(8)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(30)
TESTES

Sense strand
GCGCGGTGTGAGTGCCATCCGTGAGCGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAGGTCGCCAGCGCACTGCCAACCTAGGCGCTGGGGCCGCCCAGCCTCTGCGCGATCGCGCCCAGGCTTTTGGTGACCGCATCCGAGGGCGGCTGGAGGAAGTGGGCAACCAGGCCCGTGACCGCCTAGAGGAGGTGCGTGAGCACATGGAGGAGGTGCGCTCCAAGATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGCCTGCAGGCGGAGATCTTCCAGGCCCGCCTCAAGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACAGGCCTCTGTGGCTACCAACCCCATCATCACCCCAGTGGCCCAGGAGAATCAATGAGTATCCTTCTCCTGTCCTGCAACAACATCCATATCCAGCCAGGTGGCCCTGTCTCAAGCACCTCTCTGGCCCTCTGGTGGCCCTTGCTTAAT
.......................................................................................................................................................................................................................(((..........)))........((((((.(((((...(((((((.((((.......)))).(((....))).....)))))))......))))).))))))........................................................................................................................................................................
..................................................................................................................................................................................................................211.............................................................................................................323.................................................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.........GAGTGCCATCCGTGAGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 12.00 12.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AAGATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGCC.................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 12.00 12.00 11.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CGGCTGGAGGAAGTGGGCAACCAGGCCCGTGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 1 11.00 11.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAG........................................................................................................................................................... 20 1 11.00 11.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGCAAACCTGATGGAGA.......................................................................................................................................................... 20 1 10.00 10.00 - 4.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCTGGTGGAGCAAGGTCGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 10.00 10.00 8.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCAT................................................................................................................................................................................... 28 1 10.00 10.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CCTGGGGCCTCTGGTGGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 9.00 9.00 7.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAGGTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 9.00 9.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTCCTGCAACAACATC............................................................... 18 1 8.00 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................AGATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGC..................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 8.00 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGCAACAACATCCATATCCAGCC.................................................... 26 1 8.00 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATATCCAGCCAGGTG............................................... 17 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGCCCAGGAGAATCAATGAG........................................................................................... 22 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGCCT................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 - - - - - - - 3.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCATCGCC............................................................................................................................................................................... 32 1 7.00 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCGGCTGGAGGAAGTGGGCAACCAGGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGACAT....................................................................................................................................................................................... 35 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CGGCTGGAGGAAGTGGGCAACCAGGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGG............................................................................................................................................................. 18 1 6.00 6.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACAGGCC............................................................................................................................................... 30 1 6.00 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGC..................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTCTCAAGCACCTCTCTGGCCCTCTGG............... 29 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAGAAGAT...................................................................................................................................................... 23 1 4.00 4.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCACCCCAGTGGCCCAGGAG..................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CGGCTGGAGGAAGTGGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 2 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACA................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAGAAG........................................................................................................................................................ 23 1 4.00 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGTGAGTGCCATCCGTGAGCG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGA.......................................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATA..................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GCGCTGGGGCCGCCCAGCCTCTGCGCGATCGCGCCCAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 38 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................AGGTGCGCTCCAAGATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GGCGGCTGGAGGAAGTGGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCAT................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGGAGAAGATACAGGCCTCTGTGGCT...................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAAACCTGATGGAGAAGA....................................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................CGTGAGCACATGGAGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GCGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGCATCGCCAGTGGGCAAACCTGATG.............................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGA....................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGCATCGCCAGTGGGCAAACCTG................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CCAAGATGGAGGAACAGACCCAGC............................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AGCAAGGTCGCCAGCGCACT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGGAGAAGATACAGGCCTCTGTG......................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTTGGTGACCGCATCCGAGGGCGGCTGGAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGCCTG.................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGG.............................................................................................................................................................................................. 24 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GTGAGCGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGGAGGAAGTGGGCAACCAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCTCTGGTGGAGCAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 3 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGGCTGGTTCGAG........................................................................................................................................................................................................ 16 2 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CGCGATCGCGCCCAGGCT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCGCCTGGGGCCTCTGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACAG.................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GGTGACCGCATCCGAGGGCGGCTGGA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGCAAACCTGATGGAGAAGA....................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACAG.................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGGCAAACCTGATGGAGA.......................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAGGTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAAGACATGCATCGCCAGTG........................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................AGGCGGAGATCTTCCAGGC.............................................................................................................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAGA.......................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAGA.......................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCATCACCCCAGTGGCCCAGG....................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTGGCCCTCTGGTGG............ 18 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGGCA....................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGA............................................................................................................................................................ 19 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCCAATAGTGGAAGACAT....................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATCCATATCCAGCCAGGTGGCCCTGTC....................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CAAGATGGAGGAACAGACCCAGC............................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CCAAGATGGAGGAACAGACCCAGCA............................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGA.......................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAG........................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGTATCCTTCTCCTGTCC........................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CTGGAGGAAGTGGGCAAC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACt................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGGCAAACCTGATGGAGAA......................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGCGCCTGGGGCCTCTGGTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCCAATAGTGGAAGACATGCATCGC................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAGAA......................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGCCCAGGAGAATCAA............................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATACAGGCCTCTGTGGC....................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCCTCAAGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGA.......................................................................................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGCAAACCTGATGGAGAAGATACAG.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAATAGTGGAAGACATGCATCGCCAG............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCGGAGATCTTCCAGGC.............................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACA................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GTGGAGCAAGGTCGCCAGCGta........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 ta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CGTGACCGCCTAGAGGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGCCAGGTGGCCCTGTCTCAA................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGCCTGCA................................................................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................CAAGGTCGCCAGCGCACTGCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGGAGAAGATACAGGCCTCTGTGGCTA..................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCA.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGA....................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGGt........................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGTCCTGCAACAACATCCATATtcag...................................................... 29 tcag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCATC.................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................CTCCAAGATGGAGGAACAGA................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCTGATGGAGAAGATACA................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGCC.................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGCCAATAGTGGAAGACATGCATCG................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGt......................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACAGG................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGC..................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACATGCATCGCCAGTGGGCAAACCTGAT............................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GCATCCGAGGGCGGCTGGAGGAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATA..................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTCAAGCACCTCTCTGGCC..................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTCTGGCCCTCTGGTGG............ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGGCA....................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCCAGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACA................................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCATCG................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACATGCATCGCCAGTGGGCAAACCTG................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................CGCCCAGGCTTTTGGTGACCGCATCCGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGCGCGATCGCGCCCAGGCTTTTGGTGt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGCATCGCCAGTGGGCAAACt................................................................................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................CTGCAGGCGGAGATC...................................................................................................................................................................................................................................... 15 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................ATCGCGCCCAGGCTTTTGGTGAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGA............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCGGCTGGAGGAAGTGGGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCTCCTGTCCTGCAACAACAT................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACG...................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CAGGCTTTTGGTGACCGCATCCGAGGGCGGCT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCATC.................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCGAGCCAATAGTGGAA............................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGCAAACCTGATGGAGAAGta...................................................................................................................................................... 24 ta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAG........................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGGCAAACCTGATGGAG........................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGCAAACCTGATGGAGAAGAT...................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGGGCTGGTTCGAGC....................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATAGTGGAAGACATGC..................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATAGTGGAAGACATGCATCGCCAG............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGATACAGGCCTCTGTGGC....................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................ACCCAGCAAATACGCCTGC................................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............TGCCATCCGTGAGCGCCTGGGGCCTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCGGCTGGAGGAAGTGGGCAACC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCCAATAGTGGAAGACATG...................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGGCAt...................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGGC........................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CCAAGATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACG...................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CGGCTGGAGGAAGTGGGCAACCAGGg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 g 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCATCACCCCAGTGGCCCAGGAGAATCA................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCAGTGGGCAAACCTGATGGAGAAG........................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GAGGAGGTGCGCTCCAAGATGGAGGAACAGACC................................................................................................................................................................................................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGGGGCCTCTGGTGGAGCAAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GAGTGCCATCCGTGAGag........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 ag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATGCATCGCCAGTGGGCAAACCTGAT............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGCCATCCGTGAGCGCCTGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GCCCAGGCTTTTGGTGACCGCATCCGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCGCCTGGGGCCTCTGGTGtt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGGCTGGTTCGAGC....................................................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGATGGAGAAGATACAGGCCTCTGTGG........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTCTCTGGCCCTCTGG............... 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCGAGCCAATAGTGGAAGACA........................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCAAGATGGAGGAACAGACCCAcc............................................................................................................................................................................................................................................................. 25 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................................CCGCATCCGAGGGCGGCTGGAGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGA............................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGAGCCAATAGTGGAAGA.......................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GTGACCGCCTAGAGGAGGTGCGTGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGAGTATCCTTCTCCTGTCCTGCAAC..................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGGAGGAGGTGCGCTCCAAGATGGAGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATA..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................CAAGATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGC..................................................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGA............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AGGGCGGCTGGAGGAAGTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGCGCCTGGGGCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 15 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CGGCTGGAGGAAGTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 8 0.38 0.38 0.12 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GCGCGGTGTGAGTGCCATCCGTGAGCGCCTGGGGCCTCTGGTGGAGCAAGGTCGCCAGCGCACTGCCAACCTAGGCGCTGGGGCCGCCCAGCCTCTGCGCGATCGCGCCCAGGCTTTTGGTGACCGCATCCGAGGGCGGCTGGAGGAAGTGGGCAACCAGGCCCGTGACCGCCTAGAGGAGGTGCGTGAGCACATGGAGGAGGTGCGCTCCAAGATGGAGGAACAGACCCAGCAAATACGCCTGCAGGCGGAGATCTTCCAGGCCCGCCTCAAGGGCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGACATGCATCGCCAGTGGGCAAACCTGATGGAGAAGATACAGGCCTCTGTGGCTACCAACCCCATCATCACCCCAGTGGCCCAGGAGAATCAATGAGTATCCTTCTCCTGTCCTGCAACAACATCCATATCCAGCCAGGTGGCCCTGTCTCAAGCACCTCTCTGGCCCTCTGGTGGCCCTTGCTTAAT
.......................................................................................................................................................................................................................(((..........)))........((((((.(((((...(((((((.((((.......)))).(((....))).....)))))))......))))).))))))........................................................................................................................................................................
..................................................................................................................................................................................................................211.............................................................................................................323.................................................................................................................................................................
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCTCCTGTCCTGCAACAACATCCA............................................................. 27 1 24.00 24.00 - 18.00 - 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCTCCTGTCCTGCAACAACATCCA............................................................. 26 1 15.00 15.00 3.00 7.00 - 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGTCCTGCAACAACATCCATA........................................................... 25 1 10.00 10.00 - - - - 9.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGACA........................................................................................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - - 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTCTCCTGTCCTGCAACAACATCCA............................................................. 28 1 5.00 5.00 - 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTGTCCTGCAACAACATCCATA........................................................... 26 1 5.00 5.00 - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................GGAGATCTTCCAGGCCCGCCTCAAGGG.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTGTCCTGCAACAACATCCA............................................................. 24 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCTCCTGTCCTGCAACAACATCCATA........................................................... 29 1 4.00 4.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GCTCCAAGATGGAGGAACAGACCCAGCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAACAACATCCATATCCAGCCA................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTGCAACAACATCCATATCCAG...................................................... 24 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................ACAGACCCAGCAAATACGCCTGCA................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGTGGCCCAGGAGAATCAATGAGTA......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CCAAGATGGAGGAACAGACCCAGCAAA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCCTGTCCTGCAACAACATCCA............................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCCTCTGTGGCTACCAACCCCATCA......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GATCGCGCCCAGGCTTTTGGTGACCGCA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGTCCTGCAACAACATCCATATCCA....................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCTGTCCTGCAACAACATCCAT............................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGGTTCGAGCCAATAGTGGAAGAC......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTATCCTTCTCCTGTCCTGCAACAACA................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GCGCCCAGGCTTTTGGTGACCGCATCCGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCCCAGTGGCCCAGGAGAATCAA............................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCATCGCCAGTGGGCggc........................................................................................................................................................................ 18 ggc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGCCAGTGGGCAAACCTGATGGAGAA......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCCTGCAACAACATCCATATCCA....................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -