(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(23)
TESTES

Sense strand
CGCTTCTCTCATCTGCCTGGATTGGAGGCTCTTTACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGAGACAAGGCTCCTTAGCCCTGATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAGAGGATGCAGTTCCTCCCAGGAGGTGTTCCCATATGTGGTCAGTGGGGCATGAAGTTTTCTTTACCTCTGAAGCCTTGCTTGGCTTTCTCTTTGCAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGGTCATGTTGATGGGTACATCCTTGCTTTCA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
.............................................................................TGATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAGA................................................................................................................................................. 28 1 11.00 11.00 - 2.00 2.00 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGA............................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCAGTGGGGCATGAAGTT.......................................................................................... 25 1 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGG............................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................................TACAGAGATTGTCTCAACAGATGG................................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGGT............................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GTCATGTTGATGGGagtc............ 18 agtc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - -
................................TTACAGAGATTGTCTCAACAGATGGG................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................TTTACAGAGATTGTCTCAACAGATGG................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAACAGGCAGCCGGTCATGTTGATG.................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................TACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGAG.............................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TTAGCCCTGATCGAACTCAAAAGCTAT......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCAGTGGGGCATGA.............................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................CCCTGATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAGA................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAGAG................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................TTACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGAGA............................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGAGA............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCAGTGGGGCATGAAGTTT......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGAGAC............................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGCCCTGATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAG.................................................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCAGTGGGGCATGAAGTTTTCTTT.................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TGATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAGAGG............................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TCTCTTTGCAGAATAAAGTAACAGGC................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAGAGGA.............................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........TCTGCCTGGATTGGAGGCTCTTTACAGAGA................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................TACAGAGATTGTCTCAACAGATGGG................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGGTC........................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TTACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGA............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGATTGGAGGCTCTTTACAGAaatt............................................................................................................................................................................................................... 26 aatt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGG............................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TAGCCCTGATCGAACTCAAAAGCTATTGC...................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGATTGGAGGCTCTTTACAGA................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCAGTGGGGCATGAAGTTTTCTT..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................ATTGTCTCAACAGATttg................................................................................................................................................................................................ 18 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCAGTGGGGCATGAAGTTTTC....................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGGTa........................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCAGTGGGGCATGAAGT........................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGGGAGACAAGGCTCCTTAGCCCTGATC........................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GTCATGTTGATGGGaggt............ 18 aggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................CAACAGATGGGAGACAAGGCTC..................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CGCTTCTCTCATCTGCCTGGATTGGAGGCTCTTTACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGAGACAAGGCTCCTTAGCCCTGATCGAACTCAAAAGCTATTGCAAAGAGGATGCAGTTCCTCCCAGGAGGTGTTCCCATATGTGGTCAGTGGGGCATGAAGTTTTCTTTACCTCTGAAGCCTTGCTTGGCTTTCTCTTTGCAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGGTCATGTTGATGGGTACATCCTTGCTTTCA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
.............................................................................................................GCAGTTCCTCCCAGGAGGTGTTCCCA................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGAGGCTCTTTACAGAGATTGTCTCAACA...................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................AAGGCTCCTTAGCCCTGATCGAACTCAAA............................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................GCTCTTTACAGAGATTGTCTCAACAGA.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGAATAAAGTAACAGGCAGCCGGTCA.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CTCCTTAGCCCTGATCGAACTCAAAA.............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..........................................................................................................GATGCAGTTCCTCCCAGGAGGTGTTCCCA................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
................................TTACAGAGATTGTCTCAACAGATGGGA............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TTAGCCCTGATCGAACTCAAAAGCTA.......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -