(1)
OTHER.ip
(9)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(9)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(45)
TESTES

Sense strand
GTTCTGTCTCTAGCCCATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGGTAAGTAGTTGTGCCTTGGAAATTGGGCTGGGTGAGTACCCCGTCTCTGTCTTTTCTGCCAACTCTTTTGTCTTCTGAGCAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGCATGAAGCGGTAA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTT........................................................................................................................................... 26 1 30.00 30.00 8.00 3.00 6.00 4.00 - 4.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTG.......................................................................................................................................... 27 1 17.00 17.00 4.00 3.00 2.00 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................GATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGC....................... 28 1 9.00 9.00 5.00 - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTC...................................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCG........................ 28 1 8.00 8.00 - 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGC....................... 29 1 7.00 7.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCT............................................................................................................................................. 27 1 6.00 6.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGG......................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGC.......................... 26 1 5.00 5.00 - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGt......................................................................................................................................... 28 t 5.00 17.00 1.00 - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGTACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTC...................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGaa........................................................................................................................................ 29 aa 4.00 17.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCG........................ 27 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATC................ 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTT............................................................................................................................................ 25 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCG........................ 29 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGCCAACTCTTTTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCA............... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TTCTGCCAACTCTTTTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTt.......................................................................................................................................... 27 t 3.00 30.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGTACAAGAGGGATATGGCTTTGGGT....................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 15 14 2.43 2.43 - - - - - - - - - 0.57 - - - - - - - - - - - - - 0.93 0.14 - - - - - - - - 0.29 0.14 - - - - - - - - 0.14 0.14 0.07
...................GAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGG......................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAG.................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGt....................... 29 t 2.00 8.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCA..................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCC......................... 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGC............ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCTTTTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGGt........................................................................................................................................ 29 t 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCATGGAAGTACAAGAGGGATATGGC.............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTAGTTGTGCCTTGGAAATTGG.......................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCC......................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGCATt......... 31 t 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TAGTTGTGCCTTGGAAATTGGGCTGG..................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGCAT.......... 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGG............. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGC............ 30 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCATG.................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TTTTCTGCCAACTCTTTTGTCTTCTGAG..................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................AGAGCCGCATGTATCAGGCATGAAGCGGTc. 30 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGCAT.......... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATC................ 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CAACTCTTTTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGat.................................................................................................................................. 26 at 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGCAGAGCCGCATGTATCAGGCAT.......... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGt.......................... 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................ATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTG.......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCATGTATCAGGCATGAAGCGGTcccg 27 cccg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CATGTATCAGGCATGAAGCGGTcc 24 cc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTAT................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTC...................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCTGCCAACTCTTTTGTCTTCTG....................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................ATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCT............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAG.................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGC....................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GCCAACTCTTTTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGatga................................................................................................................................ 27 atga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGCA........... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AGTGCAGAGCCGCATGTATCAGG............. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CAAGAGGGATATGGCTTT........................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGG......................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCA..................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGa................................................................................................................................... 28 a 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTAaccg.............. 28 accg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCAT..................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAG.............. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTgggt........................................................................................................................................ 29 gggt 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GAGCCGCATGTATCAGGCATGAAGCG.... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTgt........................................................................................................................................... 26 gt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGC............ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GATGATCCCTATTCAAGTGCAGcgc.......................... 25 cgc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCA...................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCAT..................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGCAT.......... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAG.............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGTACAAGAGGGATATGG............................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GATATGGCTTTGGGTCAG.................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGGGgca..................................................................................................................................... 26 gca 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGatg................................................................................................................................. 28 atg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGgc......................... 27 gc 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCTGCCAACTCTTTTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GTACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCA..................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GGGATATGGCTTTGGGT....................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAG........................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGa......................................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGG......................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGGGT....................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATC................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGc................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGGG........................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCAT..................... 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AAGAGGGATATGGCTTTGGGTC...................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCATGTATCAGGCATGAAGCGGTcc 25 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCATGTATCAGGCATGAAGCGc... 22 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CCTATTCAAGTGCAGAGCCGCATGT................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGC.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGg............ 28 g 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAG........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................ATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTT........................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGa......................................................................................................................................... 28 a 1.00 17.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTAa................. 25 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAG.............. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGt......................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGat.................................................................................................................................. 29 at 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................AGAGGGATATGGCTTTGGG........................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................CAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGC............ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTT........................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGATGATCCCTATTCAAGTGCAGA............................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTC...................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAAGAGGGATATGGCTTTGGGT....................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCt..................................................................................................................................... 25 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................TGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTc........................................................................................................................................... 26 c 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTT............................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AGAGGGATATGGCTTTGGGTC...................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTAGTTGTGCCTTGGAAATT............................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCATGTATCAGGCATGAAGCGGTccc 26 ccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTG.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGCCAACTCTTTTGTCTTCTGAGCcg.................................................. 26 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TTTGTCTTCTGAGCAG.................................................. 16 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGTCTTCTGAGCAGA................................................. 15 17 0.18 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - 0.06

Antisense strand
GTTCTGTCTCTAGCCCATGGAAGTACAAGAGGGATATGGCTTTGGGTCAGGTAAGTAGTTGTGCCTTGGAAATTGGGCTGGGTGAGTACCCCGTCTCTGTCTTTTCTGCCAACTCTTTTGTCTTCTGAGCAGATGATCCCTATTCAAGTGCAGAGCCGCATGTATCAGGCATGAAGCGGTAA


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
..................................................................................................TTTCTGCCAACTCTgggt.................................................................. 18 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGCAGAGCCGCATGTAT................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -