| Gene: Bcam | ID: uc009fnf.1_intron_6_0_chr7_20345762_r.5p | SPECIES: mm9 |
|
|
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(7) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(2) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(22) TESTES |
| TGCCGACGAGGAAGTGCAACTTGTCAAGAAGCTAAAGCTGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGATAGGGTGGGGTCAGGTTCCATCCGCTCCTCTCCCTCTGGGTCCCAACCCTGCCCCCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCATACCCAGAGCACACCCTTGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTTTTCTAGACAGAGATTAGGTCTAGAACCATCTG ........................................................((((((((.((((((.((..((((.((((...((......))...)))).))))..((((....))))..))))))))....(((((............))).))....))))))))............................................................................. ..................................................51...........................................................................................................................176........................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGG.................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 33.00 | 33.00 | 23.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGA.................................................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 33.00 | 33.00 | 16.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 7.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGA............................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 16.00 | 16.00 | 2.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGG................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 13.00 | 13.00 | 6.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGG.................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 12.00 | 12.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAG................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 12.00 | 12.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGG................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 12.00 | 12.00 | 5.00 | - | 4.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGG................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 10.00 | 10.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGA...................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 10.00 | 10.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAG................................................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 9.00 | 9.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGG................................................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 9.00 | 9.00 | 4.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGG................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 9.00 | 9.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGAT.............................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGA.................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 8.00 | 8.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................TAAAGCTGCACGTGGCCTGTGAGAGC................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | 2.00 | - | 5.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAat................................................................................................................................................................................ | 25 | at | 7.00 | 33.00 | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGa................................................................................................................................................................................ | 25 | a | 7.00 | 12.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................CTGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGG....................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 6.00 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................GCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAG........................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CAAGAAGCTAAAGCTGCACGTGGCCTGT...................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGA............................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................TGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGT................................. | 24 | 1 | 4.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGGA.................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................TGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTT................................ | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................TAGAACGTGCTCCCCAGTGTTTTCTAGA......................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................TGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTTT............................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAG........................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGG........................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGTGC........................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GTGCAACTTGTCAAGAAGCTAAAGCTGC................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGt............................................................................................................................................................................... | 26 | t | 2.00 | 12.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................TCTCTCCTCTGCTTAGAACGTGCTCC........................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CAAGAAGCTAAAGCTGCACGTGGCCTG....................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGa.................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGt................................................................................................................................................................................ | 25 | t | 2.00 | 12.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTTTT.............................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................CAGAGTGCCATACCCAGAGC............................................................................. | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTG............................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGA.................................................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGa.......................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................AGAGCTTTGGGAGGAGctt.................................................................................................................................................................................. | 19 | ctt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................CCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAG.................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................CCAGTGTTTTCTAGACAGAGATTAGGTCT........... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAG..................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGAT.............................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGa................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 33.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CGAGGAAGTGCAACTTGTCAAGAAGC.......................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| .........................AAGAAGCTAAAGCTGCACGTGGCCTGTGA.................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCC........................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGTGCTC......................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................TTAGAACGTGCTCCCCAGTGTTTT.............................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGT................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCATA..................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................TGCTTAGAACGTGCTCCCCAGagt................................. | 24 | agt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGCACGTGGCCTGTGAGA.................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................ACTTGTCAAGAAGCagc....................................................................................................................................................................................................................... | 17 | agc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGta.............................................................................................................................................................................. | 25 | ta | 1.00 | 9.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTT................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................TAGAACGTGCTCCCCAGT................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................GTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGG.................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CAAGAAGCTAAAGCTGCACGTGGCCTGTGA.................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAG..................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................ACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGG........................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................TGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAtat............................................................................................................................................................................... | 26 | tat | 1.00 | 33.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGG....................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TGGCCTGTGAGAGCTTTGGGA......................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TCTCCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCC...................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TTGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGT............................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................TAAAGCTGCACGTGGCCTGTGAGAGa................................................................................................................................................................................................ | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................TAGAACGTGCTCCCCAGTGTTTTCTAGt......................... | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................AGAAGCTAAAGCTGCACGTGGCCTGTGA.................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................TAAAGCTGCACGTGGCCTGTGAG................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................CTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTTT............................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CAAGAAGCTAAAGCTGgc................................................................................................................................................................................................................ | 18 | gc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................AGCTAAAGCTGCACGTGGCCTGTGAGA.................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGa................................................................................................................................................................................ | 23 | a | 1.00 | 9.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................TGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGTG............................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................ACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGA...................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TGCCGACGAGGAAGTGCAACTTGTCAAGAAGCTAAAGCTGCACGTGGCCTGTGAGAGCTTTGGGAGGAGGGAGGATAGGGTGGGGTCAGGTTCCATCCGCTCCTCTCCCTCTGGGTCCCAACCCTGCCCCCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCATACCCAGAGCACACCCTTGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTTTTCTAGACAGAGATTAGGTCTAGAACCATCTG ........................................................((((((((.((((((.((..((((.((((...((......))...)))).))))..((((....))))..))))))))....(((((............))).))....))))))))............................................................................. ..................................................51...........................................................................................................................176........................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................................................CCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 26 | 1 | 101.00 | 101.00 | 79.00 | 2.00 | 6.00 | 3.00 | - | 8.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................................................................................CTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 25 | 1 | 15.00 | 15.00 | - | 1.00 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................CCCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 27 | 1 | 14.00 | 14.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 5.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................CCCCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 28 | 1 | 14.00 | 14.00 | 8.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TCCAACTGCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 24 | 1 | 10.00 | 10.00 | 8.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TCCGCTCCTCTCCCTCTGGGTCCCA.................................................................................................................................. | 25 | 1 | 10.00 | 10.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................CCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGA............................................................................................. | 28 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 1.00 | 2.00 | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................CTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGTT................................ | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCA....................................................................................... | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................TCTCCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCA..................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................TGCCCCCTCCAACTGCCTCACAGATTT................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................CCCAGTGTTTTCTAGACAGAGATTA................ | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................CACCCTTGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAA................................................ | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCATA..................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................GAGCACACCCTTGGCTCTCTCCTCTGCTTA................................................... | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................CTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAG.............................................................................................. | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCACAGATTTTCCAGAGTGCCATACCCA................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................CGCTCCTCTCCCTCTGGGTCCCA.................................................................................................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................CACACCCTTGGCTCTCTCCTCTGCTTA................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................ACTGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCA....................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGAG............................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................GCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCATACC................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CACAGATTTTCCAGAGTGCCATACCCA................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................CCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAG.............................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................GCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCATA..................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....ACGAGGAAGTGCAACTTGTCAAGAAGCTA........................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................CACACCCTTGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAt................................................. | 30 | t | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................GCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGTGCTC......................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................CTGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCA....................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................GCTCCCCAGTGTTTTCTAGACAGAGATTA................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ..............................................................................................................................CCCCCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................CTGCCTCACAGATTTTCCAGAgtgg............................................................................................. | 25 | gtgg | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................GCCCCCTCCAACTGCCTCACAGATT.................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................CTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAtaga..................................... | 27 | taga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................CCAACTGCCTCACAGATTTTCCAggg............................................................................................... | 26 | ggg | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..CCGACGAGGAAGTGCAACTTGTCAAGAAG........................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................CCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCAGTGT................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................CTTGGCTCTCTCCTCTGCTTAGAACGTG............................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...GACGAGGAAGTGCAACTTGTCAAGAAGa........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................CCAACTGCCTCACAGATTTTCCAgg............................................................................................... | 25 | gg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................CTCCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCA..................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................................................................................AACTGCCTCACAGATTTTCCAtgag............................................................................................... | 25 | tgag | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................CCCTCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAt............................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................GGTCAGGTTCCATCCGCTCCTCT................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................CTAAAGCTGCACGTGGCCTGTGAGAGCT............................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........TGCAACTTGTCAAGAatt............................................................................................................................................................................................................................. | 18 | att | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................CTCTCCTCTGCTTAGAAC............................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................CCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGAG............................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................CCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGA............................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................AGTGTTTTCTAGACAGAGATTAGGTCTA.......... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................GCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................AACTGCCTCACAGATTTTCCAGAtggg............................................................................................. | 27 | tggg | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................CCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGAGTGCCA....................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GAACGTGCTCCCCAGTGTTTTCTAGACAG...................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................TCCAACTGCCTCACAGATTTTCCAGA............................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................CGTGCTCCCCAGTGTTTTCTAGACAGAGA................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................CCCCTCCAACTGCCTCACAGATTT................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................CCAGAGTGCCATACCCAGAGCACACCC....................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................CAACTGCCTCACAGATTTTCCAGAG............................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................CCAACTGCCTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................TCCTCTGCTTAGAACGTGCTCCCCA..................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TCCCCAGTGTTTTCTA........................... | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTCACAGATTTTCCA............................................................................................... | 15 | 12 | 0.08 | 0.08 | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |