(6)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(2)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(22)
TESTES

Sense strand
AAGTTTGTGGTCAGCCTGGGCTACATGAGCCCTTTTCTTAAAACAGAAAACTAAAACAAACCGTCCCACTGTAATAGCCATAAAATGTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGACTGAGGGAGGTGGGATTTGGGGCGTTGTTTCAAAGATGCAGGGGTAACATGAAAGCTGGTTAATCCTCACCTGCTTGCCCATTTTCCAGAGAAACCTGAGAATATGCAGCAAAATACAAGATTACACCTAGGCTACATC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
..................................................................................................TGGACGCTGTAGACTGAGGGAGGTG............................................................................................................................... 25 1 11.00 11.00 8.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CAAGATTACACCTAGGCTA.... 19 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGTAGACTGAGGGAGGTGGGATTT......................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TGGACGCTGTAGACTGAGGGAGG................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGAC.......................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CAGAAAACTAAAACAAACCGTCCCACTGT.................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGAGAATATGCAGCAAAATACAAtatt................ 27 tatt 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAAACAAACCGTCCCACTGTAATAGCC........................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGAGAAACCTGAGAATATGCA............................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
................................................................................TAAAATGTGGTCAACACCTGGACGC................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGGTCAGCCTGGGCTACATGAGCCCTTaaa..................................................................................................................................................................................................................... 30 aaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TGGGATTTGGGGCGTTGTTTCAAAGAaa..................................................................................................... 28 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CGTTGTTTCAAAGATGCAGGGGTAAC........................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CTGGACGCTGTAGACTGA....................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
....TTGTGGTCAGCCTGGGCTACATGAGCCa.......................................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................CAAAGATGCAGGGGTAACATGAAAGC................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGA........................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................TAAAACAGAAAACTAAAACAAACCGTCac....................................................................................................................................................................................... 29 ac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TCTTAAAACAGAAAACTAAAACAAACCGT.......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................AATGTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGA........................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
................................................................................TAAAATGTGGTCAACACCTGGACGCTGT.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AAGTTTGTGGTCAGCCTGGGCTACATGAGCCCTTTTCTTAAAACAGAAAACTAAAACAAACCGTCCCACTGTAATAGCCATAAAATGTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGACTGAGGGAGGTGGGATTTGGGGCGTTGTTTCAAAGATGCAGGGGTAACATGAAAGCTGGTTAATCCTCACCTGCTTGCCCATTTTCCAGAGAAACCTGAGAATATGCAGCAAAATACAAGATTACACCTAGGCTACATC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
..............................................................................................................................................................................TCCTCACCTGCTTGCCCATTTTCCA................................................... 25 1 23.00 23.00 21.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................CCTCACCTGCTTGCCCATTTTCCA................................................... 24 1 13.00 13.00 12.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
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............................................................................................................................................................................AATCCTCACCTGCTTGCCCATTTTCCA................................................... 27 1 5.00 5.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................TAAAACAAACCGTCCCACTGTAATA.............................................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
......................................................................................................................................................................................TGCTTGCCCATTTTCCA................................................... 17 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................ACTAAAACAAACCGTCCCACTGTAA................................................................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GAGCCCTTTTCTTAAAACAGAAAACTA..................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................CCTCACCTGCTTGCCCATTTTCCAGAGAA.............................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................GCTTGCCCATTTTCCAGAGAAACCTG......................................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CACCTGCTTGCCCATTTTCCAGAGAAt.............................................. 27 t 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TCCAGAGAAACCTGAGAATATGCAGCAA........................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
............................GCCCTTTTCTTAAAACAGAAAACTA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................ACAAACCGTCCCACTGTAATAGCCA.......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGAGCCCTTTTCTTAAAACAGAAAACTA..................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................AATCCTCACCTGCTTGCCCATTTTCCAtg................................................... 29 tg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.........................................................................................................................................................................................................GAAACCTGAGAATATGCAGCAAAATACA..................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GGCGTTGTTTCAAAGATGCAGGGGTAACA.......................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGACTGA....................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................CTACATGAGCCCTTTTCTTAAAACAGAa........................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GCGTTGTTTCAAAGATGCA................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AACAGAAAACTAAAACAAACCGTCCCA...................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGATGCAGGGGTAACATGAAAGCTGGTTA............................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGTCAACACCTGGACGCTGTAGACTGA....................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................CTGCTTGCCCATTTTCCAGAGAAACC........................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGCCTGGGCTACATGAGCCCTTTTCTTAAA................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................CTACATGAGCCCTTTTCTTAAAACAGAAa.......................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................TTCTTAAAACAGAAAACTA..................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CACCTGCTTGCCCATTTTCCAGAGAA.............................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...................................................................................AATGTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGAC.......................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...................................................................................AATGTGGTCAACACCTGGACGCTGTA............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................GCAGGGGTAACATGAAAGCTGGTTAA............................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AATATGCAGCAAAATACAAGATTACACCTA......... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CTAAAACAAACCGTCCCACTGTAATA.............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................AAAACAAACCGTCCCACTGTAATAGCCAT......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GAGAATATGCAGCAAAATACAAGATTA............... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................GGACGCTGTAGACTGAGGGAGGTGGGA............................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................ACCGTCCCACTGTAATAGCCA.......................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
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.................................................ACTAAAACAAACCGTCCCACTGTAATA.............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AATATGCAGCAAAATACAAGATTACA............. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CCTGCTTGCCCATTTTCCAGAGAAACCT.......................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................ATGTGGTCAACACCTGGACGCTGTAGAC.......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................GCTTGCCCATTTTCCAGAGAAACCTGAG....................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CGTTGTTTCAAAGATGCAGGGGTAACA.......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................................................GCTTGCCCATTTTCCA................................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -