| Gene: Zfp329 | ID: uc009fei.1_intron_0_0_chr7_13391942_r.5p | SPECIES: mm9 | 
![]()  | 
    
    ![]()  | 
  
| 
  (6)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (5)  PIWI.ip  | 
  
  
  (2)  PIWI.mut  | 
  
  
  (31)  TESTES  | 
  
  
| GAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAGGAAGAGGTGTCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAACTGTTTCCCCTTGCTCTTTTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTCCAGTGCAACCTGGGCAATTT ..............................................................................................................(((((((((.........)))))))))....((((((((.((.((.((.......)).))..)).))))).))).................................................................. ..............................................................................................................111..............................................................................192........................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGG.............................................................. | 27 | 1 | 15.00 | 15.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 3.00 | 2.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGA........................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 14.00 | 14.00 | 3.00 | 5.00 | 3.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGAT....................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 13.00 | 13.00 | 4.00 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTATA....................................................................................... | 27 | 1 | 9.00 | 9.00 | 3.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGG.................................................................................. | 27 | 1 | 9.00 | 9.00 | 2.00 | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................TGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTC.................... | 27 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGG............................................................. | 28 | 1 | 7.00 | 7.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATT...................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 6.00 | 6.00 | 2.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTT..................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 6.00 | 6.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................TCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTG............................................................................................................. | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATT............................................... | 25 | 1 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................TCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTA........................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................TAGTAAGTTCACATGGGATTTGTGTG................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAG................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAG............................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAA.................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................TGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACT.......................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGgata....................................................................................... | 27 | gata | 3.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGgat........................................................................................ | 26 | gat | 3.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................TAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGCAGG........................................................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................GGAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGC............................................................................................. | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGG......................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................AAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGG............................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................AGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGT................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................TTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGT............................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTC.................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTA......................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTAT........................................................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................TTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTG............................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACT...................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGG.......................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGAC....................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................TCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAA........................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................CGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTTT....................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................TGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTCCAGT................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................AAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGA.............................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................TAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGA............................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................TGGACACTTTTGACTAAAGGGGGtaa........................................................ | 26 | taa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................GCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGgg................................................................................ | 27 | gg | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................TAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGAAAA................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................GAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGC............................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................GAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGGG........................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................CTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTG............................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................AGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGG.................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................AGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGgg................................................................................ | 28 | gg | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGG............................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................GAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGG............................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................TGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTT........................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................GTGGACACTTTTGACTAAAGGGGGA.......................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................AAGTTCACATGGGATTTGTGTGAGG............................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGA..................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| ...................................................................................................................................................AAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGA.............................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATT............................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................CTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTtt.......................................................................................... | 25 | tt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGAGT.......................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGA............................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................TAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGtaaa................................................................................................................... | 26 | taaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................CAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGt......................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................CACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAAC....................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................TCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAAC....................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................TTTTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGC........................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................AAAATGACGGCTGTATAGAAGGgg................................................................................ | 24 | gg | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................AAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTAT........................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................CAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGCG........................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................AGGAAGAGGTGTCAACTCTGAAATTG.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................AAAGGTGAGATTTGAGTTGGGAGAG.................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................TTTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACT...................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................AGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGG............................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| .................................TCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCA............................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAA.................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................AGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGG.............................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................TCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGT............................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................AAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGg.............................................................................. | 25 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................TTTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAG.................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................GAAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGG............................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTTG.................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................TCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGA......................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................TTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGC........................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................TTCACATGGGATTTGTGTGAGGGTG.......................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................GACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTT........................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................TTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATT............................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGga......................................................................................... | 25 | ga | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................GGTGTCAACTCTGAAATTGTAGTAAGT.................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAt................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................GAAAATGACGGCTGTATAGAAGGgg................................................................................ | 25 | gg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................AGTTTTCTCAGATGAGCAGGGAAA.................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................TTCCAGATGACTTCCAGTGCAACCTGGGC..... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................TCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGCAG......................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTtta....................................................................................... | 27 | tta | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAcagg.............................................................. | 27 | cagg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................AAAATGACGGCTGTATAGAAGGTG................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 
| ..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTT..................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................GTGGACACTTTTGACTAAAGG.............................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................GCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGG.................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................TATAGAAGGTGGACACTTTTGACTAA................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAG...................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGT................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................CTGGTGTAGCGAAAATGACGGCT............................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAcaa.................................................................................... | 27 | caa | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................TCAGATGAGCAGGGAAAACTGG............................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................AGGGGGAAAGGTGAGATTTtgac.......................................... | 23 | tgac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................TCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCACATG........................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................AAATGACGGCTGTATAGAAGGggga.............................................................................. | 25 | ggga | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................GGTGTCAACTCTGAAATTGTAGTAAG................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................CAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTA........................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAG................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................AGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGG............................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTT.............................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................GGTGTCAACTCTGAAA............................................................................................................................................................................................................. | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| GAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAGGAAGAGGTGTCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAACTGTTTCCCCTTGCTCTTTTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTCCAGTGCAACCTGGGCAATTT ..............................................................................................................(((((((((.........)))))))))....((((((((.((.((.((.......)).))..)).))))).))).................................................................. ..............................................................................................................111..............................................................................192........................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | 
|---|