(10)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(29)
TESTES

Sense strand
TACCAGGGATCTGAGGCTTCCATGGACACTGCACACATGACATGTGGTGCACAGACATACATGCAGGCAAAACACATACATATAGAAATTACATACACATACACACAATTGGGTTATAGGTCCTGGAGACCCTTATTCTGATAGAGCTCCTAGGCCCAAGATGTTCTGTACCTTAGACCTACTTCTACCTGCTCCAACAGGCTCCATGGCTCCTACGAGGTAATGCGAGGAGGTCACATGAACGAGGCTT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
...............................................................................................CACATACACACAATTGGGTTATAGGTCCTG............................................................................................................................. 30 1 6.00 6.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TTATTCTGATAGAGCTCCTAGGCCCAAG.......................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TATTCTGATAGAGCTCCTAGGCCCAAGA......................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CACATACATATAGAAATTACATACACAT...................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCGAGGAGGTCACATGAACGA..... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGATAGAGCTCCTAGGCCCAAGATG....................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGGATCTGAGGCTTCCATGGACAC............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................CACAGACATACATGCAGGCAAttt................................................................................................................................................................................. 24 ttt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TTATTCTGATAGAGCTCCTAGGCCCAAGA......................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTCCATGGACACTGCACACATGACATGT............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................CAGACATACATGCAGGCAAAACACAata........................................................................................................................................................................... 28 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
............................................................................................................................................................................................................................TAATGCGAGGAGGTCACATGAACG...... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGGGATCTGAGGCTTCCATGGACACTGC.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCGAGGAGGTCACATGAACGAGGC.. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TAGACCTACTTCTACCTGCTCCAACAGGCTC.............................................. 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGACATGTGGTGCACAGACATACAT............................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGCGAGGAGGTCACATGAACGAGGCTT 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................CACAGACATACATGCtttt...................................................................................................................................................................................... 19 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................TACATGCAGGCAAAACACATtt........................................................................................................................................................................... 22 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................................CACAGACATACATGCAGGCAAAACAgccc............................................................................................................................................................................ 29 gccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..................................................................................TAGAAATTACATACACATACACACAATT............................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...................................................................................................................................CTTATTCTGATAGAGCTCCTAGGCCCA............................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TGCACAGACATACATGCAGGCAAAACAgct............................................................................................................................................................................. 30 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................CACAGACATACATGCAGGCAAAACAgctt............................................................................................................................................................................ 29 gctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................................TGCACAGACATACATGCAGGCAAAACAgctt............................................................................................................................................................................ 31 gctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................CACAGACATACATGCAGGCAAAACAgttt............................................................................................................................................................................ 29 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................ACAGACATACATGCAGGCAAAACAgctt............................................................................................................................................................................ 28 gctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAGGCCCAAGATGTTCTGTACC.............................................................................. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..................................................ACAGACATACATGCAGGCAAAACAgcct............................................................................................................................................................................ 28 gcct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -

Antisense strand
TACCAGGGATCTGAGGCTTCCATGGACACTGCACACATGACATGTGGTGCACAGACATACATGCAGGCAAAACACATACATATAGAAATTACATACACATACACACAATTGGGTTATAGGTCCTGGAGACCCTTATTCTGATAGAGCTCCTAGGCCCAAGATGTTCTGTACCTTAGACCTACTTCTACCTGCTCCAACAGGCTCCATGGCTCCTACGAGGTAATGCGAGGAGGTCACATGAACGAGGCTT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014234(GSM319958)
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SRR029036(GSM433288)
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Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
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testes_rep3. (testes)
.....................................................................................................................................................................................CTTCTACCTGCTCCAACAGGCTCCA............................................ 25 1 9.00 9.00 - 1.00 - - - - 1.00 5.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..............................................................GCAGGCAAAACACATACATATAGAA................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................GCAAAACACATACATATAGAAATTACA............................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGCTCCATGGCTCCTACGAGGTAA........................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCCCAAGATGTTCTGTACCTTA........................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TATAGAAATTACATACACATACACA................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACAGGCTCCATGGCTCCTACGAGGTA............................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCTCCTAGGCCCAAGATGTTCTGTA................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......GGATCTGAGGCTTCCATGGACACTGCA......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................ATGCAGGCAAAACACATACATATA...................................................................................................................................................................... 24 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGCACACATGACATGTGGTGCACAGACATA............................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TAGAAATTACATACACATACACACAAT............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GGCTCCATGGCTCCTACGAGGTAAcg........................... 26 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
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..................................................................................................................................CCTTATTCTGATAGAGCTCCTA.................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..............GGCTTCCATGGACACTGCACACATGACA................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GGCAAAACACATACcatt........................................................................................................................................................................... 18 catt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
......................................................................................................................................................................................TTCTACCTGCTCCAACAGGCTCCAT........................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGACATACATGCAGGCAAAAccgc.................................................................................................................................................................................. 24 ccgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...............................................................................................................................GACCCTTATTCTGATAGAGCTCCTA.................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GATGTTCTGTACCTTAGACCTACTTCTA............................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................ACAGACATACATGCAGGCAAAAtaa.................................................................................................................................................................................. 25 taa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GATGTTCTGTACCTTAGACCTACTTC................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GTACCTTAGACCTACTTCTACCTGCTCCAc...................................................... 30 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................AGACCCTTATTCTGATAGAGCTCCTA.................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -