(6)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(5)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
GAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAGGAAGAGGTGTCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAACTGTTTCCCCTTGCTCTTTTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTCCAGTGCAACCTGGGCAATTT
..............................................................................................................(((((((((.........)))))))))....((((((((.((.((.((.......)).))..)).))))).)))..................................................................
..............................................................................................................111..............................................................................192........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGG.............................................................. 27 1 15.00 15.00 3.00 1.00 - - 3.00 2.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGA........................................................................................................................................................................................ 26 1 14.00 14.00 3.00 5.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGAT....................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 4.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTATA....................................................................................... 27 1 9.00 9.00 3.00 2.00 - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGG.................................................................................. 27 1 9.00 9.00 2.00 - 3.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTC.................... 27 1 8.00 8.00 - 1.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGG............................................................. 28 1 7.00 7.00 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATT...................................................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 2.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTT..................................................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................................................TCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTG............................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATT............................................... 25 1 5.00 5.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTA........................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TAGTAAGTTCACATGGGATTTGTGTG................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAG................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAG............................................................... 26 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAA.................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACT.......................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGgata....................................................................................... 27 gata 3.00 0.00 - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGgat........................................................................................ 26 gat 3.00 0.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGCAGG........................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................GGAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGC............................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGG......................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGG............................................................................... 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGT................................................................................. 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGT............................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTC.................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTA......................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTAT........................................................................................ 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTG............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACT...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGG.......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGAC....................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAA........................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTTT....................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTCCAGT................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGA.............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGA............................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGGACACTTTTGACTAAAGGGGGtaa........................................................ 26 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGgg................................................................................ 27 gg 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGAAAA................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGC............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGGG........................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTG............................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGG.................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................AGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGgg................................................................................ 28 gg 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGG............................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGG............................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTT........................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGGACACTTTTGACTAAAGGGGGA.......................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTTCACATGGGATTTGTGTGAGG............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGA..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
...................................................................................................................................................AAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGA.............................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATT............................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTtt.......................................................................................... 25 tt 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGAGT.......................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGA............................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGtaaa................................................................................................................... 26 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGt......................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAAC....................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAAC....................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................TTTTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGC........................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AAAATGACGGCTGTATAGAAGGgg................................................................................ 24 gg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................AAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTAT........................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGCG........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGAAGAGGTGTCAACTCTGAAATTG.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................AAAGGTGAGATTTGAGTTGGGAGAG.................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TTTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACT...................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................................................................................................................................AGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGG............................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................TCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCA............................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAA.................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGG.............................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGT............................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGg.............................................................................. 25 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TTTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAG.................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GAAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGG............................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTTG.................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGA......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGC........................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TTCACATGGGATTTGTGTGAGGGTG.......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTT........................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATT............................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGga......................................................................................... 25 ga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAt................................................................................... 28 t 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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........................................................................................................................................................................................................................TTCCAGATGACTTCCAGTGCAACCTGGGC..... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..........................................................................................................................................................................................................TTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTT..................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...............................................................................................................................................GCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGG.................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TATAGAAGGTGGACACTTTTGACTAA................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
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.............................................................................................................................................TAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGT................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CTGGTGTAGCGAAAATGACGGCT............................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
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.................................TCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCACATG........................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AAATGACGGCTGTATAGAAGGggga.............................................................................. 25 ggga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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......................................................................................................................CAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTA........................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAG................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGG............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTT.............................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GGTGTCAACTCTGAAA............................................................................................................................................................................................................. 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAAACCTGAGGGAAGCACCGCAAGGAAGAGGTGTCAACTCTGAAATTGTAGTAAGTTCACATGGGATTTGTGTGAGGGTGAACTGTTTCCCCTTGCTCTTTTCTAAACCTAGTTTTCTCAGATGAGCAGGGAAAACTGGTGTAGCGAAAATGACGGCTGTATAGAAGGTGGACACTTTTGACTAAAGGGGGAAAGGTGAGATTTGAGTTGGGAGAGTTCCAGATGACTTCCAGTGCAACCTGGGCAATTT
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..............................................................................................................111..............................................................................192........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)