chr7:31691725 31691974 -
(6)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(3)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(24)
TESTES

Sense strand
TGAGAACCAGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGCCCCTCCCCCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGGGTCAGCTTTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGGGAAGAGGAGGGGAGCTGAATCCATGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGCT
..................................................................................................(((((........))))).....((((((((..........(((((....)).)))...........)).))))))............................................................................
..................................................................................................99...................................................................................184................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
........................................................................................................TGTCTGTGGCTGATGAGGATGGGG.......................................................................................................................... 24 1 14.00 14.00 5.00 - 1.00 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGG........................................................................................................................... 24 1 11.00 11.00 1.00 2.00 - 2.00 3.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGG......................... 28 1 10.00 10.00 - 3.00 1.00 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGGCTGATGAGGATGGGGAAGAGG.................................................................................................................... 24 1 9.00 9.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................AAGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGC. 28 1 8.00 8.00 - 3.00 1.00 - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TTTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGG........................................................................................................................... 25 1 8.00 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGG........................................ 26 1 7.00 7.00 - 1.00 - - - - - 2.00 - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGAT...................................................................... 29 1 7.00 7.00 - 3.00 - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGGCTGATGAGGATGGGGAAGAGGAGG................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGTGGCTGATGAGGATGGGGAAGAG..................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 6.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGC..................................... 26 1 6.00 6.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TTTGTCTGTGGCTGATGAGGATGG............................................................................................................................ 24 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGGa.......................................................................................................................... 25 a 6.00 11.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGC..................................... 27 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTTGTGG.................................................. 28 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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........................................................................................................................................................................................TGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGA....................................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGG......................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGA........................ 28 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAG....................... 25 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGCCCC............................................................................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................GCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGG........................................................................ 27 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.....................................................................................................................................................................................................TGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAA........................... 26 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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................................TCAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGCCCC............................................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......................................................................................................................................................TGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGG........................................................................ 28 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TGGCTGATGAGGATGGGGAAGAGGAG.................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGAC............................... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGAa...................................................................... 29 a 3.00 1.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAA............................ 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................GTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACC.............................. 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCA............................. 24 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...........................................................................................................................................................................................TTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTT.................................. 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......................................................................................................................................................TGCTAAGAATATGAATCTCCCATCG........................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGC................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGC..................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAG......................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGA.......................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAG.......................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTC.................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGC..................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAG...................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AATCCATGCTAAGAATATGAATCTCCCATC............................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGTGGGATTGAAAGGAGC..................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGCC............................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.........................ACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGA.................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............................................................................................................................................................................TCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTTGTGGGg................................................ 30 g 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TGTCTGTGGCTGATGAGGATGGGGA......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGA................................ 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................GCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGct...................................................................... 29 ct 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGG......................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...................................................................................................................................................................................................TGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGA........................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
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...............................TTCAACCTGTCTGTGagt......................................................................................................................................................................................................... 18 agt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGtt.................................... 27 tt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAa....................... 29 a 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CTTTGACCAAAGGAGTTCAGAATCCTGT.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................ACTGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGA............................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTT..................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGA........................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TGTCTGTGGAGTGTGAGTGCCCCTCC.......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTTGT.................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GCTTTGTCTGTGGCTGATGAGGATG............................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGAattc............................ 30 attc 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTG................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGAC............................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTT............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTT...................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
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.....................................................................................................................................................................................CTGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGA............................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGAGTGTGAGTGCCCCTCCCCCTa..................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGCCCC............................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TGTCTGTGGCTGATGAGGATGG............................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAAAGGAGCTTTGACCAAAGG......................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGA................. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TCTGTGGCTGATGAGGATGGGG.......................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGTGGCTGATGAGGATGGGGAAGAGG.................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGATA..................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AACCTGTCTGTGGAGTGTG..................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAA.......................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGA................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GGTGTTGTGGGATTGAAA.......................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................CAGAATCCTGTGGTTACTGCTctta 25 ctta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGa..................................... 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCTAAGAATATGAATCTC................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GTTCCAGCCAGGGTCAGCTTTGTCa............................................................................................................................................. 25 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTGTCTGTGGCTGATGAGGATG............................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTa................................. 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCA............................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGACCAAAGGAGTTCAGAATCCTGTG......... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGt................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTG............................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAA........................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGA............................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................CAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGCCC.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTC.................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................CTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTG........................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGA....................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGA................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGA....................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....AACCAGTATGGCCAGAGAGCCAC............................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GAGGAGGGGAGCTGAATCCATGC................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTC............................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGTG..................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTTGT.................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGTGGCTGATGAGGATGGGGAAGAGGAa.................................................................................................................. 28 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGT....................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTGGGATTGAAAGGAGCTTTG................................. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGGGATTGAAAGGAGCTTTGACC.............................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CTGATGAGGATGGGGAAGAGGAGG................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GCTTTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGG........................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CATGCTAAGAATATGAATCTCCCATC............................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TATGAATCTCCCATCGAGGATACTGTG................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGAACCAGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTa......................................................................................................................................................................................................................... 31 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAG......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ATACTGTGTTTCGGTGTTGTGGGAT............................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGGGAAt....................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................ATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTTGTG................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGCT.................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TGTCTGTGGCTGATGAGGATGGG........................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGATGAGGATGGGGAAGAGGAGGGGA.............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTT..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGA.......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAgg......................................... 27 gg 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TACCCATGTGTTCCAGCCAGGGTCAGCTT.................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAA........................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCA............................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGATACT................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACC.............................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAA............................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGA........................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGATACTG.................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGCT 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
....................................................................................................................................................................................................GTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAA........................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCTAAGAATATGAATCTCCCATC............................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CTTTGTCTGTGGCTGATGAGGATGG............................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGGGAAGA...................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGa........................................ 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAAAGGAGCTTTG................................. 15 14 0.07 0.07 - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGAGAACCAGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGAGTGCCCCTCCCCCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGGGTCAGCTTTGTCTGTGGCTGATGAGGATGGGGAAGAGGAGGGGAGCTGAATCCATGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGCT
..................................................................................................(((((........))))).....((((((((..........(((((....)).)))...........)).))))))............................................................................
..................................................................................................99...................................................................................184................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................CCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 26 1 414.00 414.00 309.00 12.00 1.00 12.00 33.00 9.00 13.00 4.00 8.00 10.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - -
...................................................................TCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 27 1 115.00 115.00 96.00 2.00 - 3.00 1.00 1.00 4.00 5.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00
.....................................................................CGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 25 1 47.00 47.00 17.00 5.00 - 5.00 7.00 1.00 2.00 1.00 - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCA................................................................................................................................................................ 25 1 21.00 21.00 9.00 1.00 - - 4.00 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................GCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 24 1 18.00 18.00 - 6.00 - 1.00 4.00 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTG.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 13.00 13.00 11.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........AGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCA....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 7.00 1.00 1.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............GCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGT................................................................................................................................................................................................................. 27 1 13.00 13.00 4.00 - - - - 1.00 - - 5.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................CCCCCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCA................................................................................................................................................................ 28 1 13.00 13.00 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTC................................................................................................................................................................................................................ 25 1 12.00 12.00 - 2.00 - 6.00 - - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAa............................................................................................................................................................ 29 a 11.00 0.00 10.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................AAAGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGC. 29 1 10.00 10.00 - 2.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 29 1 10.00 10.00 6.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 28 1 9.00 9.00 6.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - -
..........TATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAAC..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CCGCTTCTACCCATGTGTTCCA................................................................................................................................................................ 22 1 8.00 8.00 - - - - - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........GTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAa....................................................................................................................................................................................................................... 27 a 8.00 0.00 - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................AAGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGC. 28 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........GTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCA....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................GCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGGG......................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CCCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCA................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........TATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCA....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................AATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGG.......................................................... 29 1 5.00 5.00 - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAa............................................................................................................................................................ 25 a 4.00 0.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTC................................................................................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGT................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GAATCCATGCTAAGAATATGAATCTCCCA.............................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AAGAATATGAATCTCCCATCGAGGA....................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
.................................................................CCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAG............................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAG............................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGGG......................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAA...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTCaaa................................................................................................................................................................................................................ 28 aaa 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 21 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GGAGGGGAGCTGAATCCATGCTAAGAA........................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CTAAGAATATGAATCTCCCATCGA.......................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGGGTCA...................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAa............................................................................................................................................................ 28 a 3.00 0.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGT................................................................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAt............................................................................................................................................................ 27 t 3.00 0.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTC................................................................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTT............................................................. 27 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AATCCATGCTAAGAATATGAATCTCCCATC............................................................................ 30 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AATATGAATCTCCCATCGAGGATACTGTG................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGG.......................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................CCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAG........................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCC............................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................................................CTTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGA................. 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAAC..................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGAA................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAGGGGAGCTGAATCCATGCTAAGA............................................................................................ 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CCTGTCTGTGGAGTGTGA.................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGAATCC............. 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGAGAGCCACTGCCTTCA....................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................ATGAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTT............................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CCCCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAG............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........GTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAg....................................................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CCCTCCCCCTCCGCTTCTA............................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACTGCCTTCAACCTGTCTGT............................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTG.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAa............................................................................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGcat........................................................ 30 cat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTga................................................................................................................................................................................................................. 29 ga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CCTCCCCCTCCGCTTCTACCCA......................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........AGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAA...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAagg............................................................................................................................................................ 26 agg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................CTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAa............................................................................................................................................................ 24 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................CTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTG........................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................AGCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGA.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................GAGCCACTGCCTTCAACCTGTCcctg................................................................................................................................................................................................................ 26 cctg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAa....................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................ACTGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAAA.......................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......CCAGTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAAC..................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................GAGAGCCACTGCCTTCAACCTGT................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........ATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTG.................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCA................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CAAAGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACT... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCTAAGAATATGAATCTCCCATCGAGGA....................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGC. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGG........................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCA................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CTAAGAATATGAATCTCCCA.............................................................................. 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CCTCCGCTTCTACCCATGTGTTC.................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................ATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCA................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................CACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAG......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTT.............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ATATGAATCTCCCAacac.............................................................................. 18 acac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...................................................................................................................................................................................TACTGTGTTTCGGTGTTGTGGGATTGAA........................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TACCCATGTGTTCCAGCCAGGGTCA...................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AAAGGAGCTTTGACCAAAGGAGTTCAGA................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................ACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGA.................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CCCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCC................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........GTATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAAC..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................CTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGG.......................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGTGA.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........ATGGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCT................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTCT............................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGG.......................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CCGCTTCTACCCATGTGTTCCAGC.............................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TCTACCCATGTGTTCCAGCCAGG.......................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GCTTTGACCAAAGGAGTTCAGAATCCTGT.......... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GTGGGATTGAAAGGAGCTTTGACCAAAGG......................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGGGAGCTGAATCCATGCTAAGAATATG....................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........GGCCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGct.................................................................................................................................................................................................................. 29 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTG........................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AATATGAATCTCCCATCGAGGATACT................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TTCTACCCATGTGTTCCAGCCA............................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTCT............................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAc............................................................................................................................................................ 26 c 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................AAGGAGTTCAGAATCCTGTGGTTACTGCa. 29 a 1.00 8.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGG........................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ATATGAATCTCCCATCGAGGATACTG.................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTGTT...................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAGCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTG............................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................CGCTTCTACCCATGTGTTCCAGCCAGG.......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................AATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGTG........................................................ 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ATCCATGCTAAGAATATGAATCTCCCA.............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................AATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGT......................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................CCTCCGCTTCTACCCATGTGTTCCAa................................................................................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTC................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TTCAGAATCCTGTGGTTACTGC. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGAGTGTG..................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................GTTCCAGCCAGGGTCAGCTTTGTCTGT........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCAGAGAGCCACTGCCTTCAACCTGTCg................................................................................................................................................................................................................ 28 g 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCCACTGCCTTCAACCTGTCTGTGGA.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGAATCTCCCATCGAGGATACTGTGTTT............................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TCTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGG.......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CTCCCATCGAGGATACTGTGTTTCGGttt.......................................................... 29 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GAGCTGAATCCATGCTAAGAATATGAATCTC................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TCTGTGGCTGATGAGGA............................................................................................................................... 17 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -