(1)
OTHER.ip
(6)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(39)
TESTES

Sense strand
CTGTTGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCATGTTATGTGTATGAATAAGGCATTAGCAAATACCTAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGGGTGCAGCACTTTGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAACATGCATGTACCATTAGTGTTAGTAGTGTCCCTGCTTCTTGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAGGAAGAGGTGTCAAC
.......................................................(((((.((...((.((((((.......))))))..)).)))))))((((....))))..........................................................................................................................................
..................................................51.............................................................114......................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGC................. 29 1 75.00 75.00 10.00 29.00 17.00 2.00 4.00 8.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGGG............................................................................................................................................ 27 1 46.00 46.00 1.00 - - 10.00 - - 6.00 - 4.00 1.00 8.00 5.00 - 5.00 - - 2.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCA..................... 27 1 34.00 34.00 5.00 9.00 12.00 - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCAC.................... 28 1 14.00 14.00 2.00 3.00 2.00 - 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCA..................... 28 1 14.00 14.00 2.00 4.00 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................TGTTATGTGTATGAATAAGGCATTAGC.............................................................................................................................................................................. 27 1 14.00 14.00 - - 1.00 4.00 1.00 - 3.00 1.00 - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTGATTATTTCGGATACTAATTTG............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 13.00 13.00 5.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGC...................... 27 1 13.00 13.00 - 6.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACA....................................... 27 1 10.00 10.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - -
.TGTTGTTGATTATTTCGGATACTAATT.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 8.00 8.00 3.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
....................TACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCT........................................................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGC...................... 26 1 8.00 8.00 - 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGCA................ 30 1 8.00 8.00 4.00 - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACAA...................................... 28 1 7.00 7.00 4.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TCATGTTATGTGTATGAATAAGGCATT................................................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 2.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATACTGCATTTCAGATTCTGGAAC........................................ 26 1 7.00 7.00 - - 1.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................................................................................................AACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGCA................ 27 1 6.00 6.00 2.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACC................... 27 1 6.00 6.00 - 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCAC.................... 29 1 5.00 5.00 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................TTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCATGTT..................................................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - - - - 2.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCG.................. 28 1 5.00 5.00 - 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATTCTCAAGTAAAACATGCATGTACCAT........................................................................................... 29 1 4.00 4.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................TACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCC............................................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTGATACTGCATTTCAGATTCTGGAAC........................................ 27 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAACA....................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTATTTCGGATACTAATTTGTGTAGA...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGG............................................................................................................................................. 26 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CCTAGTGGACTGTCTATATCACTCAAG.............................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAACATGC.................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAACAT...................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGT........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGGGTGC......................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGCt................ 30 t 2.00 75.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCATGT...................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGATTCTGGAACAAGAAACCTGAGG........................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCAC.................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCA..................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........................................................................................................................................................................................................TTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAG....................... 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGTTATGTGTATGAATAAGGCATTAGCAAA........................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................TAAGGCATTAGCAAATACCTAGTGGAC............................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCAtt................... 29 tt 2.00 34.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGGACTGTCTATATCACTCAAGGGTGCA........................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGGGT........................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCAt.................... 28 t 2.00 34.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TCATGTTATGTGTATGAATAAGGCAT.................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TATCACTCAAGGGTGCAGCACTTTGGT.............................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAAC........................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTAGTGTTAGTAGTGTCCCTGCTTCT.................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGATTATTTCGGATACTAATTTGTGTA........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGGGTG.......................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACAAG..................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACAA...................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TATTTCGGATACTAATTTGTGTAGAGTT................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGTGT......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGt................. 29 t 2.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGATTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGA......................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACC................... 29 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAA......................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTTGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGT........................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTGATTATTTCGGATACTAATTTGTGT......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGTG.......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCTTGATACTGCATTTCAGATTCTGGA.......................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GATTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCA..................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCATG....................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACAAGt.................................... 30 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGTGTA........................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCt............................................................................................................................................................................................................ 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGTACCATTAGTGTTAGTAGTGTCCCT........................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGGACTGTCTATATCACTCAAGGGagc......................................................................................................................................... 27 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......TGATTATTTCGGATACTAATTTGTGT......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTGTTGATTATTTCGGATACTAATTTG............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TATTTCGGATACTAATTTGTGTAGAGct................................................................................................................................................................................................................... 28 ct 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GATACTGCATTTCAGATTCTGGAACA....................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAA.......................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGTTGTTGATTATTTCGGATACTAATTT............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CACTTTGGTGTCTGTTATTCTCAAGT............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGTGTATGAATAAGGCATTAGCAAAT.......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAG.............. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................................................................TACCTAGTGGACTGTCTATATCACTC................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCc..................... 27 c 1.00 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTTCGGATACTAATTTGTGTAGAGTT................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCTGTTATTCTCAAGTAAAACATGCATG................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TAGTGTTAGTAGTGTCCCTGCTTCTTG................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATACTGCATTTCAGATTCTGGAA......................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCATGTaa.................................................................................................................................................................................................... 31 aa 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCtt.................... 28 tt 1.00 8.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAGGAA........... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGTTATGTGTATGAATAAGGC.................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGCATTTCAGATTCTGGAACAAGAA................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATTCTCAAGTAAAACATGCATGTACCATT.......................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCA......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GTTGATTATTTCGGATACT.................................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TATTTCGGATACTAATTTGTGTAGAGT.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGTGTATGAATAAGGCATTAGCAAATA......................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................ACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGCAA............... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TTTGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAAC........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACAAGA.................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGCACTTTGGTGTCTGTTATTCTCAAG.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GATTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAA........................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TATCACTCAAGGGTGCAGCACTTTGG............................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTC.......................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAA......................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAaca..................... 27 aca 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGTGTAa....................................................................................................................................................................................................................... 31 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGCATTTCAGATTCTGGAACAAGAAA.................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TATGTGTATGAATAAGGCATTAGC.............................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTATTTCGGATACTAATTTGTGTAGAGTT................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGGACTGTCTATATCACTCAAGGGTGCAG....................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAG....................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGC................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GATTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGC...................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................TAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGGGTa.......................................................................................................................................... 29 a 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTC............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................AATAAGGCATTAGCAAATACCTAGTG.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TCATGTTATGTGTATGAATAAGGCATTA................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...............................................................................................................................................................................................................AACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGC................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGC................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGTGGACTGTCTATATCACT.................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGa...................... 26 a 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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....................TACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCA......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTCAGATTCTGGAACAAGAAACCTGA............................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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....................TACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTC.......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
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..........................................................TATGAATAAGGCATTAGCAAATACCTAGTG.................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TATGAATAAGGCATTAGCAAATACCTAGT................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGTG.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCGGATACTAATTTGTGTAGA...................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGTTGTTGATTATTTCGGATACTAATTTGTGTAGAGTTCAGGTCCTCATGTTATGTGTATGAATAAGGCATTAGCAAATACCTAGTGGACTGTCTATATCACTCAAGGGTGCAGCACTTTGGTGTCTGTTATTCTCAAGTAAAACATGCATGTACCATTAGTGTTAGTAGTGTCCCTGCTTCTTGATACTGCATTTCAGATTCTGGAACAAGAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAGGAAGAGGTGTCAAC
.......................................................(((((.((...((.((((((.......))))))..)).)))))))((((....))))..........................................................................................................................................
..................................................51.............................................................114......................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
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SRR034121(GSM466731)
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SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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SRR248527(GSM733815)
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SRR248526(GSM733814)
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cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
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small RNA sequencing; sample 3. (testes)
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mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
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small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
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P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
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Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
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Ovary total. (ovary)
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mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
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small RNA cloning by length. (testes)
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Mili-wt-associated. (testes)
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25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
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small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
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total RNA. (testes)
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P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
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small RNA sequencing; sample 2. (testes)
.......................................................................................CTGTCTATATCACTCAcag................................................................................................................................................ 19 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -