| Gene: Sertad1 | ID: uc009fwh.1_intron_0_0_chr7_28272098_f.3p | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(6) OTHER.mut |
(5) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(32) TESTES |
| TGCCTACATAGCACGTTTGGGGGCAGGTCAGCCTGAGTTACACGGGACCCTGTCCCGTTAGAAACAAATAAGAATTTGCTTAGAAAACCTAGACCTGGAGGTTAATCGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGCAGTTGTCAGAGCTGGGTGTGAACTGAGTATTGGCTTCCCATAACTGAATGGCTCCTTCCTCCCTGCAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGAGGAGACGAT .........................................................................................................((((.((.((((.....((((..((((..........))))..))))..)))).))))))..................................................................................... ....................................................................................................101....................................................................172............................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGG................. | 26 | 1 | 102.00 | 102.00 | 24.00 | 21.00 | 12.00 | 14.00 | 5.00 | 4.00 | 4.00 | 9.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGC................... | 27 | 1 | 24.00 | 24.00 | 13.00 | 5.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| .........................................................................................................TCGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGC...................................................................................................................... | 27 | 1 | 20.00 | 20.00 | 6.00 | 11.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGG................ | 27 | 1 | 18.00 | 18.00 | 3.00 | 6.00 | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................AAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAGt.......... | 27 | t | 6.00 | 0.00 | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGC....................... | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TCGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGCA..................................................................................................................... | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................TAACTGAATGGCTCCTTCCTCCCTGC.................................................... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................GGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGC....................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................GAGCTGGGTGTGAACTGAGTATTGGCTT.................................................................................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................TTAATCGACTGGTCAGGATCCCACAGAC......................................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTG............................. | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCAAAGGTCTGAAG.......................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACATAGCACGTTTGGGGGCAGGTC............................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................TGTCAGAGCTGGGTGTGAACTGAGT.......................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAA..................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCG.................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TTTGCTTAGAAAACCTAGACCTGGAG...................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGC....................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................GGTTAATCGACTGGTCAGGATCCCAC............................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGA............... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCT.............................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................TGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGAGGA...... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................AGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGC....................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................GATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGC....................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................TAATCGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGCA..................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TCCCTGCAGAGGATGCTGAGCAAAGGTC............................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................ATCGACTGGTCAGGATCCCACAGACAG....................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACATAGCACGTTTGGGGGCAGGTCt............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | t | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................TGGGTGTGAACTGAGTATTGGCTTCCC............................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................AAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAGG............. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................CGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGCA..................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGt................. | 29 | t | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................TGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGA......... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGC......................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................GAGGTTAATCGACTGGTCAGGATCCCACAG........................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................CAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAG........... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................AAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAG.............. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGAACTGAGTATTGGCTTCCCA.............................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TCCCTGCAGAGGATGCTGAGCAAAGG................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCG.................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGt................ | 27 | t | 1.00 | 102.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGA......... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGa................ | 27 | a | 1.00 | 102.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................TAATCGACTGGTCAGGATCCCACAGAC......................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................TAATCGACTGGTCAGGATCCCACAGA.......................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................CGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGCAG.................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAG.................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAG.............. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TGGAGGTTAATCGACTGGTCAGGATCC................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................AGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGC......................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAG.............. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................AGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAGGA............ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................GAGCTGGGTGTGAACTGAGTATTGGCa................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................AGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAG.............. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................GAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGa................... | 23 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................AGCGCAAGCGGGAGGAGGAGGAGAC... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGAG........ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................TTCCTCCCTGCAGAGGATGCTGAGCAA.................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................TAACTGAATGGCTCCTTCCTCCCTG..................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGAGGAGA.... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................ATCGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGC...................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAGGA............ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAG.......................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGA............................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGC................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................TGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGAGGAa..... | 26 | a | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGt............... | 28 | t | 1.00 | 18.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................TAACTGAATGGCTCCTTCCTCCCTGCA................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................TCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGAGGAGAtt.. | 31 | tt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGt............................ | 27 | t | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGC....................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| .............................................................................................................CTGGTCAGGATCCCACAGACAGCAGTTt................................................................................................................. | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................TGTGAACTGAGTATTGGCTTCCCATA............................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GTCAGAGCTGGGTGTG.................................................................................................. | 16 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TGCCTACATAGCACGTTTGGGGGCAGGTCAGCCTGAGTTACACGGGACCCTGTCCCGTTAGAAACAAATAAGAATTTGCTTAGAAAACCTAGACCTGGAGGTTAATCGACTGGTCAGGATCCCACAGACAGCAGTTGTCAGAGCTGGGTGTGAACTGAGTATTGGCTTCCCATAACTGAATGGCTCCTTCCTCCCTGCAGAGGATGCTGAGCAAAGGTCTGAAGCGCAAGCGGGAGGAGGAGGAGACGAT .........................................................................................................((((.((.((((.....((((..((((..........))))..))))..)))).))))))..................................................................................... ....................................................................................................101....................................................................172............................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................................................................................................................................................................................GCAAAGGTCTGAAGcagt.......................... | 18 | cagt | 6.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |