA................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTA........................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................................................................................................TTACCTACATTGTTTggg................................................................................................................................................... 18 ggg 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACA......................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TGCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCA........................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GTTCTGCTATTACCTACATTGTTTGA................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CTGCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCA........................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GATCCCTCCACCCTgtca..................................................................................................................................................................................................................................... 18 gtca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACGCCTACCCTGCTGGCCTTCTTGCTA............................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTACCTACATTGTTagga.................................................................................................................................................... 18 agga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CTGCTGGCCTTCTTGCTAGGTGTTCCCA.................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGCGTCCAGCGTCTGTGATGTTCTGCTA.................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TTACCTACATTGTTTggga................................................................................................................................................... 19 ggga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................GCATCTCTTTCTCTCAACAGAAAAA............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GATCCCTCCACCCTgaaa..................................................................................................................................................................................................................................... 18 gaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................ACAGCCTCTGCGTCCAGCGTCTGTGA............................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................GCTATTACCTACATTGTTTGAGCCTCA........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCGTCTGTGATGTTCTGCTATTACCTACA......................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CCTAGCCTTACAGCCTCTGCGTCCAa...................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GCGTCCAGCGTCTGTGATGTTCTGCTA.................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................ATTACCTACATTGTT.................................................................................................................................................... 15 19 0.05 0.05 - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -