(6)
OTHER.mut
(2)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(25)
TESTES

Sense strand
GTGGGCCCTCCGGAGGAGGCAGAGGTGGCAGTGGAGGCTTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGGTGTCCAATGGAACCAGCTAAGTGCATGGCCAGCCTTGGGGGCTCAGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGACGACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTGG
...............................................................................(((((.....)).))).((((.((((((((...(((......)))......)))))))).)))).............................................
...............................................................................80...............................................................145.........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................GCTTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCT............................................................................................................................ 28 1 7.00 7.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................................................TAAGTGCATGGCCAGCCTTGGGGGCTC............................................................................. 27 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCTTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTC............................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGG.......................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGTCCGTTCTGTCCCCAGTGTTGAGGC......................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGACGACCT................................ 29 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................GTGTTGAGGCTGAactc.................................. 17 actc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGTCCCCAGTGTTGAGGCTGACGACCTC............................... 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AGGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTG. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GCTAAGTGCATGGCCAGCCTTGGGGGCTC............................................................................. 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TCCAATGGAACCAGCTAAGTGCATGGCC........................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGACGACCTC............................... 30 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGATGGTCTGGGTGTCCAATGGAACC........................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAGTGTT.............................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGG......................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AGAGGTGGCAGTGGAGGCTTTGGAGA.............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................TGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTG........................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................................................TTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAGTGT............................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCTTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGT.............................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GAACCAGCTAAGTGCATGGCCAGCCTTa.................................................................................... 28 a 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CAGAGGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTGG 30 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGATGGTCTGGGTGTCCAATGGAAC............................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................TGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGGa........................................................................................................................ 28 a 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCTTGGGGGCTCAGagg........................................................................ 18 agg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................................................................GCTAAGTGCATGGCCAGCCTTGGGGGCT.............................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGGAGGCTTTGGAGATGAGGTGAGT.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................CTGGGTGTCCAATGGAACCAGCTAAGTGC................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..........................................GAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGGTGT...................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTG. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAG.................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTGG 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GATGAGGTGAGTGATGGTCTGGGTG....................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AGGCAATCTCTGGATCTGGAACTT... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................AATCTCTGGATCTGGAACTTTGtg 24 tg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGATGGTCTGGGTGTCCAATGG............................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TCCAATGGAACCAGCTAAGTGCATGGCCA.......................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGTGATGGTCTGGGTGTCC.................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGATGGTCTGGGTGTCCAATGGAAC............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................AGAGGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTG. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGACGACCTCCa............................. 32 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAGT................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CGTTCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGA...................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TAAGTGCATGGCCAGCCTTGGGGGCTCA............................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CTCCGGAGGAGGCAGAGGTGGCAGTGGAGGC...................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................ATGGTCTGGGTGTCCAATGGAACC........................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ATGAGGTGAGTGATGGTCTGGGTGTa..................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GCTTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGG.......................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGGT........................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................AGGCTGACGACCTCCCAGA.......................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGG.......................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCTTGGGGGCTCAGatg........................................................................ 18 atg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..........................................................................TGGAACCAGCTAAGTGCATGGCC........................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCT............................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TCTGGGTGTCCAATGGAACCAGCTAAGTGC................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGa......................................................................................................................... 28 a 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CGTTCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGACt.................................... 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTGATGGTCTGGGTGTCCAATG................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................GTCCAATGGAACCAGCTAAGTGCATGGCC........................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TGATGGTCTGGGTGTCCAATGGAACCAG......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGGATCTGGAACTTTGG 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TGGAACCAGCTAAGTGCATGGCCAGCCT...................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGG......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................ACCAGCTAAGTGCATGGCCAGC........................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GGCAATCTCTGGATCTGGAAC..... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAGTGa............................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TTCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGAC..................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CTTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTC............................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGGTCTGGGTGTCCAATGGAACCAGC........................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGGAGGCTTTGGAGATGAGGTGAGTGA.................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AGGCAATCTCTGGATC........... 16 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGGCTTTGGAGATGAG.......................................................................................................................................... 16 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - -

Antisense strand
GTGGGCCCTCCGGAGGAGGCAGAGGTGGCAGTGGAGGCTTTGGAGATGAGGTGAGTGATGGTCTGGGTGTCCAATGGAACCAGCTAAGTGCATGGCCAGCCTTGGGGGCTCAGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAGTGTTGAGGCTGACGACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTGG
...............................................................................(((((.....)).))).((((.((((((((...(((......)))......)))))))).)))).............................................
...............................................................................80...............................................................145.........................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...........................................................................................................GCTCAGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCC...................................................... 27 1 25.00 25.00 - - 18.00 - - 5.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCA................................................... 26 1 22.00 22.00 - 3.00 7.00 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GCTGTCCGTTCTGTCCCCAGTGTTGA............................................ 26 1 16.00 16.00 - 2.00 - - 9.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................................................................................................GCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCA................................................... 24 1 15.00 15.00 - 2.00 - 3.00 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TCAGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCA................................................... 28 1 11.00 11.00 3.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCA................................................... 25 1 9.00 9.00 - - - 1.00 2.00 1.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................CAGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCA................................................... 27 1 9.00 9.00 - 4.00 - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCAGTG................................................ 27 1 8.00 8.00 - 1.00 - 1.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GCTCAGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTC....................................................... 26 1 8.00 8.00 - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TCCCCAGTGTTGAGGCTGACGACCTCCCA............................ 29 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CCAGTGTTGAGGCTGACGACCTCCCA............................ 26 1 7.00 7.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................ACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATCTGGA....... 29 1 6.00 6.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................GGGGCTCAGGCTTAGCTGTCCGTTCTG......................................................... 27 1 6.00 6.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GAGGCAATCTCTGGATCTGGAACTTTGa. 28 a 5.00 0.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GCTCAGGCTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCC.................................................... 29 1 5.00 5.00 - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CTTAGCTGTCCGTTCTGTCCCCA................................................... 23 1 4.00 4.00 - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATCTGGA....... 30 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCTGACGACCTCCCAGAGGCAATCTCT................ 27 1 3.00 3.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................ACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATCTG......... 27 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATC........... 26 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................GACGACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATC........... 29 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATCTGGAaga....... 31 aga 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...........................................................................................................................................................TCCCAGAGGCAATCTCTGGATCTGGA....... 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................GACCTCCCAGAGGCAATCTCTGGATCT.......... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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