| Gene: Prmt1 | ID: uc009gsf.1_intron_5_0_chr7_52234896_r.3p | SPECIES: mm9 |
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(7) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(7) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(36) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) |
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| ..................................................................................TGAGACAGTTTGAAAAGAGAGACAGGG............................................................................................................................................. | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................................................................................................................ATCATCAAGGGCAAGGTGGAGGAGGTG............... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................TCCAGGACTACATAGTGAGACAGTTTGA........................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................TGCCCTTGGACCAGAGTCCTCTGTGGGT............................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................TCTACATAGCAAGTTCCAGGACTACATAG........................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................TGAAAAGAGAGACAGGGTGCCTGCCCct.................................................................................................................................. | 28 | ct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TCAAGGGCAAGGTGGAGGAGG................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................ATCATCAAGGGCAAGGTGGAGGAGGTt............... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .CCAGTGCTGGGGGACAGAGGCAGGCA............................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ........................................................................................................................................................................................................TGGTGACCATCATCAAGGGCAAGGTGG....................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................................TACATAGCAAGTTCCAGGACTACATAGT....................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................TTCCAGGACTACATAGTGAGACAGTT.............................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................CAGCCTGGTCTACATAGCAAGTTCCAta................................................................................................................................................................................... | 28 | ta | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TGGCCAGCCTGGTCTACATAGCAAGTTCCA................................................................................................................................................................................... | 30 | 3 | 1.33 | 1.33 | 0.33 | - | - | 0.67 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......................................TGGCCAGCCTGGTCTACATAGCAAaa......................................................................................................................................................................................... | 26 | aa | 0.25 | 0.00 | - | 0.12 | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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