| Gene: 2310004L02Rik | ID: uc009fte.1_intron_0_0_chr7_26404480_f.5p | SPECIES: mm9 |
|
|
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(9) OTHER.mut |
(6) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(36) TESTES |
| TCCTGCCTCTTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGGCGCCCAGAGCGGTAGGTGACCGCAGCGTCCGCGTCCCGGAACTATGGTTCACTTTGTAGCTCGGTTCTCGAGACCTCTCTCAGCCTCCTGGGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAGAGCGTCTCCTGCCGGACCTCGCTCGGGAGACGCCGTCTGGGGCTGCCGAGGGCCACAGAGAGTCTCGAGTCGCTTGATAGAGAAACCAATGGGATGA ..........................................................................................................................((....)).............((((...((((((((((((((.((.....))..))))))))))..))))...))))................................................... ..........................................................................................................................123..........................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .............GTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGGC.................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 13.00 | 13.00 | 9.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGGGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAGAGC.............................................................................................. | 29 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 3.00 | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TCCTGCCGGACCTCGCTCGGGAGACGCC............................................................... | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGC..................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGG...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGC..................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGGGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAGA................................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGGGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAGAG............................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................ACCTGGCAAGATGGCGGCGCCCAGA........................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGAT........................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GTTTACGTTACCTGGCAAGATGG...................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ..........................GGCAAGATGGCGGCGCCCAGAGCGGT...................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 |
| ..........TCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGC..................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TGGCAAGATGGCGGCGCCCAGAGCGGTcct................................................................................................................................................................................................... | 30 | cct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CTTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGt................................................................................................................................................................................................................... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........TTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGttt................................................................................................................................................................................................................. | 32 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGTTTACGTTACCTGGCAAGATGG...................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................TCCTGCCGGACCTCGCTCGGGAGACG................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........CTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGC..................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCt.................................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGGCGC................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................GACCTCGCTCGGGAGACGCCGTCTGG......................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TGCGGAAACAGAGCGTCTCCTGCCGG.................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TGCGGAAACAGAGCGTCTCCTGCCGGACCc.............................................................................. | 30 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................................................................................................................TGCCGGACCTCGCTCGGGAGACGCCGT............................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................TGCCGGACCTCGCTCGGGAGACGCagt............................................................. | 27 | agt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................TGGGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAG................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................TGCCGAGGGCCACAGAGAGTCTCGAGT........................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......TCTTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGC..................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGTTCACTTTGTAGCTCGGTTCTCGAGAC......................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TGGGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAGAGCGT............................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................ACCTGGCAAGATGGCGGCGCCCAGAGCG........................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TATGGTTCACTTTGTAGCTCGGTTCT............................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........TTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGt................................................................................................................................................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................GCAAGATGGCGGCGCCCAGAGCGG....................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGt...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 15.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........TCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGG...................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................GGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAGAGCG............................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................ATGGCGGCGCCCAGAGC......................................................................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............TGTTTACGTTACCTGGCAAGATG....................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....GCCTCTTCTGTTTACGTTACCTGGCA............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GTTTACGTTACCTGGCAAGATGGC..................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................GGCAAGATGGCGGCGCCCAGAGCGG....................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| .............GTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGG................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........CTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGt..................................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGt................................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................ACGTTACCTGGCAAGATGGCGGCGCCC.............................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................TGCCGGACCTCGCTCGGGAGACGCCGTC............................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................ACAAAAGTCTGCGGAAACAGAGCGTC........................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CTCTTCTGTTTACGTTACCTGGCAAG.......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................ACGTTACCTGGCAAGATGGCGGCGCC............................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................TGGGGCTGCCGAGGGC............................................ | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................GCAAGATGGCGGCGCCC.............................................................................................................................................................................................................. | 17 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................AGATGGCGGCGCCCAcgga......................................................................................................................................................................................................... | 19 | cgga | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................AGATGGCGGCGCCCA............................................................................................................................................................................................................. | 15 | 15 | 0.07 | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TCCTGCCTCTTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGATGGCGGCGCCCAGAGCGGTAGGTGACCGCAGCGTCCGCGTCCCGGAACTATGGTTCACTTTGTAGCTCGGTTCTCGAGACCTCTCTCAGCCTCCTGGGAAACAAAAGTCTGCGGAAACAGAGCGTCTCCTGCCGGACCTCGCTCGGGAGACGCCGTCTGGGGCTGCCGAGGGCCACAGAGAGTCTCGAGTCGCTTGATAGAGAAACCAATGGGATGA ..........................................................................................................................((....)).............((((...((((((((((((((.((.....))..))))))))))..))))...))))................................................... ..........................................................................................................................123..........................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................................................................................GCCACAGAGAGTCTCGAGTCGCTTGATA.................. | 28 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................ACAGAGAGTCTCGAGTCGCTTGATA.................. | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................CCGCAGCGTCCGCGTCCCGGAACTA....................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................CACAGAGAGTCTCGAGTCGCTTGATA.................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........CTTCTGTTTACGTTACCTGGCAAGA......................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................AGAGTCTCGAGTCGCTTGATAGAG............... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................CCACAGAGAGTCTCGAGTCGCTTGA.................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................CCACAGAGAGTCTCGAGTCGCTTGAT................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................GCGTCTCCTGCCGGACCTCGCTCGGGA..................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................GACCGCAGCGTCCGCGTCCCGGAACTA....................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................GATGGCGGCGCCCAGAGCGGTAGGTGA................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................ACAGAGAGTCTCGAGTCGCTT...................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................ACCGCAGCGTCCGCGTCCCGGAACTA....................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................ACAGAGCGTCTCCTGCCGGA................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................AGCGTCCGCGTCCCGGAACTATGGTTCA................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................CAGCGTCCGCGTCCCGGAACTATGGTTCACt............................................................................................................................................................... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................GCGTCCGCGTCCCGGAACTATGGTTCA................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |