(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
GAAGCTCACAGCAAACCAGCGCCTGACATGGCTGGATATAACTGGAGCACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAGCTGGGGCCAGGACCCAGAGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTT
.............................................................((.(((((..((((..((.......))..))))...))))).))(((....)))..(((((...((...(((.....(((((.......)))))......)))..))...)))))..........................................................................
.............................................................62.................................................................................................................177.......................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAGC.............................................................................................................................................................. 26 1 30.00 30.00 - 23.00 1.00 2.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAG............................................................................................................................................................... 25 1 14.00 14.00 - 5.00 1.00 2.00 - - - - - - - - 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGCTGGATATAACTGGAGCACGTGAGT.................................................................................................................................................................................................. 28 1 14.00 14.00 - 4.00 4.00 - 1.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ACGTGAGTGACGGGGACCTGGAAC.................................................................................................................................................................................. 24 1 10.00 10.00 - 4.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TATAACTGGAGCACGTGAGTGACGG............................................................................................................................................................................................. 25 1 10.00 10.00 1.00 - 1.00 - - - - 3.00 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGA................................................................................................................................................................ 24 1 8.00 8.00 - - 3.00 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAGC................... 30 1 8.00 8.00 - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGCTGGATATAACTGGAGCACGTGA.................................................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 - - 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TAGAATTGGGCATGGTGGAGCACATC............................................................................. 26 1 7.00 7.00 - - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TAAAATAGAATTGGGCATGGTGGAGC.................................................................................. 26 1 6.00 6.00 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAG................................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTAAAATAGAATTGGGCATGGTGGAGC.................................................................................. 27 1 5.00 5.00 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAGC............................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAG......................... 27 1 5.00 5.00 - 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGG........................ 29 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TATAACTGGAGCACGTGAGTGACGGG............................................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCATGGTG...................................................................................... 30 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................AGAGGTCTGAGAGAGAAGGGCA.......................................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGG........................ 27 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGGATATAACTGGAGCACGTGAGTGAC............................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGG................................................................................................................................................................. 23 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGACGGGGACCTGGAACAGCGT............................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGCTGGATATAACTGGAGCACGTGAG................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGACATGGCTGGATATAACTGGAGCA......................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGACGGGGACCTGGAACAGCGTC............................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TAGAATTGGGCATGGTGGAGCACATCT............................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGA.......................... 27 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGC............................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGA.......................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGCAGAC............................................ 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGC....................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGACGGGGACCTGGAACAGCG.............................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGC....................... 23 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGGATATAACTGGAGCACGTGAGTGACG.............................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCTGACATGGCTGGATATAACTGGAGC.......................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGCTGGATATAACTGGAGCACGTGAGa.................................................................................................................................................................................................. 28 a 2.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGG.................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GCGCCTGACATGGCTGGATATAACTGGA............................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TAATCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGC................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAG......................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AACTGGAGCACGTGAGTGACGGGGACCTa...................................................................................................................................................................................... 29 a 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAACTGGAGCACGTGAGTGACGtgga.......................................................................................................................................................................................... 26 tgga 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AGGGCAAACACAGGAGCAATTAAAATA..................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAACTGGAGCACGTGAGTGACGGG............................................................................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAACTGGAGCACGTGAGTGACGGGGA.......................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGACGGGGACCTGGAACAGCGa............................................................................................................................................................................. 26 a 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TAGAATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTT.......................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAGt.............................................................................................................................................................. 26 t 2.00 14.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGACGGGGACCTGGAACAG................................................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TAAAATAGAATTGGGCATGGTGGAGCAC................................................................................ 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCTGGATATAACTGGAGCACGTGAGTGAC............................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GAGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAACACA.................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................AGAGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAAC....................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAAaaga.............................................................. 29 aaga 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAGCAAACCAGCGCCTGACATGGCTGGA...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTAAAATAGAATTGGGCATGGTGGAG................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ACAGGAGCAATTAAAAaaaa................................................................................................... 20 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AGGGCAAACACAGGAGCAATTAAAATAGA................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCTGGATATAACTGGAGCACGTGAGT.................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TAATCCCAACACGCAGGAAGCAGagg................................................. 26 agg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGTGACGGGGACCTGGAACAGC............................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATGGCTGGATATAACTGGAGCACG....................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAG................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................ATATAACTGGAGCACGTGAGTGACGGG............................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CAAACCAGCGCCTGACATG............................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAACTGGAGCACGTGAGTGACGGGGgc......................................................................................................................................................................................... 27 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................ACAGCGTCTGTGGGAGAGGAGCTG............................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CTGTGGGAGAGGAGCTGGGGCtaga.................................................................................................................................................... 25 taga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGACGGGGACCTGGAACAGCGTCTG.......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTAAAATAGAATTGGGCATGGTGGA.................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAGa................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGACATGGCTGGATATAACTGGA............................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................ATAACTGGAGCACGTGAGTGACGG............................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAAa............................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAGt............................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGGGAGAGGAGCTGGGGCCAGGAa.................................................................................................................................................. 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGTGACGGGGACCTGGAACAGCGTC............................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CACAGGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCAT.......................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAGaaa............................................................................................................................................................................. 29 aaa 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGa.................................................................................................................. 25 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ACAGGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCATGa........................................................................................ 31 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGCAGACA........................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGCTGGATATAACTGGAGCACGTGAac.................................................................................................................................................................................................. 28 ac 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAG.................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAACTGGAGCACGTGAGTGACGGGGAC......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAAa............................................................................................................ 29 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TGACATGGCTGGATATAACTGGAG........................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGG........................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGTGAGGTGGAGGCTAGCCTGGTCa............ 25 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCATGG........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAACTGGAGCACGTGAGTGACGGGGACC........................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GAATTGGGCATGGTGGAGCACATCTT........................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GAGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAG................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGC................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGACAGAGCTCTGTGAGGc............................. 19 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GAATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTT.......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCc.............................................................................................................. 29 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TGTGAGGTGGAGGCTAGCgtgg............... 22 gtgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................AACAGCGTCTGTGGGAGAGGAGCT............................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGc........................... 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAAT............................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGA................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................ACCCAGAGGTCTGAGAGAGAAGGGC........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GGGACCTGGAACAGCGTCTGTGGGAGAtg................................................................................................................................................................. 29 tg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................AAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGT............................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATGGCTGGATATAACTGGAGCACGT...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAt............................................................................................................................................................... 25 t 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TTAATCCCAACACGCAGGAAGCAGTGG................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AGGAAGCAGTGGCAGACAGAGCTC..................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................................................................................................AAATAGAATTGGGCATGGTGGAGC.................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...............................................................................GTGGGAGAGGAGCTGctaa........................................................................................................................................................ 19 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCATGGTGt..................................................................................... 31 t 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GACAGAGCTCTGTGAGGTGG........................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAGCCTGG............... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAGa............................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 5.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GAGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGa.................................................................................................................. 29 a 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGA................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAA............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGAAGGGCAAACACAGGAGCAATTAA......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GAGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAACAC..................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CTCTGTGAGGTGGAGGCTAGCCTGGT.............. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCATGGT....................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCA.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAAT............................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GGGACCTGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGa................................................................................................................................................................. 29 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................CGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAG................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GGCAAACACAGGAGCAAT............................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TTTAATCCCAACACGCAGGAAGC...................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCTGTGGGAGAGGAGCTGGG.......................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGAGGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACA......... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GGCATGGTGGAGCACATCT............................................................................ 19 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAAGCTCACAGCAAACCAGCGCCTGACATGGCTGGATATAACTGGAGCACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAGCTGGGGCCAGGACCCAGAGGTCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTT
.............................................................((.(((((..((((..((.......))..))))...))))).))(((....)))..(((((...((...(((.....(((((.......)))))......)))..))...)))))..........................................................................
.............................................................62.................................................................................................................177.......................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
...GCTCACAGCAAACCAGCGCCTGACA.............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 26.00 26.00 - - 3.00 6.00 4.00 2.00 - 4.00 - 1.00 - - 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGA... 29 1 23.00 23.00 - 9.00 1.00 3.00 3.00 - - 4.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGA... 27 2 13.50 13.50 0.50 2.00 1.00 - 2.00 - - 1.00 2.50 0.50 - - 1.00 - 2.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAta... 22 ta 13.00 0.00 - - - - - - - - - - - 13.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCA................................................................... 27 3 12.00 12.00 1.00 - 2.00 3.67 - 1.00 - 1.00 - - 0.33 0.33 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GCGCCTGACATGGCTGGATATAACTGGAGC.......................................................................................................................................................................................................... 30 1 11.00 11.00 3.00 4.00 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGA... 28 1 10.00 10.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GAGGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGA... 31 1 9.00 9.00 - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGA... 26 2 7.00 7.00 - - - 1.00 1.50 - - - 1.50 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCACAGCAAACCAGCGCCTGACA.............................................................................................................................................................................................................................. 23 1 5.00 5.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGA.......................... 29 1 5.00 5.00 1.00 - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GCTGGGGCCAGGACCCAGAGGTCTGAGA.................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGCGCCTGACATGGCTGGATATAACTGGA............................................................................................................................................................................................................ 29 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCA................................................................... 28 2 4.00 4.00 - - - 0.50 1.00 0.50 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GAGCACGTGAGTGACGGGGACCTGGAA................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..AGCTCACAGCAAACCAGCGCCTGACA.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAACA................................................................ 28 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTA..................... 29 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................AACACGCAGGAAGCAGTGGCAGACA........................................... 25 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................AAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGA................................ 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AAGCTCACAGCAAACCAGCGCCTGACA.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCA................................................................... 29 2 3.00 3.00 1.50 - - 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GCACATCTTTAATCCCAACACGCAGGAA........................................................ 28 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGCGCCTGACATGGCTGGATATAACTGGAGC.......................................................................................................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AGGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAa... 31 a 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................GCCTGGTCTACAGAGCGcgga.... 21 cgga 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................ACAGGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCAa........................................................................................... 29 a 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GGGACCTGGAACAGCGTCTGTGGGAGA................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAAC................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TAAAATAGAATTGGGCATGGTGGAGCACA............................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAA.................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GGGCCAGGACCCAGAGGTCTGAGAgaaa.................................................................................................................................... 28 gaaa 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AGGGCAAACACAGGAGCAATTAAAATA..................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AGCCTGGTCTACAGAGCGAcgc... 22 cgc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................AGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAATTA.......................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGAAGGGCAAACACAGGAGCAATTA.......................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTga. 30 ga 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGA.......................... 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGCTCTGTGAGGTGGAGGCTA..................... 21 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAaa................................................................... 29 aa 1.67 0.00 - - 0.33 - - - - 0.67 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCA................................................................... 26 3 1.33 1.33 0.33 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAtgta................................................................................................................................................................ 28 tgta 1.00 8.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAGC................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTTtcat 27 tcat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAAC................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATGGCTGGATATAACTGGA............................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AACCAGCGCCTGACATGGCTGGATATA.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GCTGGATATAACTGGAGCACGTGAG................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................GGGGCCAGGACCCAGAGGTCTGAGAGAGAA............................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGTGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGG........................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGGGGCCAGGACCCAGAGGTCTGAGAGAGAAa............................................................................................................................... 32 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAtgtt... 28 tgtt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................ACATCTTTAATCCCAACACGCAGGA......................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GGAAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGA................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AAGGGCAAACACAGGAGCAATTAAAATA..................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGGAGCACATCTTTAATCCCAAC................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GACCCAGAGGTCTGggc....................................................................................................................................... 17 ggc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................ATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTTAA........................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................ATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAa................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAtcag... 24 tcag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAG.................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.AAGCTCACAGCAAACCAGC...................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................ATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAtccc................................................................... 29 tccc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACCAGCGCCTGACATGGCTGGATATA.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGGGCATGGTGGAGCACATCTTTAgtt......................................................................... 27 gtt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAA.................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTTtagt 27 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTG............................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................GCACATCTTTAATCCCAACACGCAGG.......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................AATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTTA......................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GAAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGtt................................... 26 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................ACATCTTTAATCCCAACACGCAGGAAGCA..................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTTtaat 27 taat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
................................................................................................................................................................GGTGGAGCACATCTTTAATCCCAACACGCA............................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAtcg... 23 tcg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CACGCAGGAAGCAGTGGCAGACA........................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................AGCGTCTGTGGGAGAGGAGCTGGGGCCAta...................................................................................................................................................... 30 ta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................GCCTGGTCTACAGAGCGAcaga... 22 caga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GCAAACCAGCGCCTGACATGGCTGGATA.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................CTTTAATCCCAACACGCAGGAAGCAGT................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGAGCACATCTTTAATCCCAACACGata.............................................................. 29 ata 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................GGGCAAACACAGGAGCAATTAAAATA..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................GCCTGGTCTACAGAGCGccgc.... 21 ccgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................GAATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTc........................................................................... 27 c 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAA.................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAtca... 23 tca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGGAGCAATTAAAATAGAATTGGGCA........................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACA................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAG.. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................TGGAACAGCGTCTGtgtc.......................................................................................................................................................................... 18 tgtc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAG...... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAA............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................CACGTGAGTGACGGGGACCTGGAACAaa................................................................................................................................................................................. 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTtcaa. 26 tcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................................................................................................................................................ACACGCAGGAAGCAGTGGCAGACA........................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAGa.. 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................AATCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGCAGA............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GCCAGGACCCAGAGGTCTGAGAGAGAA............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACCTGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGAG............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCCCAACACGCAGGAAGCA..................................................... 19 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAACa................................................................. 31 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACAGCAAACCAGCGCCTGACATGGCTa......................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CCTGGAACAGCGTCTGTGGGAGAGGA................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCG.... 26 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GGGGACCTGGAACAGCGTCTGTGGGA..................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................TGGCAGACAGAGCTCTGTGAGGTGGA.......................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GAGAGAAGGGCAAACACAGGAGCAATTA.......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGgaa........ 25 gaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GTGGAGCACATCTTTAATCCCAAC................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................GCCTGGTCTACAGAGCGAaaga... 22 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................AGCGCCTGACATGGCTGGATATAACTGG............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGTGGAGCACATCTTTAATCCCAA.................................................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................GCCAGGACCCAGAGGTCTGAGAGAGA................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GAAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTGA................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GGAAGCAGTGGCAGACAGAGCTCTGTG................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AGCGTCTGTGGGAGAcgcg................................................................................................................................................................... 19 cgcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................................................................................................................................................GACAGAGCTCTGTGAGGTGGAGGCTAG.................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TCTGAGAGAGAAGGGCAAACACAGGA................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GAATTGGGCATGGTGGAGCACATCTTTA......................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................ATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAACa................................................................. 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGga...... 26 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................GGCAAACACAGGAGCAATTAAAATA..................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TCTGTGAGGTGGAGGCTAGCCTGGTCTACA......... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AGCTGGGGCCAGGACCCAGAGGTCTGA...................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAtcaa... 24 tcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCga..... 27 ga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAtgac... 28 tgac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAa... 24 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGAAGGGCAAACACAGGAGCAATTAAAA....................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................AACACAGGAGCAATTAAAATA..................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CCAACACGCAGGAAGCAGTGGCA............................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAa... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAtcca... 24 tcca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................CATCTTTAATCCCAACACGCAGGAAGCA..................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCCCAACACGCAGGAAGCAGTGGCAa............................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GAGCTGGGGCCAGGACCCAGAGGTCTGAGA.................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TAGCCTGGTCTACAGAGCGAGTTtca 26 tca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAAC................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................ATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAAa.................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................AAACACAGGAGCAATTAAAATAGAA.................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TTGGGCATGGTGGAGCACATCTTTA......................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAag................................................................... 29 ag 0.67 0.00 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAaa................................................................... 28 aa 0.67 0.00 - - - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAa................................................................... 27 a 0.67 0.00 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAa... 28 a 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................CTTTAATCCCAACACGCAGGAAGCA..................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCA................................................................... 30 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGGCATGGTGGAGCACATCTTTAA........................................................................ 25 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAtt................................................................... 30 tt 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GAGCACATCTTTAATCCCAAC................................................................. 21 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GGCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAaaa................................................................... 31 aaa 0.50 0.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................GCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAaaa................................................................... 30 aaa 0.33 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAt................................................................... 27 t 0.33 0.00 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GCATGGTGGAGCACATCTTTAATCCC.................................................................... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CATGGTGGAGCACATCTTTAATCCCAacaa................................................................... 30 acaa 0.33 0.00 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGA... 25 13 0.15 0.15 0.08 - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAGT. 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAgag... 28 gag 0.08 0.00 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................GAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAat... 27 at 0.08 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GAGGCTAGCCTGGTCTACAGAGCGAaac... 28 aac 0.08 0.00 - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGTGGAGCACATCTTTAATCCCA................................................................... 23 15 0.07 0.07 - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GTGGAGCACATCTTTAATCCCA................................................................... 22 17 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - -