| Gene: Zfp329 | ID: uc009fei.1_intron_0_0_chr7_13391942_r.3p | SPECIES: mm9 |
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(6) OTHER.mut |
(7) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(31) TESTES |
| ATCAAGCATGTCTGGAGCCCAAGAATGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCTCCAACATGGAGATGGGGAACATTTAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACTAGTTAACATTAACCTATATCCTTTTGATTTTCAAGTTATCAGTGCTCAAGTATGCCTGCCTGCAGACTGCTCATCAACTTCATGTCTTTCTTATTTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAG ...........................................................................((((..(((.(((.(((......)))))))))..))))...........(((((.....((((..(((.((............)))))..))))....)))))........................................................................ .......................................................................72...............................................................................................................185............................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGC.. | 26 | 1 | 31.00 | 31.00 | 7.00 | 4.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGTA................ | 26 | 1 | 29.00 | 29.00 | 9.00 | 9.00 | 3.00 | - | - | 3.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCA. | 27 | 1 | 22.00 | 22.00 | 9.00 | 7.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGT................. | 25 | 1 | 15.00 | 15.00 | 5.00 | 4.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TTTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGC.............................. | 26 | 1 | 11.00 | 11.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .........................................................................................................................................................TGCCTGCCTGCAGACTGCTCATCAACTT..................................................................... | 28 | 1 | 11.00 | 11.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................CAGTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAG.... | 27 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................TGCCTGCCTGCAGACTGCTCATCAACT...................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCT..................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................GCCAGAGCAGATTTTACCTCCAACAT.............................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................TATGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGT................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCTCC................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................CAGTAAGAGTTGGTACTGTAGC......... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TTTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGCA............................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACTAG................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................TGGAGATGGGGAACATTTAAAATTATGCTC................................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........TGTCTGGAGCCCAAGAATGTGTCAGTGC...................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................TGGTACTGTAGCAGAAGGC.. | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACTAGTT................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAt | 28 | t | 2.00 | 22.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TATTTCAGCAACTGTATGGAGTACGT................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TGCCTGCAGACTGCTCATCAACTTCAT.................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAG.... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................TATGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGG.................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TATTTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGC.............................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................TGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCTCC................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................AAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAG | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................TGGAGATGGGGAACATTTAAAATTATG.................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGG... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGTAt............... | 27 | t | 2.00 | 29.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TGATTTTCAAGTTATCAGTGCTCAAG................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................CAAGAATGTGTCAGTGCCAGAGCAGA............................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGTTGGTACTGTAGCAGAAGG... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................TTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGCA............................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................TGGAGATGGGGAACATTTAAAATTATGC................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TATCCTTTTGATTTTCAAGTTATCAGTGC........................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGAGCCCAAGAATGTGTCAGTGCCA.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................TATATCCTTTTGATTTTCAAGTTATCAGTGC........................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAcgc.. | 26 | cgc | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCTCt................................................................................................................................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................TCCTTTTGATTTTCAAGTT................................................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TGATTTTCAAGTTATCAGTGCTCAAGTA................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................AGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAG | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................TGCCTGCCTGCAGACTGCTCAT........................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TTATGCTCAGTGTCTTAACTAGTTAACATT........................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCcgaa | 27 | cgaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................TCAGCAACTGTATGGAGTACGTGCA............................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGata................ | 26 | ata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAGgac | 28 | gac | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................GAATGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTT.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................GAATGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTT......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................ATGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGT................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................TGCCTGCCTGCAGACTGCTCATCAACTTt.................................................................... | 29 | t | 1.00 | 11.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................TGCCTGCCTGCAGACTGCTCATCAAta...................................................................... | 27 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGTAC............... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................CCCAAGAATGTGTCAGTGCCAGAGCA............................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TATTTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGCA............................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGTACTGTt........... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGTACTGTA........... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CCTGCCTGCAGACTGCTCATCAACTTC.................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TTTCAAGTTATCAGTGCTCAAGTATGC.............................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................ATCCTTTTGATTTTCAAGTTATCAGTGC........................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................ACATGGAGATGGGGAACATTTAAAATT....................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCTC.................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................GTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGC.. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................TGCTCAGTGTCTTAACTAGTTAACATT........................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAG | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................AGAGTTGGTACTGTAGCAGA...... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAtt | 29 | tt | 1.00 | 22.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................CAGTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAGc | 32 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................TTATTTCAGCAACTGTATGGAGTACGT................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACTA.................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................TATGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTG................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................TATCCTTTTGATTTTCAAGTTATCAGTG......................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACTAGTTAAC.............................................................................................................................................. | 32 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................TATGCTCAGTGTCTTAACTAGTTAACATT........................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................GCAGTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGA...... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................CAGTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGC.. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................TTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGCAt............................ | 27 | t | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................TCAGTGTCTTAACTAGTTAACATTAA......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................GTATGCCTGCCTGCAGACTGCTCA............................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................TATATCCTTTTGATTTTCAAGTTATCAGT.......................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCg..................................................................................................................................................................................................... | 28 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................TTAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACT..................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........TGTCTGGAGCCCAAGAATGTGTCAGc........................................................................................................................................................................................................................ | 26 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGG.................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................AAGAGTTGGTACTGTAGCA........ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................TGTCTTTCTTATTTCAGCAACTGTATGG....................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TATGCCTGCCTGCAGACTGCTCATCAAC....................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................CATGGAGATGGGGAACATTTAAAATT....................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAta | 29 | ta | 1.00 | 22.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................................GAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAGaaaa | 29 | aaaa | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................TGTATGGAGTACGTGCAGTAAGAGTT.................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................GCAGTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGa... | 29 | a | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TTTAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACTA.................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................TGGAGATGGGGAACATTTAAAATTATGt................................................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................ATGTCTTTCTTATTTCAGCAACTGTAT......................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................AGAATGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTT......................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................TATTTCAGCAACTGTATGGAGTACGTG............................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ATCAAGCATGTCTGGAGCCCAAGAATGTGTCAGTGCCAGAGCAGATTTTACCTCCAACATGGAGATGGGGAACATTTAAAATTATGCTCAGTGTCTTAACTAGTTAACATTAACCTATATCCTTTTGATTTTCAAGTTATCAGTGCTCAAGTATGCCTGCCTGCAGACTGCTCATCAACTTCATGTCTTTCTTATTTCAGCAACTGTATGGAGTACGTGCAGTAAGAGTTGGTACTGTAGCAGAAGGCAG ...........................................................................((((..(((.(((.(((......)))))))))..))))...........(((((.....((((..(((.((............)))))..))))....)))))........................................................................ .......................................................................72...............................................................................................................185............................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
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