chr7:52378279 52378582 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(5)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(57)
TESTES

Sense strand
GAAATGCCCCTTCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGAGTGGGATGTTGGAAGGGTGGTTCTAGGTTCCTGCGTCCAGGGGCGCTGGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTCTAGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATGCCATAAATGGAGCTTCTTGGGAGCCCCGTTCAACTGACTCCTACCTGCTAACACCTTTCTGTTACTCTCCCAGGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGAC
..................................................................................................((((((..((((.........))))....((((((((.(((((....))))))))..))))).)))))).......((....))..........................................................................................................................
................................................................................................97......................................................................................185.....................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATC..................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 50.00 50.00 4.00 12.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 1.00 - 3.00 1.00 - - - 1.00 - 8.00 1.00 - - 1.00 - 3.00 - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 26 2 44.00 44.00 7.00 10.00 10.50 0.50 - - - - - - - 3.00 - 0.50 0.50 0.50 - 3.00 1.00 - 3.50 1.50 0.50 - - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTCTAGGGCACTG....................................................................................................................................................... 52 1 44.00 44.00 - - - - - - - 44.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGG..................... 26 3 40.67 40.67 2.33 6.67 8.67 - 8.67 2.00 - - - 0.33 - 1.00 - 0.67 3.33 - - 2.33 1.00 - 1.33 0.67 - - - 0.33 0.33 - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTCTAGGGCACTGC...................................................................................................................................................... 52 1 38.00 38.00 - - - - - - - - 38.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTC......................................................................................................................................................................................... 18 1 34.00 34.00 - - - 3.00 - - 11.00 - - - 12.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 27 1 30.00 30.00 4.00 7.00 9.00 1.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 24 1 24.00 24.00 - - - - - - - - - - - - - - - 6.00 - - 8.00 4.00 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 23.00 23.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - 6.00 - 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCC........ 27 2 21.50 21.50 3.50 3.50 5.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 0.50 - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 33 1 18.00 18.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - 11.00 - - 1.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTC....................................................................................................................................................................................... 20 1 18.00 18.00 - - - 4.00 - - 3.00 - - - 3.00 - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCT........................................................................................................................................................................................ 18 1 16.00 16.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - 5.00 1.00 - 2.00 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGT............. 27 2 13.50 13.50 6.00 1.50 2.00 - - - - - - - - - - - 1.50 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 36 1 13.00 13.00 - - - - 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGAT.................................................................................................................................................................................. 25 1 13.00 13.00 - - - 5.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 26 1 12.00 12.00 5.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 29 1 11.00 11.00 3.00 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATC......... 26 4 10.25 10.25 0.75 0.25 0.50 1.50 - - - - - 0.50 - - - 0.25 0.25 0.50 - 0.25 1.75 0.50 2.00 - - - - 0.25 0.25 0.25 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCT........................................................................................................................................................................................ 19 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - 4.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGT............................................................................................................................................................................... 28 1 10.00 10.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 26 2 10.00 10.00 3.50 2.00 2.00 0.50 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 28 1 10.00 10.00 5.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGG................................................................................................................................................................................ 27 1 9.00 9.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTT.......................................................................................................................................................................................... 17 1 8.00 8.00 - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTG.............................................................................................................................. 33 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - - 1.00 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGA................................................................................................................................................................................... 24 1 8.00 8.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGC............................................................................................................................................. 18 1 8.00 8.00 - - - - - 7.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCCCCTTCACTGGTAACGTCTCCATCC................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 8.00 8.00 2.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCC.................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 29 1 7.00 7.00 2.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 28 2 7.00 7.00 3.00 2.00 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 35 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCA...................................................................................................................................................................................... 21 1 6.00 6.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGAC 29 1 6.00 6.00 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGAC 26 1 6.00 6.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTCTAGGGCACT........................................................................................................................................................ 35 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 19 1 6.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCGC...... 29 1 6.00 6.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGA............................................................................................................................. 34 1 6.00 6.00 - - - - - 3.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTC............ 28 2 6.00 6.00 2.50 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTC....................................................................................................................................................................................... 19 1 6.00 6.00 - - - - - - 2.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAC................... 27 3 5.67 5.67 0.33 0.67 1.00 - - - - - - - - 3.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGtcgt....................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tcgt 5.50 5.50 0.50 2.50 1.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTG........................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 5.50 5.50 0.50 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.50 - - 0.50 - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAG........................ 27 3 5.33 5.33 1.00 1.00 1.33 - - - - - - - - - - 0.33 0.33 - - 0.67 - - - - - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAC................... 28 3 5.33 5.33 1.00 0.67 0.33 - - - - - - 0.33 - 1.67 - 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATG................................................................................................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCAT................ 27 1 5.00 5.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................AGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 20 1 5.00 5.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 36 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTT.......................................................................................................................................................................................... 18 1 5.00 5.00 - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCAT................ 28 1 5.00 5.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTG.............................................................................................................................. 34 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGACAGCCAG.......................................................................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 22 1 5.00 5.00 - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAG........................ 25 3 5.00 5.00 - 0.33 - - - 0.67 - - - 0.67 - 2.67 - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCT............................................................................................................................................................................. 30 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGA................................................................................................................................................................................... 23 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCA......................... 26 3 5.00 5.00 0.67 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - 0.33 - - - - - 0.33 - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAG........................ 26 3 4.67 4.67 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.33 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGC.......................... 25 3 4.33 4.33 - 0.33 - - - - - - - 0.33 - 2.33 - 1.00 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGAT...................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TCTAGGGCACTGCTGAGACAGC............................................................................................................................................. 22 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCA...................................................................................................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TCTAGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACA.................................................................................................................................... 31 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATGC.......................................................................................................................... 37 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAG...................... 27 3 4.00 4.00 1.33 0.67 0.33 - - 0.33 - - - - - - - 0.67 - - - 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 34 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGT............. 28 2 4.00 4.00 1.50 1.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TCTAGGGCACTGCTGAGA................................................................................................................................................. 18 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 27 2 3.50 3.50 - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCCCCTTCACTGGTAACGTCTCCATC................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 3.50 3.50 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGA.................... 27 3 3.33 3.33 - 0.67 1.00 - - - - - - - - 0.67 - - - - - 0.33 - - 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGA.................... 31 3 3.33 3.33 - - - - 1.33 0.33 - - - - - - - - - - 1.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATG................................. 18 3 3.33 3.33 - - - - - - - - - - - 2.33 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGG..................... 27 3 3.00 3.00 0.33 - - - 1.67 - - - - - - - - - - 0.33 - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TGATGTCTGTTCTCACGATGG................................................................................................................................................................................ 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGA...................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGAT.................................................................................................................................................................................. 24 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATG................................. 17 3 3.00 3.00 - - - - - 0.33 - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAG.............................................................................................................................................. 17 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGAGACAGCCAGTTGACA.................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCG....... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTa......................................................................................................................................................................................... 18 a 3.00 8.00 - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGATG...................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................ACGATGGTCTTCAGATGT..................................................................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTC......................................................................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TCACGATGGTCTTCAGATGTCCTC................................................................................................................................................................. 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CAGCCAGTTGACAAAGC................................................................................................................................ 17 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CAGATGTCCTCTAGGGC........................................................................................................................................................... 17 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGAaa........................................................................................................................... 35 aa 3.00 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 29 2 3.00 3.00 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CAGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 21 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTCT........................................................................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GCCAGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGA....................... 27 3 3.00 3.00 - 0.67 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - 0.33 - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 33 2 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGA....................... 26 3 2.67 2.67 - 0.67 1.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAG...................... 25 3 2.67 2.67 0.67 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGG..................... 28 3 2.67 2.67 - 0.33 1.00 - - - - - - - - - - 0.33 0.33 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGtct........................................................................................................................................................................................................................................................ 27 tct 2.50 5.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................ACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCAT................ 26 2 2.50 2.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTG.............. 26 2 2.50 2.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 25 2 2.50 2.50 0.50 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGC.......................... 24 3 2.33 2.33 - - - - - 1.67 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCA......................... 22 3 2.33 2.33 - - - - 1.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGA.................... 26 3 2.33 2.33 - 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - 0.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGG..................... 25 3 2.33 2.33 0.33 - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCA........... 24 4 2.25 2.25 - 0.25 0.25 0.50 - - - - - - - - 0.25 - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCCTCTAGGGCACTGCTGAGA................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGACCATTGTCATCCGCCGG... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTC............ 27 4 2.00 2.00 0.50 0.50 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATG................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CTAGGGCACTGCTGAGAC................................................................................................................................................ 18 2 2.00 2.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGACAGC............................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGA. 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTT.......................................................................................................................................................................................... 16 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCCTCTAGGGCACTGCTG.................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TCCTCTAGGGCACTGCTGA................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTGT................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CAGTTGACAAAGCTGATGCC......................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................CCTTTCTGTTACTCTCCCAG.................................................. 20 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGACCATTGTCATCCGCCG.... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GATGTCTGTTCTCACGA................................................................................................................................................................................... 17 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGA........................................................................................................................................................................ 35 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCAT................ 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CTAGGGCACTGCTGAGACAGC............................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCT................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTC........................................................................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTG.............. 27 2 2.00 2.00 0.50 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CTCTAGGGCACTGCTGAGACAGC............................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................CCAGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 22 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GACAGCCAGTTGACAAAGCTGATGCC......................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ATGGTCTTCAGATGTCCTCTAG.............................................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCAT................ 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTC................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGACAGCC............................................................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CCCTTCACTGGTAACGTCTCCATCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATC..................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................AGGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGC.......................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CAAGTGATGTCTGTTCTC....................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTC.............................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATC..................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAC................... 25 3 2.00 2.00 - - 0.33 0.67 - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGT........................................................................................................................................................................................... 16 3 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - 0.67 0.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGA....................... 24 3 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAG...................... 28 3 2.00 2.00 - - 0.67 - - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.33 - - - 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCAT.......... 27 4 1.75 1.75 0.25 0.75 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAA............................... 20 3 1.67 1.67 - - - - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TCTAGGGCACTGCTGA................................................................................................................................................... 16 3 1.67 1.67 - - - - - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GTGACGAAGATGAAGATGCAGAGG..................... 24 3 1.67 1.67 - 0.33 0.33 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 30 2 1.50 1.50 - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 17 2 1.50 1.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTC............ 26 4 1.50 1.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - 0.25 - 0.25 - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGtcg........................................................................................................................................................................................................................................................ 27 tcg 1.50 5.50 - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTt............ 28 t 1.50 13.50 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................ACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 27 2 1.50 1.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
..........................CCATCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTG........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 24 2 1.50 1.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGC.......................... 23 3 1.33 1.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAC................... 31 3 1.33 1.33 - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAG.............................. 20 3 1.33 1.33 - - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAC................... 26 3 1.33 1.33 - - - - - 0.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 16 4 1.25 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCAT.......... 25 4 1.25 1.25 0.25 - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGG................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAG................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGtcc.................. 33 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CTAGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGA...................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTa.......................................................................................................................................................................................... 18 a 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGTCTGTTCTCACGATGGTCTTC........................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...ATGCCCCTTCACTGGTAACGTCTCCATCC................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGAT............................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACG.................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAA............................... 19 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAGGGCACTGCTGAGACAGCCAG.......................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATGC.......................... 22 3 1.00 1.00 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTCTCA...................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATC..................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTttc................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 ttc 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCG......................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGA................................ 18 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATG........................... 24 3 1.00 1.00 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGACAAAGCTGATGCC......................................................................................................................... 16 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCAT................ 25 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGAT............................................................................................................................ 35 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CAGCCAGTTGACAAAGCTGAT............................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTT........................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGgcc.................. 26 gcc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCC.................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GGCACTGCTGAGACAGCCAGT......................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AGTGATGTCTGTTCTCA...................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGA................................ 19 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.33 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGAC 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCAT.......... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGa............................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CTAGGGCACTGCTGAGACAGCC............................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAG......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAGGGCACTGCTGAGACAGCC............................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGTCTGTTCTCACGATGG................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGGTCGGAT...................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGtcg........................................................................................................................................................................................................................................................ 26 tcg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCT............................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGcc.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cc 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGT........................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................ACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTC............ 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGAt 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................AGGTGTCGTGACGAAGATGAAGATcc.......................... 26 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTCTTCAGATGTCCTCTAGG............................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTGTC................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TCTGTTCTCACGATGGTC.............................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................ACGTCTCCATCCGAGGTCGGAT...................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCGt...... 29 t 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTG....................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTCTTCAGATGTCCTCTAGGGCACTGCTGAGA................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTG.............. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AGTGATGTCTGTTCTC....................................................................................................................................................................................... 16 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................AGCCAGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ATGTCTGTTCTCACGATGGTC.............................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCA.......................................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GAGACAGCCAGTTGACAAAGCTG.............................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCa........ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTG.............. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GCACTGCTGAGACAGCCAG.......................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCT................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGgc.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGAa............................................................................................................................ 35 a 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGAC 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................ACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTG.............. 28 2 1.00 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTCTAGGGaact........................................................................................................................................................ 35 aact 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCAC..................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGC................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CTTCACTGGTAACGTCTCCATgccc.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 gccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAGGGCACTGCTGAGACAGC............................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GTCTGTTCTCACGATGGTC.............................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCCCCTTCACTGGTAACGTCTCaatc................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 aatc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATG................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACA............................................................................................................................................... 16 4 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGACCATTGTCATCCGCCG.... 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CACGATGGTCTTCAGATGTCCTC................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTCTC....................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCAT.......... 28 4 1.00 1.00 - 0.75 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGATG...................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GAGGTCGGATCCTGTCTGGTGtcg........................................................................................................................................................................................................................................................ 24 tcg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGtctt....................................................................................................................................................................................................................................................... 28 tctt 1.00 5.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGa......................................................................................................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CCATCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTCTTCAGATGTCCTCT................................................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TCTGTTCTCACGATGGTCTTCAG......................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCCCTTCACTGGTAACGTCTCCATCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATa..................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAA................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGGGATGTTGGAAGGGTGGT..................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCC.................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTT............................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGAGGTCGGATCCTGTCTGGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 21 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGAT....................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AACGTCTCCATCCGAGGTCGGATa..................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTCTCAC..................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTTGACAAAGCTGATGCCATAAATGG................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGT........................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGCTGAGACAGCCAGTTGACAAA.................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACtt................. 22 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGG................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTC......................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GAGACAGCCAGTTGACAA................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTttc......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTtttc........................................................................................................................................................................... 32 tttc 1.00 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTCACGATGGTCTTCAGATGT..................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TGGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGA................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTC.............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGTCTCCATCCGAGGTCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GATGTCTGTTCTCACGATG................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGT............. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGTTCTCACGATGGTCTTCAGA........................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGAcc..................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cc 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTGTC................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................GATGGTCTTCAGATGTCCTCT................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CACTGCTGAGACAGCCAGTTGA...................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGA...................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACG.................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATa........................................................................................................................... 35 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGAT............................................................................................................................ 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAGGACCATTGTCATCCGCCG.... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCGt...... 28 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGACCATTGTCATCCGCCGGG.. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCAagt.............. 26 agt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAaa.................. 27 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGTTCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTCTAGG............................................................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CTCTAGGGCACTGCTGAGAC................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GAGCTTCTTGGGAGgcga................................................................................................ 18 gcga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCCAGT......................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCAa................ 19 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CTCTAGGGCACTGCTGAGACA............................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGA............................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGCACTGCTGAGACAGCC............................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................ACGAAGATGAAGATGCAGAGGACt.................. 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ATCCGAGGTCGGgccc.................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 gccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGtt......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tt 1.00 5.50 - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CTGCTGAGACAGCCAGTTG....................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGT............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTCACTGGTAACGTCTtt.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 tt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCt....... 28 t 1.00 21.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGAT...................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTC................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAAGATGCAGAGGACt.................. 19 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATa......... 26 a 1.00 1.25 - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GTTCTCACGATGGTCTTCAGA........................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTGTC................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GTGACGAAGATGAAGATGCA......................... 20 4 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................ATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGA........................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CAGCCAGTTGACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTt.............. 27 t 1.00 10.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAAGATGCAGAGGACCA................. 20 6 0.83 0.83 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGt..................... 29 t 0.67 2.00 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATG........................... 23 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCTCCATCCGAGGTCGGATCC.................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGA............................. 22 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAC................... 29 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCA......................... 25 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGt.................... 27 t 0.67 40.67 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGC.......................... 21 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTGTC................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 3 0.67 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 23 3 0.67 0.67 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TCCATCCGAGGTCGGATCCTGTCTGG............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGAT............................ 20 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGA............................. 21 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGG..................... 29 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 25 3 0.67 0.67 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGA....................... 28 3 0.67 0.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGt....................... 28 t 0.67 5.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATGCA......................... 23 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATG................................. 16 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................GACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 16 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGt....................... 27 t 0.67 4.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATGCAG........................ 24 3 0.67 0.67 - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGGCACTGCTGAGAC................................................................................................................................................ 16 5 0.60 0.60 - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGGTCGGATCCTGTCTGG............................................................................................................................................................................................................................................................. 18 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCt....... 27 t 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCCCCTTCACTGGTAACGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATC......... 28 4 0.50 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCt........... 28 t 0.50 2.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCA........... 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGgc......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 gc 0.50 5.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CCATCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGg.......................................................................................................................................................................................................................................................... 28 g 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCt........... 29 t 0.50 6.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGCCCCTTCACTGGTAACGTCTCCAT.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCc................. 27 c 0.50 44.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATt......... 28 t 0.50 1.75 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ATCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTG........................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCC........ 26 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCAatt.............. 27 att 0.50 1.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCATTGT............. 25 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TAGGGCACTGCTGAGAC................................................................................................................................................ 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGta......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ta 0.50 5.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCtc.......... 30 tc 0.50 6.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................ACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGT............. 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................CGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTC............ 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CAGTTGACAAAGCTGATGtc......................................................................................................................... 20 tc 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CTCTAGGGCACTGCTGA................................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAAGATGCAGAGGACCATTGTC............ 25 4 0.50 0.50 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CAGTTGACAAAGCTGATG........................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCATCCGCCGGGAC 17 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTGAGACAGCCAGTTGA...................................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCATT............... 19 5 0.40 0.40 - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 22 5 0.40 0.40 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAGTGATGTCTG............................................................................................................................................................................................ 15 11 0.36 0.36 - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - 0.18 - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGA............................. 19 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGA.................... 30 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCGTGACGAAGAT.................................. 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGA.................... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CGAGGTCGGATCCTGTCTGG............................................................................................................................................................................................................................................................. 20 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCA......................... 21 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGt.................... 29 t 0.33 2.67 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CTCCATCCGAGGTCGGATCCTGTCT............................................................................................................................................................................................................................................................... 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAAGATGCAGAG...................... 24 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGAT............................ 23 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAt...................... 27 t 0.33 2.67 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGAT............................ 21 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACt.................. 26 t 0.33 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TCCATCCGAGGTCGGATC..................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGAcgca......................... 26 cgca 0.33 0.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCA......................... 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAt................... 25 t 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................ACGAAGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 24 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAG...................... 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................CTCCATCCGAGGTCGGATCC.................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAG.............................. 21 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGt..................... 28 t 0.33 4.00 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TCCATCCGAGGTCGGATCCTGTCTG.............................................................................................................................................................................................................................................................. 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 21 6 0.33 0.33 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................GTCGTGACGAAGATGAAGATG........................... 21 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGt.......................... 25 t 0.33 1.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TCCATCCGAGGTCGGATCC.................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGA.................... 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAa................... 28 a 0.33 3.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGATG........................... 20 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTGACGAAGATGAAGA............................. 18 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGAT.................................. 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................GGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCt......................... 26 t 0.33 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAG........................ 20 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TGACGAAGATGAAGATGCAGAGGAac.................. 26 ac 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATC......... 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTaatc......... 29 aatc 0.25 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGT............. 26 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCctc......... 26 ctc 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACCATTG.............. 25 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................GTGACGAAGATGAAGATG........................... 18 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCAT.......... 29 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCa........ 27 a 0.25 10.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATtc........ 27 tc 0.25 1.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGACGAAGATGAA............................... 15 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATC......... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCAT.......... 26 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTC............ 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCATTG.............. 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTGTCAgcc........ 27 gcc 0.25 2.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCA........... 27 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGACAAAGCTGATGC.......................................................................................................................... 15 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................GATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCA........... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTtt............. 22 tt 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATT............... 20 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CTAGGGCACTGCTGAG.................................................................................................................................................. 16 5 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 24 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................ATGAAGATGCAGAGGACCATT............... 21 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCATTt.............. 21 t 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCAT................ 18 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATGAAGATGCAGAGGACCA................. 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGATGCAGAGGACCAT................ 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACCAT................ 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGCAGAGGACCATT............... 17 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGAAGATGCAGAGGACC.................. 20 8 0.12 0.12 - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................GAAGATGCAGAGGACCA................. 17 9 0.11 0.11 - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CTAGGGCACTGCTGA................................................................................................................................................... 15 9 0.11 0.11 - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................ACAAAGCTGATGCCA........................................................................................................................ 15 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAAATGCCCCTTCACTGGTAACGTCTCCATCCGAGGTCGGATCCTGTCTGGTGAGTGGGATGTTGGAAGGGTGGTTCTAGGTTCCTGCGTCCAGGGGCGCTGGCAAGTGATGTCTGTTCTCACGATGGTCTTCAGATGTCCTCTAGGGCACTGCTGAGACAGCCAGTTGACAAAGCTGATGCCATAAATGGAGCTTCTTGGGAGCCCCGTTCAACTGACTCCTACCTGCTAACACCTTTCTGTTACTCTCCCAGGTGTCGTGACGAAGATGAAGATGCAGAGGACCATTGTCATCCGCCGGGAC
..................................................................................................((((((..((((.........))))....((((((((.(((((....))))))))..))))).)))))).......((....))..........................................................................................................................
................................................................................................97......................................................................................185.....................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)