| Gene: 1500002O20Rik | ID: uc009fpn.1_intron_6_0_chr7_25200070_f.5p | SPECIES: mm9 | 
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| 
  (9)  OTHER.mut  | 
  
  
  (7)  PIWI.ip  | 
  
  
  (4)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (39)  TESTES  | 
  
  
| GCATTGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAGGTGCGGGCCCCAGCGCCTCTCCCTGCCCATTGCTTCCTCTTGTCAGAGTGGCCTGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTGGGGGTGGCCTGGGAGCTGTGTGGGTCCAGATCCTGAACTTCAGCCTTAGCAGCCCTGTGACCTCTGCCCCCAGGCCTGGTCTTACCCGACAGGAGTGCGGGCTCTACCTGTTGGGAGCT ...................................................................................................((.((((((..((((((.((.((((..((((.(((....))).))))..))))..)).))))....)).))))))))...(((....)))............................................................. ..................................................................................................99.........................................................................................190..........................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................................................TGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTT........................................................................................................................ | 27 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| ......ACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCT...................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................AGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTGG...................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................GAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAGGTGCGGGC................................................................................................................................................................................................ | 35 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTT......................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 
| ....TGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATT.......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................TCTGAGCAGCATGACTTTGGGGGTGGCC.............................................................................................................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................CAGATCCTGAACTTCAGCCTTAGCAGC.................................................................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTGG...................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTA................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| ........TTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTTC.................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................AGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAGc....................................................................................................................................................................................................... | 29 | c | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......ACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTC....................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TCATTACCCAAGAGCGGATTGTCT...................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......ACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTT..................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTC....................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............TCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTT..................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGA............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................CTGAGCAGCATGACTTTGGGGGTGG................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| ...TTGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTG......................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................AGTGGCCTGAAGGATCTCTGAGCAG................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........TTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCT...................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................AAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACAC............................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| ..................................................................................................TGGCCTGAAGGATCTCTGAGCAGCAT.............................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................TGTCAGAGTGGCCTGAAGGATCTCTGA..................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGG............................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....GACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTG......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................AGCCTTAGCAGCCCTGTGACCTCTGC.................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTG....................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................GATCCTGAACTTCAGCCTTAGCAGCCCT............................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACA............................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........TTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTC....................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................TCTGAGCAGCATGACTTTGGGGGTGGg............................................................................................................... | 27 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................TTGCTTCCTCTTGTCAGAGTGGCCTG................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................TGTGGGTCCAGATCCTGAACTTCAGC........................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................AAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAG........................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........TTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTTC.................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TAGCAGCCCTGTGACCTCTGC.................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................TGTGTGGGTCCAGATCCTGAACTTCAGCC.......................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................AGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACA......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................TGTGTGGGTCCAGATCCTGAACTTCAGC........................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................TCTGAGCAGCATGACTTTGGGGGTG................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................CTGAGCAGCATGACTTTGGGGGT.................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| ..................................................................................................................TGAGCAGCATGACTTTGGGGGTGGCCT............................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACAtt........................................................................................................................................................................................................... | 31 | tt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................CTGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTG....................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................AGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAG........................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....GACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTC....................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................CCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAG........................................................................................................................................................................................................ | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................GAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTGG...................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......CTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCT...................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTt......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................AAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACt........................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................AAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAGc....................................................................................................................................................................................................... | 30 | c | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................CTGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTT......................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................CTCTGAGCAGCATGACTTTGGGGGTG................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...TTGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATT.......................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTA................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................TGTGTGGGTCCAGATCCTGAACTTCAG............................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTttc....................................................................................................................................................................................................................... | 31 | ttc | 1.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................AGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTGGG..................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGAAGGATCTCTGAGCAGCATGAC........................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...TTGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGA............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGT........................................................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................AAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTGG...................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................TGCCCATTGCTTCCTCTTGTCAGAGTGGCC................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........TTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCT.................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TGAAGGATCTCTGAGCAGCATGA............................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................CTGTGTGGGTCCAGATCCTGAACTTCAGC........................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............TTACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTAGAC.............................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................TCAGAGTGGCCTGAAGGATCTCTGAGC................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| GCATTGACTTCTTCATTACCCAAGAGCGGATTGTCTTCCTAGACACACAGGTGCGGGCCCCAGCGCCTCTCCCTGCCCATTGCTTCCTCTTGTCAGAGTGGCCTGAAGGATCTCTGAGCAGCATGACTTTGGGGGTGGCCTGGGAGCTGTGTGGGTCCAGATCCTGAACTTCAGCCTTAGCAGCCCTGTGACCTCTGCCCCCAGGCCTGGTCTTACCCGACAGGAGTGCGGGCTCTACCTGTTGGGAGCT ...................................................................................................((.((((((..((((((.((.((((..((((.(((....))).))))..))))..)).))))....)).))))))))...(((....)))............................................................. ..................................................................................................99.........................................................................................190..........................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | 
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| ........................................................................................TGTCAGAGTGGCCTGtc................................................................................................................................................. | 17 | tc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
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| ........................................................................................................................................................GGGTCCAGATCCTGAACTTCAGCCTTA....................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |