(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(44)
TESTES

Sense strand
CAAAACCACTGCTGGCACCCGCGCCGCACGGGCGCCCAATTCCTCCCCTGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAGGGTGGCGGCCTCAGGGCGCAGGATCGGGCAAACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACCGAAAAGCAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCATCCAGGCTGGAGGCAGTAAAGATTGCTGTAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCAGGCCAGGCTGGACGACA
............................................((((((((...............)))))).))(((((.((.((.(((((((((..........)))).))))).)).))...(((.......)))......)))))..((((.((((...........))))))))......................................................................
...........................................44..........................................................................................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGA................................................................................................................................................................................ 26 1 15.00 15.00 1.00 2.00 - 5.00 - - - 3.00 - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGC...................................................................... 26 1 11.00 11.00 2.00 1.00 2.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACCGAAA.................................................................................................................. 27 1 9.00 9.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGG................................................................................................................................................................................. 25 1 7.00 7.00 - 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCAT.................................................................... 28 1 7.00 7.00 - - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACCGAAAA................................................................................................................. 28 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCATC................................................................... 29 1 6.00 6.00 2.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGG.................................................................................................................................................................................. 24 1 5.00 5.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCCACGCGTTGTAGAC......................................................................................... 18 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCA..................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGC.......................................................................................................................... 23 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGG.................................................................................................................................................................................. 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - -
.......................................TTCCTCCCCTGGTAGGTAACGCGGAA......................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCCTCCCCTGGTAGGTAACGCGGA.......................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAGGG............................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACCGAA................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAGGCCAGTGAGCTCCAGGCCAGG.......... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAG....................................................................... 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAGCAGAATGGCCACGCGTTGTAGAC......................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAACCTGTCGCTCAGAAGCTCGG........................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGC...................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................TTCCTCCCCTGGTAGGTAACGCGGAAG........................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGta................................................................................................................................................................................ 26 ta 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAG............................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CACGCGTTGTAGACGGAAGCCTGCA.............................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCt..................................................................... 27 t 2.00 11.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CAGTCTCAGCATCCAGGCTGGAGGCAG..................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAG............................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTC......................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAGG.............................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGt................................................................................................................................................................................. 25 t 2.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCAAACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGCT......................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGCTAC....................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTGTAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCAGGC.............. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AAGCAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAA..................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........TGCTGGCACCCGCGCCGCACGGGCGCat..................................................................................................................................................................................................................... 28 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCCACGCGTTGTAGACGGAAGCCTGt............................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CGGGCAAACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACCGAA................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCCTCCCCTGGTAGGTAACGCGGAAGA....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GGCAAACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGCT......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACC...................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCAGGC.............. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGtt................................................................................................................................................................................. 25 tt 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCctc................................................................... 29 ctc 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................AACGCGGAAGAGCCGGGA................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCCACGCGTTGTAGACGGAAGCCT................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TACCGAAAAGCAGAATGGCCACGCGTT............................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAAG.................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAGa.............................................................................................................................................................................. 25 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................CCCCTGGTAGGTAACGCGGAAGAGCC.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCCACGCGTTGTAGACGGAAGCCTtc............................................................................... 28 tc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CGCGTTGTAGACGGAAGCCTG................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........................................TCCCCTGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGt................................................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAG....................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AGCAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGG....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CGGAAGCCTGCAGTCTCAG....................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGTAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCAGGC.............. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GGCCTCAGGGCGCAGGATCGGGCAAA............................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAAGC................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GGTAACGCGGAAGAGCCGG.................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................GTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGA................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AGCAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAA..................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCG................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGc.................................................................................................................................................................................. 24 c 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCCACGCGTTGTAGACGGAAGC................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCa.................................................................................................................................................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCCACGCGTTGTAGACGGAAG.................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................CAAGGCCAGTGAGCTCCAGGCCAt........... 24 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................AAGATTGCTGTAAGTTC.................................. 17 4 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACCGAAAAG................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGGCAGTAAAGATTGC........................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCCAGGCTGGAGGCAGTAAAGATTGta.......................................... 27 ta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAt............................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 15.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AGCAGAATGGCCACGCGTTGTAGACa........................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCATCC.................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................................................................................................................................................................................................TAAAGATTGCTGTAAGTTCAAGGCCAGTG........................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TCAGAAGCTCGGCTACCGAAAAGCAGA............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GTAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCAGG............... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAa............................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCA........................................................................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAA..................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGGATCGGGCAAACCTGTCGCTCAGAAG................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GAATGGCCACGCGTTGTAGACGGgag.................................................................................... 26 gag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CCACGCGTTGTAGACGGAAGCCTGCA.............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GTAAAGATTGCTGTAAGTTCAAGtcc............................ 26 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCAGG............... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAA..................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCa................................................................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AGTAAAGATTGCTGTAAGTTCAAGGCC............................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGGA...................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCCACGCGTTGTAGACGGAAGCC.................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAAAACCACTGCTGGCACCCGCGCCGCACGGGCGCCCAATTCCTCCCCTGGTAGGTAACGCGGAAGAGCCGGGAGGGTGGCGGCCTCAGGGCGCAGGATCGGGCAAACCTGTCGCTCAGAAGCTCGGCTACCGAAAAGCAGAATGGCCACGCGTTGTAGACGGAAGCCTGCAGTCTCAGCATCCAGGCTGGAGGCAGTAAAGATTGCTGTAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCAGGCCAGGCTGGACGACA
............................................((((((((...............)))))).))(((((.((.((.(((((((((..........)))).))))).)).))...(((.......)))......)))))..((((.((((...........))))))))......................................................................
...........................................44..........................................................................................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
..............................................................................................................GTCGCTCAGAAGCTCGGC.......................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CACGGGCGCCCAATTCCT.............................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCGCACGGGCGCCCAgc.................................................................................................................................................................................................................... 17 gc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GCGCCCAATTCCTCCCCTGGTAGGT.................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CTACCGAAAAGCAGAATGG........................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GCTGTAAGTTCAAGGCCAGTGAGCTCCA................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................CCTGCAGTCTCAGCATCCA................................................................. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -